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transcript sequence >TCONS_00055245 ID=TCONS_00055245|Name=TCONS_00055245|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=485bp CTCATTTGCAAGAATCAAACTCGCTGAGCACAAGtcatcttttttcattt cttcagaaaacaaacTACTAACAAAAAAACACATCATCGACACGCGTGAC CTTTCCACACTTCTTCTTCCACCATTATGCATCTTTTGGCCATCGTCATC ATCTTATTGGCCTTGATGTCCCAACAACAACAAGGTGTACTTTGTCTCGA TCATGTAAACCTCGACGATGACATGTTGGATGCAGGTGGACAAGGCTGTG GAGCTGCCGGTTATGTGCTTGATGCTCCTATCCCAGAATCTCAACTCATT ACTGGACATCAACAACACAGAAAACGACGTGCGGCCACGAACCATGAATT TAAGGTGTGGCCGAACGGTGTTATACCATACTCGTTTGACAAAGCTATGC CCAGTAAGTATATCAAGATCTGACTCAACGTTTCCTTCGTTGTACCAtgt caatttcaattttgaaaataataaagttACTTCCC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_251:739709..760902- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00055245 ID=TCONS_00055245|Name=TCONS_00055245|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21194bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_251:739709..760902- (Clytia hemisphaerica) CTCATTTGCAAGAATCAAACTCGCTGAGCACAAGTCATCTTTTTTCATTT
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GCTATTTTAGAATTTCTCAGGGAAATCCCCTTTGTCTCAAATATTTTGTC
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GGTGTTTTAGAGCCAGTCCACAAAGCCTTAAAATGTTCTTAGCTTATTCT
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AAGGTCTCCTCTTATGTCTTACAACTTGTTGTTTTTTCTCTTGCGTTATA
ATAGAGATGTTAGAATCGTGTTACGTGTTTCATACATGTTATCTTGTGTA
GTAGAATATTCTTGAAGTAGAATCTTGTTTGCATACATGTGCGTGGAAGT
ATGGTTCAATGAAGTATAATCCCGAAGGGACCTTTCTCAGGCAAGAAAAA
GTGAAGCCTTAAAATATGCGCCGTATTTTTTACCACGGATTGTATCTAGC
GATTCCTTTGTTTTTGAGTAACATCTTTTTCGAAATGCAGATGTGAATTT
TAGCTTAGATCTGTCATCTGTGTAAAAACCAGATGGACTGCACTAGGCCG
CGCAACTTTGGTAGGATTTGGTAGGCTTGAAATCCTAACAAGGAGATCCG
ATTCTAGCCCTTCAGTCTTATACTTCATTGGTATGGTTGTGTCTAGGCTG
CACGCATCTTCAGAATTAATTTTAATGTAGGGGTGTCTATCGGTGTAGAC
AATTTCGTCGTTTAGTAGCCGTTGTATCAGCTACAAGATTGCTGGTAGCT
CTCTTTAATCCGATCATCTAGAGAAGAGTAAAAAAAAAAGAATTTTCCAG
CTGAGAGGACCAATAACTTATTTGGAATTACAGAATATTCAAAAATAGAA
TGCCGGAATAGTGAGTTGGCTGCACGGTTAGAGGAATTATTTTTTAGTAA
TTTTTAGAATTTATCGACTTTAAATCGGTGGCTTGTAGTTTTCATAAGAT
TTCAAGCAAAAGAGGTCAGACAGTAATTTTTAAAAATAGCTTTACAATAC
ATAAATTTCATTCATTGCTGTATAGCCACTTTTTTTCATTACCAGCGATA
AGCTTATAACTAACACCCTGGTACAGAGTACAATAGAGCTGATACGCTAA
ACTTGTGTGTACTCACAAAAGATCGACCGTCAACATCACAATCCAGTTAG
TTTTAGTGGAAAGAATTTCCGGTTTCTTTTTCCCATCGAGCTTTGCAGCT
CATAAAAGACATTTCATGTTTTAAACACGGTATGCAATATTTATTTACAA
AGAGATCACGAATCTATGATGCCAATGTCAATTTTAAGTGGGGTTTGTTT
TTCTATATTAATAACATTCCATTACATGTTGATGCCATTGATTTTAAAGC
CTGAAGAGTTGGTGGAATCTTCAACCTTTCTCAAGCAAGAAGAAGTGAAG
TCTTAATGTTTGCGCCGCGTTTAGAATGACGGATTAAATCTAGTGCTTTC
TTTGTTTTCTTTCAGTGTATCTTCCTAAATCCAGTCATAGAATATAATTT
CAATCCAGTAATTTCAATCCAGTGTTTGTGCGAAAACCACGCGGTTCACA
TGTTTTCGATGGGAAATAGGTGGCTTCATTTTCCATCCAAGAGTTTCGTA
TCTTTCCTCTTCCCGGGCTTTGAACTCAATCCTCGTGCTTCATTTTCGAA
AGTTGAGCAATCACGCCGCTTTTTCAAACAAAGACACGATGAATTAACGA
TTCGTCGGACTAAATAATAACATTCGCCGCTGGTAGACAATACTGTAAAC
TGCACACGCTAAGGGTTTGCCCGCCTAGAATGAAGCATTCATCGAAGTTA
CTGTAAGTTGGTCTAATGTCAACATTACGAATCTAATTCTGTCAATCGTC
TTTAGAGATAGGAATAATAAGAAGAAGGTCGGAATCGCTGATTGAAACGA
TATTTCTTTGGTTAGCGCTCAGAGAGGAAAAAATCACTTTTCCGACAGAG
CAAAATCCCTGACGTTACTTGATTTGAGTTAGGTAGCTATATGACAAACT
GACGTAATGTTGTTAAGTGAGTCTTTGACCTTATACTTTCTGACTCAGAC
ACTCGGTGACAACATGCTAACAAGGAGTTCATTATATTTTTACCGTCAAA
TCATTTCTCAATTGTCATGTAACAGGAGCTTTATATCGGTTTTTGATGTT
TACTCAGAACACATAGTGTGTTCCGGTTTTATCATATTTTTGTCAACGTA
ACTAACTGTCGATGTAATTTTGTTCTTAAAGAGTAGTTGTAGTTTGATTC
GACCTGCTCTTTACACAGTTCACATAACTTTGGATGGTTCAAAGAATGTT
CTAGGCCGGCTCTTGGAAAATTCTTGTAATATTCTATAATACTGTACACG
TTGTTAATTTTTGAAGCCTTTGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTGAGT
TTTTTGATGTTTTTAAGATGTTCTTAATTTCACCATTTTGTGAGAATTTT
TTGTTTTTTTTTCGTAAAAAACCGGGTGTTTCAGAATCCTCAAAGGCTTA
GAATGTTCTTAACTTTTTCTTAATATTTTCGCCTTCAAAGCCTCATGTTC
TTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAAGCGTTATATATTTGATTTGGCAGA
TGTTTATACCTAAGTATAGACATAGAAGACCTAAGTAAGGCTTAGAAGAT
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GATTTTCAGGCCTAAATATTCTAGAATATTCTTAATAAACTCACTGCATT
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TTAAGAAAAATAGTGAACCTCGTGTTCTTATAAAGTTTTTCTTATAAAAA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1575043694:760847..760902 | TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1575043694:760847..760902 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1575043694:739709..739934 | TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1575043694:739709..739934 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1510915933:760847..760902 | TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1510915933:760847..760902 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1510915933:742312..742514 | TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1510915933:742312..742514 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1510915933:739709..739934 | TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1510915933:739709..739934 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1491911889:760847..760902 | TCONS_00055245-exon-scaffold_251-1491911889:760847..760902 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_251 | supercontig | scaffold_251:739709..760902 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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