XLOC_041322 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041322
Unique NameXLOC_041322
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_448:454513..473626-

Legend: gene
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>XLOC_041322 ID=XLOC_041322|Name=XLOC_041322|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=19114bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_448:454513..473626- (Clytia hemisphaerica)
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GATCAATAGATTTGCTAACATTGACATAAATGAACCAATCAAATGTTGAG CACATTGATAAACTCGAGTACCGCAATTATTATGAACCTTGAATAGTGTT GATGGAGAAATATGAGCAAGGCTTTTAATCTAAAGATAGCTACAATCAAA ACATAGACTAAAAGCTGAGCACTCTTTCCTCAACTGGGAAAACAGTTCAT TAAATATTAGAATGAAAAGCAGATTTAATATCAACAAGTCCTGCCGCAGC TGACATCTTTCAATCTTCCTGTATATTTAAAGGGTACATGACGCCCTATA CGCCCCTTTTATCTACCGCCCTTTAATTTTACACCCCTTAACAACATTTT CCAGATATTTCAACAATGAAACACTTCACAAGCTTCTGTATAGGAGATAT AAAATGGAAAAATGGTACCTCCTTGATTCTCAATCCGCTACTAAATAGAT CTCAACAAAAGATTCAACAGATCCCCTTCCCCTTGGGTTTTCACAACATC CTATTAGGGCGTCATGCATATCCTTACAAAATTTTATCTTATAGCTAGGT CTTTATAATTTTTTTCTTAAATTGAATTTTTGTGTTAGAGATTAGACGAG AAACTCTGTACCGTAGAATAACCACCTTGCTTTTGCACTGATTTCCTTTA TCCTAAAAATGTTGCTGAATTTGGGAAGGGATCATTTAATATTTCAATTA TTAAATGATCCCATCCCTGAAGGTAGATAACGCCCTCCCTAATATTTTAT CACAAAACTTCATATTCAATAAATATTACACTAAATTAGAGAAAAATATT GTCAAAGAATTTAGTCTAGAAAGATATTATATTGTTCAAAAAGATTTTTT GTAAAGGTTAGGGAAAGTAGAAAATGAGAGAAAAATCATGGTACCAAATT TGAAAAGTAATTTTTGGTACTGGGAGATTTTAACTCTATTTTCTTCTTTT GACCAAGCCTATTGTTTCCATTTTGGTTTGTTTTTCACATTTAAAACTTT GTCAGATTGATAAACATATTTATATAAGAGCAAATGGAATACATACACGT TTTTTATGAGTTCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065968TCONS_00065968Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065967TCONS_00065967Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065966TCONS_00065966Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065965TCONS_00065965Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065964TCONS_00065964Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065963TCONS_00065963Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065962TCONS_00065962Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065964-proteinTCONS_00065964-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_448supercontigscaffold_448:454513..473626 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
JAKMIP1janus kinase and microtubule-interacting protein 1 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.07 1.77 0.79 0.87 6.55 5.32 3.99 4.49 1.92 1.47 1.32 1.46 95.41 88.73 0.62 1.03 319.8 295.93 154.42 125.41 261.34 258.55 83.64 100.32 205.73 152.79 5.45 2.88 6.16 4.34