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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00054701 ID=TCONS_00054701|Name=TCONS_00054701|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9848bp ATGCTAAGTATTCTCCATGTGACAGAGATTTGATTGCTACAATCGAGAGT AAAGCCATCCTGAATGGACAACCGAGTGATTCGCTAAGAGAATCTTTAGG AAATAAGTACACCATCTTTTCATTTCGAAGACTTCTTATTGGCGATTTCT GCTTACCTCAACCAAAGAAGCCAACGTACGTCAAACCATTTCAACCATTC ACCATCGAAATATGCAAAACGTTTCGAAGAAATTTTGACTCGAAAACATT CGTGGATGAAGAAGAcgtaaaattgaattatttggTGACAAAAATTGNCT CGAAAACATTCGTGGATGAAGAAGAcgtaaaattgaattatttggTGACA AAAATTGATAACAATTTCGTGAACGCCGAGTCCTCGTGGATTTCAGTGGA TTCTTCAAGTCATCAGTTCATTGGCATCGTCCCAACAAACATCTTCTCGG CTACACAAAGCTTGAAATATAATGTCAGTGTTCGAGCAATCGACTCAGAT AACATGCATGCCAATGGTGACGTTCTAGTTACGGTTAGAAGGGCTCAAAT CAACTCTTTTTATATCTTCGAAAGTAAAATCAAGCCAAAAGACAGCCAAC TCACGAGTCCAATTGATatcaaaatgaagttttctgACGGGGTCAACAGA TTCTTTGGTTCCGACGCAGCTATGAGTATTTCAGGTTTTGAAGCAAATAA TGACATTTACAGGATTCGATGGCAAAACTGTCTAATGGTGACATCTTGCA TTAACGAAGCTgctcttcaaattttgaaaagtaacATCATACAAGGAGAA AACCAACCAGTTCAAGACTTCAGTGACGCTTTGTCAGAATTCGACGTATT 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AKYSPCDRDLIATIESKAILNGQPSDSLRESLGNKYTIFSFRRLLIGDFC LPQPKKPTYVKPFQPFTIEICKTFRRNFDSKTFVDEEDVKLNYLVTKIXS KTFVDEEDVKLNYLVTKIDNNFVNAESSWISVDSSSHQFIGIVPTNIFSA TQSLKYNVSVRAIDSDNMHANGDVLVTVRRAQINSFYIFESKIKPKDSQL TSPIDIKMKFSDGVNRFFGSDAAMSISGFEANNDIYRIRWQNCLMVTSCI NEAALQILKSNIIQGENQPVQDFSDALSEFDVLEIGLNIADVCKTDINPP TSKDNPLEVHLPICGGFVYQIPEDQFTDTEDGNTRSLDVFLTTDTDSEVN IVYNWMAYDVTKQTLTGYPTLFEATLFNQEKKKLILTARDKTGLTSKVEL VIIFEEINEPKFFYVVGMTTLETSEMKKNFELSVKIAQFLNGSHKDIGVK SITKEKFIFFNCTMTFIPCHWAASNQIFTKLGEENRPNEVLKTLLLPKYD ILYVASEYDLPCSEDAVNPPILKFELETISISMCRWMDFVVPENTFYDLE DGNTRKLQLSFQSTLSQPFDNWILFKQQDQKFHINTLANVAINQPAEGYS FSVIATDSSSRTASTEMKIKITGPFSILEECKLKMSLTILNQLTMSSISL MRMLISKMAIYFQIKTEEIGAVDFQIDSQMKQVTFFWSFCSDVYRRVEYQ TNSKALMVDYYNFIVKILLKLYQNDRKTIRSEFLQSFGSEIQVNEVIPMF SGRCQNLPPIVYPGTASLQMDVYYYGYSSQIYQNTIFYDFEDGWTYSLHV TMRNSNRASLFIDSWINVDNVSYNIYAVANSFVRSLTTYSFTYYLYAQDS GGLETNIAITVNIIKSTLNLSPFRFSFIYIYRGSPGQVFVSQTVYLIQKF KLHYTITSNQIVTFSYTVTYGNLNYRLMIWSVLQQDCQSNIYLSTASMRS LSDGSLNQNFVKQFRDFMDLKNIFISTTCQPKTEVVINYNITLPQITFCQ VFSYQLKYDLFYDPVDGGMSNMQLQLMNENGMLVSKSSWLQINPTSLQLY GVAIRRNYRRLASQKFQLKVTNGRGVTNSLAFEAVISDEPFTTDCPITMS FTYKYFTESTQNIDVLTEMIRMLQKYYNDQEVNIKVLSFQRVDSTFTMVW SNCSSSFRSSTLSTAKNGYTEENRQKIKFVFDKIYMNGQIKQEFQTFMSQ WSLLISFVSVSYCCIEKGPVAKENEIRLNVDYCKPVNYIIPEDMFNDECD GSTRNLQMKLFYANNQEIDSNEWIQLNKEQAIFGIVTEVVKMNSPQNGYR YLLKAFDYSGRSTSISVIVNIIGNIPDYEAYFVTGYSNTNNEMVSTTQIL YETYQHLVGMIDSQNQVDSPNIFIKEFQYPEVITWTKCELSECDHGKVTS ILDKFQIQRHDAIPNTKFIESASSQMTPYWIQSFIFNQQCGSGIIIITVN PEIPKEENKGNCEMFTYQIPSNLFVASTQMDSRNFVMTARFVGSQSITTS SLIQFNQAKQTFYGYAVSYLMQSSSFQMEVTATHPQSGQKASTEIKINFP NKTITDNLNETICLINTTLISKYRAVYPDVDILSKFSQLITSYIKTSNIE IVWYKRQQLNNSVWSILWTDCFALYTFYQNKNGIQYFNTMETTISSLIQS NGELNQDFQQFLQKYEFFKFINITTSEGCGEPPNTPPDPKTPVEVLMPDC GAFEFPLEEDAFVDGIDGNTRNLDVEMMFVDGKAVPEDYWIVLNKTQFFV GSVNKEIIENQPKGGYEFKLVATDSGGLSSTMKMKVKHSGKQLPNPDYNF NVVGTIAEDFQSEVISVIKIKILKAVSNYVRPNQVEAYKTFYFQTFTVGD KIRFTVSQCKECDPFQIAPFELMDKSKAESIFESIVNVEDANAEIFDSKC GTINTLNPPFELLKVKYCEYYRYSFVQQFGEYLKNQLDYKLTDKNGNEFP RDYFLYFNKDELTVEAFPTPQIWNDAPTIYEFHFLVTFAFQPNTPAKFLY NLTVPEVRTFPKTADYSIVIQTLESQELPDGYFISKTLNNIRKIINDNEG NITFYNFQRLSTDPFQYRIDWKICIVGEKCDSNFVKNITEKLLNNELQPS DDIVAAFSPDSIQNIETECENRPPTAMKNYTIVIKSCGHFIYQLPRSLAK DEEDGDLYSMSIQLKNKDGSSLDRTSWVQLNEETKSIIAIPTAKVYESLL QTPLNFLLLIADTEGKSIETILILTGEEKSSDSYYSTTITFQNNLGTNAP FVEIQIVILRNIASTNSSNSLDDYRLVDFKKLASDESSYQMIYSICKIDE TVCLPEDNEIKTSEKQLQNDDGNPNKLDKLSPGILLKDIQFTKRYTIDEV PKTAEDSIKLAVDSCCHSRLYCLENDIFVDKEDGDIKNLKLSLMRRDTSP NSDFVGLVDDCIYVVSYQNFLPGIYNFVLEAQDKCNNTKPINIEVEVLKK CKDEFGVEFSVDIEKPAGEKIDQKDVYRIKSELEKYFSTEDNIAVISKEE QTSGKYTLNLGYCTLDINACDLKSVEQIISKLDENGESELTSILKIMNIE LQDINIERKGDCTKPPFPPPESKLEKLEFNVTYCEHMDVKMAEDTFFNQE GLSTRDFQLQLLTVDGKDVGKDSWIQLNKTSQSIYGYIRFSDNQNQPKAF NYTLFVRKNEQDRGLKVPLCVYVIGEEPVLDYQMNIKSTILGDPSIPNVY YEIEIIKLLASFFGRGPLNNLGLARSSSSLNEIESFKFSFCNARKKSCDC VLIRETQSKSTDGNGISSISNDLFLFREAETIVQGKCSESKAPVINKDII DFIQLRKGEIFEVSVPENAFTDDEDGGMSNLTLCIKDNQNHQLDKTSWMK VNQEKICGVYTLNEQRNQISTNKLEKFNLVAKDGCGKEAYNTFTVILQES EIKASASYCLIIDENIEQFKKDCSKVENIVEIIAEKFIIPESDVIITKII SKDENKTQFEWQIPNSNDITCTVQEKSSKQILPNGNVDNDFVLQLDKVNV KVEEILIKCVSTDTIKTPDKSEFPWWVIILLIVILVLLFLIWCLWLFIPR CCKENCCLSLFCERCCTKSGRFSSLNNENDPDYDENKEPIVDSDSIDGMP MVYTKFNKESDTSSNPSTKGELVDGKFSKPKEDETSMDSGQFSDPLELPP LYDHQHGYIDSPGNIQTSTTKTITNKRTTGRDFNRIDERDVKLDFNTHRT DQIDQGHQKSQAFYESWKDPQQTNTDYQSIRYVNRQYKNNQTPPGYIEEF YNDNRQATIGSYAGFNNYEERRYNEQRRARRA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_243:745375..755222 Legend: exonCDSfive_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00054701 ID=TCONS_00054701|Name=TCONS_00054701|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9848bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_243:745375..755222 (Clytia hemisphaerica) AGCTCTTCGAGCTCTTCTTTGCTCGTTGTATCTTCTCTCTTCATAGTTAT
TGAAGCCAGCGTACGAGCCTATGGTCGCTTGCCGATTATCGTtataaaac
tcttctatgtatCCAGGAGGtgtttgattatttttgtaTTGTCTATTGAC
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ATTCATAGAAAGCTTGACTTTTCTGGTGACCTTGATCTATTTGATCAGTT
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CTCTTTTGGTTTCGAAAATTTCCCATCAACTAGCTCTCCTTTGGTGCTTG
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ATCCCATCAATAGAGTCAGAGTCAACAATTGGTTCTTTATTCTCGTCATA
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GCTGTTCGTTCAGTGTGTATACACCGCATATCTTCTCCTGGTTCACTTTC
ATCCAACTTGTTTTGTCGAGCTGGTGATTTTGATTATCTTTTATACACAG
TGTCAGGTTTGACATACCTCCATCTTCATCGTCCGTAAAAGCATTTTCTG
GTACGGAAACCTCGAAAATCTCACCTTTTCTTAGCTGAATGAAATCGATT
ATATCTTTATTGATAACTGGAGCTTTAGATTCGGAACATTTCCCTTGAAC
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CTCTTCCAAAAAAGCTTGCGAGCAATTTAATAATTTCTATTTCGTAATAC
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ATAGTCGAGAACAGGCTCTTCACCAATGACATAAACACAAAGAGGTACTT
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GCTTTGGGTTGGTTTTGGTTGTCACTGAATCTAATATATCCATAAATTGA
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TGTTACGTTGAATTCCAATTTTTCGAGTTTCGATTCTGGAGGTGGAAAAG
GGGGCTTTGTGCAATCCCCTTTTCTCTCTATATTGATGTCTTGTAGCTCT
ATATTCATAATTTTTAAAATGCTTGTAAGTTCTGATTCGCCATTCTCGTC
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TCTTTGCTAATTACTGCAATATTATCTTCAGTACTGAAGTATTTTTCTAG
CTCACTCTTGATGCGGTACACATCTTTTTGATCAATTTTTTCTCCTGCTG
GTTTCTCGATGTCGACAGAAAATTCAACACCAAACTCGTCTTTGCATTTC
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TTGAGCTTCCAAAACGAAATTGTAAATACCTGGAAGAAAGTTTTGATAAG
ACACAACGTAAATGCAATCATCAACTAATCCAACAAAATCGCTGTTTGGT
GAAGTATCTCTTCTCATCAAAGACAATTTCAAGTTTTTTATGTCCCCGTC
TTCTTTGTCGACAAAAATGTCATTTTCTAAACAATACAATCTGCTATGAC
AACAAGAATCGACTGCCAGTTTAATAGAATCTTCTGCTGTTTTTGGGACT
TCGTCAATGGTGTACCGCTTGGTAAACTGAATGTCTTTGAGCAGAATGCC
AGGAGAAAGTTTGTCCAGTTTGTTTGGATTTCCATCGTCGTTTTGTAATT
GTTTCTCGGATGTTTTGATTTCATTATCTTCAGGAAGACAGACAGTTTCG
TCAATTTTACAAATGGAATAGATCATTTGATAACTGCTTTCATCACTTGC
AAGCTTTTTAAAGTCAACTAAGCGATAATCATCCAAAGAATTACTGCTAT
TCGTGGAAGCAATGTTGCGCAGGATCACTATTTGAATTTCAACAAAAGGA
GCATTGGTGCCCAAATTATTCTGGAAAGTTATCGTTGTACTGTAATAAGA
ATCGCTTGATTTTTCCTCGCCAGTCAATATGAGAATTGTTTCTATCGACT
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AGACTTTCATAAACTTTAGCAGTAGGTATTGCTATTATAGATTTCGTCTC
TTCGTTAAGTTGCACCCAGGACGTTCTATCAAGTGAAGATCCATCCTTGT
TTTTCAATTGAATGGACATTGAATATAAATCTCCGTCTTCTTCATCTTTG
GCCAGACTCCTTGGAAGCTGATAGATGAAATGCCCGCATGATTTGATCAC
TATTGTGTAGTTTTTCATAGCTGTAGGAGGTCTGTTTTCACATTCCGTTT
CAATGTTTTGTATGCTATCAGGAGAAAATGCTGCTACTATATCATCTGAT
GGTTGAAGTTCATTATTTAGTAGTTTTTCAGTTATATTCTTCACAAAGTT
GCTGTCACATTTTTCACCAACAATGCAAATTTTCCAATCAATTCTGTATT
GAAACGGGTCCGTCGAAAGTCTCTGAAAATTGTAAAACGTTATATTTCCC
TCGTTATCATTGATGATCTTTCGAATGTTATTTAGCGTTTTACTGATAAA
ATAACCGTCTGGCAATTCTTGACTTTCCAATGTTTGAATCACTATTGAAT
AATCGGCTGTCTTTGGAAAAGTTCTAACCTCTGGTACCGTTAGATTGTAT
AAGAATTTGGCTGGGGTATTTGGTTGAAACGCAAAAGTTACAAGGAAATG
AAATTCATAGATTGTTGGGGCATCATTCCAGATTTGTGGTGTTGGAAAAG
CTTCAACAGTTAATTCATCTTTGTTGAAATACAGGAAATAGTCACGAGGA
AATTCGTTTCCATTTTTGTCAGTGAGTTTATAATCAAGTTGATTTTTAAG
ATATTCACCAAACTGCTGGACGAAGCTGTATCTATAATATTCACAATATT
TCACCTTTAATAATTCAAAAGGAGGATTCAATGTGTTAATTGTGCCGCAC
TTCGAATCGAATATTTCAGCGTTTGCATCTTCGACGTTTACGATGCTCTC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Blast
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