TCONS_00050083 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00050083
Unique NameTCONS_00050083
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2552

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00050083 ID=TCONS_00050083|Name=TCONS_00050083|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2552bp
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ATCAAATTCGAAAAACTTGACATAAAATGGGTTGTGGCTCCTCAAAAGTT
GCTGTTAGTACAGTACTCGTAAATGGCACACAGGACGGCGCCATACTTAA
AGATGCTAACGGAAATATCACACAATCAAAACCTATTGGTTCTAATGAAA
AAGAGAGACTTGGCTCTCAGCTAGGATCAAGTAATCGATTAGGTCCTGTT
GAAAGTCTTGGTATTTTTCGAAAACGCAAGAAGAATTTGTATCAATCTCT
GGATGTCTTTGAACAAATCGATCAACGTTCTGTCACGGTGCCATCTACTG
TTTCAAGGACTGCTCAATCTTTAGTTCAATATTTGACTGAACCTTACGAA
GCACCCCTATTCAAACTACGTGCAATCTGGATATGGGTCACTCATAATAT
CTCCTATGAcgtcaattcttttttcaatccaagtgaaaagaaaagctcCC
AGTTAGATGCATCGGACGTGCTATCAAGCGGAAAAGCTATTTGCTCAGGT
TATGCTAATCTGATAAATGTTTTAGCAGAatcagcTGGAATTAAAACTGA
GCGCGTGGATGGTTGGTCTAAAGGCTACAATTATCAATATGGTCAAAAGT
TTGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTCGTAAAACTGAACAAT
GATTGGTGGCTGCTAGATTCAACATGGGGCGCTGGCTACGTAGACAAAGA
GAAGAATTTCGTACGACAGTATAGTGAACATTATTTTCTAACGGATCCTA
AACAATTCATTTTCGATCATTGTCCGACAGACATGCATTGGCAACTATTG
GAAGAAATGATCGCCGTTGAACGGTTCGAAAATTACGCTCGAGTTACGAA
ACATTTCTTTCGCctcaaaatgaaattattttcacatcaaaacgGAATTG
TTGTATGCGAAACTGGCCGTTTACATCTTAAGTTCCGTATTGATAAAGAT
ATTCCGATAAAATGTACCGGAAAATTATCGGAAGTTGACGGAGATGTGGA
TACGGATCAATACATTCATGTTTATTCGACAGAAAAGACGCTTCACGTTT
TAGTCGATGTTCCTCGCGTTGgacaatttgatttgaaaatattcgCACGA
GAACTGAACTCAGAGCAGAGCAATTTGAATTTAGTATGCAGGTATGCGAT
CACGTGTACTAATAAATTGGGACCGAGCTCAAGTTTTCCTAGACAATTCA
AAAGATGGAGTCCAGGCTTTTATTTACATTCTCCAACTGATGGTGTTTTG
TATAACGGTGAAACGTACAAGTTCCGAATTAGTTTACCGAATGTTACGGA
AATGGCAGTTTGTTTGGGTGGAAAGAATTCTACATGGGAACGCATTCCAA
ACAGTCGAGGTGCATTATGGGAAGGTGAAATCACGCTTCCTGATTGGGTG
GAACGAGTGAACGTGGTGGCacgttttgaagaaaaaactcCTTTCTCCAG
TCTTTTGGAATACAAAGTCGCTGAAAAGGATTGGGCaattgaaaattgtg
aaaatgaaCATTCATAATATTCGTGATATTCATttcgtaatgttttctac
ggaatcACACCggcaatttttaaacaatttttctcCAGATTGAATTTACC
ACTACTGGAAAAAACCGAGGTGTTACCGtagaaaatattacgtcatgaat
acatccccttctcacagacccggtagcattttttaagccagtggggataa
aaataacggactaaaactcgatggggattgatattcccatattttttatg
gctgaggatttcaattcttttgtttttaagtcagaaaattcagtgggaat
gggaaaaatagtaaatattttgcagtgaggattgtttTTTTAATCCTTTT
CGGtgaggacaaaaattggaggataattttccaccgggggcgatattttg
gccaatttttccagtgggaaggggtcccagtgggtcaaTGAGGAAGGGGT
GTATGAATATAATGAATCATACAAATTACgaattttgagatgtttttttt
atcattcgTTAATAAGGAAGTCTCTTATATTTGTTAACAAGGAAAGCTAC
CCCAAGGAACCGATCTCCACGCAAATTTCTATATTTGAATATACTTTAAT
CTGCAAAATATTCCGGCAAAATTTGCCCCGAGGATGTCTCAGAAGAAAAC
CGAAGATCAGCTTTTTCTATAATTTATGATTTTCAGCAGTCTATAAATAA
TTTCATTTACAGCATTTATACATAAAAATAATgtgaaaatctttctaaaa
ctAAGTTGATACATTATTGATTTTTATTGGTCTGGTTATGCATCAGTATA
CTGAagtgattttatatttttaaatagtttaaagtttgttttaaatatta
attggttttaaatttttgattgttgtgctattttttttttaaattcaaac
aaTGTAAATAGTTAATTTAGATGCtatttttatacatcaaaagatCAAAG
CATAATTGGGAAAGCGAAAACTCAAACTGGTATGATTAATccaaaaaata
tc
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_167:947391..957819-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00050083 ID=TCONS_00050083|Name=TCONS_00050083|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10429bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_167:947391..957819- (Clytia hemisphaerica)
GGTAGTGGTGGAAGTTGGAAGTGGTGAGTAGTGTATAATTATTTTCCTGC
TTTATAATCTCATAATCTCAGGAAGCTTTTAGCACCAGTGAAAAAATGAC
TAAACTTATACTTTTGCTGCTCTCTGCTGCATGAACAGGGGAATTTCAAT
GTATATAACTACTTTTCACCAAATTAAACTAATCAGCTAATCACACATTT
GAAAGGTAGGTTCTTGATTACATCACATCCCAAACCAAATGAAGCATTGT
ACCGTGAAGTCCATAACTTGCATCAGTAGTGGAGAGAAAGTTTTGTTGCA
TCGCCCACAAATGAATGACCTGGATGGTCATTAAAATACAAAGTTAAATC
AAAACAAAATGGTTGAGTCGAACTGCGAGCGGAGCAGCTTTGATTGGTCA
GTTATTTGATGGCTATCTATGCAAGTTTCCCTCCACTGATGCGAGTTACC
CGACACGGTACCATTTTAGAGAATCTCATATTTGCCGTGCAAGTAATTTT
GGCAAGTTACTCGCCGACAGAATCCCGGGTAAATGAAACAGCATGGTTGG
ATAATAAAAAATCATGCGAGATCATGCATTTCAAGATGGCAGGAATTCAG
ATGTTTCTCGATGGGCTGCGCTGGGACGTGCAACCTCAAATTTAATAATG
ATAATATTAAACATATATGATGCATGACATCACTTATGATTAGGGGATAT
GTATTTTCCACCTGCAAATTTTGTAAATCAGGTGTATGCAATGACTTCAG
GGTAGATAAGAGCTGCAAGCGGAGCTGCATAGTTCATCGTAGTTCATTTG
TTTTGAAATTTTGCTGCTTTTACTGGTCAGTCATTTGATGGCTATGCAAT
TTTCCCTTCATTGATGAAAGTTACCCAACTTCATGGTATGGTATTGACCA
TGAAATTCCGGTGTCAGTACAGGTCATGTCACGGCCCGGTTGTTCAAGTA
AAAGTGGATTAGTGGCTGATAAGCTTAAATTTTTCCAAAAATCTCTATTA
GCGCTGATTAAGACAGGCAACAGAATCCACAGTTGTTAGGAAAAAAATTA
GGCTAAAAGTTGTGATTAAATTCCGATTAAATAGACCAAATTTTAATCAT
TCTCTGACCCACAATAAAGCTGTTATATATATTATGTTATAAATCATTAA
AAGCAGAATCTTGAGTAGATTTTTATTCTTAAGAAGTGATGGCTTAAAAA
GAACTTACAAAATCAAATTATGGTTTGTTTGACCTAACCTAACATAAGGT
TAGCCCTGTATTTGCCTTAATTTAAAGATTAAGAAAATGCTGGGAAAAAC
ATTTCTAATTACTTATTTCTACTTTCTACTATTATGTCCTCTAGTTGCTT
AAATGAGTTTGCAACCAAAGTGGAAGGCAAGCCAAAGGCTCTAAGCTATC
TACCCAAAGGAAAGGGAGGGTTTTGGATGAACAACCAGCTGTAAGATCAT
CACATTTTCCATCTCATAGTTTTGTTATGGTATTAAAATCAAACTTATAT
TTTTGCCACCAATATTAAGTAAATCAATTAGTTGTAGGCCATACTCTGCT
TAGTTTTATCAAAATTTCAATATTTGAACCTGTACTTTGATTGGGATAAA
TCTGCGCGAAAAATTCCAGAATGTGGAAATCACGAAATTTAGTACTGACA
GTACTTGTGAAACACGTTTCCATGAAAAAATTAGTACCCACGAAAATATA
TACAATATCAAAAATAGATATTGCAGTTTGTTTATTCTGAAATTTTAAGA
TAGAAACATAATTTTAGAAACACACAATGTCTTAGTTATTCATTTGAAGA
AAAGATTTATAATAAGGACTTAAAAAAAATGTTTCCTTGGATTTTCATTT
CTATTGTAGTTTCCATATTAAAACAACTTATACAAATAAGTAATTCTGTT
TTGTTTTTGCTTTTTAAAAGACTTTTTACTAGATCAGATATATGGTACTT
TCTTTGATATAACTATATTAAGGGGAAAGATATTCCAAATCATTTATCAA
ACAGTGCAATTTCAAAAGCAAACTTTTTGCACCTTTTTTCTGCTCTATCA
TATTTCATCTAGTTGCAAATTTTTTGTTGCTATGGTAATATCTTGTTTAT
TACTTCTCAAATTGGATAGGACAGCGGATACAAAACCATCACTCTGGCTT
CACTGTGTACATTTGGGGTAAAATAAAGTGATTTGGCTAGTTTGAATTCT
CAAATGGTTAGGGCACTTGGTGTCTCGATATACTTGTTTTGTTCAAGACT
TTTTAATGTACCTTAATATTGAATACACCTGGACCATTTCTTCAAGAAAG
GAATCTATTTAGTTTGTATCTGAGAAAAAAAACTCCTAAAAGACCTATCC
ATCTCATTTAAAATTGCATTGAAAATACTGTATCTGATGATCATGTAATT
GTTTTTTTGGTTTAATTTCAGCTTGCTTGGCCTTGTCTAATGAGGAATTT
TATATTCAGAAAATATTTTATTTTTACGGATCTTTTTCTTCATAGAATCA
CTTAATTTGGAGTGTCCTAAACAGATGCTTTGGATTTAAAAGTAGCTTTA
CTTTTGGGACTTGATAAGGGAATGTAGGGGAATCAAGTCTCTATACGATG
CTTTGATTTAACACTTTTATTTGAGTTTGGATTTGGAGATGTGTACAGGA
ATATCTTTTAATAAATTAATCTATCTTTGAAATTATATGAGTGATTTATA
TCTAAAAAGCAGTATGAAAATTTTATTTTTCAATTAATAGAAAGCCCTCT
GCCTACCCTATGCTGGTATGGTCAAAAGGAATTTCATTTTAGGATTTGTG
CATAATTGATATTCTAGTTCCAATAGAATCGTTCTTATTGCTTTACTGGT
CAAAATCTGGTCTTTATTATAATCTTGTTCTTTTCAAGTATTAAAGCGAA
TCTTTTGTTTTAAGAGGTTTTTCTATCGAAATAAAGTTTGAGAGAGAGCT
TAATGTAAGAGGAACCTAGCCTATAGGAGTATTTCTGAACTTCTAAACAA
ACACTATATTAGAACCTTGGCTGAATAGGATCATCATCTTCAATTCAAGT
AGACTATTTCATTTTAAGGTATTTAAACTCAAGAAAGTTTGCTATTACTT
CTATCATGAAGCATAAGTCATATAGTCTATGAACAGCTTTTGGATGTCGT
TCTACACAAGGGAAGTTACAAAACAAACTCAAAGTTTCTTTGACAAAACA
CTCCTTCATTAATTTGAGTACCTTAATGGATCAGTTCAAGGACTACTAGA
ATCGCTTAAGCACAGCATGGGAAAGTTTGTCGATATGTAGCGAGGGTACT
TGAAAGTCTAGGTTTTATTTGCACTTTAGATATAAAATACTAATGACAGA
ACATTCTACTTTTCATATTTTTGCTTCTTTTATAATTTTAGAAGTAAAAT
AATGCAGAAATCAAAGATATCAAATTCGAAAAACTTGACATAAAATGGGT
TGTGGCTCCTCAAAAGTTGCTGTTAGTACAGTACTCGTAAATGGCACACA
GGACGGCGCCATACTTAAAGATGCTAACGGAAATATCACACAATCAAAAC
CTATTGGTTCTAATGAAAAAGAGAGACTTGGCTCTCAGCTAGGATCAAGT
AATCGATTAGGTCCTGTTGAAAGTCTTGGTATTTTTCGAAAACGCAAGAA
GAATTTGTATCAATCTCTGGATGTCTTTGAACAAATCGATCAACGTTCTG
TCACGGTTGGTTTCTTTCAGCTTTCCATCCTAGAACGATTGAATTTTCAT
AAAAACGCCCTGTTCAGTTTTGCTACCTTAAGGGAACTTATTTTGGCGGG
AACTAATTTTGGCGAATTTGGCGAATTTAGACGAAATTCGCCAAATTTAG
TTCCCGCCAAAATTAAATATTTTGCTCACTCGCCAAAATAAGTTCCCGCC
AAAATTAGATTTTTTGTTTCCTTGCCTAAATAACCCCTGAAATTCATCAA
AATTGCTCAAAATAAGGTAAAATAGAACAGATTTACGCTGTCATTCGCCA
AAATTGGTTCCCGCCAAAATTTAAAAAATTCACTATTCGCCAAAATTAGT
TCTCGCCAAAATTAAAATTTTTAAAGATTTTCACTGCTCGCCAAAATTAG
TTCCGGCCAAATAAGTTCCCTTAAGGTATATATTTTTTAGGAAATGTTTT
ATTCGTGTAAAAATCTGCTTGTAGAATCACAACAAATGTGCTTATAAGCA
CGCAAGCACGCCTTAGATACCTTTAACCACCACGGACTTATTCATTTTTT
TCTATGTTCAACTGTTATATATCTTTTGTCAAACGATGCAATTAACGTGC
AAAAGAGATTAGCGCAAAGGTTGATGGGATTGGAACTCGTACAAACACAT
CGAGAGTAATGATTATGTCAAAAGTAAAATCTATTTTTAGATTCAGCACG
GTGCGCTATTTAAAGTCGGCATTCGGCAGTGTTGACCCAAAAAGCGACTT
AAGTATGAGTAGAGTCATCATCAATTCTCTCGAAAACCGAAAATAAATTG
CCCAAAAAGTCAATCATCTCCTAATGCATATCATAGGAGTAAGTGACAAG
CAACCATCCACAGCCTTAATAAATAAAATTCCGACCTAAAACTCAGACAC
AGATCGAAAAATTTTTGCGGGCCTTTTTGTACGTTTCGACGCACTTTTAT
TGATTTACACATCATTTCTGTGTCTAGCTATGCAATCACTAGCCTATACT
AGACGTCACCCGCGTTTGTTTTACGCAATTAAATCGTCAAAGTGGAACTC
ACTAAGAAACGAGATGAAAAATCCCGGTTTTTAGTGAGGTGCTCGCTATG
CAATCACTGGTTTATTAGCCCATACCGCTAAAATATTTTTAATTTATTTG
GTTTGTGCTTTATTGTAGGTGCCATCTACTGTTTCAAGGACTGCTCAATC
TTTAGTTCAATATTTGACTGAACCTTACGAAGCACCCCTATTCAAACTAC
GTGCAATCTGGATATGGGTCACTCATAATATCTCCTATGACGTCAATTCT
TTTTTCAATCCAAGTGAAAAGAAAAGCTCCCAGTTAGATGCATCGGACGT
GCTATCAAGCGGAAAAGCTATTTGCTCAGGTTATGCTAATCTGATAAATG
TTTTAGCAGAGTAAGTTGCTTTTATTTTGTTTTGTTAATTGTACCTTTTG
GTTGTGTTTCATAATGAGTATCAACAAAAAGCTTCCTTTTGGTTTCTGAA
ATTCTGCCCCTATGCAACAACTTTTTTTAATATGTGCTGTTTTATAGTCA
ATTGTTGCTTTTTGAGTGTATTTTACTATTATAGGGAATAAGGGGCTGTA
AATTTGTAGTTTGGTTGAACTATTATGAAAAAACATTCGCAAATGTTGTG
TTAATATCCCTTAAGTAGGAGATCCGCCTCTAGACGTCGGCTAAATTTTA
TTGTTTTGACACCCCTGTCTCAAAGAACTTACCAGTGGATACCCTTAAAA
CCACATACCCCTTAAAACCCACAATGTTGCATTTTTGGCTTTCATAACTA
CCAGATTTAATTTTATGTNNNNNNNNNNNNNATTTATTTGGTTTGTGCTT
TATTGTAGGTGCCATCTACTGTTTCAAGGACTGCTCAATCTTTAGTTCAA
TATTTGACTGAACCTTACGAAGCACCCCTATTCAAACTACGTGCAATCTG
GATATGGGTCACTCATAATATCTCCTATGACGTCAATTCTTTTTTCAATC
CAAGTGAAAAGAAAAGCTCCCAGCTAGATGCATCGGACGTGCTATCAAGC
GGAAAAGCTATTTGCTCAGGTTATGCTAATCTGATAAATGTTTTAGCAGA
GTAAGTTGCTTTTATTTTGTTTTGTTAATTGTACCTTTTGGTTGTGTTTC
ATAATGAGTATCAACAAAAAGCTTCCTTTTGGTTTCTGAAATTCTGCCCC
TCTGCAACAATAGTACCGTGGTTACGCCCCAATAATTTTTTTAAGGATAA
GTTTTTTCCTCATTTTGTCATTTAAAGACTTTTTAATATGTGCTGTTTTT
TAGTCAATTGTTGCTTTTTGAGTGTATTTTACTATTATAGGGAATAAGGG
GCTGTAAATTTGTAGTTTGGTTGAACTATTATGAAAAAACATTTAAGTAG
GAGATCCGCCTCTAGACGTCGGCTAAATTTTATTGTTTTGACACCCCTGT
CTCAAAGAACTTACTAATTTTTCAGTTGTTTTAACTTTTAACGTGAATAA
TAATGCTTTTTCATTAAATTTCCTTTTTTAATGAATTGGGGTTTTCAAAA
AAATGTCATTCCAGTGAGAATAAGAACCCAGTGTACTTCCCAAAGATGTT
GAAAATATAATTATCTCACCGAAAACAAGTGTTTGGTCGAATTTTCCTCT
GGTGTAATAAAGGTAAAAAATTGGTTTCTATTATTTTACAGATCAGCTGG
AATTAAAACTGAGCGCGTGGATGGTTGGTCTAAAGGCTACAATTATCAAT
ATGGTCAAAAGTTTGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTCGTA
AAACTGAACAATGATTGGTGGCTGCTAGATTCAACATGGGGCGCTGGCTA
CGTAGACAAAGAGAAGAATTTCGTACGACAGTATAGTGAACATTATTTTC
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GTGAGAATAAGAACCCAGTGTACTTCCCAAAGATGTTGAAAATATAATTA
TCTCACCGAAAACAAGTGTTTGGTCGAATTTTCCTCTGGTGTAATAAAGG
TAAAAAATTGGTTTCTATTATTTTACAGATCAGCTGGAATTAAAACTGAG
CGCGTGGATGGTTGGTCTAAAGGCTACAATTATCAATATGGTCAAAAGTT
TGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTCGTAAAACTGAACAATG
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AGTCGATGTTCCTCGCGTTGGACAATTTGATTTGAAAATATTCGCACGAG
AACTGAACTCAGAGCAGAGCAATTTGAATTTAGTATGCAGGTATGCGATC
ACGTGTACTAATAAATTGGGACCGAGCTCAAGTTTTCCTAGACAATTCAA
AAGATGGAGTCCAGGCTTTTATTTACATTCTCCAACTGATGGTGTTTTGT
ATAACGGTGAAACGTACAAGTTCCGAATTAGTTTACCGAATGTTACGGAA
ATGGCAGTTTGTTTGGGTAAAAAGTATTTCTGCTCTATCGGTCTTTTCAT
CACTTATATCACGGATAACATCTGTCTCATCTTCAAACAGTGTCCAATCT
TTCATTAATGAAAAGAATGTACCTCCTAGAAACTTTGATGGTTGTCATAG
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TCGGAAATTGAAAAAACCAGCGATGTGAAATAAATTTATGGCAATCTTGC
TTCTAGCGCCAGATTAGGAGTGGTTCTGTCCTGAATTTTGAGTTGGTCAA
AATTCATGGCAAAGAACTAAAATCCTCGACATTTTAATTTCGGGAAAACC
GATCAAAGAATACCTTAGAGTGTGTTTTATAGCATTGACAAACGCAGCCC
TTTATTTAGAAAAGAAAATTTCAATCGACCTTTCGAAAAACAGTTTTAAA
TGTTACAAAATTTGTTTTTCTTGAATGATTTCTTGANGGCTACAATTATC
AATATGGTCAAAAGTTTGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTC
GTAAAACTGAACAATGATTGGTGGCTGCTAGATTCAACATGGGGCGCTGG
CTACGTAGACAAAGAGAAGAATTTCGTACGACAGTATAGTGAACATTATT
TTCTAACGGATCCTAAACAATTCATTTTCGATCATTGTCCGACAGACATG
CATTGGCAACTATTGGAAGAAATGATCGCCGTTGAACGGTTCGAAAATTA
CGCTCGAGTTACGAAACATTTCTTTCGCCTCAAAATGAAATTATTTTCAC
ATCAAAACGGAATTGTTGTATGCGAAACTGGCCGTTTACATCTTAAGTTC
CGTATTGATAAAGATATTCCGATAAAATGTACCGGAAAATTATCGGAAGT
TGACGGAGATGTGGATACGGATCAATACATTCATGTTTATTCGACAGAAA
AGACGCTTCACGTTTTAGTCGATGTTCCTCGCGTTGGACAATTTGATTTG
AAAATATTCGCACGAGAACTGAACTCAGAGCAGAGCAATTTGAATTTAGT
ATGCAGGTATGCGATCACGTGTACTAATAAATTGGGACCGAGCTCAAGTT
TTCCTAGACAATTCAAAAGATGGAGTCCAGGCTTTTATTTACATTCTCCA
ACTGATGGTGTTTTGTATAACGGTGAAACGTACAAGTTCCGAATTAGTTT
ACCGAATGTTACGGAAATGGCAGTTTGTTTGGGTAAAAAGTATTTCTGCT
CTATCGGTCTTTTCATCACTTATATCACGGATAACATCTGTCTCATCTTC
AAACAGTGTCCAATCTTTCATTAATGAAAAGAATGTACCTCCTAGAAACT
TTGATGGTTGTCATAGCATTGACAAACGCAGCCCTTTATTTAGAAAAGAA
AATTTCAATCGACCTTTCGGAAATTGAAAAAACCAGCGATGTGAAATAAA
TTTATGGCAATCTTGCTTCTAGCGCCAGATTAGGAGTGGTTCTGTCCTGA
ATTTTGAGTTGGTCAAAATTCATGGCAAAGAACTAAAATCCTCGACATTT
TAATTTCGGGAAAACCGATCAAAGAATACCTTAGAGTGTGTTTTATAATA
TACATGCCATTATTTTATTTCGTTTGCATTTATTTTCTTGACAGGTGGAA
AGAATTCTACATGGGAACGCATTCCAAACAGTCGAGGTGCATTATGGGAA
GGTGAAATCACGCTTCCTGATTGGGTGGAACGAGTGAACGTGGTGGCACG
TTTTGAAGAAAAAACTCCTTTCTCCAGTCTTTTGGAATACAAAGTCGCTG
AAAAGGATTGGGCAATTGAAAATTGTGAAAATGAACATTCATAATATTCG
TGATATTCATTTCGTAATGTTTTCTACGGAATCACACCGGCAATTTTTAA
ACAATTTTTCTCCAGATTGAATTTACCACTACTGGAAAAAACCGAGGTGT
TACCGTAGAAAATATTACGTCATGAATACATCCCCTTCTCACAGACCCGG
TAGCATTTTTTAAGCCAGTGGGGATAAAAATAACGGACTAAAACTCGATG
GGGATTGATATTCCCATATTTTTTATGGCTGAGGATTTCAATTCTTTTGT
TTTTAAGTCAGAAAATTCAGTGGGAATGGGAAAAATAGTAAATATTTTGC
AGTGAGGATTGTTTTTTTAATCCTTTTCGGTGAGGACAAAAATTGGAGGA
TAATTTTCCACCGGGGGCGATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGG
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AATTACGAATTTTGAGATGTTTTTTTTATCATTCGTTAATAAGGAAGTCT
CTTATATTTGTTAACAAGGAAAGCTACCCCAAGGAACCGATCTCCACGCA
AATTTCTATATTTGAATATACTTTAATCTGCAAAATATTCCGGCAAAATT
TGCCCCGAGGATGTCTCAGAAGAAAACCGAAGATCAGCTTTTTCTATAAT
TTATGATTTTCAGCAGTCTATAAATAATTTCATTTACAGCATTTATACAT
AAAAATAATGTGAAAATCTTTCTAAAACTAAGTTGATACATTATTGATTT
TTATTGGTCTGGTTATGCATCAGTATACTGAAGTGATTTTATATTTTTAA
ATAGTTTAAAGTTTGTTTTAAATATTAATTGGTTTTAAATTTTTGATTGT
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CTATTTTTATACATCAAAAGATCAAAGCATAATTGGGAAAGCGAAAACTC
AAACTGGTATGATTAATCCAAAAAATATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_031711XLOC_031711Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00050083-exon-scaffold_167-1510915933:947391..948575TCONS_00050083-exon-scaffold_167-1510915933:947391..948575Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00050083-exon-scaffold_167-1491911889:950204..950991TCONS_00050083-exon-scaffold_167-1491911889:950204..950991Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00050083-exon-scaffold_167-1491911889:947391..948575TCONS_00050083-exon-scaffold_167-1491911889:947391..948575Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_167supercontigscaffold_167:947391..957819 -
Expression

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Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	5.02042e-06	5.44263e-10	0	0.0147138	1.10989e-06	1.18468e-05	2.71569e-05	2.77056e-08	2.2451e-09	8.08847e-06	0	0	4.46165e-06	0	3.5907e-08	2.38717e-08	1.82218e-05	0.014762	1.29073e-08	0	0	0	0	0	0	6.40422e-10	0	0	1.38016e-08
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00050083 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: KY (Kyphoscoliosis peptidase OS=Homo sapiens GN=KY PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 141.354 bits (355), Expect = 4.254e-35
Identity = 83/220 (37.73%), Postives = 115/220 (52.27%), Query Frame = 2 
Query:  269 RKRKKNLYQSLDVFEQIDQRSVTVPSTVSRTAQSLVQYLTEPYEAPLFKLRAIWIWVTHNISYDVNSFFNPSEKKSSQLDASDVLSSGKAICSGYANLINVLAESAGIKTERVDGWSKGYNYQYGQKF-GDMSPNHAWNVVKLNNDWWLLDSTWGAGYVDK-EKNFVRQYSEHYFLTDPKQFIFDHCPTDMHWQLLEEMIAVERFENYARVTKHFFRLKM 922
            R   K++   L  FE++D  +  V  T       LV  L +     L ++RAIWIW+ H+I YD+ +     EK       +D+L + K  C GYA L   +   AG++   V G+SKG+ YQ GQ F G+   +HAWN V L   W L+DSTWG+G VD     F   Y+E YFLT P  FI DH P + +WQLL+   ++ +FEN       F+   M
Sbjct:  139 RSSLKSMSLDLQQFEKLDIYASQV--TAKSGLDELVSDLLQEAHTDLERVRAIWIWICHHIEYDIAA---AQEKDRQAFKPTDILRTQKTNCDGYAGLFERMCRLAGVQCMTVPGYSKGFGYQTGQSFSGEF--DHAWNAVYLEGRWHLVDSTWGSGLVDTITSKFTFLYNEFYFLTHPALFIEDHFPDNKNWQLLKPPQSLRQFENNMYHKSEFYNKGM 351
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00050083 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
KY4.254e-3537.73Kyphoscoliosis peptidase OS=Homo sapiens GN=KY PE=... [more]
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