TCONS_00056738 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00056738
Unique NameTCONS_00056738
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length5612

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00056738 ID=TCONS_00056738|Name=TCONS_00056738|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5612bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_282:246627..252238+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00056738 ID=TCONS_00056738|Name=TCONS_00056738|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5612bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_282:246627..252238+ (Clytia hemisphaerica)
aaaaaacttcatttttgggcATATTTTGACCCAAATAGacccaaaaaata ttatttaaaaaatcgggctctgtcacattatTGCAATGAGACAAACTTGC CAAAAAGTAACCTTTCTTTAATTTCGATTGATATAAACAATATACAATAT TTCCAGTGGTAGCAAAAAATATCatccaataaaaaataaagtataaaaat aAGGAAATGATAAATGTACAAAATGACAGTTGATTTAATaattgaaattt gttgaaagtcaaacgcttttatttataagaaccagtaaattttggctgag cctgagattgtttttaaatttctacTGCTCCAAATAATAAAGCCATTGTT CTGAGGGCCTAAATCTGAGGttggtgttcttataaaattgttcttataaa tcaaaaagcgtgtaacagatcataaaaaagttttagtCAAACTGAAAGTT TGTTAGAAAAAGAACATTGTCATTATATGATAGAAAGTATCCAAATTCGT GACAAAACTGTATCTTTactaaaaaattgaagaagcataAAAAAAGAGTT AAATAGATATAATGTATGATATCAACAACTAAAATTTCATACAAAAGAAT TATGatacattaaaattttaatttcaaaaatgaatccaattttttccatt gatAAACAGACCACATCAATCAGTTGGTGGTGAACATATTTTAGAATGTC CACTTCTCCAGTGAGTGACCTGGCAATTCCTGGAACAATACAAATTAATT CTACAGCGGCCACACTTCTTAAACTTTTTCTCTCGCTCATCTGGTTGTCT TTTACCGCAAACTGGATTCGAGCAGATAACAGTTTCAAGGACTTTACAGG TCTTATTTGTGGTGTTCATATGATGAGTGAACTTGGACAATAAAAGCTTT TTGTGGTCTGGTAACTCTTCCAGGTTAACCATATGATTGATACAATTACT 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035747XLOC_035747Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056738-exon-scaffold_282-1491911889:246627..252238TCONS_00056738-exon-scaffold_282-1491911889:246627..252238Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00056738-exon-scaffold_282-1510915933:246627..252238TCONS_00056738-exon-scaffold_282-1510915933:246627..252238Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00056738-exon-scaffold_282-1575043694:246627..252238TCONS_00056738-exon-scaffold_282-1575043694:246627..252238Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_282supercontigscaffold_282:246627..252238 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

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Values :
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00056738 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
ZOOM
x 1
POSITION
0
5001000150020002500300035004000450050005500Sequence
Match NameE-valueIdentityDescription
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