TCONS_00047624 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00047624
Unique Name	TCONS_00047624
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3681

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_133:150031..162394+
coding sequence from alignment at scaffold_133:150031..162394+

transcript sequence

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ACCTCAACTTGAAGGTGACTTTCGGATCAAACTGAAAAAAAGGAGACAAA
GTATAGCATTCAAAAAAGGACCAAGCTGGCATACTAGACATCTCACAGTC
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AGGAGAATATGCCTGATTTGAGCAAAAAGGTCGTCAGCAGTAATGATAAT
GACTACTTCAAAGCAAGTTTGACATTGTACAACAATATTTCTGCTGGAGT
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caaaagaatcaagATTATTGGTGATTTTCTTTGAAGAAGAGGACGGAAAA
GAATCATTTGTTTGTGGAACTGTTTATCATAACACAAAAGCAAAAGATAT
TTGTCAAaatcCTAAGAATAATGAAATTCCTTTCATTCGTGGCAAAATGC
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GTTCTTCTACGATGGGAAAGGGAACTGGAAGGATTCTACAGGAATATTGC
TgatcagaaaaaacaaacaatttattGAGGATAGATCAAGAACACATTCT
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AAAAAGAAGATATCTCACCATCTCCAAGTATGGGCTCAATCAGTGAAGCA
AAGGAAGATACATCAATATGTTGGGGAGCTTTCACCGACCCTGATACATG
TGGATATAATTTTAATCCCATCATGAGTGTATTTGAATCGAGTATCTCAG
ATGATGACACTACTTCCCAATCAATTGAGGATTATTTCGGAGATGACAAT
GATTCGCATGATCTGCCAGCTGACACCAACGAAGATACAACATCTGTTGC
TGATATGGAGGCTGAAGCTCAAAGGCTCGACAGCTCTATCAAAATGAAGG
AAACTGGAGCCATAATTCCAACTAATGTTGCAGCAAACTctcaaattgaa
aatgaaattgccGTTGAAAATAATGTCAATGCTGTTGATAGTCCAGATGG
GCCTGAAGAATCACCAATACTTGATGCACCTAATTCGCCAGAAGCTTTAA
TCAAACAGTACCAAGATGTGGTACTGACTTCAGTTGAGCACAGCATTGAT
GAACCAAATGAGACGAGAGAAGACTCCAGTCAAACCAAACCGCAGAATCA
ACCGAAATTGCAGGATCCTCCTATTGAAGTAACTAATCAACCAGCACCAA
TTATCTCTACCCCAACAGCAAAACCTATTCTCATACCAACAATCAAGACC
ATCACATGTGAGCTATGTGATGATTACTCAAAATCAAAAccacaaaatat
ttcatctcattatGTTTTAGATGCTATCACAAACACATCCCAAGATAGTT
ACATTTGCTTAAGTGGTGTACACCTGTTGAAAAGAGGTCAGCAATACAGT
CTACAAGATGGTTGTGAAGTTAAAGCAGGAATCAAAGATACAGAATTGAT
AGATGccgtcaaaatcaaaaattctgtTAAACGTAAATTAGGCCCTTTTA
CATGTTTATTTGTACCAAGCGTTCGGGGTAAAGGCTATTGGCTGATCAGA
CAAACGGAGGATTTGGAAGATTCAAAACATCAACCAGAGCTGAAAGAACC
ATCTTTTCCACCCCCTAAGGAAGTTCTTATTACGGAACCGAGTGACCAGG
TTGTGCATGTATCAAGCCTCCCTCAGAATAATTCATCAAGTGAAGACGAA
ATCAATACAgacgaaaatcaaaatcaaacgcAAGCAGCAGTTGACTCTCA
GAGAATGTTTCAATCCACAGCTACTGAAATGTTTAAAGGTGCACTTGTTA
GTGCTTCTGATGCCTTTAAGAAcggtgaaaaatatttcaataatgtTTTG
GAAGGCCGACGACAAAGTACTGTGTCACTTTTGCAAGAAGATAAGAACAT
TCTGAGAGATGAGTTTGTTTTGGTTGGCGAAAGATTCGTTAAACCTTTAA
AGAACACTGTCTTCACTATTTGCACTCAAATGGAAAATGTTAATGTATGT
CAACAGAAGAAGCTTGGTGACGACTTTGAGAATCAACCAATTGGATGGCT
CGTTCGGGGAGAATTTTGTACCCTTATCGCAGAATTTCTTAAAATTGGTC
TCAAAGAACAAACCAACGTTTTCAAACGGTTTTTCGCAGAACAGAAACCA
ATATCACTCTGGGATGTTGCTCGTGAATTTGCATCTGCTTTTAAAATATA
CGAGTTTGATGGTGTTTTGAGAAGTATCAAGGATGCTAATTTGAGATCTG
ACGATGAGCGGTTCCGAGCTTTCTTTTGTCAGTTATTAAATCGTAGCGAT
TCTGACGGTACCGATAAATTGATTGTCAGCTTTTTCCAAATGTTACCACT
TATGACTAACAAGTTGGAGAAATTTTATCACGAAGATTCTTTTTGGAGAA
TGAGTTATTCATCTGGGTTTAGTACCTTACAAGATGAGATTATTTTGTCT
ATGAGACACTTCAATGGTTGGCCATTTGAATTACATTTAGATTTTGAGAA
GCGATTTAACCCTACTATACCGACAAAACGTGAAATTGTAGCTGCAAAGA
AAAGAGAAGAACAAATTAACCAAGACAGTCTTCTAATGATGgagtaaatt
tttgaaattgttttttttttataatgaaactttgtgtaaactttaaaatg
aaacaatgaAGCTTGAATTTAAAATTGTACTTGaatttgatttatatatt
tgataaaatgtaGTGGGATTGGATTGGGTTCAAAGATGCTGGTAAATCAT
TATTTGTTTCcattgtttcaaattttttgttcagttgatgttttttatat
aaaatttgaTTCCCAAAGTACCATATATTGTTTGTAAATGAATTATTCaa
tttaaatagttttatatttgtaaaatttaacGTTTTTAATTTTCATCATT
TATACCTTTTCTACAGAATTTTCCATagcatttcaattttttttttaatt
ttatattatagTTATGATTGAAAGATgtttattaaaggttttgtttttac
ataagtgttcgcgtttcatatcagacacatatttcatattggGACagtgg
tcgtgttcagacctgaaagtttaagtttaaggtttaaatagtactttgtt
gatatgggaattcaattataatcacttttct

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00047624-protein

>TCONS_00047624-protein ID=TCONS_00047624-protein|Name=TCONS_00047624-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=980bp
MLHIVQLENINIYDGSNYKEWTIHIRLIEGVNFNGSTEFFIAFPSEKLFK
DWMKNLQYSKDYWYKKENMPDLSKKVVSSNDNDYFKASLTLYNNISAGVI
IHKNSTLKELAREVNMFCHCKICIVDRREAQLFAVDKNGKVQLLKEEEKI
NGYVNSGCELFLMEKTKESRLLVIFFEEEDGKESFVCGTVYHNTKAKDIC
QNPKNNEIPFIRGKMRSYDPQGDVTLNYVNREKVFFLDTPLGEKEKPTTF
FYDGKGNWKDSTGILLIRKNKQFIEDRSRTHSMTSQEFNIYQEGREKAQK
VINSQRIKDAQEALSKKEDISPSPSMGSISEAKEDTSICWGAFTDPDTCG
YNFNPIMSVFESSISDDDTTSQSIEDYFGDDNDSHDLPADTNEDTTSVAD
MEAEAQRLDSSIKMKETGAIIPTNVAANSQIENEIAVENNVNAVDSPDGP
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KLQDPPIEVTNQPAPIISTPTAKPILIPTIKTITCELCDDYSKSKPQNIS
SHYVLDAITNTSQDSYICLSGVHLLKRGQQYSLQDGCEVKAGIKDTELID
AVKIKNSVKRKLGPFTCLFVPSVRGKGYWLIRQTEDLEDSKHQPELKEPS
FPPPKEVLITEPSDQVVHVSSLPQNNSSSEDEINTDENQNQTQAAVDSQR
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RDEFVLVGERFVKPLKNTVFTICTQMENVNVCQQKKLGDDFENQPIGWLV
RGEFCTLIAEFLKIGLKEQTNVFKRFFAEQKPISLWDVAREFASAFKIYE
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FNPTIPTKREIVAAKKREEQINQDSLLMME

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_133:150031..162394+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00047624 ID=TCONS_00047624|Name=TCONS_00047624|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12364bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_133:150031..162394+ (Clytia hemisphaerica)
GTATTTTTAAACCagttttcttttaattatttcttttagaGATTTCCATT
ACCTCAACTTGAAGGTGACTTTCGGATCAAACTGAAAAAAAGGAGACAAA
GTATAGCATTCAAAAAAGGACCAAGCTGGCATACTAGACATCTCACAGTT
agtatctttatttttctaacaAAATGTTTATTAGAGGTCTCTGTTTGAAA
TAAGAGGGTAGCCAACAAACTTACAAGTGTATCATTTTAAAACTCAATCA
ATGTTACttgttttgaacttgaaaataGAGTTGGCAATAAACAATTTTTT
AGGCTCTTTTGACTTATGTCTTAATTACGGTACAAAATGGGTTTATATGG
GTTTAGTTTGACTATCAGTCAGAAGActgtagcatgaaggtagagcgtCC
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TGATGATGCCTCTCtgtttgatgctcagcaactaaagagacggattaagg
gtaagtggagaaatccccTACCTTTTGTACTTtcaggtagacagctatac
AAAAAGacagccttcgggtcgccctcgactgcgtctcaaacttacttact
tacttttcagtcagaaaagaagaaaaaaacaaactagTTTTTGGAAGTGA
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AGTGAATCCCTCATAATTACTCATAGATCTTGTTAGATATATTATTTATG
ActcatttgaattttttttactttgcctTAGGTCTTACTGAATGAGTTGC
taatatctgaaaatgaatatgcttTTCATACTGGATCTATGCTGCACATT
GTTCAACTTGAAAATGTAAGGTTATTTAGATTAACACAACTATTGTATAA
ACTAACTGTAAAAAATGTAGATTTCTCTGCTTATCACTATGTTTCTTTGT
TTCAGTTACTCTGTAGTCATGGTATTGACAAATGCAGATTAAGTCAAAAA
TACCCCTTTAGATAAAATTTGCAAATCTGTAGATCAATTTGTATTATTCT
TGAAAAGAGCAGAACAAACATGTACCAAAAGGAGCATTCATAGAGAGTTG
TCAAATAAACTGCTTTTGTTACTTTTTGATACAGATAAACATATATGATG
GAAGTAATTACAAAGAATGGACCATTCATATCCGGTTAATTGAAGGTGTG
AATTTCAATGGCTCCACAGAATTCTTTATTGCATTCCCAGTAAGATTTTC
AGTATATTTGTATGTTATTATTTTAAACTATGATCTTTATTTTAACATAT
ttcttcagccaaaattttatgactttcATCTGTTTTGAGAAACGAGCATC
CTTTTAAACATGATTTGCTCCAATAGCTCAAGCAGTGCTGAACAATCCAC
TCTTGACAATTAGTGCACTAACTGAACAACCCATTAAATACAATTTGGAA
TCTTGATTTCAGGATTTTTATAACAAGAAAAGTGCCTTTATTGAATAATT
GATGCATTTTTACGTACTGATATTCATTTTATTGAGCCTGATTCTATGAC
TTTGGTAAGTTAagatcaattttaaattttctactATCAACAATACTATT
TTAAGGAATCACTCAGAATCACTTTCTATTTCTTAAAATTAGAGTGAGAA
GTTGTTCAAAGATTGGATGAAAAATCTTCAATACTCCAAAGATTACTGGT
ATAAGAAGGAGAATATGCCTGATTTGGTATGATTTTGTTTCGATAATGCA
GTGTTGATAGTTCTTTCATATTAGACAGATCTGTTTCAGGATGGTTTTTA
TATAGAGGCTTTACTATCTTTTATACTTGgctaaattttgataaaaattc
aagaatttcaaaatctatttggtatagttttattaaaaaatcaaaaggct
ATGTCATCGTTAGTACAAACATAGAATTGTGCTTTCATATAATAGTTTGT
ATTGACCACTGTTTCAAAGTGTTGTTGTGATCACTTTTTCTAAGACCACT
GATTATTTGATTTTGGTTTCTTTTTCAGAGCAAAAAGGTCGTCAGCAGGT
GAACAATTTTGATTCATTGATTTTTATATTTGGTATCTTAAAGGGGCTAA
TCTtagtgggaactaattttcactgTTTGCCCGAACCGAAAAAATGTTTG
GAAGctcaaaaccgcaaaaattaattgtcacaaaaaatttaagaaaattt
cataactgaaattaattgtttgattttttgaataaaatgtgtatttcatt
ttattaacaattttattgtttaagaAGATGCTTGAGTGAAACTTGAACAG
GGCTTTTCTGATATCACTTATTAATTGAATAGTtcccttaaccctttaag
tgtcaATGTCGtgtatatcagacatgggctatgtaggagggcaaAGCCCT
CCTGTACTGCCTGCCCAATTTGAGTTAGaattcgtcatttttggtctcgt
aggaattggattgggctttatggtcaagcaaaaacagaatcaaaagtgag
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gtttgatgctcagcaactaaagagacggattaagggtaagtggagaaatc
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ttacttacttatcagtcagaaaagaaaaaaaaacaaactagtttttcagg
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TTGGATGCGCATTAGTGAATCCCTCATAATTACTCATAGATCTTGTTAGA
TATATTATTTATGActcatttgaattttttttacttataCCTTAGGTCTT
ACTGAATGAGTTGCtaatatctgaaaatgaatatgcttTTCATACTGGAT
CTATGCTGCACATTGTTCAACTTGAAAATGTAAGGTTATTTAGATTAACA
CAACTATTGTATAAACTAACTGTAAAAAATGTAGATTTCTCTGCTTATCA
CTATGTTTCTTTGTTTCAGTTACTCTGTAGTCATGGTATTGACAAATGCA
GATTAAGTCAAAAATACCCCTTTAGATAAAATTTGCAAATCTGTAGATCA
ATTTGTATTATTCTTGAAAAGAGCAGAACAAACATGTACCAAAAGGAGCA
TTCATAGAGAGTTGTCAAATAAACTGCTTTTGTTACTTTTTGATACAGAT
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TAATTGAAGGTGTGAATTTCAATGGCTCCACAGAATTCTTTATTGCATTC
CCAGTAAGATTTTCAGTATATTTGTATGTTATATAAACTATGATCTTTAT
TTTAACATATttcttcagccaaaattttatgactttcATCTGTTTTGAGA
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AACAATCCACTCTTGACAATTAGTGCACTAACTGAACAACCCATTAAATA
CAATTTGGAATCTTGATTTCAGGATTTTTATAACAAGAAAAGTGCCTTTA
TTGAATAATTGATGCATTTTTACGTACTGATATTCATTTTATTGAGCCTG
ATTCTATGACTTTGGTAAGTTAagatcaattttaaattttctactATCAA
CAATACTATTTTAAGGAATCACTCAGAATCACTTTCTATTTCTTAAAATT
AGAGTGAGAAGTTGTTCAAAGATTGGATGAAAAATCTTCAATACTCCAAA
GATTACTGGTATAAGAAGGAGAATATGCCTGATTTGGTATGATTTTGTTT
CGATAATGCAGTGTTGATAGTTCTTTCATATTAGACAGATCTGTTTCAGA
ATGGTTTTTATATAGAGGCTTTACTATCTTTTATACTTGgctaaattttg
ataaaaattcaaGAATTGCAAAATCTATTTGGTatagttttattaaaaaa
tcaaaaggctATGTCATCGTTAGTACAAACATAGAATTGTGCTTTCATAT
AATAGTTTGTATTGACCACTGTTTCAAAGTGTTGTTGTGATCACTTTTTC
TAAGACCACTGATAATGTATTTGATTTCGGTTTCTTTTTCAGAGCAAAAA
GGTCGTCAGCAGGTGAACAATTTTGATTCATTGATTTTTATATTTGGTAT
CTTAAAGGGGCTAATCTtagtgggaactaattttcactgTTTGCCCGAAC
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atttaagaaaatttcataactgaaaataattgtttgattttttgaataaa
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TGAAACTTGAACAGGGCTTTTCTGATATCACTTATTAATTGAATAGTtcc
cttaaccctttaagtgtcaATGTCGtgtatatcagacatgggctatgtag
gagggcaaAGCCCTCCTGTACTGCCTGCCCAATTTGAGTTAGaattcgtc
atttttggtctcgtaggaattggattgggctttatggtcaagcaaaaaca
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atgcaaacatttgacaaaaatccacttttttaagattttttgaccatttt
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AAGAATTCAACACTGAAAGAATTGGCACGAGAAGTCAATATGTTTTGTCA
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TCCATTATAATATGGTGCAAGATCATCCCAAGAAATTTCTATAGTGTGTC
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AGATACTCTGTATAAATTTCTGctgaagaaaattaattttgtatGACTTC
CctccaaattttctttgatcATATTTGTTGATCAGATCTATTGAACCGAA
TTGAAagctttttgaaagatttttgagcatTGGAACATACTCAAactaaa
aaatgtttcattttggttttgcaattaaatttaaaatttgattgaCTTTC
ACTTCCTTTTATGTGACATTGTCTGCTCTTCTATATATTGTACAataatt
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aaacaaaagaatcaagAGTAAGATTTGtcattttgatgattttcaaaTGA
ATCGTCTTTTTTTTAACTGCATCAACTGAAAATTGATGCAAAAGGAAAAC
TGCATATAGATTTTATTGAAATTGATTATGTATTTTGAAACCCAGCTTTC
TCATTTACTATTTATGCTATAAAACTTGATTTGAATAAAGCCACAAGCTT
CCGTCTTTTTTACACTTTCaaataagattttaaaaatcttgataaCTATT
TTTGGTCACATTTTACCTAAAACTTTGAATTTAAGGCTTTCTACTAAAAT
TAACTTTGAGCTTTACTAAAATATTGTTCCGTttaattcaatttcaaatt
cagtttTTCTCAGTTAAGCCTGACTTATTATGTGTTTCAATTCATTTCCA
CAGTTATTGGTGATTTTCTTTGAAGAAGAGGACGGAAAAGAATCATTTGT
TTGTGGAACTGTTTATCATAACACAAAAGCAAAAGATATTTGTCAAGTAA
GATTTAATTTCATGATGGATTGAACTTTACGCCAAActaaaattatcatt
ttgaatGTTATGCGAGACCAAAACCGAGCAAGTTGAAAAGTACGGTCCCC
TTGGGAGAAGaataatcaaaataagagtTTTTAAGGCGTTGgagcaatgc
aacatgctccatcccactaACACAAGAGAAAAAGTTTGTGTCCCATGGCT
TCTTTTaatgtttcatgggacaaaaagcgAGGGAAATACCCGAAGGACat
gctgattttgtccctgggaaaAAAGTGAGAcacacaaatgttattaaatc
gatttcacttttattgataGAAACAAAAATGGGGTGGGACACAAGAAAGC
GTTTctggttggtgggatggagcatgttgcattgcaccaacgcaaaaAGA
ATTCTCGTGTTCCTAAGCCTTCAGGGGGGGGTGACGTTCGTAAAATAAAT
TATGCATCAGACAAAATACAAATAAGATTTTATCTTGgtaaattttttgg
tatttggGTAAACAATAGTTGTAACAAGTTGTAATTGCATCGTTTTCTCT
GTTGCTTCTTGTTTGTTATAGCAATAGTATGTATGGTCCTTTTTTCATTG
AtaaccttttttttattttagaatcCTAAGAATAATGAAATTCCTTTCAT
TCGTGGCAAAATGCGATCATATGACCCACAGGGTGATGTTACTTTGAACT
ATGTCAATCGTGAAAAAGGTACACTCGAAATGATGCTTTTTATTAAGTAT
TTTTGCCTGTAGAAAACATAATGATATAATAAAACTTATGCACCATATCC
TTGCTGGCATAATTAAACTAAATATTTTATTATATCAAACTAAATCACTC
TTAATCTGGTTGGCTAATTATGTTTTCCAGTCTCCAAAATGAGAACCTCC
CCTATTATTGATTATTATTTACTAACACTGACAAATGTATAACTTCTTTT
TCCTTTAATAGTTTTCTTTTTAGATACTCCTTtgggtgaaaaagaaaaac
caacTACGTTCTTCTACGGTAAAAAAATTTAACTAAATTTTACCACAACA
TAATTTATTTAGTCAAAGGTTTTCTGCATTTCATCATCACTGAGAAAGCA
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gttcttaattttttggacttttcttgcttaaaatgttcttacaatgttct
ttaACATGATTTAAATCTGTTAAGTTCAGtgttaaaatcaatttttgcca
attttcagcctcgtgttcttataaaattgtttttatattaaaaaaaagca
tATATCTCGTATAAACTTTTTTTACCTTTATACCTTTAGATGGGAAAGGG
AACTGGAAGGATTCTACAGGTACACATTTTCAACTGCAAAGTTATCATTA
TTTTTAGTAAAATCCAGCCAGAATTTACTCGTTTTATACTTTACAGTAGA
GTTATTTATAAATTATGTCTGCATAACTGGAACCTCTGCAATTGAAAGTC
TACTTAACCTACAGGTTTTCTGGTTCCTTCAGTTaataatgccttataaa
ccagaCTCCATAAGTCGAACAAATTTACGTTCGTGTTGTGCATGTTCAAG
TAATAACGACTTCACTACATTAGAAAATGTTTGTACTATTTTTAGTCGTC
TAAAGGGGCTGTGTAATAACACATGTCTATATTGTTTTTTATACATCTCT
TGATCTAAAAATCaagattgatttaaaaattattgTATCTATTTAGGAAT
ATTGCTgatcagaaaaaacaaacaatttattGAGGATAGATCAAGAACAC
ATTCTATGACATCACAAGAGTTTAATATATATCAAGAAGGCCgtgaaaag
gtttgttttttattgcaatattcATGATACCTTATCCTATAATATTTTTG
TCAGACAagggaaatttgaaattaactCAATCCAACCCAAGAAGTAAAAA
ATTAAATCTTCTGGGATTTTgtcaaaaaagcttcaaaattcattgaaatt
gtttaaATTTAGACAAAATAGAAGAGCCTATCCCCAAAATTAGCTCTCGC
TAAAACTATAAAACTTAAAATCCCCCAAAATGAGATTGTACCAAAAGTCT
TCAAGATTAATCCTGCTCACCAAATTAAGTAAAGTAAATAAACTGGAGTC
AAGTTCTtattatttgaattttcttttcaaattcacCCTTCTCAATTTCT
TTTGCTTAAGATACATAACATTTTTAAGGACCTATTAGTGACAGGCGTGG
TTacagaaaatattcaaaagtaATGACGGACGGAGAATTTTTCTTTTGCT
AATTATCATCTTATTTatactttttacttttcatttgGGAGTAATATTGt
gcttaaaaaaagaattttgagtaGCCCAAATGCCGCTGAGAGAATTTGCA
GCAATGATGAGTGAGATATAGATGGCCTGCCCTACTGTGTGAcattataa
tataaaaataatataatattatattataattATGAAGTGTATTTACCTGT
GTACTGTCTGTTATTTCGTTCTAGGCACAAAAAGTGATCAATTCTCAAAG
GATCAAAGACGCACAAGAAGCTCTGTCTAAAAAAGAAGATATCTCACCAT
CTCCAAGTATGGGCTCAATCAGTGAAGCAAAGGAAGATACATCAATATGT
TGGGGAGCTTTCACCGACCCTGATACATGTGGATATAATTTTAATCCCAT
CATGAGTGTATTTGAATCGAGTATCTCAGATGATGACACTACTTCCCAAT
CAATTGAGGATTATTTCGGAGATGACAATGATTCGCATGATCTGCCAGCT
GACACCAACGAAGATACAACATCTGTTGCTGATATGGAGGCTGAAGCTCA
AAGGCTCGACAGCTCTATCAAAATGAAGGAAACTGGAGCCATAATTTCAA
CTAATGTTGCAGCAAACTctcaaattgaaaatgaaactgCCNgaccggcg
tgcgacgccgggtaccggctagtaatATTATAATTATGAAGTGTATTTAC
CTGTGTACTGTCTGTTATTTCGTTCTAGGCACAGAAAGTGATCAATTCTC
AGAGGATCAAAGACGCACAAGAAGCTCTGTCTAAAAAAGAAGATATCTCA
CCATCTCCAAGTATGGGCTCAATCAGTGAAGCAAAGGAAGATACATCAAT
ATGTTGGGGAGCTTTCACCGACCCTGATACATGTGGATATAATTTTAATC
CCATCATGAGTGTATTTGAATCGAGTATCTCAGATGATGACACTACTTCC
CAATCAATTGAGGATTATTTCGGAGATGACAATGATTCGCATGATCTGCC
AGCTGACACCAACGAAGATACAACATCTGTTGCTGATATGGAGGCTGAAG
CTCAAAGGCTCGACAGCTCTATCAAAATGAAGGAAACTGGAGCCATAATT
CCAACTAATGTTGCAGCAAACTctcaaattgaaaatgaaattgccGTTGA
AAATAATGTCAATGCTGTTGATAGTCCAGATGGGCCTGAAGAATCACCAA
TACTTGATGCACCTAATTCGCCAGAAGCTTTAATCAAACAGTACCAAGAT
GTGGTACTGACTTCAGTTGAGCACAGCATTGATGAACCAAATGAGACGAG
AGAAGACTCCAGTCAAACCAAACCGCAGAATCAACCGAAATTGCAGGATC
CTCCTATTGAAGTAACTAATCAACCAGCACCAATTATCTCTACCCCAACA
GCAAAACCTATTCTCATACCAACAATCAAGACCATCACATGTGAGCTATG
TGATGATTACTCAAAATCAAAAccacaaaatatttcatctcattatGTTT
TAGATGCTATCACAAACACATCCCAAGATAGTTACATTTGCTTAAGTGGT
GTACACCTGTTGAAAAGAGGTCAGCAATACAGTCTACAAGATGGTTGTGA
AGTTAAAGCAGGAATCAAAGATACAGAATTGATAGATGccgtcaaaatca
aaaattctgtTAAACGTAAATTAGGCCCTTTTACATGTTTATTTGTACCA
AGCGTTCGGGGTAAAGGCTATTGGCTGATCAGACAAACGGAGGATTTGGA
AGATTCAAAACATCAACCAGAGCTGAAAGAACCATCTTTTCCACCCCCTA
AGGAAGTTCTTATTACGGAACCGAGTGACCAGGTTGTGCATGTATCAAGC
CTCCCTCAGAATAATTCATCAAGTGAAGACGAAATCAATACAgacgaaaa
tcaaaatcaaacgcAAGCAGCAGTTGACTCTCAGAGAATGTTTCAATCCA
CAGCTACTGAAATGTTTAAAGGTGCACTTGTTAGTGCTTCTGATGCCTTT
AAGAAcggtgaaaaatatttcaataatgtTTTGGAAGGCCGACGACAAAG
TACTGTGTCACTTTTGCAAGAAGATAAGAACATTCTGAGAGATGAGTTTG
TTTTGGTTGGCGAAAGATTCGTTAAACCTTTAAAGAACACTGTCTTCACT
ATTTGCACTCAAATGGAAAATGTTAATGTATGTCAACAGAAGAAGCTTGG
TGACGACTTTGAGAATCAACCAATTGGATGGCTCGTTCGGGGAGAATTTT
GTACCCTTATCGCAGAATTTCTTAAAATTGGTCTCAAAGAACAAACCAAC
GTTTTCAAACGGTTTTTCGCAGAACAGAAACCAATATCACTCTGGGATGT
TGCTCGTGAATTTGCATCTGCTTTTAAAATATACGAGTTTGATGGTGTTT
TGAGAAGTATCAAGGATGCTAATTTGAGATCTGACGATGAGCGGTTCCGA
GCTTTCTTTTGTCAGTTATTAAATCGTAGCGATTCTGACGGTACCGATAA
ATTGATTGTCAGCTTTTTCCAAATGTTACCACTTATGACTAACAAGTTGG
AGAAATTTTATCACGAAGATTCTTTTTGGAGAATGAGTTATTCATCTGGG
TTTAGTACCTTACAAGATGAGATTATTTTGTCTATGAGACACTTCAATGG
TTGGCCATTTGAATTACATTTAGATTTTGAGAAGCGATTTAACCCTACTA
TACCGACAAAACGTGAAATTGTAGCTGCAAAGAAAAGAGAAGAACAAATT
AACCAAGACAGTCTTCTAATGATGgagtaaatttttgaaattgttttttt
tttataatgaaactttgtgtaaactttaaaatgaaacaatgaAGCTTGAA
TTTAAAATTGTACTTGaatttgatttatatatttgataaaatgtaGTGGG
ATTGGATTGGGTTCAAAGATGCTGGTAAATCATTATTTGTTTCcattgtt
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Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_133:150031..162394+

>TCONS_00047624 ID=TCONS_00047624|Name=TCONS_00047624|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=35316bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_133:150031..162394+ (Clytia hemisphaerica)
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TTTGGTTGGCGAAAGATTCGTTAAACCTTTAAAGAACACTGTCTTCACTA
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TATTTCGGAGATGACAATGATTCGCATGATCTGCCAGCTGACACCAACGA
AGATACAACATCTGTTGCTGATATGGAGGCTGAAGCTCAAAGGCTCGACA
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ATCAAAAccacaaaatatttcatctcattatGTTTTAGATGCTATCACAA
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AGAGGTCAGCAATACAGTCTACAAGATGGTTGTGAAGTTAAAGCAGGAAT
CAAAGATACAGAATTGATAGATGccgtcaaaatcaaaaattctgtTAAAC
GTAAATTAGGCCCTTTTACATGTTTATTTGTACCAAGCGTTCGGGGTAAA
GGCTATTGGCTGATCAGACAAACGGAGGATTTGGAAGATTCAAAACATCA
ACCAGAGCTGAAAGAACCATCTTTTCCACCCCCTAAGGAAGTTCTTATTA
CGGAACCGAGTGACCAGGTTGTGCATGTATCAAGCCTCCCTCAGAATAAT
TCATCAAGTGAAGACGAAATCAATACAgacgaaaatcaaaatcaaacgcA
AGCAGCAGTTGACTCTCAGAGAATGTTTCAATCCACAGCTACTGAAATGT
TTAAAGGTGCACTTGTTAGTGCTTCTGATGCCTTTAAGAAcggtgaaaaa
tatttcaataatgtTTTGGAAGGCCGACGACAAAGTACTGTGTCACTTTT
GCAAGAAGATAAGAACATTCTGAGAGATGAGTTTGTTTTGGTTGGCGAAA
GATTCGTTAAACCTTTAAAGAACACTGTCTTCACTATTTGCACTCAAATG
GAAAATGTTAATGTATGTCAACAGAAGAAGCTTGGTGACGACTTTGAGAA
TCAACCAATTGGATGGCTCGTTCGGGGAGAATTTTGTACCCTTATCGCAG
AATTTCTTAAAATTGGTCTCAAAGAACAAACCAACGTTTTCAAACGGTTT
TTCGCAGAACAGAAACCAATATCACTCTGGGATGTTGCTCGTGAATTTGC
ATCTGCTTTTAAAATATACGAGTTTGATGGTGTTTTGAGAAGTATCAAGG
ATGCTAATTTGAGATCTGACGATGAGCGGTTCCGAGCTTTCTTTTGTCAG
TTATTAAATCGTAGCGATTCTGACGGTACCGATAAATTGATTGTCAGCTT
TTTCCAAATGTTACCACTTATGACTAACAAGTTGGAGAAATTTTATCACG
AAGATTCTTTTTGGAGAATGAGTTATTCATCTGGGTTTAGTACCTTACAA
GATGAGATTATTTTGTCTATGAGACACTTCAATGGTTGGCCATTTGAATT
ACATTTAGATTTTGAGAAGCGATTTAACCCTACTATACCGACAAAACGTG
AAATTGTAGCTGCAAAGAAAAGAGAAGAACAAATTAACCAAGACAGTCTT
CTAATGATGgagtaaATGCTGCACATTGTTCAACTTGAAAATATAAACAT
ATATGATGGAAGTAATTACAAAGAATGGACCATTCATATCCGGTTAATTG
AAGGTGTGAATTTCAATGGCTCCACAGAATTCTTTATTGCATTCCCAAGT
GAGAAGTTGTTCAAAGATTGGATGAAAAATCTTCAATACTCCAAAGATTA
CTGGTATAAGAAGGAGAATATGCCTGATTTGAGCAAAAAGGTCGTCAGCA
GTAATGATAATGACTACTTCAAAGCAAGTTTGACATTGTACAACAATATT
TCTGCTGGAGTTATAATACATAAGAATTCAACACTGAAAGAATTGGCACG
AGAAGTCAATATGTTTTGTCACTGTAAAATTTGTATTGTGGACAGACGAG
AAGCGCAATTGTTTGCTGTTGACAAAAATGGCAAAGTCCAGTTGTTGAAA
GAGGAGGAAAAGATTAATGGTTATGTGAATTCTGGTTGTGAGCtattttt
gatggaaaaaacaaaagaatcaagATTATTGGTGATTTTCTTTGAAGAAG
AGGACGGAAAAGAATCATTTGTTTGTGGAACTGTTTATCATAACACAAAA
GCAAAAGATATTTGTCAAaatcCTAAGAATAATGAAATTCCTTTCATTCG
TGGCAAAATGCGATCATATGACCCACAGGGTGATGTTACTTTGAACTATG
TCAATCGTGAAAAAGTTTTCTTTTTAGATACTCCTTtgggtgaaaaagaa
aaaccaacTACGTTCTTCTACGATGGGAAAGGGAACTGGAAGGATTCTAC
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GAACACATTCTATGACATCACAAGAGTTTAATATATATCAAGAAGGCCgt
gaaaagGCACAGAAAGTGATCAATTCTCAGAGGATCAAAGACGCACAAGA
AGCTCTGTCTAAAAAAGAAGATATCTCACCATCTCCAAGTATGGGCTCAA
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CCTGATACATGTGGATATAATTTTAATCCCATCATGAGTGTATTTGAATC
GAGTATCTCAGATGATGACACTACTTCCCAATCAATTGAGGATTATTTCG
GAGATGACAATGATTCGCATGATCTGCCAGCTGACACCAACGAAGATACA
ACATCTGTTGCTGATATGGAGGCTGAAGCTCAAAGGCTCGACAGCTCTAT
CAAAATGAAGGAAACTGGAGCCATAATTCCAACTAATGTTGCAGCAAACT
ctcaaattgaaaatgaaattgccGTTGAAAATAATGTCAATGCTGTTGAT
AGTCCAGATGGGCCTGAAGAATCACCAATACTTGATGCACCTAATTCGCC
AGAAGCTTTAATCAAACAGTACCAAGATGTGGTACTGACTTCAGTTGAGC
ACAGCATTGATGAACCAAATGAGACGAGAGAAGACTCCAGTCAAACCAAA
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GGCTGATCAGACAAACGGAGGATTTGGAAGATTCAAAACATCAACCAGAG
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GAGTGACCAGGTTGTGCATGTATCAAGCCTCCCTCAGAATAATTCATCAA
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GTTGACTCTCAGAGAATGTTTCAATCCACAGCTACTGAAATGTTTAAAGG
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AAGCAGCAGTTGACTCTCAGAGAATGTTTCAATCCACAGCTACTGAAATG
TTTAAAGGTGCACTTGTTAGTGCTTCTGATGCCTTTAAGAAcggtgaaaa
atatttcaataatgtTTTGGAAGGCCGACGACAAAGTACTGTGTCACTTT
TGCAAGAAGATAAGAACATTCTGAGAGATGAGTTTGTTTTGGTTGGCGAA
AGATTCGTTAAACCTTTAAAGAACACTGTCTTCACTATTTGCACTCAAAT
GGAAAATGTTAATGTATGTCAACAGAAGAAGCTTGGTGACGACTTTGAGA
ATCAACCAATTGGATGGCTCGTTCGGGGAGAATTTTGTACCCTTATCGCA
GAATTTCTTAAAATTGGTCTCAAAGAACAAACCAACGTTTTCAAACGGTT
TTTCGCAGAACAGAAACCAATATCACTCTGGGATGTTGCTCGTGAATTTG
CATCTGCTTTTAAAATATACGAGTTTGATGGTGTTTTGAGAAGTATCAAG
GATGCTAATTTGAGATCTGACGATGAGCGGTTCCGAGCTTTCTTTTGTCA
GTTATTAAATCGTAGCGATTCTGACGGTACCGATAAATTGATTGTCAGCT
TTTTCCAAATGTTACCACTTATGACTAACAAGTTGGAGAAATTTTATCAC
GAAGATTCTTTTTGGAGAATGAGTTATTCATCTGGGTTTAGTACCTTACA
AGATGAGATTATTTTGTCTATGAGACACTTCAATGGTTGGCCATTTGAAT
TACATTTAGATTTTGAGAAGCGATTTAACCCTACTATACCGACAAAACGT
GAAATTGTAGCTGCAAAGAAAAGAGAAGAACAAATTAACCAAGACAGTCT
TCTAATGATGgagtaa

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_030337	XLOC_030337	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00047624-protein	TCONS_00047624-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_133	supercontig	scaffold_133:150031..162394 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.79715	1.65983	0.894576	0.684278	2.05575	1.16771	1.87244	2.01948	1.20178	1.78075	1.32546	1.03406	3.70806	2.55003	3.4912	2.66521	2.39591	2.01171	4.13815	4.43153	2.81087	2.3684	3.7797	3.35242	2.55831	3.41233	3.95216	3.91843	2.81855	3.03349

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR004012	Run_dom

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00047624 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00047624 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00047624 (transcript) - C. hemisphaerica