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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00051622 ID=TCONS_00051622|Name=TCONS_00051622|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3931bp gatttcgaaaaacattGAACAAGCTTAAAGGCTATCAAACCAGTTGTTCA TATCAACATCGATCTGTGCTTTTCGGTGGTCCAGATATCATTGCAGTCAG GATTTGAAGTGCCTCCAACGTTCAAGtaaagaaattcaaaatcaaGAAGA TAATAGCTTTAAGACAATTTGAAGATATCCTACCTGGTTGTATTGATCAT TAAGAAACAGAAATTGAAGCAAAAACTACACTGATATTCCAGATTGTCCG ACCACgatcaaaagaaaacttcatcacAACAACTTTACAATAATCATCAA GATCAACAACAACAATCCAATGTAACCATGGATGACcataatcaaaatca aaatcaacatcAATTAGATGTTCATCAAAACGCTCAACAAGCAGACATCG CCGTTCATAATAATGCAGCTCAAGATATTGATTACGAAGCAATTGATCAA GTCGCCGAGCAAATGAAAACATTCGCTGATCAATTTTATCGAGAACACAC AACGAACAGATTCCTACAAAAGGTGAACGACAACGCATCCACAATACTGA TTTGCAGTATGGCAGCATTGGTTGTATATCAATGTGCAAGGAAATGATGG TGTTGGGATGGCATTGGATGGCTGTTGGTTATGGTTGTCTTTGTCCTTGG CTTGAATGATTTTGCTGGATGTAGGACCCTATTATTAGTAGGTCTCCAAA ATTATGCAATGCGTGGGAAAAAAGGATTTTGTGGAGTAAGTCCGATTCAC TTTTTCGATCTGATATTTTGTATGGGTTTGAAAAGATCAAATAAAAGAGT CtaaaagaaaattgagaaaaaacgGAATTACTCTAATCTTACTTTTTTCA CATATGCAAAAAGGTATTGATATTTATCATTGTGGATAATTATCATTGTT GGAGTTCTCCAATACGGCATCTTAAGAGATTTTAGTCCGATTCAAACGTT ACATTTATTGGTACTCAATTATCTTAAGTGCCGAAACTAACTCCAAAGTG TATAAagtgtttatattttttttgaattgttattttaaaAGTAATCTGAT ACAGGTTACAACagttttaatattttgttgcgtttttttattttctttaa ctcgTTTTAAGGGTTATCATGGCGGATTCTTATGATTTCTAAAgtaaaaa agtattttgattttttaaaaatatgtacattATCATCATTtgtcttttaa aagattttaaatgcagtttttattattattacaaaTAGCTATACATAAGC atcatttctttttgatttaattttattttaaatccattttttttcgttta tttttaagaaattttagatttatagaAAAAGATATAGTTAGATTTATCAT TGATGTTTAAGATGGTTCATTTATGATCCATCATACGAAAAACCCATGTT TTGAGCTTTTGTTCACTTGTCGTTTTAGACCAGATTGTACAAAGCTTTTT GTGTATAAAATGTACAGAGAGTtccatttttattgtttttatgtaCTGTC ACTggttttatttataaatttacatttttcttgtgttttttaaagaaaaa caatttaaaaaagtcTTTTGTGCGATCTACCCATTGTCGATTTTTTGAGC TGCGGTTAAGTTAATCTCAGTAATCTTGATTTGTTTTTGCTtgagttgat ttttttattaattgtcCGATTCAGATATATCAAGGACAATGCAAGAAAGA TAATCTTTTTAATAAATCCGATGAGCCAAAAATCTGGATTGATATAGCGC TTAAAAGATACTGTCTTCATTATTTCCTCGCGTGGGGTTTTTCGGATTAC ATAGTTTTTATTAGATATTTTCATGTTTATATATTATTGTTTATATCCTT TCTTgttgtttatatttttgtatataGGTCgttcaaaaagataaaaaatt gtttattaTTGTTAGTAAAAAGATACCTAAAAAGTTGTCAGACAAATTCT Tatgatgttattttttattttgaatttttttttcattgtttttattttat tttcatgtcAAATTGGTTTTAAACCATGATCAGTTGATTGATACTAAATT TCTTGATTGGCAATTCtatattcaaaataattttgcaaAGTGACCTTGTG AGAGCTCTGGAGACTTTTTCCCCATTGTTTATAGGACCAGATTAAGATTT CAACAAAGAAGATTTTCGGAGAGTCTCTTTAAATTTTTGATCATATTTCA ATAGCCAAAAACCTCCctaaaatttttcatcttttgtcAATTGGTCAATA GAGATAATGAATATATTTGGAAGACGTTTATTATTAgcaaaagtgataaa aaaaaaatgaaggagaaaaagttttattatttattctaaattttttaagt ttatattatttttttatttctttatttataaaaatcatacATTTATTATA GATTTTTATTATCTTCTTTTTCATACTTTATTATCTTTTCCTTCTTTAAG TCGTTTTTCAGGGGAGACAAATAATCTtctaaattataaaaaaatagtcC GTTATAGTTTTTGTTTAATAGTCTGCTTAGCTCAGGGCCTGAATGTTTAt aaattttctcaaagaaaCAATAAAAAACGGACTAATAAAAAAGTATACTT CTTAACTTGCATAATTCATAAGTTCTTGGTTAGGAAACAAAAGAATTCTT CATATTTGTAACTCTATCGTTCAATTCATTTGCTAAGTGTTTCTTTAATG CTTccttcttcgtttttcttttAGTCCCAAGGGAATccaataaaaagaaa tataataataaaagtatTTGAAATTGTTTCAAAAGGTTTTCCCAACAACC TCAACATTCTCTTTAGGTCTTTGAAATAGTAATTTCTATTcctagatttt ttatttattttccacGAATTTATGTTAGGCTACGTTAGATTCCAATAAGA TCATCTAAAACTAAAATCAAGAAGTTTTAAGCAACTCCTTGTTCCTAAGG gagatttcctgaaaaaaatactttttcattcatttaatTGGAAAGATGAT TTCTTCTGATGCttcgttttttgaaaaagtgcatcATCatcaataatttt atttttcagttgaTAAAGAAATCACATGATTTTTTGATGACAATAGAGCG AGAGAAACAATGAAATCATTGCTAATTAgtcaatttaaaaaacaattaaa aaactaGGTCGTTAGCTCTTGTCAATCAAATAATACATGGATTTGATGCC GAAATAATTTGTCTTTTTCATTTATGTTTCCAACCtttgttaattttgta ttttatttttatttattttatttttaattttgttatttattttttgtttt tttttcctccttttcgtgcctcattttttttcttcatccttttgtttatt tttttcttatttacgAAAATACACGTTGCAACGTCACTTAAGCAAGACAC TAGTCATTACCATGTTGACGTTTGCTATTCTTTTGATAAACTTTCGtcgg ttttttttttgtctccTAAAGTTCACAACAAAATTAGACTTTGTTGTATT TTGTCAtaaataaaacgaaaaaatatgACTCGCCTTTCTTAACGTCTTTT tccaatctttttcaaaaaatatttttgaattttcttcgtacataattttt ttccataGGTGTAAAATGCAATAATACATatatctgatttttttttaaag attgagtTTTATCAAAAATGTTTAGTGTATTTTTCACGTTCTAATAAATG TTATTACAAAGTGTACATAGTTTTGAATCTATAGTTCGAAAATCGAAGTC AATTTTTATCGATTGTCGAAAACTATTAATTTGAAATtcgaaattataat tttttaattttttcttgtgTGTTTAGTTTACTGTAAATAATTACCTTTGT AAAtattaaatttaaaagaaacattAATTTTTAGACACTTTTTTGTGTCA TTgtagataaatatttttgtacatATTATCG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_202:338958..381951- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00051622 ID=TCONS_00051622|Name=TCONS_00051622|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=42994bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_202:338958..381951- (Clytia hemisphaerica) GATTTCGAAAAACATTGAACAAGCTTAAAGGCTATCAAACCAGTTGTTCA
TATCAACATCGATCTGTGCTTTTCGGTGGTCCAGATATCATTGCAGTCAG
GATTTGAAGTGCCTCCAACGTTCAAGGTAGGGTATTATTTCAAAAGGCTT
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CTCTTCGTCGGTCAAATCGCTATAAAATCGCTTAAATTTCCTCATTCGCC
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TTCGGCGAGGAAAACAAAATTCTATTTTGGGATTCTTGGAACAACACATA
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ATTCAAAATTCCCCTATTTCCGCTGCACGCACCTGTAAATTTGGCAGGCC
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TGCTGTTGGAAAGTTTGTCTGAATCCATATAATGCGTGTGGCTTTAGTAT
GTTTGAAGTTTGAGCTTAACTTCATTTTTTGGTCTCATTTCATGTTGTAT
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AGAATAGGTGTGTATACACATAATCTTTTCAAGCAATCAGCTTGTAGATT
TCGGGAATATTTTCAATAAGCTCAAAATTATAGTTCTGATTTCGCAAGAT
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GTTTCAACAGGATGTGTGACGAAGTTTCGAAATTTCCCCTACGTTAAAAT
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TTACGTTTTTTTTGGCCAATTGGAGTGTATTGCAAGCCAATACGATCTTA
GAACTTTCTTAAAATATAAACTCTTGCTNGGCCAATTGAAGTGTATTGCA
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AACACAATACTTTGATCTTCTTTGTCGGATTCAAGACAACTTATGGCGTA
ATGTTTTAGGTGGTCAGGACACGGTGGATTAAGTGCCTTATCTATGGGCA
AAAAATTTGTCCACTGTTACAAAGCTTCTAAGAATTGCTACAGCAATCTT
ATATGTACCTTTTGGTCATTTCAAGATTTTTTGTTTGCTCGAACTCTACT
AAGAATTTCCTCAATAACATACGATAGCTTCGGAGAGTTTTGGCGGGAAA
AATGTAGTGAACTTTGATCACTTTCGTTTTCAATCATTAGAATCAAATTA
TGAAATCGTGATTTGTTAAAATAGCAGAACGGTGGAGTGTCGTTGTTGTT
TGTTTTGAAAACCTTCGATAGGGAATCATCTTTTGCGAGAGGGAGGGAAT
CACTTTTCTAATTATGTTTATTACTTTGATTGATTGACTCGCATAAATCA
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TTTAGTAAATCTGACCACAGTTCACATTCTTGATCGGAAAATTCTGTTAT
TCTAAAATTTTTGAGGTCATTGTGATTGCTTCCCTTGAGTTGCACCATTG
TAACTTTTTAACTGAGGCATTAACTTAAGACCATACAAGGAAGCTGTGTG
GGAAAGGTTTCGTAAGTCCTCGTCTACTGTAAACCGTCATTTGTGATTTC
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CTCGAATGTCTCCTTAACTCGAACAAGTTTTATTCAGCACCCTTCAGTCA
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TTATTTCTACTATGTCTGAATTAGTCTTCTAGGTTGCTAGACTACCTATA
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GTAAAACATCATGTTATGCACGCAAAAAATGTTAATTATTTTCATTTTTA
GCATTTTGTGCCTAACACATGACTCTAGTTTATGAGGTATTTTCAGATTT
CCTTAATTGAAATGTTATCAAGTTTCGCTGAAATGTTATCAAGTATCGCT
GACAACGCAATCATCTAATACTGCTTCAATCACCGATTCCGCTTCGGACA
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TCTAATGTTCAGAATATTTTTACCGCTTTTTATTTGATTCCATTGTTTAT
TGCCACGTGTCTTGTTCAATATTTTTTTATAAAACAAAGAACCTTTTTTG
TCATCTCCAGTAGTGGTTCAATGTTATCGCAGTAAGGTAGCAACAATTTT
CATTGATTATGTTTTTCTTAGCCTGGTACACTGAAGATATTGCGCAAAGG
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GGGCGGATTTTTTTGCTTCAGCTAGGGACGGAGTAGTTCTATCTAGTGTT
TTATATAAGATTTCTGTGGAAATGAGTCACGGCGTTTTGATATAAGTATC
CCCTATGAATTGGGATCAATTTGGATACGCCTATAGTTTTCTTTAATCTA
GCCGTGTTGGCGAATGTCTGGTTAAAGTACTGGTGATTTCGTTTCCTTTT
TAAGGAAAATTTGCGAAACAGTGTCATCTGACCCAGAAGACCTAGATTTT
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AATACGCACGTGTGTTTTTGTTAAGATCTCTACCACGACGCTGGAGAAAG
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CCATAGGATAGTCTGTGGTGAGTTTCACCATGGTGACTAGGCAAGTGAGG
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CACTTTTATGGTTGTTCCGCCGGGTCTGAAATAGGTATTACAACATCTTT
TTTTTGGTAGCATCCTTACAGTTTAGAAAGGCTGTGAGATTAGGGAAATT
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GAAGCTATTTAGATTCAAATCTTGGCTCAATGAGTTAAGAACTCAAAAAA
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ATTTGAAGCCACAAATGACATCCCTTCTTTAATTAATGACAACAAGCCAC
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ATTAAGTTTTTGCTTTTCTCAGCTACAACTATATACAAAGGTTGAATTCA
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CGATCAAAAATACCCTAGATATGAAATAACGTATATGTATTTGTAAGAAC
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TAAAAATGTTCTGAGCATGTTCTTGTTTTAGCAATTATGTGAGTATCTTT
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ATATAGTTTGTTCTTATTGAAAAAATGTGTACATGTGTCTAGACAAATCG
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GTCCTCCATTGTCAAACTTTCCAAAGGAAAAATAATTGAAAAAACAAGAA
ATGACTGCATCAAGGCATAATGTAATAATTTTGACACAGTTTGCATTTTA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_202 | supercontig | scaffold_202:338958..381951 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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