|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00059560 ID=TCONS_00059560|Name=TCONS_00059560|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1609bp
ttttgtttcagcgttaaaatcaaaatgatttaaaaaaaattaacaaagac
aTTGGTTTGGCTTTTGGGTGATTGATAAATGTAAAAAAAGGAAGTCATTT
CCTTGAAGAGTATTTTGGTCGTTTTGTGAATTGACAACAAAGTTTAAGAA
ATCGATACAACATAAAGATGGGCGGCGATTCAGAGGAAAACACCAACAAA
CAACTTAACGAGTGCATCAGAAATGCAAGACAGATGCTAGATGTGTCCAT
CAAAGTCGCtaataaaaaattcaatgaaTCAATCATTAATGCTAGAATGA
AATTTGAAGAATCCATTGCTAGTTCCAAACATATTCTAAACACCTCAGTA
ACCATCGCTAAACAGGCATTAGAAGACTCGATAAACGAAGTGAAAATGCA
TTCAACAACGACAGATAATGAAAGTTTTAAGATGAATTCCTCCAAGTCCT
TCCAACAGAACACACAAACAAGAAATGAGGGAAATTCAAATGCGCCACAC
CATTCTAATAGTGAATCCAGTATTTCAACCTCGAATATCATACCTAACAG
TGCTGACAACGGTAATATTTGTGACAAAATTAAGAGAGAAATAATCGATT
ATGCTAACGATGGAACCATCGAAAGAAGAATTTTATTCAGCCAAAGAAAT
GACTGCAATAAAGAATCACCAATGAACAACATAAAAATGGAAACTGAAGA
CAATGTTTGTGGGATGAACAACCCATTTTTAACTGTTCAGCCACAAGAAG
TAAATAGGCTGCAAGAGAATCTAAGTTGTCGTAATTTTGAGGTACCTACT
ACTGTTCAAACACCATCAAAAAGCAACTATATCGATGTTGATCAGGACAA
ATTACAAGAAAGATTAAAATGTACTACATGTGGTATTGTATTTCTCACAA
AATATCTTCTGGATAAACATACTTGTCGCCctttgattttaaataaaaat
ctttCTAGACCTCATCTTCGCAGTGACACAAAGCGGTTGGGCCAAAAACA
GAATACTTCAGTTTTAGAATCTTTCGCTGCTATTGATCGGAAGTTCAAAT
GTGATTTCTGTAAAAATGTGTTCCCAAACCAAAAATTTCTCAATAACCAT
GTAAAAAGAAAGCATAACCCGAAAGTACAATTCAAATGTGACATTTGTGA
AAAGTCTTTTGTTAAACAAGCTAGACTTAATCGACACCTGAACGTGCATA
AAGGAATTAATTTCACGTGCAAGGTTTGTGGTAGCTCCTTTGCACGAAAG
GTCCATCTTAACATCCATAAGGGTATTAAGCCATTTAAATGTAAATTCTG
TGGTGATTCCTTTCGAAAGAAGAAGGCTTTAAAAAAACATGAAGAGATGC
ATGCAGAATTAAAACAGGGTCAAGTCGATAGTAAATTGGCGAATACTTAA
AGCACTTGATGGATGATTCTACTAGAGGTGAAATGTTTGTGGTAAATCGT
TCTCCTCAGAAATGGGCATATGGGAAGCATTCATTTCATGTACAAGAAAT
TCCGAAAGATCAGCTCGTTTCGAATATGATAGTGTCAAAAACCTTTCGTG
TATATTTTCTTCAATTCGCGTTATTATATATAAATTTATCAGTTTTTCGA
GTTCAATCT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_329:792843..807582+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00059560 ID=TCONS_00059560|Name=TCONS_00059560|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14740bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_329:792843..807582+ (Clytia hemisphaerica)
ttttgtttcagcgttaaaatcaaaatgatttaaaaaaaattaacaaagac
aTTGGTTTGGCTTTTGGGTGATTGATAAATGTAAAAAAAGGAAGTCATTT
CCTTGAAGAGTATTTTGGTCGTTTTGTGAATTGGTAAGTACAATCATAAT
TATACAGCTGGCACCAAccatttcaagaaatttcaaatccttttcctttt
ttttaagttttataaTTATATAATAACAATGATTTAATGATAACAATAAG
AATAACATAATaattatttaactttttttggtgaaaattttgttcctttt
ttcaGACTCTTAACAccaaatattcatttttctctACTGTTTTCACAAGT
TTCAAACTGAAGAGCTGTTCCAAAATCGAAAATGACGTAACAGGACAGAT
CTATCACCttgtatccacctgtattactcgtaatccattcttatctacgA
TTTTCACACATTTAGACAGAAAGGCTTTTCCTGAAATCAAAAGTGACGTA
ACAGGAGAGACCTATCACCgtgtatccacctgtattactcgtaatccatt
cttatctacacttttcacacatttagatagaaaggcttttcctgaaatcg
aaagtgacgtaatggtgTGAGATCTATCACCgtgtatccacctgtattac
tcgtaatccattcttatctacgcttttcacacatttagacGGAAAGGCTT
TTCCTGAgatcgaaagtgacgtaatggtgTGAGATCTTTCACTgtgtatc
cacctgtattactcgtaatccattcttatctacgcttttcacacatttag
acGGAAAGGCTTTTCCTGAgatcgaaagtgacgtaatggtgTGAGATCTA
TCACCgtgtatccacctgtattactcgtaatccattcttatctacgcttt
tcacacatttaagacgGAAAGGATTttcctgaaatcgaaagtgacgtaat
ggtgTGAGATCTATCACATTGTATCCACCTGTATcactcgttatacattc
ttatctacacttttcacacatttagacAGAAAGGCTTTATttcctgaaat
cgaaagtgacgtaatggtgTGAGATCTATCACCatgtatccacctgtatt
actcgttatacattcttatctacgcttttcacacatttaagacgGAAAGG
ATTttcctgaaatcgaaagtgacgtNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCaatcttatctacgcttttcacacattt
aagacgGAAAGGATTttcctgaaatcgaaagtgacgtaacaGGAGAGATC
TATCACCttgtatccacctgtattactcgttatacaATCTTATCTActct
tttcacacatttaagacgGAAAGGATTttcctgaaatcgaaagtgacgta
acaGGAGAGATCTATCACCttgtatccacctgtattactcgttatcaatc
ttatctacgcttttcacacatttaagacgGAAAGGATTttcctgaaatcg
aaagtgacgtaataggaGAGATCTGTCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGGAGAGAT
CTATCACCttgtatccacctgtattactcgttatacaatcttatctacgc
ttttcacacatttaagacgGAAAGGATTTTCCTGAAATCGTAAGTGACGT
AACAGGAGAGATCTATCACCttgtatccacctgtattactcgttatcaat
cttatctacgcttttcacacatttaagacgGAAAGGATTttcctgaaatc
gaaagtgacgtaatgggagAGATTTATCACCctgtatccacctgtattac
tcgttatcaatcttatctacgcttttcacacatttaagacgGAAAGGATT
ttcctgaaatcgaaagtgacgtaataggaGAGATCTGTCACCATGTATCC
ACTTGTATTACTACAaatccattcttatctacgcttttcacacattcAGG
AAGGAAATGATTTTCcgtgaaatcgaaagtgacgtaatggtgTGAGATCT
ATCACCgtgtatccacctgtattactcgttatacatcattatctacgctt
ttcacacatttaagacaAAAAGGATTAtcgggaaaacgaaagtgactaGG
AATTGGAGAGATCTGTCACCATGTATCCACTTGTACTACTCGTAATCCAT
TCTTATCTacacttttcacacatttagacAGAAAGGCTTTTCcgtgaaat
cgaaagtgacgtaacgGGAGATTTCTATCACCgtgtatccacctgtatta
ctcgttatacatcattatctacgcttttcacacatttaagactgaaagga
ttatcgggaaatcgaaagtgacgtaatgggagAGATTTATCACCctgtat
ccacctgtattactcgtaatccattcttatctacgcttttcacacattta
agactgaaaggattatcgggaaatcgaaagtgacgtaatgggagNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNtttctagtttcttccaaacctgtgaatagtgtagatagagtgt
gataagacgttattgagggtgagagagggtgactagattttcactttcgt
tttctcaaatttctagttattgtcaaacctgtgaatagtgtagatagagt
gtgataagacgttattaagggtgaaagggggccacaaaattttcactttc
gattactcaaaattctagtttcttccaaacctgtgaatagtctAGATAGG
GTGTGATAAGAtgttattaagggtgaaagggggcgacaagatttccactt
tcgatttctcaaattcctagttATTTCCAAActtgtgaatagtgtagata
gagggtgataagacgttattaagggagAGAGACGGTGACtagattttcac
tttcgttttctcaaatttctagttattgtcaaacctgtgaatagtgcaGA
TAGAgggtgataagacgttattgaGGGGGAGAGAGGGTGACtagattttc
actttcgttttctcaaatttctagttattgtcaaacctgtgaatagtgta
gatagagtgtgataagacgttattgagggtgagagagggtgactagattt
tcactttcgttttctcaaatttccaGTTTCtgtcaaacctgtgaatagtg
cagatagagtgtgataagacgttattaagggtgagagagggTGACAAGAC
TTCTGGTTTGGATTTGTTAAATGTTCTTAATGTTGATGAATAGTATATAA
TAAATGTTTATATGAAATTTACAACTAATTGtagtaattaaaaaaattca
aaaaaagttaatttaaataattttttatatagTTCAACTAGTAAATATTC
TAAGAAATCAAGTTTTTAGCTTTTGCTCTTGTCATGAGAGTAGCGTTTGT
TCGTGAAGGGTGAAAACAAAATTCTGGATCTTTAAGAATGCGCGTCCATT
TGCCTTGGCCATACTTCCTCAGTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAgatattccttataaaaaagga
atATGCATATAGATATAGTGTATGAtctgttccttataaaaaggaaCAAC
ACTTATATACAGTATGATATGATCCTTAAAAAAAGGAATATGTATATATA
GTGTATGACATGTTCCTTTTAAAAATGAATATACCCTTGTAGAACATGAT
TTATGGTTATAATCCTCAAATCATTGTTATAATCTTCAAACATTACCCTT
TGTTCTCTCGTAAAAGAATTTCCTTAttcatattaaatttttttccttca
attttAAATGAATATTATGTTctcttttaaatgaaaaagaacatTTTGTT
CTAATTTGAAAAGTTCCCAATCAAACAATACCAGCACTATTTGTTCAATC
AAAGGGAACTCATTGAATACTTTTGAAGGACCATATTCACGTGCACTGTT
GGCCAAATTGTTCCCTTGAGAGAGCATGGCAGAATATAATTTGTCAGAGA
ATCCTTTGTTCCTCCGAATCAGTTCTGAATTATCAATTAGGAACCTATTC
CAAGATCAAAGGGGGGTAATCCCATTGATTTTAGGTAGTTTTCACAAATC
CATAATTATGTTTATGTAGATAAAGGGTCATTTAGATTGTTTGAGTAGAG
TCTGTGGAGTCTTGATTTTCATCTCAAACAAACGCTTGAAATAAAAAGGG
TTTACTACTTTTGATTCCAATCAAAGTGCAGCAAGACATGGTAATATTAG
CTTTTTTCTCACTcttgattatcttttcaacgaacaCAATACGGCTAGAG
GTTCTATTAAAAGTTATACCAATTTCTCTGTCGTGAATTAAATTAAGACA
GACTTAACTTATTTGACTTTTTCACTACAGaaaacaaaacttgaaaaaat
ctCTTACTGGGCCAAAtaactttgaataaaaatgtaaaaaaaaataaaat
actatATGTGTTGTATGTGCATTGTGATCATGATGAAAAGAAGTcatcga
aacgtcaaaaaaatgcaaaaatctaTATTTTTCGTCTTCGCATTTTTATT
TACAGACAACAAAGTTTAAGAAATCGATACAACATAAAGATGGGCGGCGA
TTCAGAGGAAAACACCAACAAACAACTTAACGAGTGCATCAGAAATGCAA
GACAGATGCTAGATGTGTCCATCAAAGTCGCtaataaaaaattcaatgaa
TCAATCATTAATGCTAGAATGAAATTTGAAGAATCCATTGCTAGTTCCAA
ACATATTCTAAACACCTCAGTAACCATCGCTAAACAGGCATTAGAAGACT
CGATAAACGAAGTGAAAATGCATTCAACAACGACAGATAATGAAAGTTTT
AAGATGAATTCCTCCAAGTCCTTCCAACAGAACACACAAACAAGAAATGA
GGGAAATTCAAATGCGCCACACCATTCTAATAGTGAATCCAGTATTTCAA
CCTCGAATATCATACCTAACAGTGCTGACAACGGTAATATTTGTGACAAA
ATTAAGAGAGAAATAATCGATTATGCTAACGATGGAACCATCGAAAGAAG
AATTTTATTCAGCCAAAGAAATGACTGCAATAAAGAATCACCAATGAACA
ACATAAAAATGGAAACTGAAGACAATGTTTGTGGGATGAACAACCCATTT
TTAACTGTTCAGCCACAAGAAGTAAATAGGCTGCAAGAGAATCTAAGTTG
TCGTAATTTTGAGGTACCTACTACTGTTCAAACACCATCAAAAAGCAACT
ATATCGATGTTGATCAGGACAAATTACAAGAAAGATTAAAATGTACTACA
TGTGGTATTGTATTTCTCACAAAATATCTTCTGGATAAACATACTTGTCG
CCCTTTTATTTTAANTTTTctctttatattcaattttaaaggaacaacac
ttatatacagtatgagatattccttataaaaaaggaatATGCAAATAGAT
ACAGTGTATGAtctgttccttataaaaaggaacaacacttatatacagta
tgatatgatccttataaaaaagaaatatgtatATATAGTGTATGACATGT
TCCTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATACAACATAAAGAT
GGGCGGTGATTCAAAGGAAAACACCAACAAACAACTTAACGAGTGCATCA
GAAATGCAAGACAGATGCTAGATGTGTCCATCAAAGTCGCTaataaaaaa
ttcgatgaaTCAATCATTAATGCTAGAATGAAATTTGAAGAATCCATTGC
TAGTTCCAAACATATTCTAAACACCTCAGTAACCATCGCTAAACAGGCAT
TAGAAGACTCGATAAACGAAGTGAAAACGCATTCAACAACGACAGATGAT
GAAAGTTTTAAGATGAATTCCTCCAAGTCCTTCCAACAGAACACACAAAC
AAGAAATGAGGGAAATTCAAATGCGGCACACCATTCTAATAGTGAATCCA
CTATTTCAACCTCGAATATCATACCTAACAGTGCTGACAACGGTAATATT
TGTGACAAAATTAAGAGAGAAATAATCGATTATGCTAACGATGGAACCAT
CGAAAGAAGAATTTTATTCAGCCAAAGAAATGACTGCAATAAAGAATCAC
CAATGAACAACATAAAAATGGAAACTGAAGACAATGTTTGTGGGATGAAC
AACCCATTTTTAACTGTTCAGCCACAAGAAGTAAATAGGCTGCAAGAGAA
TCTAAATTGTCGTAATTTCGAGGTACCTACTACTGTTCAAACACCATCAA
AAAGCAACTATATCGATGTTGATCAGGACAAACTACAAGAAAGATTAAAA
TGTACTACATGTGGTATCGCATTTCTCACAAAATATCTTCTGGATAAACA
TACTTGTCGCCctttgattttaaataaaaatctttCTAGACCTCATCTTC
GCAGTGACACAAAGCGGTTGGGCCAAAAACAGAATACTTCAGTTTTAGAA
TCTTTCGCTGCTATTGATCGGAAGTTCAAATGTGATTTCTGTAAAAATGT
GTTCCCAAACCAAAAATTTCTCAATAACCATGTAAAAAGAAAGCATAACC
CGAAAGTACAATTCAAATGTGACATTTGTGAAAAGTCTTTTGTTAAACAA
GCTAGACTTAATCGACACCTGAACGTGCATAAAGGAATTAATTTCACGTG
CAAGGTTTGTGGTAGCTCCTTTGCACGAAAGGTCCATCTTAACATCCATA
AGGGTATTAAGCCATTTAAATGTAAATTCTGTGGTGATTCCTTTCGAAAG
AAGAAGGCTTTAAAAAAACATGAAGAGATGCATGCAGAATTAAAACAGGG
TCAAGTCGATAGTAAATTGGCGAATACTTAAAGCACTTGATGGATGATTC
TACTAGAGGTGAAATGTTTGTGGTAAATCGTTCTCCTCAGAAATGGGCAT
ATGGGAAGCATTCATTTCATGTACAAGAAATTCCGAAAGATCAGCTCGTT
TCGAATATGATAGTGTCAAAAACCTTTCGTGTATATTTTCTTCAATTCGC
GTTATTATATATAAATTTATCAGTTTTTCGAGTTCAATCT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1491911889:792843..792975 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1491911889:792843..792975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1510915933:792843..792975 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1510915933:792843..792975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1575043694:792843..792975 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1575043694:792843..792975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1491911889:802748..803532 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1491911889:802748..803532 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1510915933:802748..803532 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1510915933:802748..803532 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1575043694:802748..803532 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1575043694:802748..803532 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1491911889:806892..807582 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1491911889:806892..807582 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1510915933:806892..807582 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1510915933:806892..807582 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1575043694:806892..807582 | TCONS_00059560-exon-scaffold_329-1575043694:806892..807582 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_329 | supercontig | scaffold_329:792843..807582 + |
Blast
BLAST of TCONS_00059560 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: GFI1B (Zinc finger protein Gfi-1b OS=Homo sapiens GN=GFI1B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 82.0333 bits (201), Expect = 5.897e-17 Identity = 41/108 (37.96%), Postives = 58/108 (53.70%), Query Frame = 3
Query: 1044 FKCDFCKNVFPNQKFLNNHVKRKHNPKVQFKCDICEKSFVKQARLNRHLNVH-KGINFTCKVCGSSFAR----KVHLNIHKGIKPFKCKFCGDSFRKKKALKKHEEMH 1352
+ C C VF L HV+R H+ F CDIC K+F L +H +VH + +F C++CG +F R HL IH +P+ C+FCG F +K +KKH +H
Sbjct: 163 YHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIH 270
The following BLAST results are available for this feature:
|
