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transcript sequence >TCONS_00003493 ID=TCONS_00003493|Name=TCONS_00003493|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2477bp AGTTatgatttgttttgattatctaggtaaataaaaaaacaaagaacagg ataagataaataaaagaagataaacaaaaaagagACATATTGTCAGTACC AGTATCAAAGCGAACCCCCTCATTGAATCTAAATCAAtgaatcaaaaaat tgaaatacgaGCCGTCATGTGACATGTTTGTTTAAGACATTACTTCTATT ATTGTAACCACCATCAAAAGAATAGAAAAAGGAAAGGGAGAAAAAACGTA CgataaataatgaaaaatatgcGTCAAATCGCCAGACCAGCATCAGTAGA CGAGGAGAAGGATCAAACTGATGCAGCAGCAACGAAATATAAGAATTTTA ACAACAGAAAAACGAGTGGATCAACAGTTTCAAGTGACGATCAAAATACA GTTGGCGAATTTATTAACCCTGTTTACCGTGATAGCAGTATTAAACGTGA CGACCAAAATAACATCTCTCAAAAGGACAAAGAAGCCTACGACTCGTTAA ATTTCAGATCAGATTCAAAGGCTAGTCAACAAAACGGACATCCAGCACGA ACTGATATAACCAAACCCCCTGGTGAAGAGATTGAGATGGGTGTACATAA TTATGGATACGGAGACAACGAAAAAGCTAGACCCAATTCATGGGATaaaa gtatttcaacttttaGCCCGTACGCTGTAGATACTCCGATCGGCGGACCA GTTGAGTCGCAAAGTAACACAGGACTTTCTGTACAAGATAAACGAAATAG CATTTCAAAAGGATCAGAATACAGTTTTATCGGAGAGGAGAATCCATATG CTGCACCGAGCATCAAAAATCCCGATTATGACACGATTCCGGGATTAGAA AAAGGACGTTTACCGCCGCCAAGACAGGGAACACGTAAAACCAATCTCGC TTACGAGTCAGCGGTCATCAAACATACAGAGGTTCGTAAAACTGTCGATA AATCGCCAAAAGAAGGCTACGCGGCTGAAGAAGGATCTAGCTGTTGTCat gttatttttacaattttggtgggTCTGTTGGCATTGATTGCAATTGTTGT CGTCTTTCTAGTGGTATTTGGTGTgatcagtgcaaagaaatgtaAAGAAT GTGATGTTCAAGTGCCATCAACAGACTCTCAAACGGGAGGCCAGAACGGA AATGATGCAAACAAGGCAATTCTTGCTGAAATCGAAGCATTACGTAACAA CTTGACTGCACTACACAAGGCGATGGCTAATAACCCGAAGCCGGTCAACC AGACAGGGACCATCATTTTATTACAAAATGAAGTTTCGCAACAAAAATTA CACGTTCAAACACTCACTAACGAACTTGCAAAGCAACGCAATTTGACTTC ATCTCTTAACCAAACGTTTGAAGCAAAGAAGCTCGAAAAACCTGGTCCCG TAGGTCTTCAAGGCATCAATGGAGTCAACGGTACCTCTGGAGCACCGGGT CCAAGAGGGCCAGGGCCCAACTTGAAAGAGTGTACTTATGTAACAAAACC AAGTTCGAGGACCATTGGTGATGGCGATTCAATACCAGATCGATTGGTTG TAGATTACACATTCCAAaatAACGAGGTGATTGTTGGTGGTTATTGCAGT AGTTCAGTCACCATCGATTTCGAGCTTACGTTACGTGAACAGGACAATCT TTATTTGTGTACATGCACAAACTTTAAAAGTGGATCATCAAAAGTCGATT GTCATATCAGTCTTTTCAGATGTCCAAAAGAACAAGCATGAACATCACAA ATTATTGGGGAACggacatttttaaaagaacagtAAATCATATCTTTTGG ATTTGGAATACAACCTTGTGTCACAGcgccggtggaaccttttccctcaa tggggataaaaattcctattgaaatcccaatggagattctattgctccaa ggttaaaaatccaatggggatagttttggagtgcaatttttaaacattga attcccattggggatgaaatcaacGTGAATgtctcagtggggctgaaatt ccggGGTATTTTCCTGCCGGGGACGaaatctttgccaaattttccagtgg ggcagGGGTCCCAGCGGGTTTGTTACGCAGGGGTGTTGGAATTCTTTTGG AAAGTTGAATATTTTAATAGACGTATTATCAGAAGATACCTGTTCGATTC GGGTCCATGGCAAGAATATTGGCAAAATTTTTGCGGATTTCAACGGAGCT ATTTACCAAAGATATAAATCGATATGTCTCTCATTTTACGAGGTGAGTAT TCGAGTAGCCAAGATTGTTATACATATTAAAGTTtggtattttgatattt taacatttaaatttcatttaattatctgaatataagaacatttgaaaaac AACCATTGTCCACACGTTCGTTCACCAAATTGTTGTCAAATTTATCAGAA GATATTTTTGTATTCGTTTGAATAGCATGAGGTAATATGAGGGTAGCTCA TTTGCGCATAAATAAATTAATCTGCGT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000028:632818..653753- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003493 ID=TCONS_00003493|Name=TCONS_00003493|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20936bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028:632818..653753- (Clytia hemisphaerica) AGTTATGATTTGTTTTGATTATCTAGGTAAATAAAAAAACAAAGAACAGG
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CCTGAACTTGTTCAAAATATGATAAACTGGGAGACCTGATTACCGGGGGT
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CGTCAATGACAAAATCTTCCTTAAGTTGATATGAACTCGACAACTAGACG
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TGTTTCCTTTCTGTTTCTCTGCCAAAACCAGAAAGGATGTTTTTCTTTGG
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AAATATCATGAAATCTCTTATTTCGCCCAGTGGTATTTTGGTTTGGTTTT
TCACTTTATTTGCAAAAACTCCCTTTGGGAAGGTGTGAAACCCGAATAGG
CGCGGTCAGGCTGTCACGAGATGCTGAGAAAATGCATGCAAACAAACTCG
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ATAAAAGATATATGACAAATAATCGCTGTATTTGTCCTAGCTTGAAATCA
GGTTGTGTGGTCGTCTGTGATACTGTTTGTGCGTAAAGGCGAATCATGTA
CATAGCTTTACCAGGACTTCCACGAATTTTGTAGCCTACATAAAAGTTCA
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ATATATCTTTTAACTTGCGGACGAATCGTAATGCCCTTTAAAAATTAATT
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CATTTTTCCACAAAATTTGACCAAATTCCATGAAAATTAATTATCTTATG
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CTCAAGGACCACCAGGAACGAATGGTACAAATGGAGCTCTCGGCCCCACC
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AGTACAATCGCTTAATCTTCGGTTAACAACAACTGGCCAATGGGATACTA
AGGTAAGATGAATTTTCATTCATTTTTAAACACCACACTTTACCCGAATA
TCAATACAAATGTCTCTAGGGAGCTGGTTTTAAGTATAAAACATTCACAT
TTTGTTATAAACAAATAAGAAAGTCAGTAAGAAACAAAATCAGAAGTTTT
TTCTAATCATGGAAAAAATACAACATGTAACTGTCCTCCTCAAAAAGACC
TTAAATGGAAATGAAATTTCACGAAGCATCAAAGAAGTCTCTTGAAAGTA
GGACAAAATTCCTCCAATCAATTGCTTATTCGAACATCTATATATTCGAT
AGAAGCAGGGTAAAAGGAATAGAAACGAAATGAAAAATGGCCTGTTAGAA
TTTAATAAAATCATTATTGAAGAGTACATTGTTTCGTAGGACTTTGCTCT
CGTCATTCGTATCCTTTATCAAGACCTGGACAAAGATTCTGTCTATATAT
TTATATTTTTGGTTTTAGACCGAGAAGATTATCAGCGCTTCGTGTACGAG
CAAAAAAGCAGTATCGATGCAATTAATATCCAGTGAGGATGATGGTGTGG
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AACTTCACTTCAGAGCTAGGAACTGCTGAAATTTAAACTACGAAACTAAA
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AAAATGTCATGGGCAGCAACAATCGGACACCCCCTTCTCACAGACCTTTT
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CCTTACTGCAAAATATTGTGCTTTTTCTTCCATTGCCACTGAATATTCTC
GCTCGAAAACAATAGAATCCAAATCCCCAGCCATAAAAAAGCATGGGAAT
ATCAATGCCAATTGAGTTTTGGTCTGTTATTTTTACACCCACTGGCTGAA
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TTTTATATAGGTAAGAATAACCTGAAAGTCGATTATCTTACAAACGCAAT
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TATTCCCTACTGAAACACTTTTTTGTATCTTTTGGTAAAAAGAACGAAGA
GAGCCTTAGTATAACGTTATTATAACCATTATTCACACAATGTTTACCAT
AATACACCTTTTTGACCGTAGTCGCGCGGTTAGGTGCGTAACTACTTTTT
ACCACCCTAAACTCGATCCAATCCTTTTTTTACACTTTTTTCTATATTGC
CTATAGGTGCGAAATAAAAGACTGGGACGGTTTTAGGGTGGTAAAACGGA
CAAAAAATGCCCCCACGGCAATTGGCGGTTACGGTCGAAAAGGTGTATTC
AATACCCATTCAATGCTCATCTAATCCCAACAGTGGGTACGTTTACACAT
CCCTGGCATATCATTATTGGTTCCGAGGGATTTTTATCTCAATCATGTGA
TTTTATCTGATATTCCGATGGCGAATTTGGTGGCCGCCCACGCTAAAGCT
CTAATGGAGTATGCCAATTTCCATCGGAGAGAAATGATAGACGGCATTTG
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CTAAAAAATATTTCGGTTGGACACCAGTTCTTGAAAACAAGGACTGGGGT
TCAGACCTCTTGCTGCAAAATCTGTGACGCGGTATTTCAAAATTCCGTTA
TCTAAACCTTCCAGGTGTTGGAAAATTTCCCGAACTTCAGAGCATTATCG
TGTCGCATAGGAATTTTTGCATCTGGTACCAGATAAACACGAGATTACGA
ACACGAAAAACTGCGATACACAAATAAAAAACTATCAAAACTATTTTCTT
GCAAATAATTATGGTATGTCAGATGACAGGGCTGGGAAAGTACACTCTTG
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AATATCGTAACTGATGCTTCAATGTTTTCATTTTTCTGAGGTTTGTCATG
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CTTCAAACATCGAATATCAAACTTGTTGTCAGAAATTAAGGAATTTTTGA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000028 | supercontig | sc0000028:632818..653753 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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