XLOC_040247 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040247
Unique NameXLOC_040247
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_41:759081..766855+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040247 ID=XLOC_040247|Name=XLOC_040247|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7775bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_41:759081..766855+ (Clytia hemisphaerica)
CTAAGAGCTTGGGTTATTGAGCTTCATCATTGACAGATTTATGATCATGT TTTGATAATTAAGTgctaaaagatttttttccaaacacttcattttcaga tttttttttgatgcgATAAGAACAGTTAAACTTTGGCAATTGAAATCAAA AGTTAAGTGACTATCACTGACAACACGTCTATCAAAATACTTATTTAGAA GAATATTACTAGAACAAAAACACATCAGAAATGAAATTTACAATGGCTGG TTGTATTGGATGTAGTGAACTAAGAACTTTATTGGTAACGCTGGTGACAT TAGCTCTGGTCATGGATAATTACTCCTGTTATCGAATCGTTGAATggaaa atcgaaaatgatgaaaCAGGGTCAGGTAGTGGAAGTGAGGATACATCTGA AATTGCGACCAAGAGTAAAACAAACATTGCTACATTTAATGATATTGAAA AACACCAATCGACGAAATCACCACATTTCCCAGGAGGATTAGATTCTTCG GAACAAGAGATTGCCAGTAATGTTGGTAAAAGTCATAAATCGTTATCATC CAACTTGGAAGCATTACAACGTTTGAATCCTGGCATTAAGATTTTCTTGT TTAACCCAACAAAGAAACCAGACTCAAACAAATCCAAACAACAGTTTAAG GTATGTTCATTTCTTGTCCTGTTTAGATTCTAGCGATGATTGAACAGGGA ACTTTTTTAGCGAATTTAAATTACTTTCACCGTTTATTAGATTTATTGAG TAGTACCCCCTAACAATTCTcttaaaaaagtcatttgaAATTAAGGTTTA TTGAATAAAATGGGTAAAAGGCCTTCTCCAGATGAGTAAAAAATGACCCA AAATGGATTATATTGCAAATTATTTGGAACATTGGCCCATATTTATAACA CATACTGCTAATTTGCAGATCGATGCAAGAGATACGAAATATGATGTGTT GCGAGCGAATGTGAAGGGCGACAGAGTGTCAAGTAGGCGTGAAATATCTC GACATGCCATCTGTCAAACAATTTTCTTTCATGACAAGCTTCTTCCGTGG CGCGAGTTACATCGACTCGTGTTTATCTTACGAGAGTATTCACAGTTGAA TAATGGGAGGGAGGGACCTTCTGTAACGTTTTTTTGTCATTTGATCTGTC CTTAGAAGTAAACAAGTTCCGTCAATCTTTTTCAGGAAATATTTGAAGTT GATGGCATTTTTTGACTGCATTTTAATTCAAACATTTACCTGACTTTTTT GAGACCCCCTATCTTGATATGAGCGAGTAATACCTAATACATCATTTGCA AGAGAAGTTCTAAAAACCATTCAATAAAAATTGATTGCTTTGGGTTTACG TCTATATATGTAGGAAGATACATAGTTGTAAAGATAATTACAAGAAGGGG TAGCCTTGCACAACAAGACATGGTAAAAAACACGTGGAAACATACGATAA AATCCTTGGAATTCCATTCGGAAGTTGAACATTTCCTGACgagagaaaaa agttttttgaccaCCGACtataaatattttcaatcattacaaatcgaaaa ttttttcggCTTGTTCCAAAATGATGACAGGACAGGAATTTATGTCAAGG TCCTGTTTTCATACGATATCTAAAGTTTATGCAGTGTAGCAGAAATAATA TATGAAATATAGAGCACACTGCTAAATTTCCTGACAAAAAAGATAATTCT AGTGATAAAATATCGCCAAGAAACTTCATTCTCGAAGGGCGGCATTCTCT CGAATGAAACATGACGAAATGGGTTTTTAACGTCATtctaaaaaccaaaa agtgGTTTTATGAGAAACTATCTGGACTAtacagtaatattttttgtggA CTGTGGTGTGTGAAAAATCTTTCGTAATCGGAGGTTTATCTTTTGAGAca caaaaatgatgaaaaatgaatGATCATCACTTACTGAACGATGTTGTGGG TCTTTTCAATGTCAAAACTCCAGCTTTTATGCAATCCTAAACGTAAAACA GAGAAATCTACAAAAAAACGTGAACAAGGCAATTCTTTCGGATTGATGAA AGAGgttcaaaaaatttcagaaaaattttactgctGCGAAATGGTAATTT TTTGCGTGTGTGTATTAGCATATTCCTATGTTTCAGTTTCAGCAAATAAA GAATGTTTTGGCAATACTTAGAATAACAGAAGTACTGATTTTCTGTCTAC AAAGAAATTAAACCAAGACTTTGAAATTGTAATACAGGAACTGCCAAAGA gattaaaagttcaaaattggaaactCCAAAGTTTTAAAATCCAGGCTAAT TTCTCGGGAtctaaaattcagaaaaatgttAGGTTTAACAAAACTNGTAA TACAGGAACTGCCAAAGagattaaaagttaaaaattggaaaagacAAACT CCAAAGTTTTAAAACCCAGGCTAATTTCTCGGGAtctaaaattcagaaaa atgttAGGTTTAACAGAACCTTTTTTCAAAGTGCGTACCCAGAAAAATTC ACAGGAAAAACAAAGTGATTAACTGTTAGTCATTTTGTTGAAATTAGGAA ATGATTTGATCCACAACTTCCGGTAAAAATGTTGATGAAGTAACTATAAA GCCGGAAAAGTATATGCATCTAAATTCCCCGATGATAAAACATAAACATA TTTTCATCAGTGATGATGGACTGAGCAATAAAGACAACCTTCTGAAAATC TTGAATTGAGAGCATTCAAAAGTCTTTGGATTTAGAATCTAAAATCATTA CCCCCAGAAATTCCTTGTTTCGTTAGCTCCAaggaaatcaaacttttttc aaacttatagAATTCAAATCTTAGCTATGATTTATCTAATAATTGTGGTT AAATTAAAACACAAGGGTATCCCCTATGGGAGGGATATGGGCAGAAAATA TTCAGTTTTCAATTTTCTCCCAAATCTCATATCGTACGTTTAcacaaaat ttgattgaaaaacaaacaaacagaccTTCGCAAATATTGGTCATCCAAAT ATTGACGGTGACTATAATATTATATAGCAATGACATTGTTGAAAACAGCT TTCACTGGAGGAAAGGTTGattgatttttgggaattttttccATACTGAA AACACATTTCCTTCAAAAAGTGCTATTCAAGGAACCCCTCTAAAATTCAT TCAACTTTTCAACATATTTTTCCTTGAGATACAAATAAGTGCATTTAACT TATGAATGAAAATCACGAAATAAAAATCTTGACTTGACTTAGATCAGTCT CGATTTATTATTCAGAAACGTACTAGGAAGTATGATGCAATGAATGCAAC TTTGCAATGGCAAGTAATAAAGTAGCTAGATATTGACTTGGCATTTTCAG ACTTAATCGAAGAGCAGCAATCACAGCCCCCTTCAATATAGCAAACAGTC CCAAGAAAAAGACTTTGTGGCGGCAATGTCATTCCAGGGAGTCTCTTGTA GTGTAGTAGAAAAACTGTCAACTATGTAGATGATCACGTTTACAAGtcca ttcaaaattttgttaCTTAAAACTGTCACCAATTATGAAGTTGTGACGTC ATTACGAGTATCCACTTGCACAAGATGTGCCAGAAAAAAGTTCACTGTTG GCAATCTTCCCAATGGAATCTTGAACGTTTCATTGATCGTTATACAATAT AACTATTTTTGTGTATATTAGTACAGCggtggcacacaacgtcaaaataA CGTTCCTCTACTGTTATATTGCCAACTGGGGTGTTTTTGTGCAAAGACTG ATAttttattttcccttgcagttctgcctatggcgtcactattatgggcc taatccgcgtcctccttctcaaaaatatcttataaatatctgttctttgg aatagactaaaaatgactaggtcgtaaaaaagatgtcacgggaccccagg cttggccccctactattgGGCATTCTATAAGACATTTGGATAGTTTAACG ATATCAGAGAAGCGTTAACCTTTGTTAGTTAACCAATTTAAggagaaaga gtggtgcccTCCTCTCCCTTCGGGTAGACAGTTCTTGAAAGGAGAGCCTT CTGATCACCTCCGATTGCGGTCCCAGACTTACTTAGCGAACTTTACCCAA AAAAATCATGCCTAATTTTTTACTAGCGCGACTTCAAGTCTGTAATTCTA TAATTTCAAAGTGCATACATTGACGTAAATTATTCAAAGTATCATCGAAA GTTGGCGACCTTAACATGACTGTGAAAACaaacacatttttctttatttt tcagtcCTGTTCACGCAACGAAGAATGCAACAAAGGTAACACGTGCAACT TATATTCAAAGAAGTGCGAACGTTGTCGATTCCGTGAAGAAATTTGCCGT CGCGACGGGAACTGTTGTGACGGATTGAAATGCTTATGGGGACGTTGCCG TGAACCGATAACTAACGGAACGGAAAAAAGCTTGTGTAAAAGTAATGAAG ATTGTCACTCGGGACTTTGTTGTGCTAAAGAACACGGTGTCAGCGTCTGT AAACGATATCAAAAAGAAGGTGATACGTGTGAGATCCCGTTAGGAGGATT GGTATTCAGTCTACATCACTCGTGCCCGTGTGAGCAGGGCTTAAGATGCA AAGTCAATCGCCGGAATAGGTTAGTAGCCTTTATTCTTTTTCTACTCTTT AAGACGACTTAAATTTGAAATCATCAAGGGAGTTAGTCCCAGCTAACCAC ATTAGGTAATCCTTAGTTATGAGGTCGTGAATGAtaggaagatgaagaag atacagataagtctccataactcgaacttctGTAACTCGAATCTCTCTGT TCGAACAATAATTCTATTCTATAGAGTTATAAAGACTCTCTGTATTTAGA TTGTTGTTGCCCACCTAGAAGAAGCTTCCTTGAATGAGAcaaacatattt caaaaatgttagaaaGGCTTAAATCAACGGTCGAGGGTGGTAGACCACTT ATGTCGTGGATTAGAATACTTGGAAAATATTGAAACCAAAAAAACAATCG AAATTCCTTAGTACTGATTTCATCATATAAGATGACTTCAAAGAGCgtct tttgtcaaaaaaaataagCTAGGGTAGGGACAGGTCATAACCATAAAATT CTGGCCTGCAGTTATGTTTTTTGTGGTTATCACATTGAGGGAAATTTAAT ATCAATTCAGTTATTAACTGTTTCCCACTCCTTTTCACTCGAAATCACTT TAAATGAAAGCCtcactgtcctcacttactCGATATAAGAAAATTATGGT GATGCAAAACCGTTATAGCCTGTATCAAACTCTTAAATGAAACGATAACA CagcaagtttttttcaaaatatgaataaaCGTCCGTGTGTGGGGTGGTAC AGGCTAAAACCATTAGTGGTCTCGCCATTAGTAGAGCTCTCGAACTTTAA TTCTTCGAATATGTGTCGTAGTAATTCTAAATGCCAGTCGAACTAAAAAA TAACTTCTGTAATACAAACAAATTAAGACTTTCGTTCGATTTCGAATTGG GAAGAGTCAATACTGCAAATTTAATCAACGGGCACACCTATAAAAAGTGT TTAGAGTAAGGAACAGTTGCTTAAACCCTTTGAAGTCAAGACCATTTCAG CTCGTACGATAACCAAATTTAAATTCTAGTTGGTGTGTTGGTCTAGACTG CTACAGGCGCCTTAGGATTTAGTCAAGACGTGTCCAGTCTAATTCTAATT TATGTGCCTACTAATCGTAAAAGTGATGGATTTGTTTTCGATGgctcaat tttaaaaaaatctgaaaatctttgGATGACGTCAGTATATATAAAGTCCG AAAtccttttttcaaaacaactttcaacgaaaattctaatctaaatattt tgataaagtaATAATGTATTGATTTTATCTTGTTTGCGCACGCGTATTAA GAACCGTTATATCCGCTACAAAGTACAGTGATCTTTTACTTAGGATTATC TTTACGAAAAATACACGATTAAGAAAACTAAAGCAACACGATTTAAATTC CAATATCATTACGCCAAAAAACCTCATATTCTTTGCAATATGGGCCTAGT CAAAGCTAAAAATGCAATGTGAAaactgaagctctaaagacagCTATCGA TCCCGGCCAAACtgattaaatttttgaatttgctAACCTAATGGCACTAC TACTTGATGTGGGCCATAACTTTATTATACCGTATTACTGGgaataaaca cccccttcttttaaacgccccaccAATAAACGCCCcatctaaaaatcaaa aaattaatcaaacgcccggggcgtttattcgaagtaatacggtaatatCT TTTCCTTTCGTCTCGTCAAGCAATGATGATGGTAATAGCTATAATATCAT TGTATGAAATATTGACCCAAATCGAGTAATTATACCATGAGACTAACGAA TCTCGAACTCAAATTGAAGAGCGGATTTAGATATAGAACTGCATTAAATC CGTTGTAAACTCTAAGTCTTAAAAAAGGTAGTTGAGCGACCTTTTATGAA CATTAAGTTCAATGACTAAAACTTTcgcttttttttatttcagtgaTGAA TTTCGCCAAACCAACGGGCGGTGTATCAAGTGAGTACGCAACCTATAATC AGTGGCGTGGGCGTGAACAGGTTCACACAAACTGAATAAAAATGACAgaa tattaacaaaattctGGTCCCAGTGAGTGAATAACATACAAGTGGACTGA GTTCGAATCTCTGGATGGGCCGTATACAAACTTGtgcaataattttttat tcaaagagATGTGTTTTGGTATGAGAAGAAAACACAAATGGATGTCTCGA GAAAACACTTGTATACCACTTAGACAAAATAACATGAATGGATTTACAgt aataaacaaagatttaatcgaatgttttcattttggTATGCGTGGATAAA ACAGGACACGTTTGGAAGTGTAATGAATGGAATAACTGGTAACATAACAC ATCAATGAACTTTCTCGAAAATGAATTTCTATTAATCTAATGGACTGTTC CCTAGAAAAAGAATCATGCACAGGATCGTGTAAAACTGATCAAATTTATC TTTatcctaaaataaaaaatttatgatACCCTCGCAAAGGATTTGATTCG ACCTTTGTTGTATTAAGtaaatttacacgttttttaataagtGTTGAAAA GTTTTGTAACCTTcagactttttgggttttaagcctgaaaatgttcttaa agtgtGGACCACGAGGTTATTTTGGCGTGACTTCCTAAGAAATTGTATGT TTCAGTGTCTCCGAAGCCTTAAAATTATCTTAGGATATTCTTAAATATCT GGGCTACGAAGCCTTATTTTctcatataaaaaacgtgtatttgggTATTA AAGCTACAGAACTCTTTTTAAGGAACAACCCATTGGTAATAATGTGGGAA TGCATGATTTTATTAATTAATATCAACAGAAAGAAattaacatttaaaaa atataaatttaatttattttataatATTCAAAGAAAATGAAGGCTAAACT TTACACCcctttttatcaactttcacaccTTGTAAAACGTAGTAAATATA TTATAATAATGGCTAAAATCTTATCGAAAATTATATTGTTTGCCCTTACC CCCTTGTTgtatagcttttttatttttatttgcccaattttaattttata ataatatatttatgtgaaaaatagtaaaatataaatcttaaaaacaattc aaagcaCATGATTGAAGGGACCCCGGTATGTATTATGAGGTGGAGGTTTA TTCAGAGTAACAATTTCATTAGAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064189TCONS_00064189Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064189-proteinTCONS_00064189-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_41supercontigscaffold_41:759081..766855 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.05 0.07 0.08 0.1 0.82 0.95 5.98 6.12 4.05 3.78 2.49 3.92 9.35 8.84 3.17 3.94 7.27 8.88 10.6 9.14 31.34 31.16 4.37 7.49 6.22 7.91 8.71 4.13 2.36 1.44