XLOC_040258 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040258
Unique NameXLOC_040258
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_41:378824..388044-

Legend: gene
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>XLOC_040258 ID=XLOC_040258|Name=XLOC_040258|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9221bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_41:378824..388044- (Clytia hemisphaerica)
CTAGAGTTCACTTTATATTCAGTTTTAATCTAGGTGGAATTATCTAAAAA GCTGGATTTTACTCATAAAAACTTCCATTAGAAAATTAGAGAAAAATGAA AAAGCAAATAAAAAATCACCCATCGAAACTTGAAACCTAAAAACCATTTC AAAATGGCTTCAACAAATATTCAACCAAGCCAACAGATGATATCATCTTC ATTTGGAGCTGTCTTGGTTGCTCTATTTAGTAAGTTCTTATTATTTCAAA GATTGTCGTAGTTATTAAAATTTTATAAAAGAAGAATATTTTTGTGAATT GTACACTATGTTTCAACTCGGTTTGTCTTTTTAGCTACACCTTTTGAAGT TATCAAGGTTCGAATGCAAGCACAACTAAAGCCAACAGGTAGAATTTTGT ATGAAGTCACATTTATGCAATGTCAAAAACTCAATTCCTTATTTTATTAA TATAACACTCGAAACTAAATAATTAATTTTAATTATTAGCTGTTTAATCA GGACTAAAATTACCCCATGTATTAAAATCTATGTTAATTTGTTAGCATAA AAGAAAGAATGGTTCCATCAAATACCCACTGACTTTTTGTTTATTTTTAG CTGTGAAATGTTCAATCTTTGAGAATGTTGTAGATACACTTTGTTACTGC ACCACAAAACCTGCTTTTAATAGTCCTGTTCTCTGTACAATCCATAGTAA TATTCAGACTGTACCGCCGTTTAGATCAAGTACTGTAAGTATTATCGGTA AATTCACAAAGAATCAGTTGTATCTTGCAGCTTTCTTAATATACAAATTA TCTTTGCTTTCATGAACTGTAATATTCTTTCCTGGATAAATTCAAACTGG CAATCATTGAAATCTACTGTCCTAACAAAGATGTTAGTTTTTTGTGAATG ATATGTCAAAATCGCCATCTTTCATTTCTTCAATATAAAAGTTTCACCAA 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TTTTCTTATCTTCAATTCTCACTATTTCTACAGTGTGATTTAGAAAAACC TTCTTCCCAATTTTTCATTTTTCATTTCAAAAATGATAGTAATCAAGGTT TCTTGCACATGTCTTATTTACATTTTCCTCTCATGAATCTCCCCCCTTTC TCTTCATTATAAATATGTGTACTTCATTTATTATTCTTTAGAGTATTTTG CGAAACGCCTCATTCACGTTTTAACAATTCTGTTCATTTTCATACGTGCT AATCTCAAAGTGTTTTTTAGTGTCTTTCACGAATTGAGTTACACAAGGGG ATTTTCGACTGGAGATTTTCGCCTGGAGATATTGTAAACTTCAGCTTCAA CTTCAACAGATAGTATCTTCTGGAACGTTTTTCTCTAACATACATGTCTA TCGAATTTTTGTGTTTGTAATGGTTCGTACTGAGATAGATTTGCATTTAC GGTTACACCGGTTACAACAAGTCGTTTTCGAGTTTTTAAGGTCTCCTTCT TTACTAACCTAAACGGAGAATTATTGGTTCACGAGCGAGTTTTTACTTTG TGAAAAACATGCAATATTTATCGAACTTTCGATTAATCGACAAATGGGTT TCTTTTAGTACAGTTTATACCTCGCTCTTGTAGCGTATGTCAGGATCAAC ATTGATGGCGAAATCGATAGCGTTTTGGAAATCTATGCGAAGAATATCGG TGTTAAATATTTAATAAAGTTTCCCTTTTTCGGAAAAATATAACGAAAAA GCACCGAAACTAGTGACTCAGTAAATCAGTTTGCCTATAGTAAAGATCTC TTTAAACAACATGTCGCCCAACTTCCATTCCCGCATCTCTTACTTTTAGT GTCGTCAGCCAAAAAGCTGCCTTTCACATTCTCCATACTCAACGATTTAC GGAAAGTGCAAGGCTTGTCGAGTCTTTATACTGGTAAGTGGTGTCTATTT TTCAACAAGTTGTATTACAATTATTTTTTACTAAACTTTAACCGTGCCCC GTGTTTAGTACTAATTAAAATATATGAGCCCCGGCTTTACATTATTACGT AGCCATAGATTTATGAAGCCCGAAAGGCTAGATGACGTGCTTTAAGCTCT TCCAAGCGAAAAAAAGTGAATATCGCAAAAATATTTTTGCTATTGTTTTC GAAAACCTGCGAAGCTTCTGATTGGTCAAGAGCTGAAATTCTATTGTAAT GTCACGTGACTTAGGTAGGATTTCCTACCTAACCTCGGCACACTTTTCAG CAAAAGCACTCCATCTAGCCCTTCGGGCTTTTATAAATCTATGGTAGGCC CCCTCACTTTTTTCACCATGTAGCTTATGATAATTGAAGAGTCGCCATAT TTTAAACAAGTACTTCCACGTCAGGCCGATTTGACCATAAAGTAGTTCCT AATAATAATGGTCATTGGTTCTTCTTTAGGCATGAATCCAAGGCTATTGA AAGTAGCGCCAGCCTGTGCCATCATGATCAGCACTTATGAGTATGGTAAA AGTTACTTTGCCAAGAAGAACGATGACAAAGATGTTGGATGAGGTACAAT GAAGTGATTAGCTACCATCGGTGTGTGAGTATATAAATCCGATGTTTACT CGCTAGGATATTATACTTAGGTAGATTAGGTATCAGGGAGAATTGACCTA TTCGCTATATGTATTACACCTATCACCTTATTGCAATAATTTAAGTTGAA AATGGTACACAAGAGATGGGATATTTACTATTACCGTATAGGAAGGAATG CTTTGGTTTCACTATGGATATCAGATTTTGAGTGGCATTAACATATGGTA TCATAAAACCAAAATCAAAATCAAATACTTTGAATCATTTAGAATGAATA ATATTATACCCGCCATGACATACGAGGTGCAAAAATAATATAATTTTATT GGTTTTGACTGATGGTATCCTTTGAAGTGTAATCAACCCAAGGGCTTTTA ACCGTGCGCTCTGTGAAGGGGTTGAAATATGGTGCTTTTACGAACTTACT TTTGACGAATTGTAAATTTTGCTGGTTATAAATATACACAATTATGGATA AACAGAGATAAAGAGTTCAAACATTTTATCAAAACTTTTATCTATCATGA TTTGCCAATGCAAGGACTTACAAAAGATACACTGTCCCTAGTTCAGAAAT GCTGCGTTACCTTTACGTAAAATAAATGGCTTGAATACAATTAAAACTGC TATGCTGTTATTATTGGTTTGTAGCTCACAGACCATATAGTTGTGAAAGA ATTTGACAATATTTACCTTGCATAGGAAGAAATTATTTTTGAAATTAATT GATAATTTATACCTTTATCCCCTTACCTTTCCCGCACAAGTCCGTAGGAT TATTTCAAGACTTACGAAATAGCATTAATTCTGCCAGCCTTAAATCTTCA TTTTACCGTTTGCTACTTGTGCTTTTATCTCAATAAACATTGTTCAGAAG TGTTTAATTGGTCTGACCGTAAAAATAAAAAAGTATTTATTTTTGCATAT TGTTTCAGCTTAAGTTTAACTTCATTCTTCACCTTCATAGGCTACAATTT ACAGTCGATGGGCTATTCGAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064213TCONS_00064213Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064212TCONS_00064212Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064211TCONS_00064211Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064212-proteinTCONS_00064212-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_41supercontigscaffold_41:378824..388044 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SLC25A40PREDICTED: solute carrier family 25 member 40 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.54 6.36 2.31 1.29 22.23 17.02 13.15 12.63 10.96 10.59 10.24 9.14 8.01 6.74 6.68 7.15 12.1 10.83 3.06 6.32 18.01 18.47 14.33 15.18 11.2 14.32 5.99 5.32 11.03 10.14