TCONS_00050205 (transcript) - C. hemisphaerica

transcript sequence

>TCONS_00050205 ID=TCONS_00050205|Name=TCONS_00050205|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5261bp
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GATTCCCCCCTAACCAGCTGATTCCCCCTACCCAACTGATCCACCCAGCT
TATCCCACCCAAGCCAGCCAATCACATTTATACAGCTGATCCCATCTCAT
CCTTTCCCAATGAATTCCCATGCATCCATCCACCCAGACGATCCCACCCT
ACTACCCAGCCAATCTCATCCCTTCCCAATGAATTCCATACATCCATCCA
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GCGATCCCCAACCTATCCTGCAAATTCAACCCTATCCTGCCAAATTCCAC
CCTACCCCCTACCCTGCCTAATATGCATCAAATTCCATCCATAGATCAGA
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CTAGCCAATCCCTACCCTATAACCAGATGATTCAGTGTTGGCTGATTTTA
CCCAACTGATCCTCCTATCTATCCCATCATCCCAGTCCAGGCCAGATGAT
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CATGCAGTCCAATGCCATGCAGGATCATCATCTGCAGTACCAATTGGACT
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CTGCCTAGGTAGGTGGTGTGATCACACGATCCTGTTGTCCATCCACCACG
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caccattgctaaggcatatgatgatctgaaaagtttctccagcgaaattt
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ggaaaatgaaagtgaaagtcaaaacaaaaaaaattttttttacaaacagC
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TTCAGTTAATTAGGCAGACGTGTATATTTTGTGGTGgcaattttaaaata
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GATTGCCAATGAGAAGGAGAATGGTGTTATTTTGACCGAGAAGATTCCAT
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GTAATTCAGATGAATTGCTTATAGAAGTTATTGAATGCATAGCAATGAAA
TGTCGAAGTGAGATTGATGGTTTGAGTGGATTAAAACAGCCTAGTATTCT
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GACTGGAATTTAGTAGTCGGGCCAAAACTATGTTTCAGCTGTTAACACAG
ATTTTGTgctcaaatgaaaaagaagcaATCATATTACTAGCAACAATGGT
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TTGCCCGAAAATGTGGAATGAATGAGAATGGTCTTTCAATGTTGAATCAC
TTGGGATTAACAAGCTGCCCCCTAACGATTAGAGAAAAGCTGTATGAACA
AGGAATTAATCACGATGCAAGACTCTTgaattggattgaattgCTAAAGA
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caaacaaataaaaacaaaacatccaCCTACCACTGGGTTAATATGATTGC
AATTGCTGATCCAGTGTTTGGTGACCACCTTAGCGATTTCCATCAGAGAC
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AAGTACCTCAAAACTGATTTCACTAATCTCTGTGCcagaattttggtgaa
aagagTCAACAAACTTCATGATATCGCAGTCAAACATCACATTAATCACA
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TCTTCAAGATAAATACGCAAAAAATGCAAAAGgaaataaaaacattatct
tTGTTGGTGGTGACCAGTTGACAGAAGAAAGGGCGAGAAACGTACTATTG
TCACAACTCAACGGAAGGACAAAGGAACAGAGACTAGAGGCTTTGTTTCC
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AGATGCATCTTTCTGGAATGGATAAGGGTACGTACAAGTGCAACACCGTT
CGCTCTGGTAACCCTAAAGCTCTTGGAGATATCAAACAGAGATATGAACa
aatcaaagaattttttctaatGCAATTGGAAGCATTGATTGTGTCTGCAT
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GCGTTAGAACAAGAATCGATAACTAAAGATTATACCAATAAAGATTTGCA
AAGCAAAGATAAGCCTATCGAACCCTTCAAACCAACCCTAATTGCAGATG
CTCGTACAAGATACACTAATGTCAACGTGCTAACCAACTCACGTGTGCTA
CTATGCAGCCCTAATGTTTTGAACGCCTTACGTTTAAAATCTTCAAGCCC
TAGTGTGATGAGAAATGCATGAGGAAGATTCTCTAACATAAAAATAATGG
CCAAGCTGCCAACGTCCAAACCTAACCATCCTGCAAAACCACAACAGTCA
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AGACGCCTGTTTACATAGCTATTAAACaagaacaatcaaaacaaaccaat
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aaaatcaaccaacGCAACTATTAGCCCCACAAAGATTCCAAGGCTCGTAG
TAGTTAAACAACAACTATCAACCCCAAATGTAGCTCTTACCCCAACAAAG
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ATTAGAAGACAACAATCAACCCCAAAGGCATCTGTTAATCCTACAACGAT
TCCACCATTGGTAACGACTAAACAACAGCTACGGTCAACTCTAACCAATA
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AATACTAAATCTACACAAAAAGATGATTCGTTGTTTAAGTATAGCTGTTC
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AAGGTGATGGGAATCGATTGATGAATGtatatgaaatttttcaattgctC
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GGAACCGATTCTTCAATAAAAACGGAGGAAAAGGTCAGAACATTTCACGC
GATTTGAGATTAGAGCATATTAATCGATTCATGAAAGAAATGATAAAAGC
TCAAGGGCTACAGAACATTTCAAATGATAACGTCTACAAAATTTCAAAGG
CGTACCAAGGAATTAGAGAAATCTGTGATTCTATGCTGGTGGATACTGAT
GTTTCTAAATCAGATGGACATCATTCAAACATTCACAAGAATGAGATGTT
TAAATCTGTTTTACAGGAACTTAATGCTAATGAGAATTTTTCTACTCAAC
AACCAAATGAGATGCTTAGTACGCAATTTGAAAAGATGCAAGAAAATCGA
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TTGGGATGTGCAAAATGACTCTTTGTACAACTTtaaaacaattaattaaa
actaaaaagtCTTGACTGCACgctgttttgtatttttattataTTCTTAA
TATTTATTAACGTGAAAACTATTCTTTTAGTTATTTATAGTTGTTTATAT
TTCATTGAGTTacaaaatattatatttatcattagattatatatttatta
tatttattatataCACATCACTAGGAGACTTTAATTACTCTTCTCGTTAT
TTTTGCACTTCACCATCGTACTTATGAttttatactttattttttgtcgt
ttttatttcag

protein sequence of TCONS_00050205-protein

>TCONS_00050205-protein ID=TCONS_00050205-protein|Name=TCONS_00050205-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=752bp
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RNILPDGDSLLECAQFQKLRFCSKCKTKLKKVDTMVYQQAQFKEQLSAIK
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SVMIETYVMPHLRTLLESIQKEGDSEKEDNVGLERESITKDYTNKXRKTM
LR

transcript from alignment at scaffold_168:34165..41613+

>TCONS_00050205 ID=TCONS_00050205|Name=TCONS_00050205|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7449bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_168:34165..41613+ (Clytia hemisphaerica)
CCTTACCCAGCCGGTTTCACCGTACCCAGCTGATTTCACCATACCCAGCC
GATTCCCCCCTAACCAGCTGATTCCCCCTACCCAACTGATCCACCCAGCT
TATCCCACCCAAGCCAGCCAATCACATTTATACAGCTGATCCCATCTCAT
CCTTTCCCAATGAATTCCCATGCATCCATCCACCCAGACGATCCCACCCT
ACTACCCAGCCAATCTCATCCCTTCCCAATGAATTCCATACATCCATCCA
CCCAGAAGATCCCACCACCCTACTACCCAGCCAATCCCATCCAATACAAT
GCGATCCCCAACCTATCCTGCAAATTCAACCCTATCCTGCCAAATTCCAC
CCTACCCCCTACCCTGCCTAATATGCATCAAATTCCATCCATAGATCAGA
TCCCAGAAACCCAGCTGATTCCATCCTAACAAGCCAATCCCATCCTACCT
CTAGCCAATCCCTACCCTATAACCAGATGATTCAGTGTTGGCTGATTTTA
CCCAACTGATCCTCCTATCTATCCCATCATCCCAGTCCAGGCCAGATGAT
TGATCCCACAACAGCTCCCACAACATATTTTGTGGTCCAGCCCATCATGC
CATGCAGTCCAATGCCATGCAGGATCATCATCTGCAGTACCAATTGGACT
AATGCAATTTGCCCAACTGATATATGATCTGCCTAATCAATTCACCTAGC
CTGCCTAGGTAGGTGGTGTGATCACACGATCCTGTTGTCCATCCACCACG
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CTTTCCAAAATTCCAAAAAGAATCCAAACTAAACCTCCCAAATCAGCAgc
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GAGCAACAAAGATTCCACAAAGAATATTGATTGCCAATGAGAAGGAGGTA
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GATCCTAAAACCTGACCAATTTGGGAAACTTATTTTTCTATAAGTAAGAA
AttcctaaaaaattaaaaaaaaattggttctGAAATCCctgaattgattt
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AAGACCTACTTTTTTTCTCTCTGGGGTTAAAATTCTAAGAAAATAGATTT
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GTGGATTAAAACAGCCTAGTATTCTGCGAGACATCTCCCCAGAACACATC
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AACTATGTTTCAGCTGTTAACACAGATTTTGTgctcaaatgaaaaagaag
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GCCTTTGCCCACAAACTCGGACTTGTTGCCCGAAAATGTGGAATGAATGA
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GTCTAGAGATTGTATTAAATCAAATCTGAGTTTGTCACCTCACTAATTAG
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ACAGCAATTAATTCACACCTTTTGTTTGAAATAGAAGAATCATCTTTTCA
CTTTAAGCTATCTTGGCTGTCTGAGATCATCTGAGATTTCTTTATTTTGG
AAcctaaaaacaatagaattttttttggaattttcaatTAATGTGTAACC
GTTTAAGATTTTCCATGATTAAATTGATTAAATTAATGTTCAATGGGTTA
TTTTGAAGGGTCTTTCAATGTTGAATCACTTGGGATTAACAAGCTGCCCC
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ACTCTTgaattggattgaattggtaggtTTGATTTTATATTTGTGATTTA
GTGTGATAACTACTATCAATCAAAATTGATGGTTGTGACTTGTtaataat
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ATTTTCAGCTAAAGACCTTCCAGCTAATTATTGACAACTTGGACTTGAAT
ATCGGTGTCAAAcatcaaacaaataaaaacaaaacatccaCCTACCACTG
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ATTTCCATCAGAGACACTTAGGAgatgtaaaaaataattgattatttttt
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TGCCAGGGTCTCTGTTGTAAAACACTGAACAATACAGTAAGAAATCTTTT
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TTTCTTCAAGATAAATACGCAAAAAATGCAAAAGgaaataaaaacattat
cttTGTTGGTGGTGACCAGGTGaattaaatcaatttttataccttttaag
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TGATGTAAgaataatgaaagaaatttttattagaGACATTATTTAGTAAG
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AACAGAGATATGAACaaatcaaagaattttttctaatGCAATTGGAAGCA
TTGATTGTGTCTGCATTCCTAAAGCAAGAGGGTATGGAAACTGTTGATGA
CGACTGCGTTCCAAAGCATATCAAAGATGGTGATGCAAAAAAGCGATGGC
TTAATGGAAGGGTTTCTGTGATGATCGAAACTTATGTAATGCCTCATCTT
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tttttgaaatattgacaGCTCAAACATAATACTTATCAGACCTTTAAGAC
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AAATTggcaaaaataattaaaagtcTCCAAGTGTATTTTTATGTATCCCA
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ACTAAAGATTATACCAATAAANAAAGGAAGACAATGTTGCGTTAGAACAA
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ACACTAATGTCAACGTGCTAACCAACTCACGTGTGCTACTATGCAGCCCT
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AAATGCATGAGGAAGATTCTCTAACATAAAAATAATGGCCAAGCTGCCAA
CGTCCAAACCTAACCATCCTGCAAAACCACAACAGTCAACTCAGAGCAAT
GCAGCTATAAACCCAAAACAGACACCATTGTACATAGCTATCAAACAACA
AGATGCAACCCAGAGAAATGCAGCAGTCAATGCTAAACAGACGCCTGTTT
ACATAGCTATTAAACaagaacaatcaaaacaaaccaatgcTGCAGCTAAA
CAGACCCTACCTTTCGAAGTCGTTAAACAGCAAcaatcaaaatcaaccaa
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AACTATCAACCCCAAATGTAGCTCTTACCCCAACAAAGACTCCATCATTA
CTGGCCGTTAAACATCCACTATCTACCCCAAAACAAGCTGTTAATCCCAC
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CAGCTGTTAGCTTCAAAAGAACCCCACCACTACCGGTCATTAGAAGACAA
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AACGACTAAACAACAGCTACGGTCAACTCTAACCAATACTCCTGACACAA
CGTTTGTAGACACCGAACAAAAACAGTTGCCACAGAGCAATACTAAATCT
ACACAAAAAGATGATTCGTTGTTTAAGTATAGCTGTTCTTTGATGAGTTG
GGGTTTGTGTCTGTTGGATGCAGATGATGCAGTACGAGAAGGTGATGGGA
ATCGATTGATGAATGtatatgaaatttttcaattgctCTTCCGCATGATG
GGTAACACCAAATACAGTTATAGCCTTCTAAGATTGAAAGCTTGCAGGTT
GGCTCTCCTCACCCCTAAAACGGCACATCAACTTGTCTGGAACCGATTCT
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GAGCATATTAATCGATTCATGAAAGAAATGATAAAAGCTCAAGGGCTACA
GAACATTTCAAATGATAACGTCTACAAAATTTCAAAGGCGTACCAAGGAA
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GATGGACATCATTCAAACATTCACAAGAATGAGATGTTTAAATCTGTTTT
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TGCTTAGTACGCAATTTGAAAAGATGCAAGAAAATCGATCAcagaatttg
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AAATGACTCTTTGTACAACTTtaaaacaattaattaaaactaaaaagtCT
TGACTGCACgctgttttgtatttttattataTTCTTAATATTTATTAACG
TGAAAACTATTCTTTTAGTTATTTATAGTTGTTTATATTTCATTGAGTTa
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aCACATCACTAGGAGACTTTAATTACTCTTCTCGTTATTTTTGCACTTCA
CCATCGTACTTATGAttttatactttattttttgtcgtttttatttcag

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_168:34165..41613+

>TCONS_00050205 ID=TCONS_00050205|Name=TCONS_00050205|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=24849bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_168:34165..41613+ (Clytia hemisphaerica)
ATGGCGACACCAAAGAAAAAAGCAGTACAAATTGGGACCTCTGAAATAAA
GTTTCAGTTAATTAGGCAGACGTGTATATTTTGTGGTGgcaattttaaaa
tacaaaaaataagcTCATATGAGACAGTTACACCTAATCTCAACTTGATT
AGAAATATTCTACCTGATGGTGATTCACTGCTGGAATGTGCCCAGTTCCA
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CCATGGTATATCAACAAGCACAGTTCAAAGAGCAGCTTTCGGCAATAAAA
TCTCATTTTGAAGAAGAAATAACAACAAAGAGAATAGCAACACCAACTCA
ACCACTTTCAAGGAAACGAATTAACTTCAGCATCACTCCTCAACAAACGC
caacatcaaaaattttgcaaaaagtcCAAAGTACTTCTAAAAAGTCCCCA
GCACAAAAGGAACTAATGTCTCCACTTTCCAAAATTCCAAAAAGAATCCA
AACTAAACCTCCCAAATCAGCAgcaacgccacatagaagaacGCCACTTT
CAGAAATCCAAACTATTCAAAGGAGAGCAACAAAGATTCCACAAAGAATA
TTGATTGCCAATGAGAAGGAGAATGGTGTTATTTTGACCGAGAAGATTCC
ATCAACTAGTAGAACAATAGCATACAATGAGGCAAAGGTCATAGAAACAA
ATGAAGGTGGAAAAACGGTACAAAgaacattgaaaaagaattatgCCAAA
ATCGCCAAGTATCTTTCAACCAATTTGACCAGATTAGCTGCCAAAGCAAT
CTGTAATTCAGATGAATTGCTTATAGAAGTTATTGAATGCATAGCAATGA
AATGTCGAAGTGAGATTGATGGTTTGAGTGGATTAAAACAGCCTAGTATT
CTGCGAGACATCTCCCCAGAACACATCAGAACAATAGACATTGCTCAAAT
GAGACTGGAATTTAGTAGTCGGGCCAAAACTATGTTTCAGCTGTTAACAC
AGATTTTGTgctcaaatgaaaaagaagcaATCATATTACTAGCAACAATG
GTTCATCTCGAAAAAAAACACCTGAGTGCCTTTGCCCACAAACTCGGACT
TGTTGCCCGAAAATGTGGAATGAATGAGAATGGTCTTTCAATGTTGAATC
ACTTGGGATTAACAAGCTGCCCCCTAACGATTAGAGAAAAGCTGTATGAA
CAAGGAATTAATCACGATGCAAGACTCTTgaattggattgaattgCTAAA
GACCTTCCAGCTAATTATTGACAACTTGGACTTGAATATCGGTGTCAAAc
atcaaacaaataaaaacaaaacatccaCCTACCACTGGGTTAATATGATT
GCAATTGCTGATCCAGTGTTTGGTGACCACCTTAGCGATTTCCATCAGAG
ACACTTAGGAgatGTGGACGTAAACGAATTTTTTCCCACTGAGTCAACAA
TCAAGTACCTCAAAACTGATTTCACTAATCTCTGTGCcagaattttggtg
aaaagagTCAACAAACTTCATGATATCGCAGTCAAACATCACATTAATCA
CATTTACTCAGAAACTATGACACAAAAGTCTGAAGAGATTCCACTTGGAG
TACTAACGCTAAACGAAAACAAGAACGAAGACATGTTAGAGATTTTGAAG
TTTCTTCAAGATAAATACGCAAAAAATGCAAAAGgaaataaaaacattat
cttTGTTGGTGGTGACCAGTTGACAGAAGAAAGGGCGAGAAACGTACTAT
TGTCACAACTCAACGGAAGGACAAAGGAACAGAGACTAGAGGCTTTGTTT
CCTAAATTTGAAGATTGGCATTGTATCCGGACAGCCTATGATtcaGTCAT
CAAGATGCATCTTTCTGGAATGGATAAGGGTACGTACAAGTGCAACACCG
TTCGCTCTGGTAACCCTAAAGCTCTTGGAGATATCAAACAGAGATATGAA
CaaatcaaagaattttttctaatGCAATTGGAAGCATTGATTGTGTCTGC
ATTCCTAAAGCAAGAGGGTATGGAAACTGTTGATGACGACTGCGTTCCAA
AGCATATCAAAGATGGTGATGCAAAAAAGCGATGGCTTAATGGAAGGGTT
TCTGTGATGATCGAAACTTATGTAATGCCTCATCTTAGAACCTTGTTGGA
ATCCATACAAAAGGAAGGTGATAGCGAAAAGGAAGACAATGTTGGGTTAG
AACGAGAATCGATAACTAAAGATTATACCAATAAANAAAGGAAGACAATG
TTGCGTTAGATGGCGACACCAAAGAAAAAAGCAGTACAAATTGGGACCTC
TGAAATAAAGTTTCAGTTAATTAGGCAGACGTGTATATTTTGTGGTGgca
attttaaaatacaaaaaataagcTCATATGAGACAGTTACACCTAATCTC
AACTTGATTAGAAATATTCTACCTGATGGTGATTCACTGCTGGAATGTGC
CCAGTTCCAAAAGTTAAGATTTTGCTCAAAATGTAAAACTAAATTAAAGA
AGGTAGATACCATGGTATATCAACAAGCACAGTTCAAAGAGCAGCTTTCG
GCAATAAAATCTCATTTTGAAGAAGAAATAACAACAAAGAGAATAGCAAC
ACCAACTCAACCACTTTCAAGGAAACGAATTAACTTCAGCATCACTCCTC
AACAAACGCcaacatcaaaaattttgcaaaaagtcCAAAGTACTTCTAAA
AAGTCCCCAGCACAAAAGGAACTAATGTCTCCACTTTCCAAAATTCCAAA
AAGAATCCAAACTAAACCTCCCAAATCAGCAgcaacgccacatagaagaa
cGCCACTTTCAGAAATCCAAACTATTCAAAGGAGAGCAACAAAGATTCCA
CAAAGAATATTGATTGCCAATGAGAAGGAGAATGGTGTTATTTTGACCGA
GAAGATTCCATCAACTAGTAGAACAATAGCATACAATGAGGCAAAGGTCA
TAGAAACAAATGAAGGTGGAAAAACGGTACAAAgaacattgaaaaagaat
tatgCCAAAATCGCCAAGTATCTTTCAACCAATTTGACCAGATTAGCTGC
CAAAGCAATCTGTAATTCAGATGAATTGCTTATAGAAGTTATTGAATGCA
TAGCAATGAAATGTCGAAGTGAGATTGATGGTTTGAGTGGATTAAAACAG
CCTAGTATTCTGCGAGACATCTCCCCAGAACACATCAGAACAATAGACAT
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