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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_462:33670..62313+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041814 ID=XLOC_041814|Name=XLOC_041814|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=28644bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_462:33670..62313+ (Clytia hemisphaerica)
AAATTATTTCAtaattatgtaaaaaataaaccaatcaaatcactcATTTG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAggggtaacgaaaaagtaacgaagtaacg
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ggtggtcaatgcagtgatggaaccaatggtgctggtcaatacaatgctgg
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gcaatgatggaatcaatggaactggtcaatgcaatgatggaatcaatggt
gttggtcaatacaatgatggaatcaatggtgctggtcaatgcaatgatgg
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gctggtcaatacaatgatggaatcaatggttatATGGggaattcaatggt
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gtgttggtcattgcaatgatggaatcaatggtgctggtctatgcaatgat
ggaatcaatggtgctggtcattgcaatgatggaatcaatggtgctggtca
ttgAAATGATGAAATCAGTGGaactggtcaatacaatgatggaatcaatg
gtgctggtcaatgcaatgatggaattaatggtgttggtcaatgcaatgat
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aatgatggaattaatggtgttggtcaatgcaatgatggaatcaatggtgc
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tgaacggtgctggtcaatacaatgatggaattaaTGATGCTGATCAATGC
AATGATTAaatcaatggttctggtgaattcaatggtggaatcgatggtgg
TGTACTGGTGGATGCAATGCTGCACTCACCAATGGCACTGTTTGCAGGGG
aatgcaagttagggattgtgcattttttgtaagcatcatctttataagaa
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cattcaaagcaacgtggggtttgtgcaaaacgtgagcatattcatttttc
ttataagcatcatttttataagaatgcaatcaataacttttgattcaaag
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aaaatgtgagcatatttatttttcttataagcatcatcttcataagatta
caatccataacttttaattcaaggggtattggctttcggcgattggttca
ttcaaagcaagttagggattgtgcaaaatctgagcatatttattttttct
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gtgatgcttataagaaaaataaatatgctcacatttcaaagttatggatt
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tgcacaaaccccaagttgctttaaatgaaccaatcaccgaaagtcaatac
cccttgaatcaaaagttattgaatgttttcttataaagatgatgcttata
agaaaaataaatatgctcacgttttgcacaaaccccaagttgctttgaat
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ttgcattgaccagcaccattaattccatcattgtattgaccagcaccatt
gattccatcattgtattgaccagcaccattgattccatcattgcattgac
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gattccatcattgcattgaccagtaccattgattccaacattgcattgac
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cattgcattgaccagcaccattgtttCCAtaattgcattgaccaacacca
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ttgattccatcattgcattgaccagcaccattggtTCCATCTCTGCATTG
ACCAGttccattgattccatcattgcattgaccagtaccattgattccat
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accaacaccattgatccaccaaagccgtcaaatctttcactttattcaca
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cccctcgttacttgcgttacttcatcgttaccgaccgttacttcatcgtt
acctgtcgttacctaccgttacttgtcgttacctaccgttaccactttta
gtaacaacgtttATTAAAGGCTGAACGAATTTTATACCCAAAAGCTGTAt
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GGAAGTAAAAAGTTAGATATTGTTTCAGATTACCCATTAGTCCTTATGAA
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ACATTCTTATCGGCGCACTTGGAGCATTATCTTTGACAGGTAAAGATCAT
ACATTTTGATGGTTATTTATATCATAATCTTTTCATCGAACAATATTTCA
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TGGTAATAAATACCTTGCTAATCTGAATGATTTCtccaaaaaatcattga
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ttcttttagtagtgaattttgactaaaaactaAATGAAATACTGAAACAC
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TTGATATTTCATTTTAATCTTTATTAGAAGCATTTTTAAATCTCTATTCT
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TTTTAAAGCCAAAGTTAGTGTTAATCTTTCCCAACTCCTCACTACTTAAA
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TTCTATGATGCACAATATGTTGAAAAACATCTTATATTTCATTCCTATTT
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TCTGAACCAGCTTTTGATGAGAAGATCATTCAAGTGCCATCTGCAGATTA
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ATAGAATTGCTTTCAAAACCGATTTCTTAATTTCTAGATTAATATATCAT
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TTGGCATTGCACTCACTGCGATTGATATTGATCATGATGGGTACCCACTT
TAATATATCTTAAATTAttctatttcataaaaaaacttgtCTTCCAAACT
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TAAGTGATTCCgtctcatatcagacacatatttcatatcaggacagtgtc
ttgctattgttatattatgctgatataagcaaaaaaatgtttttcttttc
ctctttctgaccaatctttctccacatccgtgtcaatccaatgtgaaaaa
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aacaaaacctttaaaattaaGTAGAAATTAACAGTAttgtattttgaaat
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TCTATGCAGACAAAAAAAAGCCAAACATGGGGCGTGTTTATGTTTTTGGT
TTGAAAGATAATGTAAGTGACCAATTTATGAGCCTCAGGGCTGAAAAGTT
TTGCTTATcaaatttaattaaatttaTATAATCAAAATAATCTTTTCATT
CACAGGaatacaattttttgaatttttctaataGCTTTGTCTAAATAAGC
Ttttaaagttatatttcagatttaaagaaaatatcaagtttcttcaaaat
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AGgttcatttttataagaacacagtTATACAAATGATTTGACACTTTTGT
AGAGccgtttgtttatttttgttgtgTTAAGAAGCTGTTATTTCGAATGG
GGTCTTCAATAGGTAGGCGTTTACAAATATTATGAAATGATAAAATCAGA
TTAAGCCTATTAAATTTTCTTATATTTAGAAATTTGccttgaaaaaatca
ttttatggTGGAAAGGAAGCTTATTCTTCTTTTGGTTACTCTGTTGCAAA
CGTTGGTGATTTGAATCTTGATGGATACGATGGTAAGGGAAAATCTCTTT
GAATTCCACACCCAAAATACACACATTAAGGAAGTTTAGTCAACGCCACA
AAATGATTTGCTTCCAGTTTGTCATTAGGGCTGAATAATGCATTGATCTC
CTTTGTTTGATGTCATTTAACTATACCAAACTTGAATAGCTTTTAGAGTA
AGAATTATAGATGAACCTTACATATTTTTAAGACACTCTCCAGGATTTTT
CACATGAAATTACTGACCCCCCTCGATTCTCCAGTTCTTGTAGTAAACCT
CCTTGATGGAAAAATATGACCTTACCAACATGGGGTGTGattgtttttcc
aaaattgcCAGTTTCATGTTACACAGAtgaattcagtttttttttctgac
atGCATTTGTTTATTCCCTTGTTAGATTTGGTAGTTGGTGCTCCACACAG
AGAAGATAATAAAGGTGTAGTCTTCATCTACGAAGGAACAAATATTGGGC
TAGCTGAAGAGCCACAGGTATACATTTTACTTCCTCGTGACTCTGATTTT
AAATGTATGACAATCCATTGTATCCTTGGGGATGTTAGGgttttataata
ttattttactTCCTAATTATATTGTTTGGGAAGTATTTTATCAAAGTATT
GATCAATAACAGCCCTCTAATAACCCTACTGGAATCTAAACTTTTATTTC
ACtacaaaaaggaaagaaaaattcttaCTTTCAAATATTCTTTGAAGGTG
CATATTctcatttaaaattttatccTGTTTAGTAGTTTCCAATCCTGTTT
AACTTACATTTATTTATTAGCTTTTTTCCTTTTACATTGGCCCCTTGGGG
AGACAATGGATGGGCTGTCTAAACTCGTTATTTTATGGCCAGCCATTTTA
AATCTAAGATATTAATTAGAATTATTATTAAAGTGTTGAATGATTTtaaa
tcatcattttctttGGTGTCAGTCAAAACCCTTTTTCTAACAAACCTCTC
TATTATGTTCAGATCATCAAAGCAGAGGAGGTGGTGAGCACACTTGCAAG
TGCAGGGACTCTCACTCTTGGTGGTTTTGGACGATCAGTTGCTGGTGGTT
TAGATCTTGATAACAACGGATATAAAGGTActcttttatttcatatttga
tTAAAATTAATTTGTATTTACAGTCAActgtctctaattcgaacctctat
agaTCGAAGCTTTACGTATTTCGACAGAACTTGAACTTGAATACTCtctt
ttattcgaatctttctctaattcgagaAAAAGTCCTCATCTCTCGAAAAT
AGAATTAGGCAATAGTAAGCTCCAGGGTATCAGTCCCACCTTACTGGTTC
TACCCTCAACTTGAACCTTGTTTAAATAAATCGTTACTAAATGTTTTACA
GTAATGtaccttttcaaaaattcaggtCATAGTTACTCTTaccgtttttt
tctttttgcttcttAGATGTTTTGGTTGGTGCTTACTCAACCGACCACGC
AGTGCTTCTAAGGTAATTGGGTCTTTTTTGATACATGTATAATCTTTCAT
AATTATGCACAAATATAAGAAGCTACTAACAAACAGTTTGCGTTTTTCAA
TACACAGTAGAGAGTCTCTTTAActggaacctctataactcgaatgtctt
cttagctctaacaagttttatggtccttTCAGTTGAATATGCCTCATAAA
CCTTACTCAAAAACTGGGTCAAGATgaacattttacaagaatttttgtca
ttggattggtcgttaactatttAGACAAAaccttttattatatttttcta
aagaacgcgtcatctctattgttttgaataaccaattatgtgagcaCCTT
ATAAAGACTTCAACACAACtgcaaaaaatagaaatttccattactcaaac
aaatttgtgttttttttttaatttgataataAAGATACAAATATTCTAAA
GGGAACTATGTATGAAACACGTCTTAAATTCGCTGAACATAATACAAAAT
TATGTTCTTGTATAAAACAATCTTAATAGCTATTTCAAATTACTGATGAC
ATTGTTTTTCGTTTAGATCGCGACCAATTATTTCACCACACGCAACCTTA
CAATTCGATCCACCACAGATTGATCCAcgagaggaaaataaaaactgTGA
TAAGGGTGGACCTACAAAAACTGTCTGGTAAGATATGGCTGGAAAATGtg
attattcatgatatgcactattgcaatgtcttccacgcacccaacagctg
attggttgtaagtgacgtactGACTGTTtctacgtcacttacaaccaatc
agctattgggtacgtggtgtaatgtcagaagacattgcaatggtgtatat
catgaatatgaAACATTTTACCTAGATTGCGAACTGCAGTGTAGAGTATT
TGGCTAAGGTGTGTAAACTTGTGGGTTCAATACCTGGcagggtcatacca
aagattcctaaatggtatttgatgcctctctgcctattgctcagcaatta
aagagaagATTCAAGGGTAAATTGAGAGggaaagagtggcaccctctTCT
ACCTTCAGAAGGCTCCTCTCCGCCTACGATTGCAAGACTTACTTATAGCT
TTAAACTGGATAGTCAACAAACCCATCGAGAACCTTGAAACCGTCTTTTC
ATTGTTATCACGGCATAGTCGGCTAATATACCCGCAAAGGGAACAGAACA
GAGTAATAACTGGCTTTCGAAATATCATCCTCAAACCTTCTTCTTAGTTT
CAATGTCAAATTATGTCACAACATCACTGGTCAAGAATTCTCCAAAACTA
CTATCAAATCAGTCAGTAAGTGGCTTATTTAACAGCACCCTCGACGTAAA
TAGGAATTATTTTATCTCCAGAAATTTTTCTAGTAGGGTCAACTCTTACT
TGTTTACCTTTCATACACGGTGTTTCGCTCATCTCCGTTGCAATCTTTAT
GAAGTTCTCTATTTAGTAGTAAAACCATGAGTCGACGGTATTTTGGTTTG
CGTCGATAGATGTTAGATGCTTCAAACCACTTTGTCTTTTAGTTTTCTGC
AACCAACTAAAATTGTAGTTATATGTGTTTGTTAAGACAAATCTGTTAGA
GAAAGTCATTTCATTCTCTATTCTTTTTTCAGACATGAAATTTACTTTGA
CCGCTGATGCTGGCCGCCCTAACGATCCTCGCGTATTCATTACTGATAAA
TCAAATGTTCTCGAGTTTGTTGCACCGAGCTATTCAAACGAAATCAAATG
TTACGAAATCAAAGACTTGTACTTGGAATTCGGACCTGACGGAACCATAG
CTGAATATCCTGATGTTAAATTCACAGTCGCTTACTCGATACCGTACGAC
GAGGCAGCTGGCTCACCCAAGCCTGTACGCACCGATGTTTCAGTAGCTAG
CCTTGATGCCTATCCTATCCTACACAAGAAATTCAAAGATGGACACGCTA
TTGACGCCGGGCTAGAAGGAACTCAGGTATGTTTTTGCCCATTGACATCG
AATTACTATCTTTCAGAATATTATCCCCATGTTTTTGAGCTTTCACTTCA
TCGAACTTTCTTTTGTTCTCTATTTGGAACTGTATTCGCTCTAAGCCTTT
TTCGATACTCTTTCGGTAAAGATCTTATTGGCATCGTTGTCTTATTATTT
ATCAACCATAGTTTTACAAAACTTCTCCATTTTCTTGCAGTTGACCTTCA
AGAGAGAATGTACCCAATGTATTCCAGATTTGAAAGTGACATCTGCGCAA
TCTGTATAGTAAGTCGCTTTTGTTCCTTCGATATTATCATAATTTATTTA
ATATATCGGTATCAGGAAATACATCATCCAAAACTTGCTTACTTAAACTC
ACAGATACAAATATTTGATGCCATTTAACCCAAGTAAACTACAGCTCGAT
CTCCTTAAAGGTTGAGGTTCTTTTAGGTGTATCAACGCATGCATAAATGT
ATGCAGATTTCCTATCAAACTTCTACTTTCACTAGTTTAGTACCACTTTG
TATAGTGCTTCAATTCAAAGTTTTTATTAAAATGCAAATCTTCATCTTAA
AGCAAAACAATAGAGGAGTTttttaaattataatttttcgATATTTAGTT
CACTACGTTATCGAGGAACAGAATTTGAATTCAACATCACTATAGAGAAT
AACGGCAAGGATCCTGCTTACGCCGTCGACTTAGCTTTCGACGCACCAGA
ATCAATGAAAGTTGCTCTGGTTCGTGAAGTCGGTAGCACTAAGGTATGTT
CTTTATTGTGTTTggttttaaatgaaaataatattcgTGACAGATTGTCG
GTATCTGCGAGTGATTCAAGAGATGTTGGCGAGCTTTGGTCTGGTTTTCG
ATTACtttaatgagataaaatttcACAGGGAacaaatttcgcggatttcg
cggatttgggtgtcatccgcgaattTAAGTCCCAATGAAAGTTTGGAAAG
GACTTATCcgtgaaacctttttaaacaaaatgtcAAATATCTACTTCTTA
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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_462 | supercontig | scaffold_462:33670..62313 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| ITGA11 | integrin alpha-11 precursor | Homo Sapiens |
|
