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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00049389 ID=TCONS_00049389|Name=TCONS_00049389|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2240bp TTTTTTTCTACAAGTGTAACATTTTCTTTTAACCTTTAAGTATTCTCTTT TCGTACATTAATACACGtcttattttcctttttctcttGGTGTGTGAGTT TACTATTCACCACAAACCAGTAAAATTTAATACATAGGGTATTGTTATAT TTTGTATGTAACtatattttatttgtttacagtatttttttaaaaaaatt tcaaactttgaatatcCTAGATTATTTTATTGTAATTGTAATTCTACTGT TTTTAATTCCATGTAAATATGTAcagttttaagctttttttcccaaaatt acGTAAATAGTTTGTCACAgcttttgaaacaattttgatACGCTATTACA TAATTTGCAtgagatttttatcaaattttgttaaaagtggCTATGCTTCC ATTTCTATAATAATTTTGCAGCTTCTTCTACTTTTAAATAAATACTTTGC ATTCTTTCATGATCATTATCAAACTTTagagtttttgaaaattgaaattg tatATTATCATGTTATTGTCTCTCTCACCTATGCAGTTATTCTAGGAGTT GATGGCAAAGAAATTTCAAGGAAATGATGATAGACTTGGAAAATCTTCAT ACTACATATATTTGTGATGACACATTCTCTGTAGTAATGACAGGTAAAAT TACGCCAACCTTTAGTTCATATATATTTCTAGACATGCATGAAGGTTACT TGAGTTAAGCACATTTCActaacaaaaagtttttgtttatttgaaagTCT TCTTTTGCTGGTGCGGgggtaaattaaaattttgattgaattatatatgt tttgaaattcgatttTCCATTCATCTGTCATCCTAGTTCATTTCAATctt gtaaatattttaattttctagTTTTTAATTTATCAATTATTTCAGATGTA AATGACAGATGAAAGAAGAATCTTTGCCCAAAACTCAACCATTTACTCAT AGTATATagaaaaacagaattttttcaatgattATAATAATGCTCTATTT CAAAGATATCTAAATCATGTGGTTTTAGTTCAAAGCTTCTTTAATCTCAC ATATTAATCTTCCTATAAATAAAACATAGAGCTAGTAATCGTTTCAAAAA GAATATTTATCAACTCTTTCTTGTAAAACTATTTCAGCACCCACATCAGC AAACTTCATAAAGCTcactttttaaggaaaattctCGCATCATAATGCTA CCCTTGTTACAAGATAACACACAGGATGCAGAAAATGCTTGAGAAGATAG ACTAAAAGCCTTTGCTTTACAAGTTCCCTTCATGCATAGACAATATTTCT GAGTCAATTGGTATTCTGTGGTTGGGGGGTCCCTTAAGATCTCGACTTAG AAATATTGTCAAAAGTATATTTGATAATCTAacctaatttctttcttttc aggTTTTGCAAAACTTGTGATTGAATTGCTTAACACTctacttttgtttt tttctttagacCAGCCTGCTGTGAATATAAGGGTTTAGGTTGCACATGGG TAGGTGTTCATCACCAAGTGATGTCTCATGTCAAGGACTGTTTGTTCCCA CAGAAATGTGGAGCAGACCTTCTGGAGAATGTCAACAACATTGCTGCAGA ATCTAACGAGGAATTGAGGCGTTATCAAGACCTCTTCCAAATGTTATCGT ATGAAAAAATCACTCATTGTGGtaacaaaatctttttgggGTTTTTTACT CTTATTCAGTTACAAACAttcctttcattttttttgataCACGTGTGATT TAGTTATCGTATGGAAACCTATATGATTGATCTATGTAACCGAGGATTTA AATTGTGTGACGCAGgtcactgaaaatttttaaagattttctaaaCTTAC ATAAACGTGTTTTGCTTACTCTGGACAAAAATTGGGCTTTTaccaacttt tcaaaatttttatcaagGAAACTCTATTTTTTTAGACATTCAACTATGCC CAAGTCGCAGTGATGATTATATTCCCAAGTTGTATTACGAGACAAACAAG TTCACTGCTTTCGATCAGTTGTGGACAATCAAGGCCAAAGTTGTCGGCAA TGAGAAAATTGCAGCACGTTCACTCTCATACCAATTAATATTAAAAGGTA TTATTTGATAAACATATTTTGAATGTTTATAAAGACAGTTCAATGCTcac aaaaacaacaacttcTTGTCATGTGGGTTGTACTTTGAAACGTCACGTGA GAATTCGTTAATTAGCCATGACATTAAATCGATTCAGCCG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_156:17639..19878+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00049389 ID=TCONS_00049389|Name=TCONS_00049389|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2240bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_156:17639..19878+ (Clytia hemisphaerica) TTTTTTTCTACAAGTGTAACATTTTCTTTTAACCTTTAAGTATTCTCTTT
TCGTACATTAATACACGtcttattttcctttttctcttGGTGTGTGAGTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00049389-exon-scaffold_156-1491911889:17639..19878 | TCONS_00049389-exon-scaffold_156-1491911889:17639..19878 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00049389-exon-scaffold_156-1510915933:17639..19878 | TCONS_00049389-exon-scaffold_156-1510915933:17639..19878 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00049389-exon-scaffold_156-1575043694:17639..19878 | TCONS_00049389-exon-scaffold_156-1575043694:17639..19878 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_156 | supercontig | scaffold_156:17639..19878 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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