Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00058491 ID=TCONS_00058491|Name=TCONS_00058491|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1647bp GTCGAGGAGGAGGTATTTCAATCGATCGTTTTACAGTAATAGTACTAAAC CCTTTTTGAAACCACTTGTGGTGGAGTGAGAGAGATTCATCTTatctttt tgttgattttctgagTTGAtttattttgtgactttttaccagaaaaaaag tttttattttattttggaaagaGGAATTCATAATGGCAGTTGTTCAAGCA CCGCTCGCTTTGCTGCAATACAATCGAGATGATGAGCAATCAATACTGAC TGGTATTCGTAATCAATCGCAATCACAAAAACGTCGCATTCTCGATCTTG AAAACCAATTCGAAGATGCTCGAGTACGAATCGATAAACTTTTACAACGA AAATCGATTCGTCGAAATACATACGATTCGGTATCGAATTCTTCATCGTT CGTGACTCCTTCAGCTTCGTTTACATCGGAACGATCTTCGCATTCATCAA AAATGAACATCGATAGAAGCGATTCAATGGATTCGACGTCCTCAACAGAA TTACACAAAACACAAATCAACATCAATCCAGCGAATAATACTAAACAAAC TTTCGGTACTGTTACACTTACAGTAAAAGTTGATGAAGATTAACGGGaat cgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattg attgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgat tgattgattgattgaatgattgattgaatgattgaatgattgaatgattg aatgattgaatgattgaatgattgattgaatgattgaatgattgaatgat tgattgaatgattgattgattgattgattgatctgTTGACAATGAAGGAT CAGAGGGTAATGGTTCAAAATGTAATGTTTATTCTTTTTCACGATATTAC AAATATTACTAACCTCGAATTCGTAAGGGACTGAAAAATCTATTTgcaaa aaagtgacaaaattggTACAGATCTTTCGAAATTTAGTATCTGATATTTC CCTCTCTTATCCATTTCTACCTACGACTAcatataccttattacacgaat atcaCTATTTACTATTTTATTACCacggattgaaaaatttcgtgttaata aaaatccccttaattaaaaccagtcATGGTGTcagtccttgaaaaagcaa taaaattcgtgttaatttttggagtgttaatttcaaggccgttgaatact tgcctagtaatattcgtgtaacgTGTAATAGGTATTATCCTCAATTTTCT AATTAAAATCAAGCGATCTTCCAAAAGTGCTGCATTATTGCAAAGTATCA TGAAAATGTATAAAAGGGCATATTTTGTACTCTCCATTTCGATTACTATA TAATATTTAAATGGTTGTTAAAATCATCCAAAGACCCAGAACAACCTGGA AAATGTCTACCCAGTgagaatttcaacgtaacttGTTTAATGTATATTAT AAATTTTCTAGGGATTATTTTTCATGGATTATTTTTCTTGTGATTATTAT AATTAACAAAATTTCcccgtttctttttttttcgctcATGTTGTACAATG TTTAGAATTTATATAAGAGAAACTTACGGTTTATATAAAAATAGGTTATA GGGTtttttaaacgaaaaaaaattgttttgttctttatttatgaaat Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_311:1202812..1206780+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00058491 ID=TCONS_00058491|Name=TCONS_00058491|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3969bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_311:1202812..1206780+ (Clytia hemisphaerica) GTCGAGGAGGAGGTATTTCAATCGATCGTTTTACAGTAATAGTACTAAAC
CCTTTTTGAAACCACTTGTGGTGGAGTGAGAGAGATTCATCTTatctttt
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1491911889:1202812..1203059 | TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1491911889:1202812..1203059 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1510915933:1202812..1203059 | TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1510915933:1202812..1203059 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1575043694:1202812..1203059 | TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1575043694:1202812..1203059 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1491911889:1205382..1206780 | TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1491911889:1205382..1206780 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1510915933:1205382..1206780 | TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1510915933:1205382..1206780 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1575043694:1205382..1206780 | TCONS_00058491-exon-scaffold_311-1575043694:1205382..1206780 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_311 | supercontig | scaffold_311:1202812..1206780 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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