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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00047916 ID=TCONS_00047916|Name=TCONS_00047916|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4217bp AATTTGGGTACATCGAGAAGAAGCGAAATATGGGTCTGCCATCAgGCTTA ACTGCCGCCTTCCGCATTTCAACAAATGGGATTACATATGGCTTCTGATC ATGGTAATATGACGTTGTGGTTGAAAATCACTTTACTGGTATTAAACTTG GCAAACTCAATCCTACACGGAGTTGGAATCTACCTCCTTGTTACGTTATT CCCACAATCCAGGTTCAAGATTCAACAACGGTATCTGATCCACTTGAGTG TATGTGAATTCACCATAAATACTTTAGAAGTCATCAACATCTTGAATGGA TTTGTGGAATACAGCCCTGATGTACAGTCTAAAGTGGATGAAGTTTTTCA TTACGTTCTCATTATACAATTCACTGGTGTATCACTTGTTTTCTACTTGG ATATGATCTATTTGACTTTGGACAGACTTTTCGAGATTGTGTTGAACATC AAATATCCTGTATACTGGAGTGAAGAAAAAGCAAGGAATCTGTTGATAGT CACGTGGATTATATCCGGATTAANCGAAGAAAAAGCAAGGAATCTGTTAA TAGTCACGTGGATTATATCTGGATTAATCACCGTTGCAATTTGTGTTGCC CGTGGATTAGTTGGATGGGCTTGGGAGCCTGTTATTTTCACATATTTCTT TCCAACAATGGAGTTTCTATTCGTCATCCTTGCCATTACAACctacattt tcatcttcaagaAATACAAAATCACCAGAATCTCACCAGCACCTAACTTG GAGATTCTGAAACTTTCACCGAAGACCAGGAAAAGACGACGCAGCTCTTT CTACATCTTCCGTAGATCGAAATTCTTTATTCCAGTTCTACTGATCTTGA CTTTCATGGTTTTTATGGTTGGTGCAGATCTGACGTTACTTTTTGTCGGG GTCATTCAAGGTAATGACAGCCTTGAGTTGAGAACAGCTGTTTTTATCTC TTACGCTATATCTAATCTATTCGACGCATGGATCTATATCTTCCTTCAAA AAGACGTCAAGAGACTTTTGTACAAGAAACTGGGACTAGTTTCAGCATCC AATCAGAACACAGCTGAGACATCATTCCAGCTTCCTGCAGGCAAACGATA TAGTGTCAACTTCCCATCAGTTTATAATGGTCGAGTTAATTCGACACCTG TTGCCAGCCCTGTTGCTAGCCCAATAATGACAAATAGGACTGCTAAAAGA CACAAAGCTGATCATTTGGAGATACCCAGTTGATTGGATGTTAAAAATTC TTGTACGTTTTGAAAGAAAGGAATATTTGCTTAACAAACGATGTGAAAAA AAGAACTGAATCTAAAACTTTGCagtataaaattgaaaaatgaagtacTG ACTCTGATATGACGGTGATTGTCCATTTTCTATGAATTAAGGATAAACCT CTAGCTTCTTATACCTTAaggaaacttattttggcggaaactaattttgg cgaattcggcgaatttagaaaaattcatcattcgccaaaattaaaaattt tcaggatttttgcaGCTCGTCAAAATATACCCGCCaaaaaaaagttccct taaggtacctgTGGGACTATAACATTGATTATTGCTTGCGTTGAGCATGC CCTTATTTGAGACGTGATTGTGGTGCTAACCTTTATATATTTCATTATTT GGGTAGCCTATAATAGATGCCACGACTTTTTTTCTGCGCAGTAACGTCTA TTCTACTTTGCGGCTATTTCGAATGTTTGGAACATAACATTACCCgttat ttgattttattatttaggTAGCTTTTACTGGATAAAAAATATACTGACAT ACGCGGACGTTTTATGTCAGCGTGGTAGCCTCAGACTTAGCCTGGTTTTC TTAGTATACCATAATTTGTAAATCTTAGCCTTAATGTTAATGATGTGATA TCTTAAAtaaatagaatttcattttatattttacaatataAGAACAAGCA ATCTAGCATATTCTAATATTTCAATACTTATCCAATGAGGAAAGTTTTTG CAATTTGTGCAACATATAGGATCCACTAGAACACTAATATTATAGTTTGA TGATGGGGTAGTTTGCAAGATCTAGGGTTAGCTCAAACAATTCATttaga ttttgttaaaaataagaCGATTGAAACTCCAAAAATGACAAGAATATGTA CATCGATAAAAGCcaacaaaaaaaatacattaTTCGATAAAATCTACATC ctgatattttaaattcctaGTTAAATTTCTATTTACAAGAGCTGTGTGCT CATGAGCGGTCTCCAAATATCAAACTGTTCACCAGGAGGCTAATCCATTC AGCTTTTTTATACAGAAAGTTGCATTGTGGAGCATTAAAGATATCCAGTT GAGATTATCAAAACTGAGAAAAATTCGCGTTcctttaaaatgtcatttta caATTGACAATTACAAGTAACGAGAATTTTGTTGCAATTGTATCTCTGGC CTCTTCTTTTAAGACGGACTTACATCCTATTCAACCTTCCTAGGGAATAG AAAAGTTTTAAACTTTCTGTAATAATTTCGTTTGACGTCAACACAATTTT CACTATTACAAAATCCTCAAAGTCTTCGTGAAAATTACGATTTGAATGTA TCTTTTGCAACAGTTCTTGCAGCTGCTCTCGTGTGAGGTAGATACTTCAT GGTGTCGCACTTCACAAATCCCCAAACTCAGAGTTATCCTCTTTGCCTTC TTTCTCTCGCTAAACCAATTCAAGAGATTTTTAATATATCATTCATTTGT CACCAGCTTTTTGTAAGAAGATACTTTCTTCACCACATGGAGAAGATCCA CCTTTTTCAGAAGTTGAAGCTGTGGAAACAGATTCCTGTGTTCTAAGTTG AGAAGCTTTTCTTCTGTTCCTCATATATTCAATAAAAGATGGTGTCAAAG CACCGACCAATATTCCAACCACAAAGAACAAAACCACCAAGACTGGTACT AGAATTTCCCAATTAACTTTACCATCACTATTATACTCATCTGAGACTTG GGGTTGTTTAACCTGTCTCCTTTCAATACAGCGATTAATTCTCTCATCTC TATCCTTACAGATCTGATCGTCATTTGAACAAACTTCCACTTTGAAGAAC ATGTGTTNCACTTTACCATTACTATTATACTCATCTGAGACTTGGGGTTG TTTAACCTGTCTCCTTTCAATACAGCGATTAATTCTCTCATCTCTATCCT TGCAGATCTGATCGTCATTTGAACAAACTTCCACTTTGAAGAACATGTGT TTAGTGGAGGCTGAACCACTATCAACTCCTAGACTAGCTTCAGTGCCGTT GCTGGTTGTATAGAAGTAATAAGTATGTCCAGCCTTAAATTCCGGTTGGC TTGATGATGCCCGAATCGGGGAAAACTGGATTCGATATTTATCAATGACA GATAGTTGTAGACCATTTTGGCCCAATGTTTTATGTTCACGACATATGAA AATTGTGTCAGCCTCTTTATTTCCTGTACGTTTTTTGCGCTCTTTGAATA GTTCTTTATCCTCAGTCATTAAAAGATTATAGTTGTATTTCGACTTCGAT CTACTCATCTTGTCCAAGATAGCGTTATTTAAGTCACGATTTGGGCAGAT AACGTTCATTGTATCAAACTCTTTAACATAGATAGTTGTAGAAACTGGAA GACATTTCTTCGTATTAAACATTGGCTCGTCCGGATGCCAATAAACGTCC GGTAATTGAATATTCTTTTGAAAAGTGTCCGTAATGAAGGTGGTGAGGGA TAACGTGTAGAATACTATCAACTTCATAATGATCATCAAATTTGCTCACT CAGCTATCGctcctttctttcttttgaatcaatccaaatatttcttttat taaTTCAAATTTTGTCGCACTAGCATTCAAGGTATCAAAACCAGGAAATC TAGACGGATGGTGCGTTCCAATATTAACGTCTGCTATTTCTCGGAgctga tttctcgtgtactTTTGTCTTCCCTCTCtggatcaaaaactgagcaaaaa cCAAGAAATTCCTGATCAAAACCAATTCTTTTTCAGTATTGtggatataa tatttcataAGTATCAGAAGGTTATCATGTCTATAACTTGTCCATTCGCA TGACACAATTTGTTGTTTTCTCTGTGTTTGTTATCCTGAAAAATTCAAAT AGAGAAAATAATTTAATCTGAAATATGACAACTTTGGCAGCCTTTTAACA CTCTTGGGAGGTATAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_139:322513..333557- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00047916 ID=TCONS_00047916|Name=TCONS_00047916|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11045bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_139:322513..333557- (Clytia hemisphaerica) AATTTGGGTACATCGAGAAGAAGCGAAATATGGGTCTGCCATCAGGTATA
TTTTCTTTATTTTAATATTTTGGACTTTGATATTCGTCCTTTTAATTTCC
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CTCTTATTTTTCTTTGAAGTTTGATTTTTCTTCTTTAATTTCCCATGAGT
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CAACTCCTAGACTAGCTTCAGTGCCGTTGCTGGTTGTATAGAAGTAATAA
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CCAATGTTTTATGTTCACGACATATGAAAATTGTGTCAGCCTCTTTATTT
CCTGTACGTTTTTTGCGCTCTTTGAATAGTTCTTTATCCTCAGTCATTAA
AAGATTATAGTTGTATTTCGACTTCGATCTACTCATCTTGTCCAAGATAG
CGTTATTTAAGTCACGATTTGGGCAGATAACGTTCATTGTATCAAACTCT
TTAACATAGATAGTTGTAGAAACTGGAAGACATTTCTTCGTATTAAACAT
TGGCTCGTCCGGATGCCAATAAACGTCCGGTAATTGAATATTCTTTTGAA
AAGTGTCCGTAATGAAGGTGGTGAGGGATAACGTGTAGAATACTATCAAC
TTCATAATGATCATCAAATTTGCTCACTCAGCTATCGCTCCTTTCTTTCT
TTTGAATCAATCCAAATATTTCTTTTATTAATTCAAATTTTGTCGCACTA
GCATTCAAGGTATCAAAACCAGGAAATCTAGACGGATGGTGCGTTCCAAT
ATTAACGTCTGCTATTTCTCGGAGCTGATTTCTCGTGTACTTTTGTCTTC
CCTCTCTGGATCAAAAACTGAGCAAAAACCAAGAAATTCCTGATCAAAAC
CAATTCTTTTTCAGTATTGTGGATATAATATTTCATAAGTATCAGAAGGT
TATCATGTCTATAACTTGTCCATTCGCATGACACAATTTGTTGTTTTCTC
TGTGTTTGTTATCCTGAAAAATTCAAATAGAGAAAATAATTTAATCTGAA
ATATGACAACTTTGGCAGCCTTTTAACACTCTTGGGAGGTATAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1575043694:333513..333557 | TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1575043694:333513..333557 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1575043694:322513..326684 | TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1575043694:322513..326684 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1510915933:333513..333557 | TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1510915933:333513..333557 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1510915933:322513..326684 | TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1510915933:322513..326684 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1491911889:333513..333557 | TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1491911889:333513..333557 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1491911889:322513..326684 | TCONS_00047916-exon-scaffold_139-1491911889:322513..326684 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_139 | supercontig | scaffold_139:322513..333557 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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