XLOC_040778 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040778
Unique NameXLOC_040778
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_428:300222..312066-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040778 ID=XLOC_040778|Name=XLOC_040778|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11845bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_428:300222..312066- (Clytia hemisphaerica)
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CGGATCTGCCACGGTAAATACTCTACTGTATGAGTTAAAAGGACTTTCTT CTTATTTTCATACAACAGGCTGACTACACTTATGTGGCCGCACATAATTA CGACATTGAAGAAGCTTATTTAAAAATGGCAACCACATTTGATGCTGCCA AACAAATTTATGAACAAAGCGACTTTGATGGTGATGGAAATGCTGATGGT TTGTTTCTTGTTTAAATGTGTCACACAACGTCGTTTCAACGCTTTTCTAA TGTTCACAACGTCCATATAACGTTAGATGAACGTTGAAACAACGTTGTGA ACGTTGAAACAGTGTTGTGTGCCAGCTGGGATACTTGTCACTACAGTAGA ATCTCTTTAACTCGAACCTCTATAAGGACATACCTCGAATGTCTAATTAA CTCGAACAAGTTTTCTCATCCCTTTAGTTAACAATGCCTTATAAACTCTA CTCCATAACTCGAATAACGTTATGTTCCCCGTGCGGGTTCGAGAATACAC TATATCGACTTCCTTTCTTACTCCACTTCTCTCTTAGACTAATAAACGAC GTCGTTTTATTTCGCTTCAGCTTAAGCTTGCAATGGGCTCTATTTCTAGA TATGTTCACCGCTCTTTCCAAACCACTCTCCCGCAGCAATTTCTATTTTT TTACAAGAACTCTTAATAAGCACTATTCCCGCGTTCCCGTGTCCAAGGAA AGACAGACGCTTGCTAGTCCAATATCGAATCCTCTTTATTCTCGAATACA TCATTTGTGAAAAAATTTGTCGGATAAATATTTCGTAACCCAGCAAATAT TTTGTCATTTTTGCAAATTGACTTCCTTCCGAAAAGGTACCATATATAAT TGCATTCTTACTCTCGGGTACCTAATAGCCGGGGGGAGGCGCTAATTAAT TTTCTTTTAATTAACATTCTTATTCCAGCCCCCCCCCCCCCTTTTTGGTT TTTGGGAAAAAAAATTTAAATTTTGTGAAAGTTCCCTCTTCTGCCCAAAT TCTGCTGTATTAGCCTCCTTTTCGAAATTTTTATTCTAACCCCCCGCTTT TATTAGGTTTTGAGATTTTTTACACACCACCTCCCCCCAACTTATTCCAA ACCCACTGGCTGTTAGGTCCCGATAGTAAAGAGAATTTTCAAGTCTTAAA ATCAGGGATCCTGATTGGTTACAAATCTCAAATTGGCTTGATTAAAATCA GGTTGATAACACTTGAAAACCATAATGATTTAGTTCGAAATTTCTTCTAA GAGTCTTTATAAAGATGTAATTAAATTTCTCTGGGACGAGATGGAGTTTT TACAAGCTCTTATTTTGATTTGGTTGGTTGGTTTTTGTTACTTTTTCTAA AGAATGCGTCATTTTCATTACTTCAAAGGACCAAGTATTATTAAACTCCA TCTCATCTGATTTCAGGGATAACGTTGAGAATCGGTGGATTCAACCGAAC GAAGAATTCCACCGAATGCGTTGGAGATGAGTGTCGGTATAACTCGACAC TAGGTATAAATGAACTTTTGACGGTTTTCACGACAAACGACCATGGAGAC TACTGCTTGGCTTCTCTTTTTGTTGACCGAAATTTTGCACCTGCTGCAAC AATTGGTTTAGCGTGGGTTGGTAAGTAAGATTTTTTACTATCATAGTTGG ACTAGAAGAGTCTACTTCTCACTGAACTTTGCTTTTTTATAATTTTTTAT GACGCTGAGACAGTAAGGTCAGTGACTATGAGTTCTAGAGCAACGAGATA AAGAATTGAGAAAATCGATTTTTATTTTCCGTTTTCAACAAGTGGAAAAG CTTACAACGAAAGATCATAAAGGGTGTCCGGAAAAAAATGTATTGGTTGT AGAAGGTTGTTGTGTGTGTTTAACAAAATGTAAAAAAATATTTACCAACA 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TATAACACGAATTGGGTGACTATCAATTCTCGGGGAACACCTTTAACAGA CGCTGTCGTTGAAATTGTTACTGCACATGAATTTGGCCACAACTATGGAA GTGATGTAAGTACCCAGATAGTCTGGCACGTCAGTCGGGTTGGAACAGTA CCTCGTGGGAAAAGTGAGCGTAGGAGTTAGGTAAGCGTAGGAAGAAATTT TGTCGGCGGCAAGGGCTGAAAACCCTTAGTTAATCAGCAGCCTCTCACCA ACTTTTGCTCGTTCTCCTACGCAGCTCCTATTTTAGCAAACGCCTGCCGC CTTTATGTTCCCGCCCTCTGACATGATTAATCAACAGACTAGTTTGCTAG TCTAGTACTCAGATGAATTTCTTTTTTCAGAAAAGACAAAAAAACATACA GTTGACGCTCTCTAATTCGACATTATACTATTCGATACGCTCCATTATTT GACAATATTGAAAATCGTCATCAATAAGAAACCCTCACAAACAATACTCT ACTATTCGATGCACTCCACTTGAAAATCGAATTAGAGAGCGTCAACTTAT TTTAACGGCACGAATAACAAATTTACCATATGATAGAGCTACGGTAAATC GCAAGGTATTAACGATCATTTTTAAGCAATTTATTTTTATTTTTACTGCC TCAAGTGAAGAATCTTATGTCTAACATGGGATTTAGGGAAAACGATTTCG TGCCCAGAGAGATGTGCTAAACAAAAGGGAAAATTATCAATTACTAGTAC TTCCTTTCAACTAACTATTGTAAAGATTTTTGTAAGTTTAAGACCATGTT CGCACGTGACGTGGTTCGCTTTCGCTCCGAAACGGAATGAAGCCATTCTA TTGGTTAGAAGTGACGTAACATTTGAATGTAACCTATAGAATGGCTTCAT TTTATTTCGGAGCGAAATAGAACCGTCACGTGCGAACATGGTCTATTATT TTCTTTCGATAATATTTTTCTAGCATGACAACTCAACTTGTCAACCAAGT GACGTCAGCCCTAATGGTTATTATATTATGAACCCAACAGCTCCACAGAA CGGAAATTTGCCAAACGAAAGACAATTTTCTAGATGTAGTTTGAATGAAA TGTGGGCTAAGATACAGACACAAGGAGGATGTTTTAAAGGTATGATATCA AACTTACAACAAAAAATTTTGCATGATAGACGACTTCACCTAACCTAGAA ATGTAAGCTAGTTTGATTCAGTCACTAAGATAAATCTGATGGTAAGTTGT GACTGAATAACTAATAACAGTATTCCAAGGGCTTCCAAGGCGAACTTAAA ATCCGTAAATATAAAAAATCGTTAAAGCGCCGAAAGCGCTATATTGCCAT TAGCCGTGTGTCCTAGCCTTGTGAATACGGGCTTAGTTAACTACGCGGTG TATTTAAGGGCGAACACACATGTTTATAAAAGACTTTTTATATAGATTTT TCAGTCGCAAATAAAATTATTTTAGCATTCGAATTTCGCAAAACAAAGTA CATATTTGAAGTCTCCATTAAATTTCGCGTTTTTTGATGTATATATGATC AAGGTAATTATTAAAACATAATTACTAATTTGTGGAAAAATGCAAGAATT CTCTAATTTTTAAGTGAATTCTTGAATGCCCGGTACGTGTTAAAAGACGA AGAAAATGAAGCTATATAGTAATGGTGACTTTGTTTGGCTTGTAAGAGGA AGCCCTTAAATAAGCTTTTGCCTAGTTCGAGAAAACTAGGACAAAGACAA AAAATGCCAAGTCAGTCTACCCTTTCTGATAACTGAACGACGTGCAAGGA TTAGATATTATAACAAATCTCAAAAATATTTTGTTAAAGTCAATAGACCT GTGAAATATAATTGTATGAATATTGATTTCTCTCAGAAGGGTAGATTCCT 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065043TCONS_00065043Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065042TCONS_00065042Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065043-proteinTCONS_00065043-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_428supercontigscaffold_428:300222..312066 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 1.86 1.36 1.71 2.14 0.83 0.94 0.89 0.64 67.7 83.45 0.29 0.37 0.46 0.55 168.18 280.06 0.39 0.26 0.34 0.47 0.26 0.2 0.18 0.08 0.12 0.36