XLOC_041633 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041633
Unique NameXLOC_041633
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_456:567652..583075-

Legend: gene
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>XLOC_041633 ID=XLOC_041633|Name=XLOC_041633|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=15424bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_456:567652..583075- (Clytia hemisphaerica)
CTCTGTATTGCTTGTCCTTTTCAATTGCACACATCATCAATCAAAAGTAT GGGTTATTTTTTGAAGATTTTTGTGCACTTAGGATTTAGAAATACTGAGA AATATGCTAGTTTTTAATTTTTTGTAACTGACCTTTTGAGGACGTTACAG GACGGTAGAGTGACTGAAGCGATTTGGAAAAACCCGCAGTTCTTACCCGC AAAATCGAGGACGGTAAAATTGCTGATTCATCGTTGTCCTCAGTTGGTCA GGGTTTAGTCAAATTAGAACCTTACCGTCTCCGTCACAGAAAAACACAAA TACATAAACTCGGTAATGTCTCTCGGGTGACTTCACAGATATTTTTTTCT AAATCGAATCTCGAACGGAATATCTTTTTGTTTTTGGAATTTTTTCGAAT TACAGCTAACTTTCTCTAATTCGAACTCAAACTGGAGTTATGACCTATTC GAATTACAGAGAAAGTTCGAATTGTAGAGAGTGTTTTAGGAAGTTTTCCT CTTGACAGGAACTTAGAATCAATTCTTGAATTGTACAAAGATTCAAATAC ACGTTCTTTTTAAAAATAAACTATATAAGAACATATGGCTTTGATGGCCA AAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTAAAGGCTTTGCAAACTATAAAA CAACCGATTTTCTTAGGAAAAAGGTCAAAAATGCTCAGAAACTGGTCAAA TTTAAGAACATATTATGAACATTTTTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAT AACATCCGAAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATAAAACGTGTAATA CAAGTTTGATTTAGCGATAGTCTACTGTACGTAGATATTCAAATTGTCTT TGGTGCATGTTTCTCCTGAAGGAGACTGAGAATAAGTTTGGTTTATTGAA ACATAGAATTAACTTAGCGTTGTAGGTGCGGGCTACTGAAACCGTATAAC 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ATTTAAGATAATTTTGATAGACATGTGACTTAAGTAAGTTGTTTTAAAGT CGCATATTTTAAGTGTCACTCATCAAAGCCTATCCTTGTTTACATTTTGA TCTTGTATTGACGCCTTTTTAATGTTTCCTGGATACTAAACATTCATGGT TCGAATTTCACGAAATCTTTTTTGAAAGTATATACTAAGTGCCTCTTTAT ACATGACAACACATTTTTTATAAAAATTATTCTAATGATACTGCGACTGT TCATATTTTATCGATATTCAGTCTTAGCCAGTGGAGCTAGAATCTGAGAA TGTCTGTCTGTGTCACTGTGTGTGTCTGTGTGTCTCAAAAACCTTGGGGC AGCCTGGAGACTTCAAAAATGGTTCGATTTGCTGAAATTTGGCACATTTG TTCCTTGAGTGAATATCTGGGGATGGTTTTTTTACTTTTCAAAAATTTTG ACATTCAAAGGCCTGGGTACTAATCTTTTGTTTTCTTTGCTACAATCGGG TCTATGAATAATTTGAAGCATCTCAAGTTGAGCCCAGTGCATCGCCCACA TTAAACTATATTTCAATCGCTCTTCCAAATTTTTTTATATCTTCGTTCAA GCTAAAAAATACCTTTGTCCTTTCGTGCAGTTTTGGACATTTTTAGTTGT GATTTCTTTTCTAACTCCGACAATTCAAGTGTCCTGTTTTTATACCTTGA ATTTTGTAGTACATATTTGAAACCAGAGAGGAAGTTAAAAGAATACGCGC AATGTTTACATGTAAGTTTCTTGTTTGAGCAGTAAAAGTGTTTTATACTT GTTGGTTATATGTTGTGATATAAAAGAAAGTTTGCTAGGATTTTATATGA TAACATACGATTATACTGCTTAGTAGCGAGCACCTCACTAAAAACCGAGA TTTTACATTTTGTTACTGCTTAGAAAAAAGGTCATGGCGTCTAGTATAGG 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ATTAGATAAGGGCCTCATCAGGAACTGTGATAAATCCCTTTATCTGTCTT TAGTTATAAAGGATCTAGCCTAACTAGTGAAATCGTCGATTTTACTTAAA GATTCTAAATAACTCGCAACTCTCTTTTCTAGGAGAGACATCAAGCTCTC GTGTCAAACGGACAGTCGAATATGCGTTTGTTATTACACTTCCAACGACC TCTTCCAGTGCTCCGGTTCCTATTTTACATTAGTCGGTGGATATTCCAAA GAGAAAGATCTGGTCCTGCTTTTCGATGCTTCCAGTCATAAAATTCCGCC ATTTTGGATACCGTTACCAATACTGTTCAAATCCATTCAAAGCAAACCGA TCGATGAGACTAATATCAAAGGTATGGCATGTTCTTAAAAATCAATCCTT AGCTCTTTGCACCCTTGTATCTGTGGCCCCGTTCTGAGCGTTTTTTTGCA GTGTGGGTAAAATGAATTAAGTAACTAAATACCAACAGGGGTGTAAAATT CGTTTGACTTTAATAGCTATGGAATTAAATACATAGTTACTGTAAATATT GTTTGAGGATGCTTATTCGGCATCTAAAGTTTTCTCCATTTAAAGCTCCT TGATTTAATAGAGAATGAGTGAAAGTAGGATGATTGATTATTACTGAAAT AACAGTGCCGTAGCTGCGGGCAAGGGGGGGGCTGTGCCCCACAATAATTT TTTCAAAAATGGTTATTTTGCAAAATACAAAGTTTTTCTTGTTTTTTCTT GAAAGCATTTTGTTTTGAGTGCATTTTCAAGCAATCTAGAGCTTAAATTT TCAAAATTTCCCCCCTCGGGCCAAACCATGGTTGGCCCTCGCGCCCCCCA ATAAGAAATTGCTTCCTACGGCACAGAATAAGCGCCTGGGAGAAACTCAA ATTTTGAGCCGAATCAATTAGCAGATCTTCATTTACGCGGGGCTTAAGTG TATATTGTTGGTGGAGTCTTACGGTCTGGTAACCCTGTTTCATAAACATA ACATAAACACGGTCAGAAACGGAAATTTACTTTTCTAAGCCTGAAAAGTA AAGGACTATAATCTTATTTTAATCTGGATATTTTCTGTTGACAAATGATT TGTTTTCTTATTTTCTCGCTTACTGTTTAGAATTCAAACTGGGTTATTTT CTTTTGGAGAAAAGTGAAAAGAAAGCTTCCATATTATTGAACATCAACAA AAAGATTTCTGTCTTGTTAAACGCTCCCGATGAACATTATGAGAAATTAT GTAACATGAAAGATGATTGGGAAATGTGGTTAATATCTCCACTATCCACA TCTAGAAAAGATGACATCCTCAGACTTGCGGTTGATAATATTATGGAGAT AATAAAGAAACAAACTTTAAGAACAGTCCGTGTCAAAGAAGAGCAAGCTA AGTTAACATACAAACAAGGCAGTTTAGTTGACTCGCTAACAAAAACAAAA ATTTTCCCTGTAATCGAGAAATTCGTATCGAATATGAATAATGATTCCTT ATCGAAACTAACAATTTTCTCCGAATGGGTCTTAGAGACCGTCTTCATTA TGCGAAAAAGTGATAAAAACAAAAACAAATTTGCTGCTCCTACAAAGAAA AAGAAAAAGAAGTTGGTTCGTACTAACGTTAATATGAACACTTTCAACAA CACGACAATGTTAGCTACCTGGTTGTTATTCTGGCCGTACGCGCATAAGA AATTTGATTCGAACAGTACGTCACTCTCTGAATGCATTGAAAACGATTTA AAAATATTTCCATCTAAATTGGTAGAGACTTTTCATCATCAAATGGATTT TGTTATCAAAGTAGTTCAATCTTCTACTATGAATGTTGTCAAAAGGAAAG CCAGAAAAAATGGAACTTTGCCACATGGTTTATGATGATTTTTCTTATTT TATTCTAGCTTGATGAACCTTTTCATAAATAACGTTACGAACATCACTTG CGTCGTTTTGACTTCCTATTTACAAAAAAATAATTTAACCATGTCTCATG AGACATAATCACCATGGTAATTGTTTGAATACAAGGCAAGTGATGTTCGT GACGTAATTTATGAAAAGGTCTACTAGCTGTATTTTTATTGTTTCTCTTT AGGTTATCTTTCCAACGAGATTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00066566TCONS_00066566Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00066565TCONS_00066565Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00066566-proteinTCONS_00066566-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_456supercontigscaffold_456:567652..583075 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.1 2.24 1.1 1.02 5.51 4.8 18.08 19.08 7.53 14.53 5.62 5.13 15.89 9.15 10.4 8.77 5.09 14.03 12.97 23.65 5.93 6.5 11.69 11.57 5.72 8.51 8.53 6.76 7.81 9.02