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transcript sequence >TCONS_00002858 ID=TCONS_00002858|Name=TCONS_00002858|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1795bp TGGAAattggctacggtcgaaaagGAGCCGGACTTATGAAAATATCTTGA AATACAATGAAGCAAAGAATTTCATCGAGCTGTTGTTATCCTGATTTTAC ACACGCCGCGGTCAACTGACTCCGCCCCAGTATTCACGGACAACACAAAT AAAAAACTCACGGCAGCTGAAAACGTGCATCGCGATCGTGCCAAAAGCTT CGAGGATATTCCGACCTACATTAAAGACTTGTATGGTATCGTATCGAAAC AGAAACGTCCTGACCTGATGCACCACAGTGACTCCGTCAGAAGTTACTTC GAtgaagGTACTGAAGAGAACGAGAATAAACAACACAAATATCAATTCAA TGTTAACGATATCAACCGTAAAGAAGAAAAGATACAAAATGCAGAACTGC ATCTCTTCAAACAATATCAACCGAACGGCCAGGGTCGGCCTCGTAGCGCC ATGATCCAGATCGATATTATAAACATGCACAACGAGCGTGTAATCAGCTC GCGTATCGTCAGCGTTCATGTACACGGATGGTTACGTTTTCCCGTCACGA AAATAGTTAAACGTTGGGTACGCAAACGTAAGAATAATAAAGGTTTACAA GTTCGCATCCGTAATATTGGAGATGATAAAAACAATGTAAAATTCGGAAC CAAAAACACTTTACGGCGTGAACCTATGCTGGTCGTATTCACGAAGCGCG TGAAAGGAAGTAGCCTTGCTGCTCTGCTGAACGGTAATGGACTCAATATT TTACAGAATAACGAGAAAAAGAAACGAGTTAAGCGGACCATAGTCACTAT GAATGATGACAAACCAAATAATCATATAGAGCATCATCACAAAGATGGGC ATTTAGAATGCCAGTTAAAACCATTGCGTATAAACACTAGAAACATGGGT TTCGGAGAAAACATTATAAACCCTACAGAAATCAATATTAACCAATGTGT TGGGTCATGCCCAGCTAGAATTAAAGAAGACTTTTTAAACAATCGCCATA CTTCACACGCTATTTTTCAAGCTATCGTGGCTGATTCCAGTAGACCAGGC GCAACTCACGACCAACCGGCGCTGCCTTGTTGTTCGCCGTCCGAATTTAA AGATGAGGTGATGATAATTAGCGGACGGAAGGGCTCACAAGAACTAATAC AGTTGGTGAAGTTTGAGAAATTGATTGCCACCAAATGTGCTTGTTTGTAG AGCAATGGTAGCTGAATTCGGGACAATCTTATCCCATTGACACTCGCACG CTAGTACAATAAAGTCCATTAAAAGACTCGACAGGCACAATTGGCCAAAT AACTTTCTTTAGTTTGTCTGTAGTTATGTTGATGCAATCGTAGAACCATT TCTTCTCCCGATAATTTATCCTGGAAATTGCCCTTTAATTTTCCCTTTTT GtataaattttatatataatatgtAGTATAGCTTTTATggtaactttttt ttgttcaagttGCTCATCAGAAAAATTTGCGAACAGCGTCCTACTTACTC AAAGATGTTTCGGGTTTAACAGGAATGGAAAATCGGAATTACTTATCGGA TTTCCCTGTataaaataggaaaaaaaaaacccggCAGTCAACCGTGACGc ttttgacaaatatttttgACCGTTTTACTTTCGTTTAGAGAGAGAAAGAA TATTTATATAGTCAACCCCCTTTtcgtttttttacaaaatgaagAGAAAT TCCTTAATTTATATAATGTGAATAATATTATATAGTCATAAATTCTTACa gatatttaaaattttaaagaaaaagaaatattttatacaTACAGA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000023:242176..260121- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002858 ID=TCONS_00002858|Name=TCONS_00002858|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17946bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023:242176..260121- (Clytia hemisphaerica) TGGAAATTGGCTACGGTCGAAAAGGTGTATTTGGTTATTTACTTTTTAAT
GAGAAACAATAATTAAGAACAATAATTTCAAAACTTTCAGAACAAAAGAA
TTTCAAGCAATTTATTTACTTTACAAAGTATTAAAGCCTAAGAAGCCGCA
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TGAAATTATATTTTGACGTCGAAGCCAATTTAGGGCTATTAACTTCCGTT
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GCGATTTTTTCTTACGTCAGCTGAGTTATGGGTTTCGCTTTTTTGTTGTG
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TGTGAAGCCATATTGTTAAATTATAATATTGTGCAATTGGGAAAGTGGAA
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CTCTGAATTTTCTTACAAAAAGAAACCTTCTAAATTTCTACAGCTTTGTA
GGTCTTTTTAGAGAAAGCTTTGGTGAAAGTGCCAATAGACCTTTGTTGGT
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CTTTGTGGAGCTGGGAAAAACTTTTTGATATTTTTCATAAGCAAAGTTCT
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TAAGAACTTTAAACTGAGCATTGCATTGATTTTTATAAAATACAGGAAAT
GTTAAGAATTTCCATTGTATTCAAACAATTATTCTTTCGTTTGGAGAACC
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TGATACTTGAGGATAAATTTTAAAATGTCATTTGAACTTTTCTTTAAAGG
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GCACGGTGATTAAGAACTAACCGTACACTACTTAAATTTCGAAAGCAATT
TGAAAGGAAGTTTTAAAATAAACTTTCTCTTAAAGAACGTCTATGTATTT
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GAGTCATAAAGTGGACCTAGAAAATCGGTATTATTGACATGCACGTTGAA
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CCTAACTTAGCTAGCTAACTACGCTAAAAACTTTGGGTTTTTTATTTGAA
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TTAAAAGTAAATTATTAATCTTAAAAAATATTCAATAGCTTTAATTGCAT
TCTTAAATAATTGTCCCCGGTAATTTACGTACTAATTTTCCCAAACGATG
AGGTCAGGCGTACAGGAAATCAACTAAAATATCTTTAGGGAGAAATTATA
ACATATTTAGATGCCTTCGACAAATATTTGTCGACTAATTATGAGAATAT
GCACAAGGCATTTTATGTTAATGACCCTATTATGATTTAAAGGCGAAACA
GGGTCACATGTTAATGATTTTGTTAAAGTGGTTTCATAATAATATGCTTA
TAAATTCAATGGAAGGTATTCAAAAATATTTCCATGTGCAGTCAGATAAG
TGTTACGCGTGGGCCTCATTGAACCGATCTAGCCTTATTAAAAATCATTA
ATGTGATACCTTAATTCCATACCTCAATTAAGATTTTCTTTCTGCCACAG
ATATTTTTTATACCACTGAAAGATTTTCGTCAATAAAAATGATGAAGATC
GCATAGTCATTAGTGGTTGATACTTTGTTATTTCTGTTTTCAATATTTTG
AAGTTTTGCCAAGTTTTGCTCCATTATTCAAATGCTTAGATTAGAGCTTT
TTGCCTCCATGAGACAGGTAAGTAAAGATTTGAGAAGCCCCATGCTCCAA
TGCTTTTCTTATTTTCGCCATAATGAGCCCGAAACCCTTCGAATGACCAT
CGAGGCTCAATATTTTTTGATGGCCATCTTGATGGTTTTTATTGAAAAGT
TTTAGTCGTCAAGGGAGAAAAAATTCAATCATCAGCTTTAGGGTTTTAAC
GCAAGCTAATCGTATACATGATTTAATCGCGTACATGATTTAAAATTCTA
TCACTTTTAACATACAGAAGGAGAAAAATTGTTAAGTATTATAAGACTCG
TTGACAGCTTAATGCTTTCTGAAAGGTGTTTGAAAGTTTTTCATTGCATC
TCGTTATTTAAAGGTTTTTAATCGTGTGAAAAAATTTTAAACGAAGTCAT
TTGAAGAAGGTAGATTTGAAAGATGGCTTTAAGATAACCGCATGTGTGTC
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GATTTGCTAAATTTCAAGATAAAAAAATCAAAATTATCAAAATTATTAAA
ATGGGTCTGTTAAAAAGAGAATGTTACTGTTCTCGATCATCTTGGCTTTC
AAATCTTAGACATTTTACAAACATTTTTTAGAAATCCCGTTCAAATTCTC
AACTTTGTAGATACGTCCAACTTACATCCATTTAACATCCATACCGATAA
CGATAACGTCTGTTTAGTCGAAAAATTCAGACATTCGGAAAACAAGATCA
TCAAAATACCATCCACTAATGATATTACAATTTAACAAACAAAGATATAT
TATTTTCGAGTTAAAAAAATCATAGGGAATTTTCTTTGATCATTTAAGCA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:260098..260121 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:260098..260121 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:258298..258352 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:258298..258352 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:253796..254023 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:253796..254023 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:242176..243663 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1575043694:242176..243663 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:260098..260121 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:260098..260121 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:258298..258352 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:258298..258352 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:253796..254023 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:253796..254023 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:242176..243663 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1510915933:242176..243663 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:260098..260121 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:260098..260121 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:258298..258352 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:258298..258352 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:253796..254023 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:253796..254023 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:242176..243663 | TCONS_00002858-exon-sc0000023-1491911889:242176..243663 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000023 | supercontig | sc0000023:242176..260121 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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