TCONS_00061304 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00061304
Unique NameTCONS_00061304
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2826

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00061304 ID=TCONS_00061304|Name=TCONS_00061304|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2826bp
TGAATTGAAAAATCCTGGTGTAACGACTCTGTTTGGCGACAAGACAAAGA
CTCTATATGTCCCGAATATTCCATCACTGGAGGCAAGCACCCGACCCAAC
CTTTCCAAAACGTTGACATATCTTGGATTTCAACCGGGACAAACGCTGAA
CATCAGGACAGTGCATTACCGAAAACATTAGAAATTCAACTACTGTCTTA
GACAATCTATATTTTGTTGTGGCTTTGATCTCGAGACTTACATTAGTAca
aatacagtcaactctctctctaattcgaacttctttaATTGGAATCTTTT
GTGTTACtcgaactaaaacattgatTCTTTTAACTGGAAAACGGTATAAA
GTACTTCAAATAATTTGAAGAAGATTCTCTATCCCTTGAAAATATAATTA
GAGAGGGTCTACTGTAGTGGGGAAAACATCCCACACCTTGTCCGAttatg
ggagaagaatctctcgaaacatAAGTAAATCTcatgatccaagccacgat
gaGCTTCAAATAAATATGGTCTGAATTCTGCTTAGTCTCTTTCAGCCagt
tttcttctctcgcctctAACAAACACAACGTGACCGAGCATAACAGAAAC
AATAAAATCGCCATCTCTGTTCATCAGTTAGTTTTAGTCGTTATTTTTCT
AACACCCatatcttttgtaaaaaataacatTTGTAAATATCTTCTGATCA
ACTTTTCCCTTTGTTTTTATTGGGCTTCACTCACCCCTGCGTCTTGCTTT
ACATTCTAAAGCTTAACTTGGTTACAGATAAAATGATTGGCCTAAAATTT
AATCAATAGCTCTACAGATTTTCAGCTCTCCTAGGAAACAATTTCAGGGG
GAGCAATTTTCTTTGAAGTTCTATCGCTTCTCTTAAAACCCTAGGAGAAT
TTAAAGAATTCGTCCACATAAATTGGGTATCAAACCGCAGAATTGTCCTT
TGTAAAGATCGACAAAGATTAGTTCCCTTAAAGATTTCCAATATCCGGGA
AATGTTACCATAAAACAACTATCAACCCTAACAGCGCGCTCTGGGGCTGG
TAACGAAAATACAAAGCGAATTTTTTTGATGTAGGATACCCTTGAAGCGA
TGAAGTAACGTCAATATAGTTGAGCTATTTGAACCATTTACCTTTATATa
tcctggaccaagtttctcaatcccggccaaactaaatctttgatcggagt
ttttcgGAGTACCCTAATAGTAGCACTAAtcaatagcggtgaaaatgcat
cgagagcgctagatctactgtTCCTCCAATACTTTAGTTGATGTAGCGCT
GTttaacgttaatttttaacattacaatggcttcttctcgggtaccagaA
GAAGTTCATTGATTCGAATGCTGAAAATAATTTGCTTTCCATAACAGAGG
CCCAAGGAAATGTCTCTCATATATCATGAAGGTTTGGCGGGAATTTGCTT
GGTTTGTTTTTAGAAGCAGTCTTAAAATGTCGTTTGCCGAGAACAAATAT
TCCTTGTAAATTTATTACCAGTCTCCTAAAAAGCTAGCCTGTTAGTCGAA
TGTTTTTGGACGGGAAAGTCCGTCCAAGATTTTCTCTTCGGCGCGGCGCA
TTTTGCCGTGACTTTGGACAAGTTGCACTCCATCGCATGTACCTTTTTCT
GATattcaagaagtcattgcattgcttCGAGCGGTAAACttcaaatagat
tttcgaactttcgaattttgtgattcgaatgttgaaaattgtttgttcAA
TCATTTCTTTGCTTTGGGTTGGATCCTAGCCATGATACACGAACTTGGTT
TGgactttttgtatgttttggGATGGCAACGAATATCTTTTGGATATGAC
TTGAAACCTAGAAGAATTTATCCCTCGCTTATTCCAGTGGAAAGAAGaac
taaactaaactaaactgtttgtttgttattgtttttattggtgGTTCGAC
GTGGTTTGTGATCGCTTGTTTGAAAATGTGACATGAATTGAATTGTAGAA
TGTAAATTGACATACGATTGAAAGTaaactgaaatttgattgtattcGAC
TCGAAAGAATTTAATGAATGTTGCTGGGTGTGGAAATGATTTTCTTACGC
TCTCAGCACCAGTGCATTGACCATTGTAATTGGCAAATCTTGACATATCA
AAACTTGAcactatttttttgattttgatttaaaaattatgcgCTGAAGT
GTTATGTACACCGTCTACGTATGGcttttaccgaaataccgttgtttttt
atgagaattacctcatcccggacgaaaaatcaggtgttttaccgtcaccg
tggctcttgcaaaataccgtttcccgaacactttttatcgtttttatcGC
TTCCCGGCCCTAAATTAGGCCTTATCCCGAATACCGCCagatcgtacgcc
ccccacgATACAATGACagattttctatatttttatgGGAAAAGTTTTGT
TCTGTATAATTAGAGTTTAAAGGTTTACTACCAATTAATTTCGAGTGAag
attaaaaactttcaaattcctCAACTTTGGAAGCTAGATAGCCAGTAAAA
ATTGAAGGTTTTGCTTCGAACTGTGGGAGGAATCTAcctaaattttgtta
tttttatctgACTTTCCTTTTAAGATTTTACAGTCATGGTCATAATTTTA
TTAcaacttttataaaaactttgataattttttaagtAAGTAATGATGTa
gcaaatatttatttttattttgtacctCTGTACCTTGGTTTGGAAATGTA
CGAGATCGACTTATTCCATCAAATACTAGTCTTGGAATCCTCATTAtttt
acatccctgtttcaaaGACTGGCTAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_355:329022..345165-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00061304 ID=TCONS_00061304|Name=TCONS_00061304|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16144bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_355:329022..345165- (Clytia hemisphaerica)
TGAATTGAAAAATCCTGGTGTAACGACTCTGTTTGGCGACAAGACAAAGA CTCTATATGTCCCGGTAAGCAGTGTGAAGTTCAGTCTTTTGCTTCTTAGC AACCTACCCTGCGGGCACACAGCGTTGTTCAGATCTCACGTTTAAAGGAC TGTCTCCACTTTCGCGCGACACGAGCGAAAACCTTTTTACGTTTTTGTAA GGGCATTGGTCGGTCGAAAAATGAAGCAATTCCATTAGTCAAAATTGACG TAACGGATCAAAAAAGTAGAACTTCCCTCAACTTTTTTTTTTGTTCGCAA ACTCGAAACTTTTTTATGATGTAATCTTTTCTTCAGGTAAAAAATGTTGA GAAAAAAACCGTCGCCCATTTCGCTCGAAAGTGGAGACCGGCTTTAACGT AGCATTGAACATTACGTGAAGAAATCTCCACGGAGAACGTTCTTTTTGTG GAGCGTGCTCTAAAGAAGGTGAGCATCTCCGGCGCACTTTGAAAATGTTT AGAAAAGTACAGACAATTTCCGTACTACTACTACTACTCAGTGAAACAAG TTAACGCTGTTTTCAAGCTTATCCAAATCTGCTCCTTCTGTGTCAATTCT CTCTCGTAAGGCTAATTTTCTTGTTCGAAAGAAATAAACCCCCACGTTGA CACAAATACACTCTTCTCGAGATGCATAAATTCATTGTTGTCCTCGTTTT CAAACAGATTTCATTGCTGTAAATTCACATATTCACAATGATAATTGTGT TGTTTACACCTCATGAGACATTTTGAATTTCAAGTACTTTTGTATTAGAG TTAATGTTTGCCTTTTGGGAATTTAAATTGGTTTAAAAAATGTATAATTT CATAGCAATGAAATGTGTTTGAAAACGAGGACAACAATAAATTTATGCAT CTCGAGAAGAGTGTATATTTTCGCGCATTTCTTCTTTCAACCAACGAAAA AAGCCTATTAACGCATCTACGTGCTAGGGGGGGCATAAGATTGTACGATG AGGCTGTGAAATCTGTGAAAACTTGTCATTAATTTTCTTCATTTTTGTGA TTATGTATGAACACGATTTGTTGCTAAGACACTTCTTTCAGCAAAGTTTC TTATCATTATCAAATAACAGAAACCATGGTATAAAATGAGCTTTATCAAC AACTTTTTTTTGTTAGTGTCACGCTGACGTCAGCATATAATATGTCAGCA ATTTTCTTTTCTCTCTCTTATTACACGCAGTTATTTATAAAGGGCATTTT GATGTGAAAATGTTATTTACAAATTGAATCGAGATTGTTACAGCAATACT CAGTAATACTGAGTATTGCTGTAGTTGTGTGCCTTTATACAGCATGGAAA GCCACCATTATGCATACACTCTCAAAGTTTTATGGTATAGCTTTTAGACA ACATTAGTAACTTGTGGTGCCAAAGTGCTCTATACCAAGGAAGAGCTAAT TTCAAATTTTATTTTTCTTTAAAAAATTAAAAACATGGTATAGCGTTTAG AAGTAGACCATAGAAAATGGCTTGACTTGGCTTGACTGATTTTCAAAGTA GGTATTCGTATACGTTTTTTACTCTCTAGAATATTCCATCACTGGAGGCA AGCACCCGACCCAACCTTTCCAAAACGTTGACATGTAAAAGAAATTTGCC GGGTAGTTTAGCTTGGAAAACATTACGTAATGACTCCAAAAGCATTACAT AATCTTAGCACAGGATATTACAAGCGCTGAGAAATCTCTACACTGCTATT TGTAAATTAATAGTTGGACCAAGAGATATACATTAGAATAAATATAAATA TTATAAGACTAAATTAGTTAAAAACGAATAATAAGAGGCAAACAAATCAA GTATCACAAATCCACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCA AGTATCACAAATCCACATCATAAGGATAGTGGCATAACCTTGCGGTCACG CCGGGCGCAAAACAAGGGGTTAACGATAATGCAAAAGTCTGAAAAAAAAT AATCTCAAAATCGACGAATAATAAGAGAGATTGACTAAAAATTTCTCCCA GTAGATTCATGAATTTCAATCTCATTCATATCAAGGTTCAATTTCCTAAC AGTTCTCGATCCACGTAAGCATAGGATAGCTGATCGTAGCAAGCAATATG AGAGCTTAGTTCTCAACCAATTCAACATGATACCAAATNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTCTATACTTTCGAACATCACCGG GTCGACAAAAGGCTTTGGACCATGGATCAAAACGGATTCGTCTGCTTCTT GTGCTTCTGGGTGTTTTGATTTCAAACTGTCGATTACATCTTTCGATAGG TTAAGCACACCGCATCCTTCTTGTTTATCGAGCATTTTCAGAGCAGCGTT GATTTTGCCCATGAAAACGAGTTTTGCGAATGTCTTTGAAAATTGTGCAT CACGTTGTTTGCTGGGAAACATCTTGAGAGCTTTTTGGATGGTTCGTGAC TCTCTCATTAGTGCGTCAAAATCACCCTCGTCCCATAACCGAAATCTTCT TTCCAGACATAAACTGTGTTGCTTAGCGGTTGATTTGTAGCTGGGTTTCT GGAGAAGCAGTGCGGGCATGACCATTACGACGGTGAGGGCAATATTCTTG TACGACTCGGAATCATCGACCCATCGCTGCAGCCATTTGGTTGTTTCGCC GACAAACCTCTTTCCATTTGCACCACTCGGGACGAGAAAGATGTTTCGTC TCCAAAGCACGATTTCACTATACATGGCTCGGAATATTTGATAGATGTCT TCCTTGGCGTGGTTTCCCCATATATGGTTTATTTGAAGCGCTGAGAAATT GATCCGTTATCAGATTATGTTATTTTAGTTATTACGTAATGTTTTCGCTG CTAATTTGGGTAATAAGATTCATCAAACCTCTACTTTTATCTAAATGTTT CTAAGCTAAGGAAGAGGTTAGATGCTTGACTACTTTTCTCGCTTCCCTTC GAAGTCCACCGTCCAAAAATTCGGTCTAACGGTGCCCTCTCTCTACTCAT TATTATTATTATTATTATTACAACGAATCCAAAGTTCAGGCACGCCGTGG GCCTCTAGAACTGGTCTTTGTTTATTTACAATAAATAGCGTAGTTCATGG TTTGCCCATGCTTTGTTTAAATTATTCTTGAACGATTTTATCGATGATGC TTCTGCCACGTATTTTGGAAGCGCGTTCCATATTGAGATAGTTCTATAAA AGAAGGACTTCATCGTCCGGGAAATTCATCTGAAGCTCGTGTATATGCTT TCTACATGGTCGCGTCCTTTTGATAAACTTTTTTGGTGTTGTTTTACTAT CATAGATGTGGATATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNTTACGTAGTTCAGCATTAATTGGAATTTTCCCTTTCTT TTTCCAGTGAGGCGCTCCTACATACACACTGAGTTTTATAATGAACCCTG GAAGAAATTTCTAAATCCCCCAGCCAACAAAAATATTTTGATAGGAGTTT TTAGTTTTTTTTAGTTTTTATTGAATATTTATACAGGATTACGCAAACAG TTACAAGTATCTGATATTACCTTTGGTCCTGTTATAAATCTAAAATAATA AATAAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNCTATTAGTGGCATTGCTTTTTTCTTTAGATTCTGT GCCACTTTGGCGTAATAATTACAAAACATATCGGCTTTGTCTTTTGGGCT AGTAGCGGTTGCGTCACCGTCTTTGAGAACGTCAGTTGGTTTTGATTTTA CGTTTGAAGATGGTAAAAGTTTTTTGATGTGACCCCAGAACTTTTTACTA TTTTTGAGGTTTTCGGTGAGGATTTCTTTATGGTAATTGTTTTTCGCCTG TTTGATGAGATTGGTGCATCGGTTCTTTTTACGACGATAGATATTTCGAT CACCTTCGTCTTTCGTTCGCCTTGCTTTTCGATCAGCTTTGTCACGATCG TTCAGGTGTGCTCGGATTTCTTGGGTGAGCCATGGACATGGGCGACCTTT GATGCGTTTTGTTATTTCAGGGGCATGGCGATTGAAGGAGTTAGTCACGA TTTGTTTGAAGTATTTCCAAGCAGCATTTGGTTCGGACTGTTGATATACA AGATTCCAATCGACTTGGCGAAGTTCGTTGTTCATAGCATCAGGATTGTA CCGCGAAAAGTTTCGGCATTTGATGGTTTTGGGTTCATATCTTTGATGGT TACGTTTCCGAACAACTCCAATCATATCATGATCACTTAGTGATAAGGGA ATTACGGTTTCGTGGGAGATTTTCGACTTGTCGTTTGTCAGGGCGAGATC GATTAATGTTGAAGATGTGTCAGTTATACGGGTAGGTTTTGTTATAATTT GGTCAAAACCTTGCAGGTTTAAGAAATGTTTTTCATCTCTGTGGTCGTTT CGGACGAGATAATTGATGTTAAAGTCCCCCATTAAGATGACCTCTCGGTA TTCGTTCATGTTAGCTGTTAAATTGTTCTGAAAAAGTTCATCGAAGTCGG GAGGGAAATAGTCAGACGTATCGGGTGGACGATAGATACAGCCGAGGAGA AACGGACTTGTGTTAGTTTCGAGGACTTCGACCCATATACACTCTAAACG CTCGTGTTCAAGGTCCTTTCGTCGTTTGTATTTGATCCGGTCAGATATGT AGAGAGCTACACCTCCGTGGGTGCCTGTCAGCCGATTCTTTTTGATCAAT TCGTAGTTCTCGATTGAGCAAATGTCGGTTTCTTCGAGCGACTTTTCGAG TTATAAAAAGTTATTTTGAAGGTGGTACCTGCATCGAGAGCTATCTACTT TGCTTGTACACTATCTCGCACCTAGATAAAGAAATTTTCAGCCAACATGC TAAAGCTCTGAAGGTCGGGAAAATTTTCAACACCTGGAAGGTTTAGATTA CGGAATTTGCAAGACCGCGTCAAGGATTTTTGCAGCCGGGATTGGCGGGT CCAACCGAAATATTTCCAGGTTTACGCCTGAGGGTATTTGCGGCACATCA AAGGCCGACTATCTATCATTCCTCTCGGATGGAAAATCGGTCCGCTCTTT TAGAGCTTTAGCGTGGGCGGCCGCCATTCCGCCATCGGAATATCAGATGA GCACACTAGTGATGTAGCGCCGTTTGTCATTAGGAAAAGTTTCAACACTA AAAAAAAACACTTAAAAAAAACTCTGATCAAAGATGGGGAGTATATCTTA GTCTTGGATTTATAAAGGTCAGTAGGTAGATAATGTAAAAGCGTAATTGA GTTTTTATCTACTTTACAAAAAGCTCTCCCCTTGTAAACTATGTTCGCAC GTAACGGTTCCGTTCCACTTCAAAACAAAATGAAGTCATTCTATTGGTTA GAAGTGACCTAAAAATTGAATTTAACCAATGGAATGGCTTCTTTTCGGAA ACGGAACCATAGCGTGTGAGCATGGTCTTAGAAAAAACAGGCCTTTTGTT GATGACTACCATTCACCAATATATTTGCCATTAATATACTACAAGGAAAG AATCTTACAAAGAAATCTGAGAACAATTTGGTAACTTTGTCAAAAAATAT CACGTCCCCATGATATCACCTCCAAAAATTTTAGTTGTGTTTTAACCTAG GTAAAACAAATTGACCATTTTCTTCTGAAATCTATTATTGGACCTGCTCT TTCTGATAATGAGGCTTCATTCTTTTCTTCGTTATAGATCTTGGATTTCA ACCGGGACAAACGCTGAACATCAGGACAGTGCATTACCGAAAACATTAGA AATTCAACTACTGTCTTAGACAATCTATATTTTGTTGTGGCTTTGATCTC GAGACTTACATTAGTACAAATACAGTCAACTCTCTCTCTAATTCGAACTT CTTTAATTGGAATCTTTTGTGTTACTCGAACTAAAACATTGATTCTTTTA ACTGGAAAACGGTATAAAGTACTTCAAATAATTTGAAGAAGATTCTCTAT CCCTTGAAAATATAATTAGAGAGGGTCTACTGTAGTGGGGAAAACATCCC ACACCTTGTCCGATTATGGGAGAAGAATCTCTCGAAACATAAGTAAATCT CATGATCCAAGCCACGATGAGCTTCAAATAAATATGGTCTGAATTCTGCT TAGTCTCTTTCAGCCAGTTTTCTTCTCTCGCCTCTAACAAACACAACGTG ACCGAGCATAACAGAAACAATAAAATCGCCATCTCTGTTCATCAGTTAGT TTTAGTCGTTATTTTTCTAACACCCATATCTTTTGTAAAAAATAACATTT GTAAATATCTTCTGATCAACTTTTCCCTTTGTTTTTATTGGGCTTCACTC ACCCCTGCGTCTTGCTTTACATTCTAAAGCTTAACTTGGTTACAGATAAA ATGATTGGCCTAAAATTTAATCAATAGCTCTACAGATTTTCAGCTCTCCT AGGAAACAATTTCAGGGGGAGCAATTTTCTTTGAAGTTCTATCGCTTCTC TTAAAACCCTAGGAGAATTTAAAGAATTCGTCCACATAAATTGGGTATCA AACCGCAGAATTGTCCTTTGTAAAGATCGACAAAGATTAGTTCCCTTAAA GATTTCCAATATCCGGGAAATGTTACCATAAAACAACTATCAACCCTAAC AGCGCGCTCTGGGGCTGGTAACGAAAATACAAAGCGAATTTTTTTGATGT AGGATACCCTTGAAGCGATGAAGTAACGTCAATATAGTTGAGCTATTTGA ACCATTTACCTTTATATATCCTGGACCAAGTTTCTCAATCCCGGCCAAAC TAAATCTTTGATCGGAGTTTTTCGGAGTACCCTAATAGTAGCACTAATCA ATAGCGGTGAAAATGCATCGAGAGCGCTAGATCTACTGTTCCTCCAATAC TTTAGTTGATGTAGCGCTGTTTAACGTTAATTTTTAACATTACAATGGCT TCTTCTCGGGTACCAGAAGAAGTTCATTGATTCGAATGCTGAAAATAATT TGCTTTCCATAACAGAGGCCCAAGGAAATGTCTCTCATATATCATGAAGG TTTGGCGGGAATTTGCTTGGTTTGTTTTTAGAAGCAGTCTTAAAATGTCG TTTGCCGAGAACAAATATTCCTTGTAAATTTATTACCAGTCTCCTAAAAA GCTAGCCTGTTAGTCGAATGTTTTTGGACGGGAAAGTCCGTCCAAGATTT TCTCTTCGGCGCGGCGCATTTTGCCGTGACTTTGGACAAGTTGCACTCCA TCGCATGTACCTTTTTCTGATATTCAAGAAGTCATTGCATTGCTTCGAGC GGTAAACTTCAAATAGATTTTCGAACTTTCGAATTTTGTGATTCGAATGT TGAAAATTGTTTGTTCAATCATTTCTTTGCTTTGGGTTGGATCCTAGCCA TGATACACGAACTTGGTTTGGACTTTTTGTATGTTTTGGGATGGCAACGA ATATCTTTTGGATATGACTTGAAACCTAGAAGAATTTATCCCTCGCTTAT TCCAGTGGAAAGAAGAACTAAACTAAACTAAACTGTTTGTTTGTTATTGT TTTTATTGGTGGTTCGACGTGGTTTGTGATCGCTTGTTTGAAAATGTGAC ATGAATTGAATTGTAGAATGTAAATTGACATACGATTGAAAGTAAACTGA AATTTGATTGTATTCGACTCGAAAGAATTTAATGAATGTTGCTGGGTGTG GAAATGATTTTCTTACGCTCTCAGCACCAGTGCATTGACCATTGTAATTG GCAAATCTTGACATATCAAAACTTGACACTATTTTTTTGATTTTGATTTA AAAATTATGCGCTGAAGTGTTATGTACACCGTCTACGTATGGCTTTTACC GAAATACCGTTGTTTTTTATGAGAATTACCTCATCCCGGACGAAAAATCA GGTGTTTTACCGTCACCGTGGCTCTTGCAAAATACCGTTTCCCGAACACT TTTTATCGTTTTTATCGCTTCCCGGCCCTAAATTAGGCCTTATCCCGAAT ACCGCCAGATCGTACGCCCCCCACGATACAATGACAGATTTTCTATATTT TTATGGGAAAAGTTTTGTTCTGTATAATTAGAGTTTAAAGGTTTACTACC AATTAATTTCGAGTGAAGATTAAAAACTTTCAAATTCCTCAACTTTGGAA GCTAGATAGCCAGTAAAAATTGAAGGTTTTGCTTCGAACTGTGGGAGGAA TCTACCTAAATTTTGTTATTTTTATCTGACTTTCCTTTTAAGATTTTACA GTCATGGTCATAATTTTATTACAACTTTTATAAAAACTTTGATAATTTTT TAAGTAAGTAATGATGTAGCAAATATTTATTTTTATTTTGTACCTCTGTA CCTTGGTTTGGAAATGTACGAGATCGACTTATTCCATCAAATACTAGTCT TGGAATCCTCATTATTTTACATCCCTGTTTCAAAGACTGGCTAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038464XLOC_038464Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1575043694:345102..345165TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1575043694:345102..345165Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1575043694:343532..343586TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1575043694:343532..343586Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1575043694:329022..331728TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1575043694:329022..331728Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1510915933:345102..345165TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1510915933:345102..345165Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1510915933:343532..343586TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1510915933:343532..343586Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1510915933:329022..331728TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1510915933:329022..331728Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1491911889:345102..345165TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1491911889:345102..345165Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1491911889:343532..343586TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1491911889:343532..343586Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1491911889:329022..331728TCONS_00061304-exon-scaffold_355-1491911889:329022..331728Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_355supercontigscaffold_355:329022..345165 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 0 0 0 0.143742 0 0.309483 0 0.153535 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00061304 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top