TCONS_00060054 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00060054
Unique Name	TCONS_00060054
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3129

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_333:302453..308525-
coding sequence from alignment at scaffold_333:302453..308525-

transcript sequence

>TCONS_00060054 ID=TCONS_00060054|Name=TCONS_00060054|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3129bp
taaagaaaTGACAACACAATTCTGAAAAgtttaaacaatttttcttgcaa
ttgattagatgaTGTTGGTTGGATACGCTCTTATTGTCGCGATTTCTCTT
TTACCAGCATCTTTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGA
TGAAGTCACCTGTGGAAAATCATTAACAATATCACCATGTCTATCGATAG
GTTATGCTGTGAAACACGTAACAAAAGaTGACGATACCATCTATCTTGAC
AACACAGAAAAGCAACAGACATCAGGCCTAATAACGTACGTGGAGTCAGC
TTCGGTGATCGTCTCAAATAACTTGACCATTGATGTTGTCAATCATGAAG
TCGATGCTGCTAAAGTACTGGTCAAAACAGATCGACATCCAGCGTTATTC
TATATGCATTGTCGTTATTATTGTACCGTGAATATCAGGAACATCGATAT
CCAAAGTCCTTTTACGGGCTTTTACCTCTCTACGACGTTTCATGGGAAAA
TAGCGGTCACCAATAGTGCCATCCATTGTAGAGTTAGCATATTTGGGAAA
ACTATGAGAAGTGGAATTAATGCTGAAGTTATATTCAATAAGACTAAAAG
TAAAGGTTTTAACATTGTTGGCAACGTATTAGTAAAGGCGTATTCCTCGG
TATTTGATGCTGAAAATATATTCCTTAATGTGGACCCCATCAGCGGGAGA
GATTTTATCAGTGTTAGTTTCCATGATAGTATTCTGAAGAATGGAACGTT
TATGTCCAACTGCGCGTTATCACGATACAGCACTTTCAATTTCGAAAACT
GTACTTTGAACGCGTTTCGAATTTTGTTACGAGAAATTAATAACCTATTC
GTACAAAAATCTACatttgaaaacaatcaaaaaacaTTGACTGGAAGCAC
GCAACACTATCTATCATTTATCCAAGTCTACAAAGCTGCTCTGGTTAATA
TTCAAGATTCCAACTTTATTAACAGCACTTTTGGAGCAGTTAGTGTATCT
TATTGCACGAATGTTACAATTAATTCGTCacaatttaaagaaaatattaa
gcttGTTGAAGATGCACAAGGAGGAGGGGCGCTTCTCTCCTTTTTTTCTG
GCGTCTCCATAAAAGATTCTACCTTCTTCAACAATACTGCCATTAGAGAA
GGAGGTACTATCCATCTTATAGGTGGCAATCTGCATTTAACGAATATATT
GATCAACACACCAGCGTCAGTTTACAACTTAGTTATATTCTGCCAATCAA
AAGGTGTCTTAGAAAATGTCACCATTGTGGCTAACGACTTTGTCAATGAT
AAACGAACCATTTTAACATTATTACCGTTCAATGTCGATTTTATCAATAT
GGGGACTTGGGAAATGAAATCAAATGTTTCAGTATATTGTGCTGAAAACC
AAAAAATTGACATGATATCAGAGCGTACACCCTTCAGCAACAGTACCAAT
AAATTTACTGATATAACAACAACTTGTACTCCATGCCCTAAAGGAAGTTA
CAGTTTTCAGAAAGGCTTTCAACATTTATGGTTTGCAGACCacaatcgaa
aaaataaaagTCGACAACAGACTAGTTTTGAAGACGTTTACCAGAATAAT
GTAACCTGTTCTAAATGTGCATCAGAAGCTTCGTGTGACTCTGGCACCAT
CAAAAGTAAAGGAAATAGTTGGGGATACAGGCAAAATGACGAAGTTAAGT
TTATTCAATGTCCGGCTTTCTATTGTTGTTCACCATATGGAGAACGTTGC
ATTTCGTATGATACATGTGCTAAGAATCGAGAAGGTACTCTATGTGGAAA
ATGTATGGAAGGATTCAGTGAAGATATTTTTTCAGCTAAATGTCTTTCAA
ATCAAATATGTTCCCAAAAATCTGTTTTGTTTTGGATTGTGTACATCTTG
GGTGCAATAATCTTCACATATTTCCTTATGTACTTCAAAGATGTCTTCAT
TTTACTGAAAATGTATCTACGTCCTCGCAAATACCGTTCATTAGCGATGG
AGGAACCATTGATGGGACCAAATGCGAATGCTGGAAATGTTTTGAATGAG
GTTGAAAATGACATTGAAGATGAGGAGGTTTCAGATGAGGATGAAAACGA
CTCTCAAGACTTACTAATACCTTCGCAAGACAATGAAAATCACCATGCTT
ATAACCCATTGACAGGCCAAGATGATATAGCAGTCAACTCTAAGAATACT
gggaaaaacaataaaaacaccaTATCAGGAATATTCAAGATCCTTGTTCA
GTTTTACCAAGTGGAATCAATGCTACGAGTAGATTCACCTTTTAAGACGT
CTTTGTCAGTTTCGATGAACACTTTTATGGATTTCATTATCTCTCTTTTC
AACATCAAGATCATTTCTGATAACGACGCTAACTCATTTACCGTATGTCC
TATAGAGCGCATGACAGCTCTTGGTAAAGAGTTTATAATGTCCAGTATAC
CATTAACTTGCCTGGTGATCCTTCTCATATCCTACATTATCAATCAAATT
CTCAATAAACAAAAACCAGAACGCCAACCCAAACAGAACCAAATCTTAAC
CAAACCATTTACCACAAGAATTAAAGTCTGTATTTTACAACTTTTCTTAA
CCGGTTATGTCACCATATCCTTGTATCTTCTCAAACTGGTACATTGCATC
GAAATCAATGGCATCAATGTTGTTTACGTGCAAGGAGATACCAAGTGTTA
CCAGAGCTGGCAGTACTTAGCTATATCTATCATTGTTTGCTGGGTCGTAC
CATTTTCTGTctctttatatttttcaagtcaaaTGCTTATGGATGCTGTT
CTAACACCAAATGAATTTCTAGCAACTCTCTTCATACCAGCATATATCAT
TGTCAAAAAGATTCAAATGAGAAGGAATAAAAATGTTAATAAAAGTTATG
TTGATTCATTACTACACAAGCAAGAACGTGATAATCTGGTCACTGTTCTT
ACTGGACCTTTTCGTAATACCTATAAGCTTGGTCACCCGTTGGTGTTCTG
GGAGAGCATAATGATTCTTCGTCGTTTGATTTTATGCCTTATCTACGTTT
ACGTTAACAATGTGGTGATCAAGCTATACTTAACATTGGCTATTTTGATT
CTATGTTTAGTTCATCATGGATTTATTAG

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00060054-protein

>TCONS_00060054-protein ID=TCONS_00060054-protein|Name=TCONS_00060054-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1023bp
MMLVGYALIVAISLLPASLQREVYVSPLGKDEVTCGKSLTISPCLSIGYA
VKHVTKDDDTIYLDNTEKQQTSGLITYVESASVIVSNNLTIDVVNHEVDA
AKVLVKTDRHPALFYMHCRYYCTVNIRNIDIQSPFTGFYLSTTFHGKIAV
TNSAIHCRVSIFGKTMRSGINAEVIFNKTKSKGFNIVGNVLVKAYSSVFD
AENIFLNVDPISGRDFISVSFHDSILKNGTFMSNCALSRYSTFNFENCTL
NAFRILLREINNLFVQKSTFENNQKTLTGSTQHYLSFIQVYKAALVNIQD
SNFINSTFGAVSVSYCTNVTINSSQFKENIKLVEDAQGGGALLSFFSGVS
IKDSTFFNNTAIREGGTIHLIGGNLHLTNILINTPASVYNLVIFCQSKGV
LENVTIVANDFVNDKRTILTLLPFNVDFINMGTWEMKSNVSVYCAENQKI
DMISERTPFSNSTNKFTDITTTCTPCPKGSYSFQKGFQHLWFADHNRKNK
SRQQTSFEDVYQNNVTCSKCASEASCDSGTIKSKGNSWGYRQNDEVKFIQ
CPAFYCCSPYGERCISYDTCAKNREGTLCGKCMEGFSEDIFSAKCLSNQI
CSQKSVLFWIVYILGAIIFTYFLMYFKDVFILLKMYLRPRKYRSLAMEEP
LMGPNANAGNVLNEVENDIEDEEVSDEDENDSQDLLIPSQDNENHHAYNP
LTGQDDIAVNSKNTGKNNKNTISGIFKILVQFYQVESMLRVDSPFKTSLS
VSMNTFMDFIISLFNIKIISDNDANSFTVCPIERMTALGKEFIMSSIPLT
CLVILLISYIINQILNKQKPERQPKQNQILTKPFTTRIKVCILQLFLTGY
VTISLYLLKLVHCIEINGINVVYVQGDTKCYQSWQYLAISIIVCWVVPFS
VSLYFSSQMLMDAVLTPNEFLATLFIPAYIIVKKIQMRRNKNVNKSYVDS
LLHKQERDNLVTVLTGPFRNTYKLGHPLVFWESIMILRRLILCLIYVYVN
NVVIKLYLTLAILILCLVHHGFI

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_333:302453..308525-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00060054 ID=TCONS_00060054|Name=TCONS_00060054|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6073bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_333:302453..308525- (Clytia hemisphaerica)
TAAAGAAATGACAACACAATTCTGAAAAGTTTAAACAATTTTTCTTGCAA
TTGATTAGATGATGTTGGTTGGATACGCTCTTATTGTCGCGATTTCTCTT
TTACCAGGTAAGCTATAGTATTCAAAATATTCAATACACAGGCTACAAAA
TTAAAGTCTGAAGACAAATCACGCTTTTACTCGAAATTTTTATGTGCTTG
TTACATGACGTTTATTTCTGATTGGTTTCGAATTTATAAACACTAATAAA
GTTATCCGCTGTAAATTGTAAAGCAAGTAACATGGGAACAAAATCACGTG
AACTTTTTCGAGTAATCACATGTTTTGACTGCATTGATTTGATTTTGCAA
CCCGCGTATTTTCTGAATATCATCCCGATTATTCGATTGTAAGTAGAAGT
AAGTCTGAAGCCGCAGTTGGCAGGTGACCCTAAGGCTCTCTTTCGATGTC
TAACTATCCAAAGGTAGGGATTCATTTTTCTTGGATAGCTCCACTTATCA
TTAACCTTTTCTGAGTATTAAGCAGAAAGGCATCAATTATCATTTTTGTA
CTAAGATTGTACTAGGGTCAAAAGTTTTATTGGTGTTGAATTGTCAGACA
GTCTTTTCAAAATTTCCTTTTTTAAAAGCAGTGTCATACTCATTTGGAGA
CTGAAAAAGTGACCCTGATGTTATATATGTCATATTTATGATGAGTGACC
CCCTTACTTTTGCAGAGTTGTCAATATTTATTATCTCTTCTTCCAAATGT
TTCAGCATCTTTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGATG
AAGTCACCTGTGGAAAATCATTAACAATATCACCATGTCTATCGATAGGT
TATGCTGTGAAACACGTAACAAAAGGTATAAAAAAGTTTACGTTACATAA
GCCTATATTGAAAAGCAATAAATTTTGGAATATTTTGAATTTCAGTGATA
GTCAAAAATCAGACTAAGTTTCTAGAAGAAATCATCTTCATCCTCGCACT
TCGAATGAATTTCACCAATCGTCGCTTGAAAACTTGTAGTTGAAAACGAA
TAATTACTTTTTAATCGGATAGCGAGTACCTCACCAAAAGCCGGGATTTT
TCATCTCGTTAGTATAGGCTAAATCATGGATGGCTATTTTCTTTTTCATT
AGATGACGATACCATCTATCTTGACAACACAGAAAAGCAACAGACATCAG
GCCTAATAACGTACGTGGAGTCAGCTTCGGTGATCGTCTCAAATAACTTG
ACCATTGATGTTGTCAATCATGAAGTCGATGCTGCTAAAGTACTGGTCAA
AACAGATCGACATCCAGCGTTATTCTATATGCATTGTCGTTATTATTGTA
CCGTGAATATCAGGAACATCGATATCCAAAGTCCTTTTACGGGCTTTTAC
CTCTCTACGACGTTTCATGGGAAAATAGCGGTCACCAATAGTGCCATCCA
TTGTAGAGTTAGCATATTTGGGAAAACTATGAGAAGTGGAATTAATGCTG
AAGTTATATTCAATAAGACTAAAAGTAAAGGTTTTAACATTGTTGGCAAC
GTATTAGTAAAGGCGTATTCCTCGGTATTTGATGCTGAAAATATATTCCT
TAATGTGGACCCCATCAGCGGGAGAGATTTTATCAGTGTTAGTTTCCATG
ATAGTATTCTGAAGAATGGAACGTTTATGTCCAACTGCGCGTTATCACGA
TACAGCACTTTCAATTTCGAAAACTGTACTTTGAACGCGTTTCGAATTTT
GTTACGAGAAATTAATAACCTATTCGTACAAAAATCTACATTTGAAAACA
ATCAAAAAACATTGACTGGAAGCACGCAACACTATCTATCATTTATCCAA
GTCTACAAAGCTGCTCTGGTTAATATTCAAGATTCCAACTTTATTAACAG
CACTTTTGGAGCAGTTAGTGTATCTTATTGCACGAATGTTACAATTAATT
CGTCACAATTTAAAGAAAATATTAAGCTTGTTGAAGATGCACAAGGAGGA
GGGGCGCTTCTCTCCTTTTTTTCTGGCGTCTCCATAAAAGATTCTACCTT
CTTCAACAATACTGCCATTAGAGAAGGAGGTACTATCCATCTTATAGGTA
TGTTTTGTTATCAAATAATTGTTTCCCAAATTATTGTTTCAGTGTTGTTT
CAGTAATATATCATTCAGAGCCTCCCATAGTTTCATAGAAGATCACCGAT
TCTGTGCACATAGCGCGCTGCTATATGTGAAATCTGACGATCAGACTAGG
TTTTTTAGCCCAAACATTCAATATCGCATCATTTTTTGCCTGAAAACGAA
AGTGAAAGCGATTGGATTCTAATATTTATGGTGATGAATGTTTGCTTTGG
TGTGATAGTTTTGCTTTTGCCAATCACCACCACGTAGTATCTAGTTAGCT
AGAAAGTTACTTCAGACAATCGGCAAAAAAATAATAGAAAGAACAAATTG
ATGGGTTGACTCTTTTATAGTGAATAGGTTATTGAGTTTCAAGCCCGAAG
GGCTAGAGGCGAGATTCCTGAATGGGAAATGAAACCACTTATTTCCCATG
CATAACGCCCGCGCGTAGTTTTTACACACACAAACGCTGGATTGAAACTA
AAATTTATCGGTAGATTTCAAAAAATGTAGTCCTCCAAAACAGAAATACC
GCTAGATACAATCCGTCGTCATGATTACGGCCCGTTCTATGCGCGTTTTG
GGTGGGAAATAAGTGGCTTCAATTTCGCTTACCTGAGAAGAGTTAAAGTT
TTGCCTTTTGCCCTTCGGGCTTGAAACTCAATGGAATAGGTTCCATGCGG
GTAATGATCAAACTGCTTGGAGATTGGTTAAGTCTCTTCAAAAAACGCTG
AAATAATGTAATACGCTAGGAGATAAACATTAAAGAATCTTTTAGTATGT
TTAAGGGTGTTTTTGATCTCAATATTTAAAAATGATGGCTTCTACTTTTC
AAATCTTCCAGGTGGCAATCTGCATTTAACGAATATATTGATCAACACAC
CAGCGTCAGTTTACAACTTAGTTATATTCTGCCAATCAAAAGGTGTCTTA
GAAAATGTCACCATTGTGGCTAACGACTTTGTCAATGATAAACGAACCAT
TTTAACATTATTACCGTTCAATGTCGATTTTATCAATATGGGGACTTGGG
AAATGAAATCAAATGTTTCAGTATATTGTGCTGAAAACCAAAAAATTGAC
ATGATATCAGAGCGTACACCCTTCAGCAACAGTACCAATAAATTTACTGA
TATAACAACAACTTGTACTCCATGCCCTAAAGGAAGTTACAGTTTTCAGA
AAGGCTTTCAACATTTATGGTTTGCAGACCACAATCGAAAAAATAAAAGT
CGACAACAGACTAGTTTTGAAGACGTTTACCAGAATAATGTAACCTGTTC
TAAATGTGCATCAGAAGCTTCGTGTGACTCTGGCACCATCAAAAGTAAAG
GAAATAGTTGGGGATACAGGCAAAATGACGAAGTTAAGTTTATTCAATGT
CCGGCTTTCTATTGTTGTTCACCATATGGAGAACGTTGCATTTCGTATGA
TACATGTGCTAAGAATCGAGAAGGTAAGATGATGAACTTTAATCTTTCTT
CGGGCTATCCAGAAAATTGTTATCTTATTTTTTTATTTCAACTTTAATAT
TTTTAATATTGAGGATTGATATTAGATCCATGGAGTACTTCTTAAGAGAC
TTGGAACGAAGGTGATATATTTTCTCTAAATTTTTGGTTTACCTTTCTCG
CAGACCCGGTGAATATCCGTCCTACTGAAAAAATTGACCAAAAACTCGTG
GAAAAAAATTCTGAAATTCAACCCCACTGGAAAAGTGCCTTATGATTTTA
TCCTGGATTTTATCGCCATTGCCAATCGAAAAAAAAAAAATGACATACAC
TTCAAATTGATCAGGCCAATTGAGCTTGAACTTTCTATCTCTACTGGGAC
TTCAATCCCCACAGAGAGAAAGCTCCTGAGACAGGGGTGTTAAAAAGGAG
TATGAATCCCTGAGGATTTGAAAAATAACGTAACAAGAATTATCTTAAAA
ATCCAGGCCTCGACTTAGGTTTTCATAGAATGGCCCTGTATGGAGTCCCA
GTTAGGAGTACATCAAAAGATAAAATGAACTTATCCCCAACCAACCTCGT
CCCCGTGTATCCCAGGCTTTATTTACGTTACTGATTGACGCCAGAGAATT
ATCTAGCGCTCTAAATAACCAATAAAAAGCTGATAATAAGCAGGGAACGA
GGTTGATCCCCAACCATAATGATATGATAACCCCATGTGTTAAATGTTTT
CAGGTACTCTATGTGGAAAATGTATGGAAGGATTCAGTGAAGATATTTTT
TCAGCTAAATGTCTTTCAAATCAAATATGTTCCCAAAAATCTGTTTTGTT
TTGGATTGTGTACATCTTGGGTGCAATAATCTTCACATATTTCCTTATGT
ACTTCAAAGATGTCTTCATTTTACTGAAAATGTATCTACGTCCTCGCAAA
TACCGTTCATTAGCGATGGAGGAACCATTGATGGGACCAAATGCGAATGC
TGGAAATGTTTTGAATGAGGTTGAAAATGACATTGAAGATGAGGAGGTTT
CAGGTAACATTATAGACGATCCTATCGTCTACACAAGATCACTAAAAAAG
GAATAGTTTAGGAGGCAGGATAAATTTGAAAATGGTGTTTAGCCCGGGGC
GGAGTAAGCAGTGGCGGAGGTGCTTACAGTGTTGTTGTTGTTGCAAAACT
CTACCGCCACTATTTTCCCGTAAACCGCCCTCGCGCCCTGACTCTGCGCA
TATATACTTTCCCACGTTTACTGACCTTTAAACGGACGATAGCATCGTCT
AGTAACATTAGTAATCTTTGCGAGAAATCAAAGCCTCAACCAAAGTAAAC
AACCGCCTTACTTAACAAAATCTTTCAATCCCCAAATTAAATACCCACCA
AAAACAACACCACATTTTAATCTTCTACAGTATACTTCTGCAGCCATAAT
AATCATAGTTATTGGCTTTGTCTTTTAGATGAGGATGAAAACGACTCTCA
AGACTTACTAATACCTTCGCAAGACAATGAAAATCACCATGCTTATAACC
CATTGACAGGCCAAGATGATATAGCAGTCAACTCTAAGAATACTGGGAAA
AACAATAAAAACACCATATCAGGAATATTCAAGATCCTTGTTCAGTTTTA
CCAAGTGGAATCAATGCTACGAGTAGATTCACCTTTTAAGACGTCTTTGT
CAGTTTCGATGAACACTTTTATGGATTTCATTATCTCTCTTTTCAACATC
AAGATCATTTCTGATAACGACGCTAACTCATTTACCGTATGTCCTATAGA
GCGCATGACAGCTCTTGGTAAAGAGTTTATAATGTCCAGTATACCATTAA
CTTGCCTGGTGATCCTTCTCATATCCTACATTATCAATCAAATTCTCAAT
AAACAAAAACCAGAACGCCAACCCAAACAGAACCAAATCTTAACCAAACC
ATTTACCACAAGAATTAAAGTCTGTATTTTACAACTTTTCTTAACCGGTT
ATGTCACCATATCCTTGTATCTTCTCAAACTGGTACATTGCATCGAAATC
AATGGCATCAATGTTGTTTACGTGCAAGGAGATACCAAGTGTTACCAGAG
CTGGCAGTACTTAGCTATATCTATCATTGTTTGCTGGGTCGTACCATTTT
CTGTCTCTTTATATTTTTCAAGTCAAATGCTTATGGATGCTGTTCTAACA
CCAAATGAATTTCTAGCAACTCTCTTCATACCAGCATATATCATTGTCAA
AAAGATTCAAATGAGAAGGAATAAAAATGTTAATAAAAGTTATGTTGATT
CATTACTACACAAGCAAGAACGTGATAATCTGGTCACTGTTCTTACTGGA
CCTTTTCGTAATACCTATAAGCTTGGTCACCCGTTGGTGTTCTGGGAGAG
CATAATGATTCTTCGTCGTTTGATTTTATGCCTTATCTACGTTTACGTTA
ACAATGTGGTGATCAAGCTATACTTAACATTGGCTATTTTGATTCTATGT
TTAGTTCATCATGGATTTATTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_333:302453..308525-

>TCONS_00060054 ID=TCONS_00060054|Name=TCONS_00060054|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=18414bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_333:302453..308525- (Clytia hemisphaerica)
ATGAGGATGAAAACGACTCTCAAGACTTACTAATACCTTCGCAAGACAAT
GAAAATCACCATGCTTATAACCCATTGACAGGCCAAGATGATATAGCAGT
CAACTCTAAGAATACTGGGAAAAACAATAAAAACACCATATCAGGAATAT
TCAAGATCCTTGTTCAGTTTTACCAAGTGGAATCAATGCTACGAGTAGAT
TCACCTTTTAAGACGTCTTTGTCAGTTTCGATGAACACTTTTATGGATTT
CATTATCTCTCTTTTCAACATCAAGATCATTTCTGATAACGACGCTAACT
CATTTACCGTATGTCCTATAGAGCGCATGACAGCTCTTGGTAAAGAGTTT
ATAATGTCCAGTATACCATTAACTTGCCTGGTGATCCTTCTCATATCCTA
CATTATCAATCAAATTCTCAATAAACAAAAACCAGAACGCCAACCCAAAC
AGAACCAAATCTTAACCAAACCATTTACCACAAGAATTAAAGTCTGTATT
TTACAACTTTTCTTAACCGGTTATGTCACCATATCCTTGTATCTTCTCAA
ACTGGTACATTGCATCGAAATCAATGGCATCAATGTTGTTTACGTGCAAG
GAGATACCAAGTGTTACCAGAGCTGGCAGTACTTAGCTATATCTATCATT
GTTTGCTGGGTCGTACCATTTTCTGTCTCTTTATATTTTTCAAGTCAAAT
GCTTATGGATGCTGTTCTAACACCAAATGAATTTCTAGCAACTCTCTTCA
TACCAGCATATATCATTGTCAAAAAGATTCAAATGAGAAGGAATAAAAAT
GTTAATAAAAGTTATGTTGATTCATTACTACACAAGCAAGAACGTGATAA
TCTGGTCACTGTTCTTACTGGACCTTTTCGTAATACCTATAAGCTTGGTC
ACCCGTTGGTGTTCTGGGAGAGCATAATGATTCTTCGTCGTTTGATTTTA
TGCCTTATCTACGTTTACGTTAACAATGTGGTGATCAAGCTATACTTAAC
ATTGGCTATTTTGATTCTATGTTTAGTTCATCATGGATTTATTGTACTCT
ATGTGGAAAATGTATGGAAGGATTCAGTGAAGATATTTTTTCAGCTAAAT
GTCTTTCAAATCAAATATGTTCCCAAAAATCTGTTTTGTTTTGGATTGTG
TACATCTTGGGTGCAATAATCTTCACATATTTCCTTATGTACTTCAAAGA
TGTCTTCATTTTACTGAAAATGTATCTACGTCCTCGCAAATACCGTTCAT
TAGCGATGGAGGAACCATTGATGGGACCAAATGCGAATGCTGGAAATGTT
TTGAATGAGGTTGAAAATGACATTGAAGATGAGGAGGTTTCAGGTGGCAA
TCTGCATTTAACGAATATATTGATCAACACACCAGCGTCAGTTTACAACT
TAGTTATATTCTGCCAATCAAAAGGTGTCTTAGAAAATGTCACCATTGTG
GCTAACGACTTTGTCAATGATAAACGAACCATTTTAACATTATTACCGTT
CAATGTCGATTTTATCAATATGGGGACTTGGGAAATGAAATCAAATGTTT
CAGTATATTGTGCTGAAAACCAAAAAATTGACATGATATCAGAGCGTACA
CCCTTCAGCAACAGTACCAATAAATTTACTGATATAACAACAACTTGTAC
TCCATGCCCTAAAGGAAGTTACAGTTTTCAGAAAGGCTTTCAACATTTAT
GGTTTGCAGACCACAATCGAAAAAATAAAAGTCGACAACAGACTAGTTTT
GAAGACGTTTACCAGAATAATGTAACCTGTTCTAAATGTGCATCAGAAGC
TTCGTGTGACTCTGGCACCATCAAAAGTAAAGGAAATAGTTGGGGATACA
GGCAAAATGACGAAGTTAAGTTTATTCAATGTCCGGCTTTCTATTGTTGT
TCACCATATGGAGAACGTTGCATTTCGTATGATACATGTGCTAAGAATCG
AGAAGATGACGATACCATCTATCTTGACAACACAGAAAAGCAACAGACAT
CAGGCCTAATAACGTACGTGGAGTCAGCTTCGGTGATCGTCTCAAATAAC
TTGACCATTGATGTTGTCAATCATGAAGTCGATGCTGCTAAAGTACTGGT
CAAAACAGATCGACATCCAGCGTTATTCTATATGCATTGTCGTTATTATT
GTACCGTGAATATCAGGAACATCGATATCCAAAGTCCTTTTACGGGCTTT
TACCTCTCTACGACGTTTCATGGGAAAATAGCGGTCACCAATAGTGCCAT
CCATTGTAGAGTTAGCATATTTGGGAAAACTATGAGAAGTGGAATTAATG
CTGAAGTTATATTCAATAAGACTAAAAGTAAAGGTTTTAACATTGTTGGC
AACGTATTAGTAAAGGCGTATTCCTCGGTATTTGATGCTGAAAATATATT
CCTTAATGTGGACCCCATCAGCGGGAGAGATTTTATCAGTGTTAGTTTCC
ATGATAGTATTCTGAAGAATGGAACGTTTATGTCCAACTGCGCGTTATCA
CGATACAGCACTTTCAATTTCGAAAACTGTACTTTGAACGCGTTTCGAAT
TTTGTTACGAGAAATTAATAACCTATTCGTACAAAAATCTACATTTGAAA
ACAATCAAAAAACATTGACTGGAAGCACGCAACACTATCTATCATTTATC
CAAGTCTACAAAGCTGCTCTGGTTAATATTCAAGATTCCAACTTTATTAA
CAGCACTTTTGGAGCAGTTAGTGTATCTTATTGCACGAATGTTACAATTA
ATTCGTCACAATTTAAAGAAAATATTAAGCTTGTTGAAGATGCACAAGGA
GGAGGGGCGCTTCTCTCCTTTTTTTCTGGCGTCTCCATAAAAGATTCTAC
CTTCTTCAACAATACTGCCATTAGAGAAGGAGGTACTATCCATCTTATAG
CATCTTTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGATGAAGTC
ACCTGTGGAAAATCATTAACAATATCACCATGTCTATCGATAGGTTATGC
TGTGAAACACGTAACAAAAGATGATGTTGGTTGGATACGCTCTTATTGTC
GCGATTTCTCTTTTACCAGATGAGGATGAAAACGACTCTCAAGACTTACT
AATACCTTCGCAAGACAATGAAAATCACCATGCTTATAACCCATTGACAG
GCCAAGATGATATAGCAGTCAACTCTAAGAATACTGGGAAAAACAATAAA
AACACCATATCAGGAATATTCAAGATCCTTGTTCAGTTTTACCAAGTGGA
ATCAATGCTACGAGTAGATTCACCTTTTAAGACGTCTTTGTCAGTTTCGA
TGAACACTTTTATGGATTTCATTATCTCTCTTTTCAACATCAAGATCATT
TCTGATAACGACGCTAACTCATTTACCGTATGTCCTATAGAGCGCATGAC
AGCTCTTGGTAAAGAGTTTATAATGTCCAGTATACCATTAACTTGCCTGG
TGATCCTTCTCATATCCTACATTATCAATCAAATTCTCAATAAACAAAAA
CCAGAACGCCAACCCAAACAGAACCAAATCTTAACCAAACCATTTACCAC
AAGAATTAAAGTCTGTATTTTACAACTTTTCTTAACCGGTTATGTCACCA
TATCCTTGTATCTTCTCAAACTGGTACATTGCATCGAAATCAATGGCATC
AATGTTGTTTACGTGCAAGGAGATACCAAGTGTTACCAGAGCTGGCAGTA
CTTAGCTATATCTATCATTGTTTGCTGGGTCGTACCATTTTCTGTCTCTT
TATATTTTTCAAGTCAAATGCTTATGGATGCTGTTCTAACACCAAATGAA
TTTCTAGCAACTCTCTTCATACCAGCATATATCATTGTCAAAAAGATTCA
AATGAGAAGGAATAAAAATGTTAATAAAAGTTATGTTGATTCATTACTAC
ACAAGCAAGAACGTGATAATCTGGTCACTGTTCTTACTGGACCTTTTCGT
AATACCTATAAGCTTGGTCACCCGTTGGTGTTCTGGGAGAGCATAATGAT
TCTTCGTCGTTTGATTTTATGCCTTATCTACGTTTACGTTAACAATGTGG
TGATCAAGCTATACTTAACATTGGCTATTTTGATTCTATGTTTAGTTCAT
CATGGATTTATTGTACTCTATGTGGAAAATGTATGGAAGGATTCAGTGAA
GATATTTTTTCAGCTAAATGTCTTTCAAATCAAATATGTTCCCAAAAATC
TGTTTTGTTTTGGATTGTGTACATCTTGGGTGCAATAATCTTCACATATT
TCCTTATGTACTTCAAAGATGTCTTCATTTTACTGAAAATGTATCTACGT
CCTCGCAAATACCGTTCATTAGCGATGGAGGAACCATTGATGGGACCAAA
TGCGAATGCTGGAAATGTTTTGAATGAGGTTGAAAATGACATTGAAGATG
AGGAGGTTTCAGGTGGCAATCTGCATTTAACGAATATATTGATCAACACA
CCAGCGTCAGTTTACAACTTAGTTATATTCTGCCAATCAAAAGGTGTCTT
AGAAAATGTCACCATTGTGGCTAACGACTTTGTCAATGATAAACGAACCA
TTTTAACATTATTACCGTTCAATGTCGATTTTATCAATATGGGGACTTGG
GAAATGAAATCAAATGTTTCAGTATATTGTGCTGAAAACCAAAAAATTGA
CATGATATCAGAGCGTACACCCTTCAGCAACAGTACCAATAAATTTACTG
ATATAACAACAACTTGTACTCCATGCCCTAAAGGAAGTTACAGTTTTCAG
AAAGGCTTTCAACATTTATGGTTTGCAGACCACAATCGAAAAAATAAAAG
TCGACAACAGACTAGTTTTGAAGACGTTTACCAGAATAATGTAACCTGTT
CTAAATGTGCATCAGAAGCTTCGTGTGACTCTGGCACCATCAAAAGTAAA
GGAAATAGTTGGGGATACAGGCAAAATGACGAAGTTAAGTTTATTCAATG
TCCGGCTTTCTATTGTTGTTCACCATATGGAGAACGTTGCATTTCGTATG
ATACATGTGCTAAGAATCGAGAAGATGACGATACCATCTATCTTGACAAC
ACAGAAAAGCAACAGACATCAGGCCTAATAACGTACGTGGAGTCAGCTTC
GGTGATCGTCTCAAATAACTTGACCATTGATGTTGTCAATCATGAAGTCG
ATGCTGCTAAAGTACTGGTCAAAACAGATCGACATCCAGCGTTATTCTAT
ATGCATTGTCGTTATTATTGTACCGTGAATATCAGGAACATCGATATCCA
AAGTCCTTTTACGGGCTTTTACCTCTCTACGACGTTTCATGGGAAAATAG
CGGTCACCAATAGTGCCATCCATTGTAGAGTTAGCATATTTGGGAAAACT
ATGAGAAGTGGAATTAATGCTGAAGTTATATTCAATAAGACTAAAAGTAA
AGGTTTTAACATTGTTGGCAACGTATTAGTAAAGGCGTATTCCTCGGTAT
TTGATGCTGAAAATATATTCCTTAATGTGGACCCCATCAGCGGGAGAGAT
TTTATCAGTGTTAGTTTCCATGATAGTATTCTGAAGAATGGAACGTTTAT
GTCCAACTGCGCGTTATCACGATACAGCACTTTCAATTTCGAAAACTGTA
CTTTGAACGCGTTTCGAATTTTGTTACGAGAAATTAATAACCTATTCGTA
CAAAAATCTACATTTGAAAACAATCAAAAAACATTGACTGGAAGCACGCA
ACACTATCTATCATTTATCCAAGTCTACAAAGCTGCTCTGGTTAATATTC
AAGATTCCAACTTTATTAACAGCACTTTTGGAGCAGTTAGTGTATCTTAT
TGCACGAATGTTACAATTAATTCGTCACAATTTAAAGAAAATATTAAGCT
TGTTGAAGATGCACAAGGAGGAGGGGCGCTTCTCTCCTTTTTTTCTGGCG
TCTCCATAAAAGATTCTACCTTCTTCAACAATACTGCCATTAGAGAAGGA
GGTACTATCCATCTTATAGCATCTTTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCC
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TATGTTGATTCATTACTACACAAGCAAGAACGTGATAATCTGGTCACTGT
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TGGCACCATCAAAAGTAAAGGAAATAGTTGGGGATACAGGCAAAATGACG
AAGTTAAGTTTATTCAATGTCCGGCTTTCTATTGTTGTTCACCATATGGA
GAACGTTGCATTTCGTATGATACATGTGCTAAGAATCGAGAAGATGACGA
TACCATCTATCTTGACAACACAGAAAAGCAACAGACATCAGGCCTAATAA
CGTACGTGGAGTCAGCTTCGGTGATCGTCTCAAATAACTTGACCATTGAT
GTTGTCAATCATGAAGTCGATGCTGCTAAAGTACTGGTCAAAACAGATCG
ACATCCAGCGTTATTCTATATGCATTGTCGTTATTATTGTACCGTGAATA
TCAGGAACATCGATATCCAAAGTCCTTTTACGGGCTTTTACCTCTCTACG
ACGTTTCATGGGAAAATAGCGGTCACCAATAGTGCCATCCATTGTAGAGT
TAGCATATTTGGGAAAACTATGAGAAGTGGAATTAATGCTGAAGTTATAT
TCAATAAGACTAAAAGTAAAGGTTTTAACATTGTTGGCAACGTATTAGTA
AAGGCGTATTCCTCGGTATTTGATGCTGAAAATATATTCCTTAATGTGGA
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TGAAGAATGGAACGTTTATGTCCAACTGCGCGTTATCACGATACAGCACT
TTCAATTTCGAAAACTGTACTTTGAACGCGTTTCGAATTTTGTTACGAGA
AATTAATAACCTATTCGTACAAAAATCTACATTTGAAAACAATCAAAAAA
CATTGACTGGAAGCACGCAACACTATCTATCATTTATCCAAGTCTACAAA
GCTGCTCTGGTTAATATTCAAGATTCCAACTTTATTAACAGCACTTTTGG
AGCAGTTAGTGTATCTTATTGCACGAATGTTACAATTAATTCGTCACAAT
TTAAAGAAAATATTAAGCTTGTTGAAGATGCACAAGGAGGAGGGGCGCTT
CTCTCCTTTTTTTCTGGCGTCTCCATAAAAGATTCTACCTTCTTCAACAA
TACTGCCATTAGAGAAGGAGGTACTATCCATCTTATAGCATCTTTGCAGA
GGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGATGAAGTCACCTGTGGAAAA
TCATTAACAATATCACCATGTCTATCGATAGGTTATGCTGTGAAACACGT
AACAAAAGATGATGTTGGTTGGATACGCTCTTATTGTCGCGATTTCTCTT
TTACCAGATGAGGATGAAAACGACTCTCAAGACTTACTAATACCTTCGCA
AGACAATGAAAATCACCATGCTTATAACCCATTGACAGGCCAAGATGATA
TAGCAGTCAACTCTAAGAATACTGGGAAAAACAATAAAAACACCATATCA
GGAATATTCAAGATCCTTGTTCAGTTTTACCAAGTGGAATCAATGCTACG
AGTAGATTCACCTTTTAAGACGTCTTTGTCAGTTTCGATGAACACTTTTA
TGGATTTCATTATCTCTCTTTTCAACATCAAGATCATTTCTGATAACGAC
GCTAACTCATTTACCGTATGTCCTATAGAGCGCATGACAGCTCTTGGTAA
AGAGTTTATAATGTCCAGTATACCATTAACTTGCCTGGTGATCCTTCTCA
TATCCTACATTATCAATCAAATTCTCAATAAACAAAAACCAGAACGCCAA
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CTGTATTTTACAACTTTTCTTAACCGGTTATGTCACCATATCCTTGTATC
TTCTCAAACTGGTACATTGCATCGAAATCAATGGCATCAATGTTGTTTAC
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GTGATAATCTGGTCACTGTTCTTACTGGACCTTTTCGTAATACCTATAAG
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GTGGCAATCTGCATTTAACGAATATATTGATCAACACACCAGCGTCAGTT
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GGATACAGGCAAAATGACGAAGTTAAGTTTATTCAATGTCCGGCTTTCTA
TTGTTGTTCACCATATGGAGAACGTTGCATTTCGTATGATACATGTGCTA
AGAATCGAGAAGATGACGATACCATCTATCTTGACAACACAGAAAAGCAA
CAGACATCAGGCCTAATAACGTACGTGGAGTCAGCTTCGGTGATCGTCTC
AAATAACTTGACCATTGATGTTGTCAATCATGAAGTCGATGCTGCTAAAG
TACTGGTCAAAACAGATCGACATCCAGCGTTATTCTATATGCATTGTCGT
TATTATTGTACCGTGAATATCAGGAACATCGATATCCAAAGTCCTTTTAC
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ATTAATGCTGAAGTTATATTCAATAAGACTAAAAGTAAAGGTTTTAACAT
TGTTGGCAACGTATTAGTAAAGGCGTATTCCTCGGTATTTGATGCTGAAA
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TCTACGTCCTCGCAAATACCGTTCATTAGCGATGGAGGAACCATTGATGG
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AAAATAGCGGTCACCAATAGTGCCATCCATTGTAGAGTTAGCATATTTGG
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TCGATTTTATCAATATGGGGACTTGGGAAATGAAATCAAATGTTTCAGTA
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GTGACTCTGGCACCATCAAAAGTAAAGGAAATAGTTGGGGATACAGGCAA
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ATATGGAGAACGTTGCATTTCGTATGATACATGTGCTAAGAATCGAGAAG
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GGCGCTTCTCTCCTTTTTTTCTGGCGTCTCCATAAAAGATTCTACCTTCT
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TTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGATGAAGTCACCTG
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TTCTCTTTTACCAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_037775	XLOC_037775	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00060054-protein	TCONS_00060054-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR012334	Pectin_lyas_fold
IPR011050	Pectin_lyase_fold/virulence

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00060054 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00060054 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00060054 (transcript) - C. hemisphaerica