TCONS_00053432 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00053432
Unique Name	TCONS_00053432
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5003

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_231:218192..230151+

transcript sequence

>TCONS_00053432 ID=TCONS_00053432|Name=TCONS_00053432|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5003bp
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ATGGACAAAGAGTAACATGCTGCTCGCCTAAAAAATAAAGCAGGAAACAA
TGG

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transcript from alignment at scaffold_231:218192..230151+

Legend: exon

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>TCONS_00053432 ID=TCONS_00053432|Name=TCONS_00053432|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11960bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_231:218192..230151+ (Clytia hemisphaerica)
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AGAAAGATCACGtgcacaaacaacaaaattattaGGATGGCGATTCCGAC
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CTTTAAAGAAATTCAGATAAAGTAATGCTGGTTTCGTTGGTAAATCAAGA
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GAAAATCCATTGGTTCCACCAATCAACTACGCCCTTATAATAAAGTCCTT
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CCGTTTTTCCACAATCGGATTTATCGGATTCTCTTGTTCGGTATCAATGA
CGATCAATGCGCTGTCACTTTTCTCGTCGTAATTTTCGAGGGTTTGCTCC
AACTCATTATAACTCTCTTGTTCTTGGAGCAATGTTGGTGAGCTTGAAAG
GCTTTCTTGTTGGCACGTGATTCGACATGTTGAAAGGAGGAGAAACAAAG
ATAAGGAATGGACAAAGAGTAACATGCTGCTCGCCTAAAAAATAAAGCAG
GAAACAATGG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_033734	XLOC_033734	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_231	supercontig	scaffold_231:218192..230151 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.000797302	0	0.010695	0	0.00309092	0.0767999	0.102272	1.00074e-07	0	0	0.0295746	0.0451428	0	0	0	0.00195153	0	0	0	0	0	0.0107018	0.0145151	0.0801319	0.0322547	0.0592209	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00053432 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00053432 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00053432 (transcript) - C. hemisphaerica