TCONS_00049596 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00049596
Unique Name	TCONS_00049596
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	6394

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_161:83514..104108-

transcript sequence

>TCONS_00049596 ID=TCONS_00049596|Name=TCONS_00049596|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6394bp
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ATCTTGGATTGGATGATGACGATCTTGAAGTGGAAAGTGACGATATCATT
ATTGATAGTGACGGTGATATCAAAGAAGTGCCTAAAAATAAAGAAGAAGA
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CAAATTGCTGACGAAGAACTAAATATCATATGTCAAGGCATCGCTGATAA
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GAGTTGAAGCTTTGATACAAGCTATTGAAAAATGTGAGACTCTTTTAGAT
GTGACAATTGAACCTTGTGAAAACGTGTCTCATGAAATGCAAGAACAAGT
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TAACATAGCTTAGAATTACGATTGTATATTGTTTCTTTATCTATCCTGAT
AAGACTTGAGCGAATTTGGGTTTACAGTTTTATTGCAAGAATTAATTTAT
CCTCTAAGAAAACCTCTAGCCTTTCGTGGTTTTTCGTACCCTTCCCACtc
gaaatataaaaattttgaccaGAATATTCTGCCATTTTGTTGTC

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transcript from alignment at scaffold_161:83514..104108-

Legend: exon

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>TCONS_00049596 ID=TCONS_00049596|Name=TCONS_00049596|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20595bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_161:83514..104108- (Clytia hemisphaerica)
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TTAACACAACACTCTGAAGTTCTAAAGATCACTGAAAGCTAACATTTGAG
GAAAATGGTCATGCTTTTACGAAAAATTTTCAATTAACTTTTTGACTTGT
GCCAAAAGCATGAAAATCATAACCAGCTGAAATAGCACTTCATGAAAAAT
GTGTTTTATAGATAGGAATTAAAATTCTTTCCCATAATGGTTTGGAACTG
GAACTGACTGGAAAGCTTTTTTCAAATTTGAGGCAAAAGATAAAATGGAT
GTTTGTTATTGTTGTAAAACTCAAATTGCTTGGTCTTAATTTTTAAAAAC
TTTGTAAGTATTCTGATGGTTGGTATCCATTTTCTTATAGCTTCAATTTT
CCCAATGTTACTTTAGTATGTCTACTATATTGAAAACCCTATTATTTAGA
AAGATACATTTAGTTACAAATTCTTCAAAATATCAAAAACATACACATGA
CCTTTAAAGATGGCAAGCTACACAGCAGGGTAAGTGATATATCAGTTTTT
TTTTGAATTATTGTCAAATCCCTGTCATTTGAAATGTGAAATGACTAATA
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CTGTACACAAGTTCATGTGAAAAGGGAGAGTTAAAGTTACTTCAGGGTGA
CTTCACCCTAAGGCCATTTTTATGTACGGCTTGTAGGGCAGGCACAAGAG
TTTTTCCTTTAGAAAAAATCATTAACCTCAAATCTCAAAAGTGACTTTCT
GGTGAAAAATAATTCTTCACTAAAATATTTTTCTCTAAAGATAACTTTTT
TGATATATGCGCATCCTGAAAAAAATCATAGAATTTTTATGAAATTTCAT
TGAAAATCATCCAGGCTGCATGTAAAAAAACCCCGAAGAATTTTCGAAAT
GAGTTAATTTCACCTGATTTTACCCTTATATAATTTTTCCCAGGCTAAAG
TAAACTCTATCAGATATCTCAATAATCACATCAATCATTATTTTACTTTA
GACAATTTGCCAATTACAACAGTTTAACAGACAAAAATCTCAGTGGATAC
TTTGCAAACACACAGATGAGAAAACATTTAGTCAGATCTGGTCTGGTATG
TATTTCAATACTTTTATTTACTTAATCATCCTTTCATTTTAACTCATTGG
TATTAGTGGAAATGAAATCATACCTGGATATTTTCGAGATTTGATGTTTA
CAATCGAAGAACAGTTTGTTCTATCATTAAAAAAATGACTCCATTGTCTA
CCTTTTTCTACATGGCCAAAGTCCTTCATATCCAGGGTAATATTTCTAAG
TCCTCATCTAAATGGATATAGTTTTCTTTATTGAATATTTATAATTTTGT
TCAATCTTTTATTTTTCACTTCTAGATAACAAAGAATGGAAAAATAACAA
GTGAAAATTCATACAGATTGAAAATTGCTAAACGAGAGCATAGAGAACAT
GTCAAAGATCTTTTGGCAACAGCCATTGTTGAAAAAGCATTAGATATGGA
GGTATAACCAGAAAGTATTATGGCTTAATCAGACTAGCATAATTTTGGGT
CATGCTTCTTAGGTGGCCAAGACACAAGACATATATGATTAATTTCTCTT
TTTCATTTTTTTGCCAAATCCTCAGATTTAGGCTGATTGACATTTGCATT
CTTATAGAGAGAGAGCAGACCGGACCTTTAACAGTATTGTCTTTTTTGAA
AGTTCCTGAAAATCTTTCAAGATTTCCCAAAAAGAAACACCTTGAGAATT
CCTGCTTTTTTAATAATTGATGGTAAAACAAGAACTCAAAATAAAATTTC
GGAAGGTAGTAAGTTTCTAAGTGCACTTGAGGGCAACCAGAATACCTCCT
TTCCCTAGCTTTTCAAGGCTATGGTAGGGCGCCAGTCCTTCCCAAAGATT
TTTACACTTACCCTTGATACTTTGATTGCTGAGCATCAAACAGAGTGGCA
TCAAGTACCATGTTATAAGTCTCTGGCACCATCTGGCTGGAGATTGAACC
CGTAACCATGCACACTATAGTTGAATGTTCTATCTTTATGCCACAGATTG
CCTGAAATGGATGGTTGATTCTTATTTAGTTTTTATTGTTTATTTTACTC
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GAAAAGTCGGAGAAGTGTCAAAAGTGCAGCCATCACTTCAAGCGAAAGAG
AAATGACAAAACTACCTGAAATCAATTTTGATGAGCGAACTCGGTTATTA
AAATATGAAGTAAGTGATTGCATTTCTTAAAAGTGTTTTTCAGATTTCCA
TTTTTTATTTTGATGTAATTGAAACCAGCAGCTTTTTAAATAATGACAAG
ATAATAGCATAGTGGCGTAGCGGTATAGTGGTTATCATCCTTGACTCCCT
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ACGTGTTGTGGCACTCAGAAGGTTCAGCCTCGCATGAGCATTGCTCTCCC
AGTGTCATTCAAGTGTCATGGTATACGCCATGGCTTGGCAGCTCGTCTGT
CAAGTCGCAGTGTCTGTCAGCGCCGTGATTCCTACTCCTTTGTGGGTAGG
ACCCATCCTGAATGCATTCGGAGAGCTCATATCTATCTATCATATCTATC
TAATAGCATGTCGTATAAAATTTTATTAATGATCATAATGAAATTTGTTT
CCTTTCTAGACAACATCGGTGGATAGTGGTAGTGACAGTGCTTCTAGATA
TACTGCACCTCGCCCTCCCAAACAACCTTCTGCTGGTAGAAGTGTCAGTG
CACACACCTATGGTAGCAAGGCTCCACACCCACCGCCACCAAAGTCAAAG
AAAAAGAAGAAAAGGAAAATTCATAGGGTAAATTGAATTGAATTGTCTGT
TTTATTTCACTTTGCAGAACTTAAGTAAGGGGAGACACTAAGCCTAAGAC
TCCACTTCAGTNATGTTTTATTTCACTTTGCAGAACTTAGGTTAGAGGAG
ACCCTAACCCTAAGACTCCACTTCAGTTAGATGTGCCTAAGAGGTAGGGA
GGGACCCCCTTTTATACCTGGATTATTATTTGCAACTTTTACAGTCTTGA
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TTATTTTCAGGGATTGATGTTAGCAAAGAGTGAACAAATGGTAGCACATC
GTGTACAGGTATGCATCCATTGTTTTGAGTGAATTTTGTTTTATCTCACT
CAGATTGCTTACCTTTCTTTCCTTCTTTCTATTCAATTTAATGGAGGGAT
TTTTAGAAAAAAAATTGTATAAAGTGTGATGAGGAGGGAGGTATATCTGG
ATGTCTGGATATCATTTTTGTGGATATCCAGGGGGAAAAGGTCAAAAGCT
CTTGAATATCCAGGGCAGCTCAGTTGGTAGAGCTTTCGCATTGCAATTCA
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GGGTAATCTGATCTAAGCTCTAGTTTAGACTGCCCACTTTTCGCCCTGCC
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CTATTAGAATAGGCAGGGCGAAAAGTGGGCCGTCTAAACTAGAGCTAAGT
TATGATTCTCTTGCAACTGAGCTCTAGCTTAAACGACCGACTCTCTACCC
TACTCCAATCGATTGGGGGCATAAAGTTGTAAGTTGTAAAACTTTGTTTG
AAAAAGATTGAAAAAACATTGTATTGACATCAAAAAGCAATACATTGACT
TTAGACAGCCAGCTTTATGTCCACTTAAGTTCACAGTTAAAATAATCAAA
TCACAAATCTATCTATCTCGTTTCTAACTCACTTTCAGGTTCAATCTATG
GCTGAAGTTACCATGAAATTCTTAGGTTCCAATTTACAATTAGCAAGCGA
TATGTTTCCCGCCAACAAATTATCAGAGATTCAAGTTATTCAACAGCATT
GTGGAGCAAGCACCGTTTGTGTTTTTCGTGAAATGATCCCACCAAATAGT
AAGGACATTCATTTTTTTTTCTTCACTGAAGAAATTCTTCTAGAATAAAT
ACGTAAAAAGTTCCAATTTTCCTAAATCAAAAGTTATAGGCGTTTTTGTG
GGGAAGTTCCCCATTTTACCGCATTTTTTTATCATTTGATCCAAAAAAGT
CGAGACTTAGAAGTTTATTTTAGTTTGAAAATGTGGTATATAGTTCGTGA
ATTCTTAGTCCTTGTAATTTTGCCAGGAATCACAAAAAATCACATTATAA
GGAAAAACTACGGGCTTTTGAGCTTGGTAACATAAAATTGACCAAATTAA
AATCATCTTTTTGCTGATACTAATTTCATTTCTTTTTAGCTGTATTCACT
TTTGTATCTCGCCGTCACCGTGGTTCACCGTTCGGCCTCACCATCAACAT
AGACGGTATCAAAAACATTCGAATCAGTTCGTGTTGCGAATACAAACATA
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CTTTGACGCTAATGTTACAAACTGTTCATGATTGGTCTTTCCATATCTTG
TATAATCATATATGCATGAGACGCCGTTCAAACAATTTATGAAGTTTCAA
AATCCAATTTTGCCATCTTTAAAAGGGTCAAGGGTGTTTTAGTGTTACGA
TTCATTTTTTTCTAACTTAGATAATCAGCATTCAATTTCAAGTTATTTTT
GGTTTTCACCCTTCCATACAGTATGTATACAACAAAAGAGTTCTTAAAAT
CTTAAAATCAGAAGACTCATTGCAAATGTCTCGGTTATTCAACATTCTTT
ATCTTCATGTTCGTACCANCTAAAATCAGAAGAGTCATTGCAAATGTCTC
GGTTATTCAACATTCTTTATCTTCATGATAAAACTTGCAGTTTGCTTAAG
AATAATTTGCTTCTTATCTTATTCTTAGATGTCAAGTCAGACTGAACCTA
CTGGATAAGAATAACAATGAAGCCGAAAAAGAGGTTTGTTTGTTTGTTAG
TTCTTTCTTTATCATCAGTTTATAATAACTCATAACTTCATTCATTCATT
TAGTCATCTTTTTATTCGTTCTTAAATTCATTCACTCGTTCATGAATTTA
TTCACTCTTTCTTGATTTTACTTAATTCACTCATTCTTAAGTCAGTTCAC
TTGTTCTTAAATCCATTTCGTAATTCTCCTTTTCCCTCTTAGGCTCTTTG
CGCATTCTTAGTTGGTTCAGCGAATGTGGAATGCATAAAATGAAAATTTA
AAAGTTAGGTCCAAACAAGAATTTATTTCATTCGTTTGATGCTTCTCTCT
TCTTAGGCGTCAAGTGACGAAGAAGCGGCTACAAGAAGTTTCGACATCAT
CGTTAGTCGTGGTGGGAAGCGTCAGGAAGCCGTCAGAGAAAGACCTAGTA
AGAAATTGCCACTCTTTCCTTTTCTTATTTATAACGTCATTGAGTGGCCT
GTCTGAAAAATAAAAACCTTGTAAATTGAAGTTTCAGCAAATATTTCACG
TTATGTATTTAGTACCCCGAATAGTAGTTAATCTATATGTCTAGTATGCT
GTCAAGAGTCAAGAGTGCTAATTTAGGACCCATTCATTTCTAAAAAGGCT
TCTACATAGCTTTTCTTTGCAAAATATTGAGTGGGCATGACAACCCTGAC
CCCTCGTAGACGAAGTAATTGAGTCGTAAGATGCTCAATCAAAATTGGAG
AATTTTGAGCAAAATAATCTCATTTAAGCGCTATTAAATTTAGACAACCG
ACACTTTTGGTATGAGTTTGAGCAAGCGTGTGTCAAGATTAAGTTATTAT
GTACCGTTATTTTTTTCTTTCATAGTTTCAGCGAATGTTACAACTCAAAC
AGAGGCATCTTTATTACTCCCAAACTCGCAAGAAGATGACGAGTCACCAA
AAGAAAAAGATGCCGTGGCACTAACAGAACAATATCAAGACGACTTCGAC
GATGACTTTGAAGCCGACGAAAACGACAGTAAAAACGGCGACGATGATTT
AAACGAAAACGTATCATCTTCTTCCGAATCGGATTCGTCGGATAATGAAT
CCGATAAAGATTCCGATACAGAAAGCTCAGATACGGAAAGTGATTCAGAA
AAATATAAATCCGAGGTAAAGCTTTTTTTTGTCCTTCAAATTTATTTATT
AAGTTCATTATCTTTAGACTTGTATTTGAGACGTGACTTGACTATAAACC
TTTTCATAAATTACTTTAAGTACAACGGCTGCCTCGTTTTGAAACCATTG
CCAAGGTGATCAAATCCCTCTAGTCTTCAAGTGTTACTTTAAAAGTGTTA
CTTTAATAAATAGAGTGCACTTCTTATGAACTCCTTTGGGAATCAGTTAC
AATAGCAATATTTTGAAAACGAGGTAAGCGTTGCTCGAGACGTAATTTAT
GACTTCTATCCTGCTGTACAGTCTTCCAGGTTTTGCTGAGTTACATAAAT
TCTGCTTTTTCGGCTATTCCAAGAAATTGTCCACCATGATTGCAGTCTAA
GCCCGAGCCGTATCTAAGGGTGCTATCAAATAGTGCACGGGTCGTGGCGC
TCCTAAGTATGACCTAACGTACCCTTTCCTCAGAATTGGCCGTTTTATGG
AAGAGCAATTGGATTTTTTAGTAAAATTGTTTATGAAAAACTTGATCTGT
TGTAAATGCTTCCAAAAGATATTGTAAATAGCTCAAAACAATATTTTTAG
ACTGTCCTTCAAACTAAAGACTGGTCCCCTCTGCTGGAAGGTCATATACA
AACTCAAATTCAAACTTTTGAGAATAGAATTAACATAAAAGTTAACTTTA
TTGTCTTTCTTTACTCTAGAACTCTGGAGAAAAACAGATGGACAACAGCT
TAACTGAAACGGATGATACGATCACTTCAACCAATCAGCAACGAGATGAA
GAAGACGAGCATCAACCAAGTGACGTTGACGCTCGTTCCGACGCTGATTC
TGATACCGACGTCGCTAAAAAGTCCGACACTTACGACGATCATGATGATC
ATGATGACGATAAAGAACATGTCAATGTAGAACAAGAAGACTCTAAGAAA
CGAGACAGCGATTCAGAGTCGGATAAAGAAAGCGTCAAGTCGGATGGTGA
CGGACGTCGTTCATCGGTATCGTCGGAAAGTGATTCAAGTGATGATAACG
AGAAAGATAAAAACTTGAAGGACAACGAAGAAGAAGTCGAAGGTGATTAT
TTCAAATTTTGAACTTTTAAACGGGGAGAATATGATGGTATTAGGTGACT
TATATGAAATTTTGACGAGTGTTTAAAAGGTATACAGCCCCTGTTATAAT
AACCATTAAATTCTTATTGGGGCTTCTTATCTTATAGTCTAGCAAGCTAG
ACAACTAATTCAGACATAAAGCAAAAAGTAATGGAGGGAACAATTTTATA
CAAGCTAAATCCCGTAACAATAATCGTATTATCATATAACGCCTATACTA
CTGTATTACATGCATTTTAAACGACTCCAGTCTACTTATCTTTGGGCGAA
AATTAGGTTAATTCAGGCTTTTATATTTTTACTACTTTACCCTTTAAATT
TCTCATATTTCTTAATAACTGATTCCAAATTTAGGTTTGTTCTTAAATTG
TTCTACTTATTTTTGGTATTTTTTAACCTTATTCTTATTGTTCTCAAGAA
ATTGTTCTATAAGAAAAAGGATTTAATATACTAATTTTGATATTGATTTT
GTAGAGGGAAAGGATGATGTGAAAGACAACGAAGAACAACATAACGCTAA
ATTAGCTGATGATTTGATAGAGAAAATTGAACACATGAATATAGAAGATG
AACCCGAACATCAACCCAAAGAGGTATAACCACTGATCTCTAGCTACTTG
ACTGGATCGGACTTTCCATTTAAAAGAAAGCGTGTACAGCTTTAGAGCTT
ACTAGTCCGCCATTTTGTTTTCAACTCTGGTCGTTAACAGCGCGATTCGA
ATGTTTTGAATTTCAAACGTTCGAAAATCTGAGATAGAAAACAACATAGA
GGACCAACGGACTTACAAACTGGACACACTTCAACGGAAAATCTGTGACC
TGTTAGTCTCTAGTGTGTAAAGGAATATGATATCTGTGAGCATTACGGAA
ATAATATATGGGCCATCCATATAGTACGTACGCAGTGAAGGGGGGAGAGG
GGGGTTTAGCAAAAGCGTACATCTATTGTTTAAATGACATCATTTCTATT
ATTCTCTGCGTACAAGGGGGAGGGGGTATCAAATTTTTGGAAAATCTTTG
CGTACGTACTATATGGACAAGCTAGAATTCAGAAATATTTAGCTGACCTT
TAAACGTAAGTAAGCAAAGTATTTTCATCTGGTGGCTGTATACGGCTGGC
TCCCAGTAACTTACCACATAGATCAGATTGCCCAATCTAAGCCATTGAGA
TGGCAGTGAACGGGGACTTAAAGATTGACGCTCTATAATTTGATTATCAA
GAATAATCAAAATCATCGAATAAGATAAAAAGCGCTGATTTACCGTCGTT
CTCAGTCAGTCAGGATGTAAACAATTTAGGAGCATACCGTCTCCGTCGTT
TAAAAATACAGATACATAAACTCGGTAATAACAAGGTAATGATAACTGTC
TTCCCAGCTGGCACACAATGTCGTTTCAACGTTTTTCTAATATTCACAAC
GTCCATATAGCGTTAGATGAACATCGAAACAACGTTGTTTGTCTGCTGTC
TTTAACACTATTGTTGTAATTGACCAATCAGGAGAAGCAAGACCACAATG
ATGATGAAGAATCTAACCAATTAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGTGGAA
AATGAAGATGGTGCTGGTGAATATGAAGAAGAGATGGCGCCAAGTATCCC
GTCAGTTGTCAGTAGAGAAAGCACCATGGTGAGAATAAAAGGGCTTTTCC
AGAAAAAACCGTGCAGCCCCTGTTGAGGAGGTCCAACCTTTTGAGACCTA
CCCCCTTGGAATTCCAGGCAATTTTAGGATCATACTCCTCTGGAATTCCG
AATTTTTACAAATTTTCAATCATTATCCCCTTGGAATTCTGCTTATTTTT
GACGGATTTTCGTCTACCCTTATGGAATTCCACTGCATTTCAAACCTTAC
CCCCTCGGAACGAAAATGGACCTCCTCAACAGGGGGTGCACAATTTTTTT
CTGGAAAAGCCCAATGAAAGTTTTTTTAAATTTGCAATTTTGTATTTTAT
TACTTCGATTAATGAATGATAGACCCTTCCTCATGTTTACATACAGTTAA
CACTCCCTGATTCGATTTCCATCAAATAAGGGAGCGTACCGAATAGCAGA
GCGTCGTTTATGAGAGTTTCTTGTTAACGATGAATTTCAGTAATATCGAA
TAATGGCGGAGGGTATTGAATAGCAGAACGTTATTAGAGAGTGTCATCAG
CACCTCAAAAGAAATCATGTTATGATTATGTTGCCTTAAAGGCTTTGCTT
TGACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACATATTTCATATCGTGACA
ATGTGTGTGTTATGCTGATATAAGCAAAAAATGTTTTTCTTTTCCTCTTT
CTGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGTCAATCCAATGCGAAAAAAAATTG
GGAATTAAAATTGATGAGTAAGCAAACGATATCACTCTTATTTAAAAACA
AAACCCTTAAAATCACTGTTGGGTTTTTAATTCGTTCGTTCGTACATTCG
TTTGGTCATACTTTCATCCATCCATCCATTCATTTGTTCGTCCATTCATT
CGTTCGTCTATTCATTCATATATCTCTTCATTTTTCTAGCTAACAGGTAA
CGAAGACGGACGTTTTGAGAGTGAAAACAAAACAATTCAATTCAACGAAG
AAGTCGATGTAGTGGTACGAAGTTTTCTCGTATTTTTTACTGTTACTTAC
TTTCTCCCTTCACNTCTTCATTTTTCTAGCTAACAGGTAACGAAGACGGA
CGTTTTGAGAGTGAAAACAAAACAATTCAATTCAACGAAGAAGTCGATGT
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CTATAAAACCTTTCCCCATTCTTCCAGCATTATGAGAAAGTTGAAGTTGA
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ATAAAGAAGGTACTCTTATCATTGAGTAAATTGTGGAGTAGGGTGATTAA
TTTTACTAATCTACTGTCAAGTAGTGTTAAGTGAAAGTCTTGCTTTAGTT
ATGATTAGGTTTGAGAATTAAGTGAGGCTTAAAGACTCTTTCAGAGACAA
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AGTCACAAGAGTAGCTCTTTCAATTTGATAATATTTAACAGCCAAAATGT
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AGAGGGTGCAAAGGTGGTGTATTGTGGATGTGGGCGTGGTTTATTATTCA
AATAGGCTTGGTTTGTTAGGAATGCGGTTTGGTTTGAATTTGACAACCAC
TTTTTAAAAGACTTCTAAAGATGAAATATAGTTTAAAAGTAAGGGTATGA
TCTGAGGGGTTTTCTCAGCAAGCACTTTCCGAACAGGGACACATTTTCGG
ATTTTTAAGACCACCCCCTTGTTTTGTTTATCAATGTCCCTCTCTCCAAG
CTTCTGTGCATTTTCTCCTCTTTTTTTTCAGTTGATTCAGTATAGAAAGA
TATGAAGCTTGCAGAAGACTGTACGTTGCGAAAGGATTCAGTTAAAAGGA
CTTTTATTATAAAAGTGTAAACTGAGTAATTGATAACAATTAATTTTAAC
ACACTATTAACCCACTTAAAATTACAGTCAACTCTCTCTAATTCGAACTT
CCGTTGCTCGAATATTTCTAAAATTCGAAGAAAATTTTCCACTTTTTGAT
TGACAATGGTATCCTTAGTTTTTCGAATGAACACTCCGTTAGATTCGTAT
CCTTCTCTAGTTCGAACTCCTTTACCCTTGAAAATCGAATTAGAGAGTCT
ACTGTATAATATAGAGATAACTAAATTATTTTATTATAAAAAGCTAAATC
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TTTGTTAAGTTACGCAATTTCCGCCATNTGTGGTATGATAATTTAAAGAG
GTTTTTCATGCTTTGTAAACTTACGTAACTTCTGCCATTATGGGAGCAAA
CGTTCGATTTGCGTAAGGTATCGCCTTTACAGATTCGAACGTTTGCTTCC
ATAATGGTGGAAGTTACGTAATTAAAAAAAAATTGAAAACCTCTATACAG
ATTGTAAATAAATGAATTAAAATGCGATATCATTATTTTGTTTTGTTAAT
TGTTATAAAACTTGTAATTCACTATTATCGTGTATTTTACCTGATTTTAA
ATCCTTTTTTAATTTAACGTATTATACTATACATAATATAAAGATTTTTA
ACAACATAGTAAGAATATATATTATTATCGATCATGATTTAACATTTAAA
CACAAAGTACTTTTTTTTCATCTTGGTATATACAGTGTGTCCGGGAAAGA
GTGGATATTCAACTCTTCCTAATCAAGAGAATTTACATTGGTATGCAAGA
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CCCGGGAGTTTGCAACTAAAGTCTATTCACGATAAGTGTGCACTCTTTTT
TTTTATAGCACTTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTTCTTCTTCATTTTCA
TCTTCATTTTTAGAATTTTTTTAAAGACTTTTTTATTTCAAATTGTTCCA
CTCACAAATATCTCTCCAACGATACCAAATTTATAAAGATTGAAGAATTC
CTTCAAAAGTTATAGGTAAATGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAATA
GACTTTAGTTTACAATTAGTGGCAAACATCCGGTCTTTTTGGGTGCTTCC
GTATAAAACATTACGTCATGAATATCATGAATTGAGGTTCAAGTCGAGGG
CTAGAGACAAATCTTCAAACTTTCTCAAACAAGAAATGATGAAAACTTAA
AATTTGCCTTGCATCTTGGTTGACAGATTGAATCTTCCACATTCTTTGTT
TTCGCGTTTCATATTTTTCAAATTTGGGTGGTAAATGTTACTTCTAATCC
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TTTTCCGGACACACAGTAGTTTTGAAATATCCATTCCTCCACTCCATCTA
ATTAACATTAATTTTAAACTAACTTAACACACTTGTTAAAAATTCTTCAC
TATTCATTAACCGACCCGTAATAATTTTCACTGCCAAAAGCTTTCCATAT
GACCATATCAACCTTTCCAGTTTTTAACAATATTTTCTTCACTTGCTGCT
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CTCTGACCCGATGACACTATAATCACTATACGCCCCTGTCTAACAGCCAC
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ATAGCTTTGGAGTTTCAATTTCAAATGAGGATGAAGGCAAGGTCAATTTT
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GAAGACAAAAATAAGCGTCTCATTCACCTTATTGAAATGACCTTGGTTAT
AAATTATTAAAAAGATACCCCCTCCTTTTAAGCGCCCCTCGAATTACCGC
CCCCTTACAATTATAACGGGCGTTTATTCGTAATACGGTAATGTAAACTA
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TTTGATTTTGCAAATTACTTCCTTTTTTTTAAATCACAGATTACTGGGTC
GCGAAAATACCTATTAGGGAAACTAATTTTGTCGAAATTGATAAGTTTAG
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TCCGGCCAGAATTTTGTTATTAATCATATTATCATAATCATAAATACTAT
TTAATATTACCCATAATTCGTTGCAAATTTGAAATTAATTGATTGTTAGA
TAAAAATTCGCATTACTGTATATCATTTTTTTAGAAGAAGACTTTTCATT
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TTGTGCCTAAAAATGTTCTAGAGGAGCAATGAAGTTTTTTTTAATTAATT
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AAAAATTTTAACTTTATGAAAAATTAAACAAAATTAATTGAGGCTCAGCA
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TTATAAAACTGTGTATGTCTAAAAGTTAAGAGCTCCTTAGCATGCCCCTC
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CGAAAGCAGCCAAAAAAGACGGGCATGTTTGCCACTAATTTTGAATTCTA
ATAAAAAAAACTAGTGGTAAAGTTCGGGCTCTTTTTGGTGCTTCCGTATA
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TGATATGTGTTTACTTTGAGTTGAAAAATGTATAATAATGAAAAACATCT
TTGAAAAATATTTTAATTATTCAACTGGGCTATTTAATGAAAGCTAGTTC
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TATATTGATAGAAGAGTGTGATTTCATGATAGCTTTTAAAGGTTTTATTT
TTACATAATTGTTTCCGTTTCATATCAGACACATATTTCATATCAGGACA
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TTTCTTTTTCTCTTTCTGGCCAATCTTGCTCCACATTCGTGTCAATTTAA
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TCTTAATGGGGATAGAGATTCTAATTGTTCCAAGCTTAAAAAATCCAGTG
GGGATGGTTTTTGAGGGTGCAATTTTTTACAATGAAATTTGAATGTGGAT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_031446	XLOC_031446	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00049596 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ERIC3 (Glutamate-rich protein 3 OS=Homo sapiens GN=ERICH3 PE=2 SV=1)

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            H+  + S A +TM +LG N+ L+SD    +   EI+V QQHCG   +CV++  +     F F+S+RH G PF LT  ++G++  R+SSCCEYKH+ G RLGGK   FG + V+ ++PCY+C + +
Sbjct:  279 HKTSLHSNAAITMIYLGKNVHLSSDN--PDFRDEIKVYQQHCGGENLCVYKGKLLEKETFQFISKRHHGFPFSLTFFLNGMQVNRLSSCCEYKHRKGSRLGGKRGYFGFVCVERSSPCYKCIIAM 401

HSP 2 Score: 122.094 bits (305), Expect = 2.411e-27
Identity = 58/119 (48.74%), Postives = 85/119 (71.43%), Query Frame = 3

Query:  516 SYTAGQFANYNSLTDKNLSGYFANTQMRKHLVRSGLITKNGKITSENSYRLKIAKREHREHVKDLLATAIVEKALDMERMRQYEIRKKLDELYKIELVNKVRSERGGKSKEELYALLSP 872
            S+ AG  A YNSL DK+L+GYF NT++R+HL+RSGLIT++G+I SE  Y+L + KR+H++++++ LA AI  K LDMER  Q EI+KKL+ L + E + + + E   +S E    +LSP
Sbjct:    4 SHPAGLLAAYNSLMDKHLAGYFNNTRIRRHLLRSGLITRSGRILSEKEYKLNMMKRDHQKYIRECLAQAIFHKVLDMERYHQLEIKKKLETLARKERIQRFKGEHTRRSVENNMPILSP 122

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00049596 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00049596 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
ERIC3	1.890e-30	43.20	Glutamate-rich protein 3 OS=Homo sapiens GN=ERICH3...	[more]

You are here

TCONS_00049596 (transcript) - C. hemisphaerica