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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00056862 ID=TCONS_00056862|Name=TCONS_00056862|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4033bp
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ACAAAAAAGACCCTCCCCCAGAGGATCTGAAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_284:394904..409474+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00056862 ID=TCONS_00056862|Name=TCONS_00056862|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14571bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_284:394904..409474+ (Clytia hemisphaerica)
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GCTCAAATGGGTCTTGGACATTTTAATTTCAGATCCCCATGAAACTGTTT
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TAATTGTTTATCTTCTATCGAATATTACTCTTCAAGTAAAATTATGTGCA
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GGGGGTATGTCATCTTCCAAAGTGATGTTTGAATTTCTTGAACAGAAAAT
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CCCATGTATTGcttttatctttttaatttcaatacAGTACCGTAGTTACC
GTTAACAATCTAAAAGTCCTCTCAGCAATCATGTCAATccgattgattga
ttgaaatctCAGAATTATGATGTAATTGAaccaaatcaaccaatcaatgg
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AGCTTTTCCCCAAAAAGCACCCAAAGGGAGGGTTAGACCATgctcagacg
ttacggttccgttccgaaacgaaacggttccgaaacaagtgtgaacgtca
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ATTTAGACCCTTCAAACTTTCTGAAGTCTATTGTTgaataggcttctgct
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TGACCATGTTTTTACTTCTTCAGACTCTGGTCGATCCTCAGGAGCATCTG
CAAGTGACGAAAGTCGAGACAAAGATGAACTTATTGAGAATTTAAAGAAC
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TGctactacacaatagatttgataactgaaaattcattattttcgaaaaa
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TACATTGGAGCTGGAGTGGACACTGTGGGTTTGCTTGCGATGAAACTATC
TTgttattttattgtttattgGTTAGCAGAACTGTATCCCTTGATCACAG
TATCTGGTCACTGTATCTGATTtgccttaaaggttttatttttacatgag
tGTTTCCgattcatatcagacacatatctcatatcaggacagtgtcttgc
tattgttatactatgctgatataagcaaaaaatgtttttcttttcctctt
tctgaggAAATTCTttccaatcttgctccacatccgtgtcaatccaatgt
gaaaaaagcttgtgaattaaaattgatgagtaagcaaacgatatcactct
tattaaaaAGTAGCTCTTTTTGTGGGGTTTGATATCAAGGGGTCTTTCTA
CTGGTCAATTTGCAAAGGGGAGATTTTAGGAGCTATTCCATAAAAAATAA
TTACCCTTCGTATTGAGGATTGTCAAAAACATTTTCGGAATTCAGTAAAA
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ACAATAATATTATATAAGAGTTCCTATAGTGGTTGGATATTGCAAATCGa
tctgacaatatattgtggacaccttttcaataacAGTTCGAGAAATTGTA
TAGATTCGCAACGTTGCAACATTCCGAAACGTTTTTTCGCAACGCTTCAC
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GAAAAATCGCtaggtaggaaattaaaatgctagggtgaaaagtttccttt
tgaGTAGTTCTTCAAAATGCACATTATTTTGTGACCTCGGTCCAAGCCCT
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AAAGCTGCGGAATTTCGCAGCGCTGCGGAATATGACAACGCAAAAGATGC
GAAATTTCGCAACGTTGCGGATCTATGCAATTTTCCGAACTGATAAGGgt
tacatacactacacaatattatattgtcaggcaattatattgatgatata
ttgttGAGTTCCGGCAACAGCTTGATTTGCAtttttccaacaatataggg
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atttgccTTTCATTAAGTAACTGACTCTGGATGTACAGACAAAAAAGACC
CTCCCCCAGAGGATCTGAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
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| TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1575043694:394904..395068 | TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1575043694:394904..395068 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1491911889:398350..398520 | TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1491911889:398350..398520 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1575043694:398350..398520 | TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1575043694:398350..398520 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1510915933:400799..400898 | TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1510915933:400799..400898 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1575043694:407027..409474 | TCONS_00056862-exon-scaffold_284-1575043694:407027..409474 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_284 | supercontig | scaffold_284:394904..409474 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
