TCONS_00001473 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00001473
Unique Name	TCONS_00001473
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1398

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000010:414932..427870-

transcript sequence

>TCONS_00001473 ID=TCONS_00001473|Name=TCONS_00001473|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1398bp
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TTATTGGATGGTTGTTTTATCTGATTGTGCATCGAATTTGAAGTAGAAAG
ATGCCTGCTCCAAAAGAACAACGAAGTTTTGAAGAACCAGATAGTCCTGG
TGGAAGACGACCAAGTCAAACATTTTATGGTTCAGAGAAACAAGTCCTCC
GTGATGGAAGAAaaataAAAGAGATCGAAGTGACAGGTGAACGACCTGAT
GAATCAAATACTGATATGAAGAAACAGAAGAAATTACAACGAAGAAAATC
CATTGATAAAGAAGAACTGAACGTCTCTTGTCGTGCTCTCGGTAAAGCTG
ACCATGAGGGCTGGATGTTCAAGAAAGCCGGTGGACATGGTATTGTTCCA
GTAAGCTGGAAGAAATTTTGGGTGGTTATCAAATTAGGGAAAATATATTG
CTACAAAACGTCATTCAACATGCAAGCAGATTATTTGTTTATGGTCACTG
ACTACAGTGTGGATAATGCTacagagaaaaagaaaaatttCGCTTTCGTA
TTGAAACCAAACGAAGAAGACAAGAAAGGAGTGATTTTCGCTTGTGAGAC
AGAACAAGAATGTAATGATTGGATGGGAACTATCAACAAAATATTGTCCG
GTGTCCATCTCAACAATGAAGAAGATCATTCGGAAGTGCGAGATTATGAA
GACCACAAGCGATTGAACGCCATCAAACCAACATTTAAAGAAGAACACCA
AAATAATGGTGTTCGAAAACATCGACCTATTTCTATCGCTTTCCAATCTC
AAGAAGATGAAGAAACGACAGGATTACCTGCAGGATTCGGTACTCGCACA
TCCTCAATGTCACAACCGCGCGTACGAAAAATGAGCGCTGGAACGGGTGC
ACCAAGCTCTGTTCTATCTGTGGGTTCAATGTTTCACAAATTAGAAGAAA
AACCGAAGGAAGACcaagatgaagaagatgatgAAGATGTCGAAttaaaa
gatttattatacaaagAAGTCGAAGTCGAAACTGAAGCGCCCGCAAAAAC
ACCTTCACCCAAACCCGCTCCCATTCGTGTGGTGGAGCCTGTCGCTAAGC
AAGTCATTCAAACAAAAGAACGCGAAAACGAGAAAACCGCCTCCATTGAT
GCTGAAACTATCAttaaagaaatggaagaaaaaacgaaagaaaatgAGGA
GCCGACCCCAGAGCCGGCACTAGCTGGTGCTCCCGTCTCTGTAGAGCCAG
AACCAGTTAAAAAACCAGAGCCAGTTGTTCTTCCCGTCTCTGTAGAGCCA
GAACCAGTTGAAAAACCAGAGCCAGTTGAAGAGTCAAAAGCGCCAGTTGC
GGAGCCAGAAGCATCAAGTGACGAGACAGAAGAAGCAATTGAAGTCGC

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000010:414932..427870-

Legend: exon

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>TCONS_00001473 ID=TCONS_00001473|Name=TCONS_00001473|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12939bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010:414932..427870- (Clytia hemisphaerica)
AAAAGAGGTTGGATTTGAAACCGCCTTGATTTTTTGATAAGGACCTGGCT
TTATTGGATGGTTGTTTTATCTGATTGTGCATCGAATTTGAAGTAGAAAG
ATGCCTGCTCCAAAAGGTCAGTACCTACTTCTTTTGCTTCTTTTCGTCAT
GGGCTCATGGATTTTCATTCCATATAGTGGTTCTGGTTACTTTCGTTGGA
AATAATTACTTGCCAACACCTCAGTGACCAGTGATGTTTTGAAATCCACC
AGTGTGGTTATAAAAAATTGAAACTTCACCGGGTTTGAATTTTAGATCTC
AAAAATTTACTGTTCGCTGTGGTAGGGAGAAAATTCATTTTCAAGAATGG
ACGAATCTGGTTTTCCTAGAATTCATTAAAATGTTTTTTTTCGATTTTGA
TGATCTTATGACCATAAATTTCCTAGTTTTGATCGGAGTAGAGAATTTCA
ATAAAATTTGACCGAGTTTACTCATACTCCTACCGGGGCTCAAAATTTGA
TCATTTTTAGTGATTACTTTCACTGGGACGGATCTGACCGGGTCATCGAT
ACAGGGGTATTTTGTAGACCGAAAAAATCTTGGAATAAATATGTAAAAAA
ACATGAAGTCATTGTATTATAGAGAGATTTTGTATGAGTTTTGTAAAAGA
TTTGTGGTCAATAAAAATCTGCGCGATGAAATGGACAACAAAATTAGACT
GCGGATTGTCAGTGTAAATTTTTAATTAAATCTATGTAACCTAATGTGGT
CACACATTTCCTGGTTACTACCATACAAATTATCTTTTCTTGTTTGATTC
GCAGACTTCCATACTTCTTATATATAGAAACTCCCACCAGAATTTAGTTT
CAATTTTAGCTATTCAAGGAGGGTCGGCATTTTGAATCCCGGTGATTCTG
CTTATTAGAGATTCCACTGTAATAAAAAAAGATCACGATGGAAGTTTTTT
TCGTGATCAGAATAAAAAGGTATCGTGATAGTCACGCATGACAAGACCAA
GCTGGCACGCAACTTTGTACGTAACGGACGTTATGTACGTTTAATGGATG
TTTTGATGACGTTTTGTGTCAGCTGGGAAGCGTTGCATTCTCTTGTGAAT
GAAGCTTAGCACTTCAACATTAGCTAAATTTTGATAGAAATCTAATCTAA
ATTATACTAAGTCTTACACTCAACCCTTATATGGAAATTTGTTTTGCTTG
TGGGTTAGATGAGTATAACGTATGGAATTTTGTTGCTTCACAAAACAATC
GTTTTTTCTGAAAACATATTTTGTTTTAATTTTGATATATTTAAGCTAAA
TCTTGTTTATGTTAGCTATCTGAGAAATTCAGGCTCACTACTCTTTGCCA
AATAGATTTTGGATACCCCATTCTCACAGACCCGGTAGGATTTTTTCAGC
CATTGGGGATAAAAATAACGGACTGAAACTCGATGGGGATTGATTTTCTC
ATATTTTTTATAGCTGGGGGTCTCAATTCTTTGTTTTCAAATCAGAAAAT
TCGGTGGGGATGGGAAAAACAGAAAATATTTTACAGTGAGGATTGGTTTA
TTTTAATTTCAATGGGGACAAAAATTGAAGGAAATTTTTTCACTGGGGAC
GATATTTTGGCCAATTTTTTAGTGGGAAGGGGTCCCAGTGGGTCTTTGAG
AAGGGGGTGTTTTTGGTTTATAATTTCAAAATACTGTAACGTCAAATGAT
GTCTTTCCTTCCCTTTCACTCGCAATTCTATCGAAGTGATAATTTTACCT
AAAGGTTGCTGTGTAATCCACAAAGCTTTGACATAATAAAGTTTTCTTAA
ATCTTGATTCTTTCGATTAATGTCTTAAGATTTTTCTCATAAAATTAATC
CAAATGATTAAAAATCGACGTCAAATTTTCATTCATTGATTCAATAAAAT
TTTCAATTTAAATTTTCAAAACGCTATGTTGTTTTTTGAAATTTCTAAGA
TATTCAAACATTGACAAACCATAGTAAATTGTAAATCAAATGCGATTGAA
AATTTAAAAATTGAAACCAACCGTACTAATGCAAAGCAAAGAATTTTTAA
ATTCACAACTAATACCAAGCGCTCACGAAAAGCTCTCACGATGGTATCAC
CAGTTAAATCAAAAAGTGGTGCTAGTGGCTCTGGTTGTGAGATGAAACCA
AAACCATACCCATGTCATGAAATGAATCAAATAATATATATTTTTTGTGG
TGATTACCTTTCATGAAAGGCAAAGGCTTCCTAATTTTTAGTGAATGGCT
TATTTTCACATTTTATTTTCACTGATGACACCAAACTCTCTTAAAATTTC
GTCCCAATTTAATTCTATCCACTTCTTAATTTTTAGAACAACGAAGTTTT
GAAGAACCAGATAGTCCTGGTGGAAGACGACCAAGTCAAACATTTTATGG
TTCAGAGAAACAAGTCCTCCGTGATGGAAGAAGTAAGTTCTTCGACTGCA
ATGCCTTATTTCATCTAATTTCACAAAACCATTGTCCTGTGGTTTTTAAT
ATATATATTTTTTCGTTTTATGGCAAAAGCTTAGAATTTTGGCTGGTGGC
TTGACCATTATTTGGTGGTGTCAAAAGCTTTTAGGGAGTATCTTTTGCCA
GATTTTGTTCAGTTATACCCCGCACCAAAACCATGGTGTCGAGCAGTTGC
CATGCCACTGGTGGCTGATAAAACAATGTTTTATATTTCGTATCGATTTC
TTGAGAGGAAAAGGAAATAAGAATTTATGCATTTGCAATGATTTTTCTGT
CATGAAATTTGATACCTCTAATATAAATGTCGGATTAATAGGGTATATTT
GATTTGGATTATAGTAGAGCCGTCTGTAAAAATAATCATTTTTCATCCCA
TATCAAACAGTACATTTTCATCATGAAAGAAAGTCTGTTATGTTGTGAGN
TTCCAATATCAAACGGTACATTTTCATCATGAAAGAAAGTCTGTTGTGTT
GTGAGAAGAGGTTTTTTGTTAAGTTTGACCTAACATAGAATTTTATTTAG
GAGACCTTCTGTCTAGAGGCTGTTCGACCATCTTGGAATTGTATGCATTG
CTTTTTAACTGGATTTATTTCATATTAAAATGTGTACTTATATATAAATT
CTGATGGTTACTTCTCTTCCAAAAGTGTCTATCTATGGAAGTTTTTCGTC
TGTTGATCAGTAATGGCTTGCTAAAGTTTCCGTATTTCAAATGATGGTTT
ATTGCATTTCTATGAAATTCTTAGCCAGATTAGAGATTAGACTTAAAGAC
CAAGAATTAAATGTCCTCTGAAATTTGTTGTTTCTACTAAGCTTCCTCGT
ACTTTAAGGAAGTTTTATAGCGATTTGAAAGGATGCACTTTTATACCAGA
CTGAGCTTGATAGGTTGGTTCTTGGTCAGGTTTGCTCGTCTCAGATCTTA
TATAAAAAAATGTCTACAAGCTGACTAAATTTTGAATGATTGAATCTTTG
AAACATAAATTCTAAATTCGTGGTAATTCATTCGAGATTTCAGGCAATAT
TTCGGCAGCTTTTGTTTCTAAAGAGCATGAACTTTTAAGAAAATAGAGTG
CCGTTCTAACGCAAGGGCGAAGTACTATGATTTTATTGGAAAATTTCTGA
TTAAAATGGTTTCAAATTCAGAAGCCTGAATAAACAGTCCTTGTCGATCC
GCATCAACATTACATCATCCTAACCCAATGATGTCAAACTCTACAAAATA
TCTCAGTATGTAGTCCTCGTTGACTTCCTACTAATCTGACTAACTCACAA
TACAGGATCTTCTCTTGACTTTTTATGGTCAGTAGTTTATACGTTATTCA
GGTTGAGAGGCAGTGACGTCATATTTCAAACTGATAAGCTTAGAGGCAAC
ATGTAATAATAGAGAAATTTGAAAGAATTGATTAAAATCAATGAGGTATT
TTTAGTGTGTAATAGTATGTTATATTGATAAGGTATAGAGAATTTGAAAT
TAGTAACGTATTGTCAAAAAACCTACACGATAGAGCTTATATAATCAAAA
TTAAACCCTTATGAAAAACGCAGTCGACCTTTATTTTAATCATAACAGAA
GTCATTTTTTGGTTCGATATAGAGAATCACGGGAAAAAGAAACACGTTAA
AGTTAAAAGTTTTTTTGAGAGAGAATACGCTTTTGATTCGGTTTTTTTGA
GATTTGAGAATTTCGTCAGATCATGGATTGGATTTCAAGGTTTAGTTCCA
ATTCAAAGAGAAGATTGAGAAGAAGTGTTTCAACGTTCAGTATCTTTGGC
GGAGGAGGTAAGTTGTTCACCATAGGGGCCATGGCTCCACATTGAAAGTG
ATAGTGCAGCAATATACTGACTAAGGAGGCTCCGCCGTGGTAAGGGTCCT
AAAACGCATAAAACAGATTTGTTTTAAGGTTACTAAATAGAATTTGGCTT
GATTAGTAAATTTTCTGTTTGCTTTGAAAACGTGGTCGGGCAAATTCCCC
CCACCAGGCTGCGTTAAAGAAATTGATTTATAAAAAGAATAACAGGCTTC
AAGAGGTTTCAAGAGGAAAATTTCGATATCCTTTAGATGAAAAGAATTGT
GTTTAGGTTAATTGATTTAATTCTTATGTTCTTATGAATAGATACCAGAA
TTCTTTAAATTTCGATTTTGGGTTGCTTTTATAATTACTTACACGGAAAC
CAAAACTCTCCGTCATGAGTTTTGAACGCTATCAGTTCCTCCACTCTAAA
GTGTCTACATAATTGTTTTGGGTAGATAGAAAAGATAGCTACAGTAATGT
ATTTTCATGAGATGGGTAAACTTTTTAAAAAAGGTATTTAAACTATGTGT
CACTTATAATATTGCGGTAATACGGTAGAAATCTGAGATGTGAAATTCTA
TTGAAATGTGTTTTTAAACGGGTATTATTTCAATGAAATCAATAAAGTTA
TTGCCCAATTTTTTTGACAAGATTTGTGAGTATTGATTTTCGTTCTGCTG
TTTGTGGAGTACTAACTATGTCATCACTGAAAAAGTTAAAGGGATTTAGA
GAGATTTTTGGAGAGTATTTGCAAAATGACTTTCAAGTGGTCAGTTGTGA
AAAGTTTCTTCTAATTCACAACGAAAACGATTTTAAGGAGTTTTCACTCT
CACGTCCAAGAAAGTTTGAGTAAAATACTTGATTTTTATAATATAATTTT
TTTTTGGGTTAAAACCTTTTAAAATATTATCGTGAGAGATTTTAAACACT
ACAACTAAAGACACACCCCTTTTTGTGAATAAGCTTTAAAATCCAATGCT
AGACTAACATGTTCAAGGGGTAAGATTGACTGTGTTAGAGGTCACATTTT
GTCACGCTATCACTGACACTCTTACATTTCTTTTCCTGTAACTCTTTTCT
GGTCAGCCCAATGAAAGGTTCTTTATTTGTCTGATGAGGTGATATTAAAA
GGAGAGTCTACTTTAGACCATGTTCACACGTTACTGTTCCGTTTCGCTCT
GGTATGATTTTCGTTACGGATCGAGAGTGTTCATATTGGTTTCAGAACGT
TTTGTAGAACGAAAACGGAGCAGTTTCATTCAGATGAAAAAAGTGGAGTG
AAACCATTTCGATCTGTTTTGCTTTGTAACGTCTTTTTTTTGACGTTTCG
AATTTTGACGTTCACACTTGTTTCGGAACCGTTTTGTTTCGGAACGGAAT
GGAACCGTAACGTCTGAACATGACATTAATGTCCTTAATTTAGTTACTTA
ATTGTTTTTTATTCGAATAGTCTTTTACAAATCAACCTGTCCGACTCTTG
GTTCTCCCAACCTGGCCTGGTATATGGAGTAACAAACGGTTTGTTCGATT
AGATTGTTTATAATTGATTATTTAGATATCTATTAGCTAAAAAAGCTAAT
TTGCTTTTAGACTGGTAGCTAGTACCAGTCTCCAAAGGATTGTGANGTTA
GATCGCAAGCTATTGATAAAAAAGCTAATTTGCTTTTAGACTGGTAGCTA
GTACCAGTCTCCAAAGGATTGTGATATTGTATGTTGGTGTTTGATGCAGG
CTAAACGTTTTTTTTTTATAAGAATAACTTCTATAAGAATATCAGGGTGT
GATTTCAGAGTTAGAACAATAGGTCTATTGTTTAGAACAATAGAAATATA
AGAATAATGCACACCCTCAGCCAAAGTACACTATTCTTATAAAAGAAAAA
CGTGTATGTGTATTTGTTTTTTTCTTTCCCATTATTGGTCACTAATTAAA
CTGAAGCCATTTACAATTAAGTTATATCTAGCGTAATAGCATGCAACAAG
CTGCTATTTAGATACAATATGGCAATTTTTGTTGATATTGGTTTATTTTT
ACTTTGTAAGGTTATTCTATTTGTTTCGTTCTGATATAAACTTTCGGTTG
TATTGTGGTTTATCTGGAGGCATATTGGATAAACTACGGTATTATTAGCA
GAGTAATGCTTGCAGGTGGGCAGTTGGAGCGAAGCTAATTCACTCCTGGA
GAAAAAGCCACCGTTCCCCACTCTATGAAAAGCATGAATTAAGTTATCAC
GAAGACATAATCACAGAAGTTTTTGTTGACTAAGAATTCGCATTTGAATG
GCTTGGGTCTCTGATATCAATGATTATTATAGTTAACCCGGGGGGTTAAT
TTACTAATTTTCAAGATGTTTATCTGACAGGGTCAAATTTTGGTTGCGAT
GTTTATCTGGCAGTGTCCATTTTTTCAAACTCCAGCGGCACGTCCTCGTC
GGCCGGTAAGGTTAGTGCCCCCCACCCCAGGAGTTAACTAATTCGAATTC
GAAACGGGTAGCCCATTCTGTTCGGATAACAGAGAGATTCAAATAATAGA
AAGTGTTTTACTAAGAATTAGTTCGAATTATAGAAAGATTCGAATAATAG
ATGTTCGAATTAGCGAGTTTCAACTGTATGTAGACTATCCACAACAAACT
TATCAAAAAACTAATGATTTTTTCATTCACGTGTGATGACTTTCAGTTTT
TGGTTGATTGGTGCCAATTGAATGATATTAGATTGTTGGCAATCTCCCTC
TAAGCTTTTATCAAGCTTATTTGCACTATTTAAAGAGCTTATAGCTACAA
TATGGAAGATCTTTCAATCGAAAAGAATTCCTTATTTGGTCATGACTGCT
CTCCTCGATTGAGTTTTTGTTGACTTTTGTTTTAAACGGTGGTTAATATT
TGCATTCTGTTCTTTGAATTCGTCAAACTTTTTTACGTGCAAACATGAAG
ATAATTTTATCATTATTGAAGGCGATATTTTTGTTAGTGCTGGAATCGGA
AATGAAAATTGTATTGCTGGTTGCGTGTCTGAGTAGATGTTTTGGCAATT
GAACTTTTGGTACCTATCTGTACAGCGTATTCTCGATAACTTCTGATCCT
GCAACGATGTTCAAAGTCCTAATAACTAGAAATTGACTTTTCGTTGGGGA
ACACAATTTCCGGACAAAGTTATAATCATCATCTTAAAACTTACCTATGT
TATTCTCATTTGCATTAATAGAGATGTATAGAAAATCAATAGTTAAGTAA
GAAGCTACAACGGGCTACAGTATTCAGGGGTCTTTTATAGGCCAAATTTC
GCCGATCGAAGCCACTAAAAAATTACAATTCGCCTGTCTAAAAGTNGACT
TTCGCCGATCAAAGCCACTAAAAAATTACAATTCGCCACTCGAAAAGTTC
GATTCACCGTCTCAAGTACTTATTCACGCTAATCAATACATTGGGGTTGC
TAAGAATTTGGGGGCCCAGAATCTAGAATTCACCGAGGGAGATTTTTCAT
TTGCCAGCCTATCGAAAACAAAGCAAAACCCCCGATGAAAAGTGCTGTCA
AGTAGAGAAACTGGTAAAACACACGTTTTTTATAAGAACAAACTATATAA
GAACATAAGTCTTCGAAGGCCAAAATGTTAGTTAAGAACATTTTAAGGCT
TTGTGGACACTAAAACACCCAGTTTCTTAGGAAAATGAACAAAAATACTC
TGGTAAAAAATAAGAACACGTTAAGACCATTTTTAGGCTTAAAACTCAAA
AAGTTAAGATTATTCGAAGCCTTCAAAAAATTTAGATGTTCTTATGAAAT
AAACATGTAAGCGAAATCAAACTTACGAGCTTTACTCTAAGTGAAATAGG
GTTTTGAATTATTAGTAGAACGTCTATGGTTGTAAGAACGGGCAACAACG
GGCTATTAAAGGGAATTTAGGACGCTATGAAGAGCTGGGAAAATGGCCTT
TTTTAACAACTTTGTACCATTTTCTTTTCAGAAATAAAAGAGATCGAAGT
GACAGGTGAACGACCTGATGAATCAAATACTGATATGAAGAAACAGAAGA
AATTACAACGAAGAAAATCCATTGATAAAGAAGAACTGAACGTCTCTTGT
CGTGCTCTCGGTAAAGCTGACCATGAGGGCTGGATGTTCAAGAAAGGTAG
ATTGATAGCTTTTTGTTATTAGAATGGTGTTTTCCACTCATGGATATTCT
TTAACTTTTTGGGGAAAATCATTCTGAAATATTCTTACAGCATTCTTAGG
GCCAGAATCCAAACCCAGCCTAAATTTAACATGTAATGCTAAAATTTGAC
ATTTTTGGGAAACAATTGAGCATTGCTGGGAAATAATTGTTAGTTTAAGG
TGAAATGCTCAAAAATTGGCATTCTTAGGTTCAGTTCCCAAATTCCGAGA
TGCTAAAAGAAAAAGCGTGTACCTATCAACCCGTATTGAATTCTGACCTA
TTTAGTAAACTGCAAGGCAATTCTTACTACTTTGATGCCAAACTGAAAAA
ATACTGACAAAAAATACACTATCGTGACGAGTTAAAGAGGTTATCTACCG
ATCTCCTTTCTTTATATTTTCCATTTCACTCTCTACTTCTAGTTACCCGT
GGGATTTTGAATGTTTTAATGTTTTTCTCCTTACAGAGTTAAGGCTAATT
CATATAGGTGGTTTTAGACTATGTCGAACTTATCAGGGGAAGAGATTTGT
AATTGTAATTTCATTGTCTTTTAACGAGCGTTGCACTCCTTCGCATGCTT
CCGACGTACTTGCTCTGTCGTCTTTGCTGGCTCTTTGTTGGTTTTCATCA
ATATAATTTGCTGTTTTCTTTTTAGCCGGTGGACATGGTATTGTTCCAGT
AAGCTGGAAGAAATTTTGGGTGGTTATCAAATTAGGGAAAATATATTGCT
ACAAAACGTCATTCAACATGCAAGCAGATTATTTGTTTATGGTCACTGAC
TACAGTGTGGATAATGCTACAGAGAAAAAGAAAAATTTGTAAGTATATCT
TAAAACCATTATTTTGATATGGGCTTTAAAACGCTATATTTTCAAAGCCT
TAAACTTCAAACTTTTTAGTTTGAAAGCTATTTTCTCCCTCCTCGGTATA
TCTAATATATCACATGAAATTGTACTCGACATGGAAGCAAAACTTGTTTT
AGACCTTCTCTGACAGCTAAAGGGTAGCATACTAGGAAGTTCTTGAGTAC
AAAAGGCAGGGATCACATTAAGGCCCTCCAAACGAAGAATTTCGCCGTTC
CAAGGCACAAACAAAATTACAATTCACCGGTCTTAAAATTTGTTTCATCG
CCTCAAGTACATATTCACGCTAATCAATACACTAAGCTTGCTAAGAATTT
GCCGTCCTAGAATTCGCCGGAGCTAATTTTTCATTCGCCAGCCTATCAAA
AATAATGCAAAACGTGCCGTTTCATTTCAAAACGTACCATTTTATTTTCG
TAGCGCTTTCGTATTGAAACCAAACGAAGAAGACAAGAAAGGAGTGATTT
TCGCTTGTGAGACAGAACAAGAATGTAATGATTGGATGGGAACTATCAAC
AAAATATTGTCCGGTGTCCATCTCAACAATGAAGAAGGTTAGTACCATTG
AGTTTAAAGACCCGAAGAGGCTAGAGATGAATCTTTAACCTTGCTCAAGT
AAGTAAAAAAAGTGAAGCGTTAAGATTTGCGCCACATTAAGAATGATGGT
TTACATATAACACTTTCTTTGTTTTCAAGTGGCATATTTTTCGAATTCTG
GCGATATGTTTTACTTTCAATCTAGCGTTTGTAGGAAAACTACGCGGGTC
ACGCGCTAAGAATGGGAAATAAGTGACTTTATTTCCCATCCAGGAGTCTC
GTATTTAGTCCTTCCGTCTTGGAAGTCAATGGTTAGTACGCATGCATGTT
CAAACAAGAAGTTTATCTTTTTGTCATGAACCTAAACCTAAAGTCCATTT
GCTTAAACTTTTCTTCTTTCACTATTATGTGGAAACCACTCTTAAAAGAA
TTAGTCTAATTGAGCTGACATGGTTTCCACATGAAAGATAACATAGTTTA
CACTTAGTTACAGCGAATATAGACACAGCGTCAGCTTAAGTTTGAGTAGA
TTTTTGTCATCAACTTTTGCCTCTCATGCCAAAAATTAATTGGGCTTATT
AGCTTGATCATGATTCGCGTGCAGCCCTTCCTTAGTTTTATATATAGTTT
AATATCACTTCATTGATTTACCAAATACCAATCGACCCCAGAGTTTAAAT
AATAATTCATATCTTGCCCAAGTTTATATGCATCAAACCAATTCAAATCT
AACGATAATCAACTCTCTTCTTTTTCCATACGCCGCTCCTTATCACCTAC
CCTTCAACCAATCAATAACAATCATTACGTCATTATTACATCATTATTCA
TTAATAAAATCAACAACCAATCAGATCATTCGGAAGTGCGAGATTATGAA
GACCACAAGCGATTGAACGCCATCAAACCAACATTTAAAGAAGAACACCA
AAATAATGGTGTTCGAAAACATCGACCTATTTCTATCGCTTTCCAATCTC
AAGAAGGTAAGGTTTTGCTAAACTGGAGCCCAGTCCTTTAGTTCGATTTT
TTATGATTCTGCTTAATTTTATTGCTTTCCAATCTCATTAAAGTAAGGTT
TTACCAAACTCGAACCCAGTTCCCCAGTTCTCTTTCTCATGATTCTGGTA
GCGCTCACAAAAGGTTACGTTCATCAATCAAATCAAAAAGTGGTACAAGT
GTTCTTGGGTGAGAGATTTAGGTTTAGTATATCCAACAAATTGCCATATC
CATTTTTGAGTTACCACTCGTCACTTTTAATTTCAAAACTTCGAAAATAT
TCTTTAATTTGACTTTCGGATGACAAGACGCTTTTTCGAATTAGAGATTC
GAATTACGGAAAGCATTTTTGTAAGACCTTACAAGCCTCATCATTTATGT
TCGAATTACAAAAATCTGAGTTGTAAAGGCTTCGATGAGAGAGTGAACTG
ACTTGAAGTGATCCATTTTTGATACGATCTAGAAGAGAGGGAAATAATAT
GGGCTAAACACTCGAATTTTCTCCAGTCAACCATTTTTAAAGAACAAATA
ATCTTACACGAATATACTTTTTCTGTAATGACTATCTTGTATGTAGAAAC
ACTATTCGCATGACTATAGCATTACTTTAGCTAACATAACAAGCACAGTA
ACATGTACATCTTATAACACCAGTAAAACTGTCTTAGCCTTGAAATATAT
GGTTGAACAAATCTTGCACGAATGCTAGGTTTTATTGACACTTAATTTCT
ATTATGTTAGTTATGTAAACTTCCCGTACTTGAATCTGTATAATTTAGAC
CTCTCTTATTTCTAATCTTTTGAACTTTTGTTGTCTGATCTGTAGGTCCT
CGTTTCAAATAATTGATTGCAAATTTTTGAATAGTTTTACTGATTTGATT
TAGAATTTCACCAAAGAAATAAAAAACATCACCAAATGGATTACGTGTTT
AAAGATTTCAACACTTTTCCACCTCTTTTCTTAGATGAAGAAACGACAGG
ATTACCTGCAGGATTCGGTACTCGCACATCCTCAATGTCACAACCGCGCG
TACGAAAAATGAGCGCTGGAACGGGTGCACCAAGCTCTGTTCTATCTGGT
AAGACTACATGCTTTGATTTGAAGTTTTCTAAAGTCGTTAGGGGTGCTTG
AGGTTATGGATATGACACCCCCTTCTCACAGACCAACTGGGCTTCCTTCC
CATCGGAAAAATTGTCCAAAATATAGTCCCCGGTAGAAAATTGTCCTCCA
AGTTTTGTCCCTACTGAAAATAATCAAATAAAACAATTCTCATTGCAAAA
TATTATGTTATTTTCCCCATCCCCACTGAATTATCTGAGTTGAAAACAAA
AGAATTGAAATCCCCGGCCATAAATAATATGGGAATATCAATCACCATCC
AGTTTCAGTCCGTTATTTTTATCCCACTGCTTGAAAACATTTCACCGGGT
CTGTGAGAAGGGAAAATCTCTTCTTTTTTATCTATATTAGTTAGCTCAAA
CATATTACAAACATTAAAGGTTCTTTTAGAAATGCGATCTGTAAAAGGTT
TATCTTTTAACCTGTTCGTTTATGATCGTTGAAACTCATGCACAAATATT
GATGTTGTTGACAGAGTCTTGTATGACAATAAACTTAACTATTCACTTTC
TTATTATCCAGTGGGTTCAATGTTTCACAAATTAGAAGAAAAACCGAAGG
AAGACCAAGATGAAGAAGATGATGAAGATGTCGAATTAAAAGATTTATTA
TACAAAGAAGTCGAAGTCGAAACTGAAGCGCCCGCAAAAACACCTTCACC
CAAACCCGCTCCCATTCGTGTGGTGGAGCCTGTCGCTAAGCAAGTCATTC
AAACAAAAGAACGCGAAAACGAGAAAACCGCCTCCATTGATGCTGAAACT
ATCATTAAAGAAATGGAAGAAAAAACGAAAGAAAATGAGGAGCCGACCCC
AGAGCCGGCACTAGCTGGTGCTCCCGTCTCTGTAGAGCCAGAACCAGTTA
AAAAACCAGAGCCAGTTGTTCTTCCCGTCTCTGTAGAGCCAGAACCAGTT
GAAAAACCAGAGCCAGTTGAAGAGTCAAAAGCGCCAGTTGCGGAGCCAGA
AGCATCAAGTGACGAGACAGAAGAAGCAATTGAAGTCGC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000752	XLOC_000752	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000010	supercontig	sc0000010:414932..427870 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.510739	0.516047	0	0	0	0	19.3966	19.0726	4.47248	2.2818e-06	0	0	11.6161	9.57728e-05	2.23746	3.61244	8.99382	11.9379	8.76238	24.0233	6.25512	5.56501	1.2942	1.8766	3.5775e-09	1.10889e-08	7.01109	3.2131	0	0.313092

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00001473 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00001473 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00001473 (transcript) - C. hemisphaerica