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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00052050 ID=TCONS_00052050|Name=TCONS_00052050|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10785bp
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TTGCAGAAAGGAGCTTACTGGATAGAGTGGTACCTGTTGAGTTGATAATC
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TCCCCATTCGGTGATGAATTTAAGGGAACTGAATGGTATCCATCCACTGC
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CGACAGGACAGTTTATCAACCCACCAACAGCCAACACTTGATAAGCATTT
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GCACCATAGATTGTCGTTGTTGGGGTAGTGAGGTCGGCCATTCGCGTTTT
ACATTCTCTTGTCATGGTAAGATTTGAGTGTCCTGCTACATTTGCCATCA
TCTCAGTCTTTGCGAATTTTTCTCTCAGCTTTTCTTCTCCTGTTAACCTC
TCTGTTCAAATGTGTATAACTTCAAATGAATGCTG protein sequence of TCONS_00052050-protein >TCONS_00052050-protein ID=TCONS_00052050-protein|Name=TCONS_00052050-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=568bp
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KKRKCKTAYVTLSCYSQVQQIIDFYSTNFDDQGFAFEDGFANIGMVRVKK
YIGKAKPKNENDLNIKPLQNEENASNQDTERLFCPTEEDWDTETFDNENT
QNIAEDSKYDENSSSQTLMFQQLPNRTTKSEVKELINQLQPETKIAHIDL
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LNKWLPPIFTVSKVVYHKDDKLFHVKLPSWEACDLLLSHFRVNFQPHGGF
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NELHAELICPSPPSVSSSNDWKSVDINLQAEEISHNSVSSSSQPSRISGS
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RKEIMLLEDELKTKCPELFVSEVDMMLLRLDLNKMETKKNELLIMKNKAQ
SELDELREQISCLNEGDA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_209:55246..66151+ Legend: exonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00052050 ID=TCONS_00052050|Name=TCONS_00052050|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10906bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_209:55246..66151+ (Clytia hemisphaerica)
tttagaaaaagaactattaaaatgtcacaaaatgaaaataaaattatgat
gGAAAACCTTCCAATTGGTTCAATGAAAAGTGATATTGAGAATGTCTTGA
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GCTTTCCAAAACGCGAAAGGACGTTTCAATCTAATTGACGTAAAACGTAA
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ACTATTCGTGTCAGAGGTTGATATGATGCTGTTACGCTTGGACTTAAATA
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TCCGAGCTTGATGAACTGAGAGAACAGATAAGTTGCTTGAATGAAGGTGA
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ATTCTCAAATTgggttttttagaattttttgcaatttaggCACATTCATG
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TGTTTCAGTTGGTTATGGTGATTTCAGCTCACCGCCATGCATTGATTTGC
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GGTTATCTCTATCTTTTGTTACTTTTGATGTCTTCCCCGATCGCCTCGTT
CTGATTTGAcagtttttatcagtttttttgGAACCATTATGCTGAAATCT
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ttcttttagttttataTTCTGAAGCCAGATTGATTCGAATGCTTGAATTT
GTTGGTTTATATTTTAAATAGTTTTGAATTGTCTTGTCGGATAATTACAA
GTGGTTGTGTTGTAATCACTTGATTATCCTTCTTTCGCTGGTTTAACAAC
CTCCTATCAATCCTTACTGAGGTCATTTACGAATATGCAAGCAACGACCG
AAGATTCTTTGTTTGAGTACTGATGTATTTCTTTTAACATCGCCACACCA
TTGAAACAGTTGTAGCTCCAATGCTATCATGTAATGCTTTGACAGCTGCT
GGATAGTGTTTCCTAACTTCTTTTATGTAAGTGCTTTGCACATTGATGAT
TCAAAGCCAAATACGGAAAACCTATGTCCAATGGTTGTCCAATGTAAGTT
TTAGATGGTTAATGTTTATGTCATATAGATCTTTTTGCTGTAGCAagact
tttcctttttttcattaAACATCAGAATCCAAAGGAAGTTCATTataaat
tgtttttaatttagAAACAAGGTTAAGCACTCGTTCTACATTGACCTTGT
TTGTGTTGACCTCTGCTAACCTCTGCACATCTATACGGGCTTGGTTGAGC
TCTGCTAATCTCTTCACATCTATACGGGCTTGGTTGAGCTCTGCTAATCT
CTTCACATCTATACGGGCTTGGTTGACCTCTGCTAACCTCTGCACATCTA
TACGGGCTTGGTTGACCTCTGCTAACCTCGATCTTTAGTTTCAGGAAACT
AGCTGGTTCACGAATATACGGGAAATTTGGTTTTGttataaagtaaataa
aattaaaacgaAACCTGAAGAAACTAACACATAAACATAATGAATGAATT
GCAGATTTTGGTATAGTAACTTCAATGTATTGATGTTCTAGCCGTCTTGT
CTATTTTGATTAGATGAACCTCGTTTTTAGGGTGATTTTCAATAATATCC
CAAACATAAACATAGTCCTAGTAACTAGCACAATCCATCATATAGCTCTG
GTGTCGAATTGTTCGAAAAATGGGACTTATTCAAcacattttgtaaattt
tctatgttgaaaTACACCAATCCTTCTTCTCTGTCATTGATGTTGTTGAG
AACAAGATAATTGTCGATGACTTTGAACGACATGTTCCATCTTACAGGTG
ATGGAAGTAAAACTGATGGATTGGAAGTTTTCAGCTTTTGAACGGTCCTT
GTTTGCACCTTGTAAAGAGGTGTAATACATGACTCCATTCATCTGGTTTC
CTTGATTTCTGAATGTCAGGTAATATCTCAGAGTATTCGGTTTAAAAACT
CTTGTAGAGACGTTGTCTTCACAAAGCAGCTCCATGTATGCCCTCGTGAT
TTAAGAAGGATGCGATCTCCATCTTGTAAATTGCCTTTCCATTCCTTATC
TTTAGAGGACGAGTCACCATCCTTGATTGCCAATGTTGGCTTTCATCATT
CTTCTTTTTGATTGATGTCAATCCATCGACTGAGCACGCATCACCCATCC
CTCCAACAGAATGGAAAGCTTTCGTTCTGGTCAATGTAAATATTTAAACC
TTATAATTAATTAAGACTAAAATAAAATAAGCTGTAAAGAAAAGATTAAA
TTCAATTAACACTAATGCACGACCAGTAGTCATATTTAAGTCGATTTTTA
AGGTGATTCTGAAATGATTACAAATCTATCCTTATCTCTTATGGAGCAGG
AGTCAATATCCCAAATGGTTGTTGCTTTCTCGGTGGCTTGTACGGCAtgc
aaatttttcttcttttcttgtgAGCCTTCTTTTTTTGAGCAAAAGCAGTT
CTTGCGTCGTTTTTGACGGGTCCGAAGAGAAAAGAAATAATAACTTCACA
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ATGGATAGATAACAGTGAATGGTTTTGAGACAATATGGCATGGGAGAGAT
AAGATGGTTAACTTAAAATCTAGTCCAATAGGATTACAAGTCGATCTCTC
TCGTATGAAGCAGGGGTTAATATCCCAAATGGTTGTTGCTTTTTCGGCGG
CTTCCACGGCATGcaaatctttcttcttttcttgtGGGCCTTGTTTGAGC
GGAAGAGCTTCTTGCATCGTCTTGACAGGTCCGAAGAGAAAACTAATTTT
AATCATACACAGGGTACATATCGTCATATGTATGATATATAGGTAACATT
GAATGGTTTCGAGTCAATGTGACTTTGGAGAGATGCGATGGTTGACTAGT
CAGCACGATCGCAAGTCAAGGACACTGCTGTAAATGACAGCTTGTATTTG
ATGTCAATGGTTTTCATGTGTGACAAGTATGATCAAGTACAAGTAAATAA
CAAAGCCTGTTTGCGTCTACCAGTTTTCACCGAGAATCTACATGAGCGAA
TACGTGAGTGGAGCTTTTATTGTGGTGGATTAGATGACATCTTCGACCAT
TATTGGTAAACTGGCAATGAATAGTTTTCGATACAGAATAAGGTGTGTTT
CATATGGTTTGGAATAAGACGGTTAATTTTAAAATAGTTGAAGAAATTGT
TTGCAAAGATATCTTAAGTGGTTCCAACTTGGACATGTGCAACTCGACAT
GGTTTCATCATCGCCCTCGTTGTCTGTTCTTTGATTGTCACTCGGTAGCT
TAGGGTTTTGAATTCTAAATTAAAAAATCCATGTTTGCTTCTACACNACT
TGGACATGTGCAACTCGACATGGTTTCATCATCGCCCTCGCTGTCTGTTC
TTTGATTGTCACTCGGTAGCTTAGGGTTTTGAATTCTAAATTTAAACAGC
CTCAATTTCTGAAGAGGAAAAAACACATTAATCTCTCCCTGTACAGGCCA
AGTTTATCATTGCTTAGTTAGTAAACACTCAATTATTACACCAAGGGCTT
TACTTTCTGTCGGAAAATAGTCGCTTTCCGCCCCTTGGGTGCATCGAGAT
CCGACAAAAATGGTTGCATGATTGGGTCGATTGAATATGCACAGGTGACT
TGGTTGACAAGACCGAACCAAGATCGAGCATCAGTAATGTTCTCTGGAAC
AGGGAAGTTGCGGATTGCTGCGAGGATTTTCTCTGAAGGTGCGATACCAG
TTTCGGTTAGACGAAGCCCCGCATAGTCGACAGCTTTTTGACAAAACTGA
ATGTTAAATACAGTATCATTCGTAGCACAGTTAGTAAGAAATCATCAACA
ACTTTTGTTTTACGAGGGAAGTCGccaaagattttatcaaatcggCGTGT
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CGTTTCTAGCTTCCTCTTTCCAATTGTAAGGGGCTGGGATTGGTGAGCGT
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ATGCTG Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_209:55246..66151+ >TCONS_00052050 ID=TCONS_00052050|Name=TCONS_00052050|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1707bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_209:55246..66151+ (Clytia hemisphaerica)
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gGAAAACCTTCCAATTGGTTCAATGAAAAGTGATATTGAGAATGTCTTGA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
|---|
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Vocabulary: Molecular Function
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|---|
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
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Blast
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