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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00066566 ID=TCONS_00066566|Name=TCONS_00066566|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2251bp CTCTGTATTGCTTGTCCTTTTCAATTGCACACATCATCAATCAAAAACAA TAAATCACCAACACTGAAATCACCAAATGAATCATGACGACATTCACACC GAGGCTTGATCGAatcattgaagatgaagaatcATCAAAACATCCAGATG ATCCAATCGATTTTGATGATAATATTTTGGAGGAATATGATTTGCTGACT GAGCAAGATTTATTCATTGCTCTTGAAATCAATCCGAAGAAATTCAAAGA TGGTGAATACTTAAATGGTGTTACTTATAAGAAAGATGGTGACGATCAAA GTGAAGATGACGATTCGAATTTTACGGAATCCGATGATGAATTTGATGGT TGCCATATCAACGGGCCAAGCACCCTTAGTAACGGACATAATGGCGCTGT AGACCACTTTTCGAAATTACATAGTGGGACTCAGGCTAAGAATTTTGAGA TTATGCAACGCTATCAATCACCAATAGACTGTGTTCGTAATACTTCGAGT AGTGCTGACTCGGCAAATAATGATGAAGTATCAAGTATGATCAGTGATTC ATCCAGTTTATCCAAAATTTCGCGACGACGTAAAATATCTGGTCATTCGA ATCCATTTTCACCGATAACACGAGGTCAAgatttgttgaaaaaatatttg agcAACTACGAAGGTTATGAGTTTGATTCGAAAAACGGCCGTAAAATATT CGTGAAAGCCATCTTGAAAAAATACATGACAATGTATTACGTCATTTCCC CACCCAAGATCACTGCAGCAGATATTGATAATAGTGGTGTTTCAACTTTA ATGGCGATACGCAACGCCTTGAAAATTAAGGAGGATAAATTAGTAACGGA ACAAAATGGCGGTGATAATAACGACAGTTTAATTACGTCATGTCTAATGT TTGACTACCAGAATAACGACGAGttgaattttgatgaatttgcttgtatc gcgaaattaaatgctTTGAATGTTGAAGCTGTTGTTGCACACTCGGATTC AAACATCAAAGAATTCAGGAGAGACATCAAGCTCTCGTGTCAAACGGACA GTCGAATATGCGTTTGTTATTACACTTCCAACGACCTCTTCCAGTGCTCC GGTTCCTATTTTACATTAGTCGGTGGATATTCCAAAGAGAAAGATCTGGT CCTGCTTTTCGATGCTTCCAGTCATAAAATTCCGCCATTTTGGATACCGT TACCAATACTGTTCAAATCCATTCAAAGCAAACCGATCGATGAGACTAAT ATCAAAGAATTCAAACTGGGTTATTTTCTTTTGgagaaaagtgaaaagaa agCTTCCATATTATTGAACATCAACAAAAAGATTTCTGTCTTGTTAAACG CTCCCGATGAACATTATGAGAAATTATGTAACATGAAAGATGATTGGGAA ATGTGGTTAATATCTCCACTATCCACATCTAGAAAAGATGACATCCTCAG ACTTGCGGTTGATAATATTATGGAGATAATAAAGAAACAAACTTTAAGAA CAGTCCGTGTCAAAGAAGAGCAAGCTAAGTTAACATACAAACAAGGCAGT TTAGTTGACTCgctaacaaaaacaaaaattttccctgtaaTCGAGAAATT CGTATCGAATATGAATAATGATTCCTTATCGAAACTAACAATTTTCTCCG AATGGGTCTTAGAGACCGTCTTCATTATGcgaaaaagtgataaaaacaaa aacaaatttgctgctcctacaaagaaaaagaaaaagaagttgGTTCGTAC TAACGTTAATATGAACACTTTCAACAACACGACAATGTTAGCTACCTGGT TGTTATTCTGGCCGTACGCGCATAAGAAATTTGATTCGAACAGTACGTCA CTCTCTGAATGCATTGAAAacgatttaaaaatatttccatcTAAATTGGT AGAGACTTTTCATCATCAAATGGATTTTGTTATCAAAGTAGTTCAATCTT CTACTATGAATGTTGTCAAAAGGAAAGCCAGAAAAAATGGAACTTTGCCA CATGGTTTATGatgatttttcttattttattctaGCTTGATgaacctttt cataaataacgttacgaacatcacttgcgtCGTTTTGACTtcctatttac aaaaaaataatttaaccatGTCTCatgagacataatcaccatggtaattg tttgaatacaaggcaagtgatgttcgtgacgtaatttatgaaaaggtcta ctagctgtatttttattgtttctctttaggttatctttccaacgagattt t Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00066566-protein >TCONS_00066566-protein ID=TCONS_00066566-protein|Name=TCONS_00066566-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=642bp
MTTFTPRLDRIIEDEESSKHPDDPIDFDDNILEEYDLLTEQDLFIALEIN PKKFKDGEYLNGVTYKKDGDDQSEDDDSNFTESDDEFDGCHINGPSTLSN GHNGAVDHFSKLHSGTQAKNFEIMQRYQSPIDCVRNTSSSADSANNDEVS SMISDSSSLSKISRRRKISGHSNPFSPITRGQDLLKKYLSNYEGYEFDSK NGRKIFVKAILKKYMTMYYVISPPKITAADIDNSGVSTLMAIRNALKIKE DKLVTEQNGGDNNDSLITSCLMFDYQNNDELNFDEFACIAKLNALNVEAV VAHSDSNIKEFRRDIKLSCQTDSRICVCYYTSNDLFQCSGSYFTLVGGYS KEKDLVLLFDASSHKIPPFWIPLPILFKSIQSKPIDETNIKEFKLGYFLL EKSEKKASILLNINKKISVLLNAPDEHYEKLCNMKDDWEMWLISPLSTSR KDDILRLAVDNIMEIIKKQTLRTVRVKEEQAKLTYKQGSLVDSLTKTKIF PVIEKFVSNMNNDSLSKLTIFSEWVLETVFIMRKSDKNKNKFAAPTKKKK KKLVRTNVNMNTFNNTTMLATWLLFWPYAHKKFDSNSTSLSECIENDLKI FPSKLVETFHHQMDFVIKVVQSSTMNVVKRKARKNGTLPHGL Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_456:567652..583075- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00066566 ID=TCONS_00066566|Name=TCONS_00066566|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15424bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_456:567652..583075- (Clytia hemisphaerica) CTCTGTATTGCTTGTCCTTTTCAATTGCACACATCATCAATCAAAAGTAT
GGGTTATTTTTTGAAGATTTTTGTGCACTTAGGATTTAGAAATACTGAGA
AATATGCTAGTTTTTAATTTTTTGTAACTGACCTTTTGAGGACGTTACAG
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CAAGTTTGATTTAGCGATAGTCTACTGTACGTAGATATTCAAATTGTCTT
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ATAATACTCGGAGACAGTCTTTATTTTGATTTTTTAATGATTTCTCTTAC
GAGAGATAAGAGGGGAGATGGGCGGTCAATTTGTCAAACTTTCTTTAATA
AGCTTTAGAGACAAAAGACAGTTGTTATTTTTATAGTCTTACTGGTATTA
AGTGTTAAGATCGTGCATTACTTGATGTTGACTGCGGTTGATGTTTCTTT
CCTAAAACCAAATTTATGGATTATCGAGTGGTACTAATCTAGCTTTGACA
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CCGAATCTCTTGGTTAAAATTCACCGAATTTCTTACAAGCGATTGTCCTG
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TCCATAACTCGAACACGCACGGGGAGCTAAAATTTTTTTCAAACATTGAG
GTTTTAATTGGATTAGCAAAGTGTCTCTCTTATAGAATTTCTAGTTGTTG
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TGAAAAACCGTGATTTTATGTCAATAAGATCAGTTATTCTTTCATTTTTG
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GTTTCTTGTTGACGGGGACTTTAAATCTCATCGAATATTTGAACGTCGAA
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GAGCGCGAGGGGTAAATCACTTGAAAAAAGGTGTACAATACTTTTTGACT
TTTTGAATTTTCATTTGACTTTTTGACTTTATTTTGACTTTTATTTGACT
TTTTGACTTTTTTTTGACTTTTTTCAAACTTTCATTTTGACTTTTTCCGA
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GCAAAAACGCCAACCGCCCATAAATTTTGCTCCACCCATCCGCCCATTCA
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TTATAAGAATTTTTGACTTTTTCTTTGACTTTTTGACTTTATTTTTGACT
TTTTGACTTTTTCTTTGACTTTTGGACTTTTTTGACTTTTTTTTTGACTT
TTTGTAGAGGTGTACGATAATTTTTCGAGTGATTTACCCCTCGAGGCTGC
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TATCCTTTAATTTAGACGCTTGCTTTGTTCTCTACATTTGTAACTTCTTT
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TCTTTTTCATTTTCTCAAAATTTTAATTTAAAGGGCGTGGTCACGAACTT
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TGTGGCTGGAAATGTTGTAACCCCCTGGAATTCCCGGCAATTTCAGGTTT
AAACCCCTCCAGAATTCTGAATGTTAGTAAGATTTAAAAAGCTACCCCCA
TGGAATTCCAGTTGCTTTTGACAAATTTTTGTATCTCCCTATGGAATTCC
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TTTTCCTCTTCGTTTTTCTACTTCATTTTCAAACATGAATCAGGGTGGCC
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GAAAGCTGGAAAAACTGGAAAAGTTTTTTTGATAGTTTAAGTTTTGATAG
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GTATAATCGATTTGAAAGAAATAGTAGGGGGGGATTTGTTCGTTTTTTTG
AGGTCACTCGATTTTTTTTAGTCAAAGCACTTGTTATACATTTTTGGAAA
GCTAAGGGGTAGGGGAATCAAAATAACTTGGGTGCCAATTTTTTTTCGGA
CACTTTGGTGTGATTTTTGGACAAATACGACGGTCTCAAGCAAAAATCAT
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TATATTGCCAGTATAGGTGATTTCTTTACCTAACTCGAGATATTAATCCT
TAAAAATAGTGTTTTTCAGTGTTTTTCAGCCAGAAACAGCTGTTTTGTCC
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NNNNNNNNNNNNNNNNTCAGCCAGAAACAGCTGTTTTGTCCAGTTTTTGC
GCTTTCGGAAGCTCAATATCTCGAGTTAGGTACTGAAATCACCTATACTC
GCAATATATCATTAATCTTATTTTTTTGAGATCTTTCCAAAAATATACAA
CAGGTCTCCGTTTTCTCTTGAAAGCTAAAATTTTCATTAATTTTTCACCC
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GTCCGAAAAAAAATTGGCACCCAAGTTATTTTGATTCCCCTACCCCTTAG
CTTTCCAAAAATGTATAACAAGTGCTTTGACTAAAAAGTTCGAGCGATTT
TACAAATTTCCCCCTACTAAAATGTCTATTGAAAATCTAGAAGTACCAGT
GGATACCCCTTAAAATCTACAAAGTTGCACTTCGGGCTCTCTTAGCCACC
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CTTTCATAATCATAAAAAAACCTAATTTTGAGAATTTCACTTATCGCAAA
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AATGAAGTTTCTCGGATCTAGAGATTACACAATTGTATTTTAGGGTCATA
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TTTTCTTTTTCATGGTTAGACCCCAGAGAAATCTTTAGGCCCTCAAAGTT
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GAAAATGTACAGATTTTTAGGTGAAGGCTGGAAAAAGGTACATTTTTCAG
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TGGTATTATACGCGTAAGTTTCGAATATACAGAATTTTATCAATAATCTG
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AAGTAAGGTTTTGTAAGGTTTTGGCAATTGAAGGGGTCATAAAACTTGGT
TGAGCTACAACATACTGTTGACTCTCCACTCAAACTTGAGTTAAAAAACA
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GAGTTAAGGAGACATTCGAATTATAGAGGTTCGAGTTATAGAGACTTTAC
GGTAGAGTTTTGACAAGGTTTTGAGAAAGATTTATCAAAGGTACGCAAAT
TAACGTCGTTAAGACCATGCCCAACAGTAAAATCGAGCCCTAATTAAGAT
TAAATTCAATTAAAGAGAGGTATATAGAAAAAGTAGCTGCAAGGAATATC
ATTTATTACATAAGGTTGATCTTTGCATGGTATTATGAGGGGAAGTCGCT
AATCTTGGTTATGTCGGTGTTCAACTTAAATGCGAAACGCTTTTTTATAA
CAGCTAGTAAATCATGTCCTCAGCTGGTCTTATTTTATGTGTTTTTTGGA
TAAATTGTTCTCAAGCTGTTCTTACTGTGCTGTACTGTTCTTCATGTAAT
GCTTAAGCTTTAAGAGCATCCAGATATATAGTATATGCTTATTATCAAGT
TAGTTATTTTTCTATCGTGGTACATGCTTATATCGTCCCTCACATGACTA
AAGGTTCAATCTCAAAATAAGCTTAATAGCTTAGGAAACTGCTTGAAAGC
AGAAATCTAAAAATGTGAAATAAAAATCGCTTCGTTTTAAAACACAACAT
CACATCCTGTATGTATATGTAGCAAGATAAAACGAACAATAAATTTGATT
TGAAACCAGGTTGATGAATAAAAACACACAGGGCTTGAATATCCCACAGC
AAGGGGGTGCAAACAAGGCTAAATTCGTATCTTTCATTCTAGACAATAAA
TCACCAACACTGAAATCACCAAATGAATCATGACGACATTCACACCGAGG
CTTGATCGAATCATTGAAGATGAAGAATCATCAAAACATCCAGATGATCC
AATCGATTTTGATGATAATATTTTGGAGGAATATGATTTGCTGACTGAGC
AAGATTTATTCATTGCTCTTGAAATCAATCCGAAGAAATTCAAAGATGGT
GAATACTTAAATGGTGTTACTTATAAGAAAGATGGTGACGATCAAAGTGA
AGATGACGATTCGAATTTTACGGAATCCGATGATGAATTTGATGGTTGCC
ATATCAACGGGCCAAGCACCCTTAGTAACGGACATAATGGCGCTGTAGAC
CACTTTTCGAAATTACATAGTGGGACTCAGGCTAAGAATTTTGAGATTAT
GCAACGCTATCAATCACCAATAGACTGTGTTCGTAATACTTCGAGTAGTG
CTGACTCGGCAAATAATGATGAAGTATCAAGTATGATCAGTGATTCATCC
AGTTTATCCAAAATTTCGCGACGACGTAAAATATCTGGTCATTCGAATCC
ATTTTCACCGATAACACGAGGTCAAGATTTGTTGAAAAAATATTTGAGCA
ACTACGAAGGTTATGAGTTTGATTCGAAAAACGGCCGTAAAATATTCGTG
AAAGCCATCTTGAAAAAATACATGACAATGTATTACGTCATTTCCCCACC
CAAGATCACTGCAGCAGATATTGATAATAGTGGTGTTTCAACTTTAATGG
CGATACGCAACGCCTTGAAAATTAAGGAGGATAAATTAGTAACGGAACAA
AATGGCGGTGATAATAACGACAGTTTAATTACGTCATGTCTAATGTTTGA
CTACCAGAATAACGACGAGTTGAATTTTGATGAATTTGCTTGTATCGCGA
AATTAAATGCTTTGAATGTTGAAGCTGTTGTTGCACACTCGGATTCAAAC
ATCAAAGAGTTCAGGTGAGNTGAATGTTGAAGCTGTTGTTGCACACTCGG
ATTCAAACATCAAAGAATTCAGGTGAGAAATTTTATCATTGTGGGAAGGT
TACCTATCGTTACCTGCTATTTGAGTTTTAAGCATAAACATGTTCTTAGT
TTTAGCTTTTTGAAAGTATTTTAGTTTCTAAAGGTTTTATGATTTTTTTT
GGCCTGGTTCCATGTTTTTCTTATACCTTATTGAAAGAGAATTTAATTTT
TGAAATTTCAAGAATCTTTATCCCCAGCAAGAATTTTGACCAGTTTTTCT
ATTAGATAAGGGCCTCATCAGGAACTGTGATAAATCCCTTTATCTGTCTT
TAGTTATAAAGGATCTAGCCTAACTAGTGAAATCGTCGATTTTACTTAAA
GATTCTAAATAACTCGCAACTCTCTTTTCTAGGAGAGACATCAAGCTCTC
GTGTCAAACGGACAGTCGAATATGCGTTTGTTATTACACTTCCAACGACC
TCTTCCAGTGCTCCGGTTCCTATTTTACATTAGTCGGTGGATATTCCAAA
GAGAAAGATCTGGTCCTGCTTTTCGATGCTTCCAGTCATAAAATTCCGCC
ATTTTGGATACCGTTACCAATACTGTTCAAATCCATTCAAAGCAAACCGA
TCGATGAGACTAATATCAAAGGTATGGCATGTTCTTAAAAATCAATCCTT
AGCTCTTTGCACCCTTGTATCTGTGGCCCCGTTCTGAGCGTTTTTTTGCA
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CGTTTGACTTTAATAGCTATGGAATTAAATACATAGTTACTGTAAATATT
GTTTGAGGATGCTTATTCGGCATCTAAAGTTTTCTCCATTTAAAGCTCCT
TGATTTAATAGAGAATGAGTGAAAGTAGGATGATTGATTATTACTGAAAT
AACAGTGCCGTAGCTGCGGGCAAGGGGGGGGCTGTGCCCCACAATAATTT
TTTCAAAAATGGTTATTTTGCAAAATACAAAGTTTTTCTTGTTTTTTCTT
GAAAGCATTTTGTTTTGAGTGCATTTTCAAGCAATCTAGAGCTTAAATTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
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Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
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Vocabulary: Biological Process
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category |
Term Accession |
Term Name |
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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