TCONS_00052751 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00052751
Unique NameTCONS_00052751
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length637

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_22:36940..59348+

Legend: exon
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>TCONS_00052751 ID=TCONS_00052751|Name=TCONS_00052751|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22409bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_22:36940..59348+ (Clytia hemisphaerica)
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AaattccgatcaaagatggtggatttATAGCTTAGTAGTCACTGATGCCA TCACATTAAAAATCATTACCAAAGCTGCAGTCGACCCTCAATGTAGGGAT TTTCACGTAAGAGtacaatatttaaattttttatgtttgatcgacttttc tttgttttgatagcGCACACGATAGGTTGAACAACTCTCCCTGTAAAATA TGTTCGTCAATCAAACGATAAGTCTAGATTTCTCTGCTTTCAGCGAGTTT TCGTAACTGTTTTCCATGGGTACTGAATTTTTTATTGGCGTCGAATCCAA CGACGACGTTATCGATGAAGAAGATGACGTTGACGTCGATCCATAGTCGG TACTTTTCTCGTCATCatcagaaaattcaatttctttaaCAAAATATACA AGTGCTAGTACGACGAGAGAAACAACAGACATGATAATATACGGAAAATG CGGATCGAAGGGGAATCCCAAAGGATCGGTGTTTTTGGTGATTCCTTTGA TGTTGCGTAACGACCATGAGTAAATTGTCCCGTAAGCATATGGTGCAACA GCgctgaaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033354XLOC_033354Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:36940..37071TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:36940..37071Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:36940..37071TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:36940..37071Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:36940..37071TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:36940..37071Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:58844..59348TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:58844..59348Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:58844..59348TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:58844..59348Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:58844..59348TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:58844..59348Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_22supercontigscaffold_22:36940..59348 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
27.1236 27.894 22.5861 21.558 2.16704 2.11083 2.15287 1.32266 0.810693 0.291634 0.164068 0.207064 1.965 0.399541 0.0772677 0.198065 0 1.0094 0.388129 0 1.71051 2.28229 13.7749 9.79217 2.97625 1.03502 5.69804 9.79443 3.94619 8.87259
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00052751 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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