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transcript sequence >TCONS_00061637 ID=TCONS_00061637|Name=TCONS_00061637|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=784bp AAAAGCACTACTAATCTACAGAGGCGTACATACTCATAACTTTTTAGAGT CAGATCAATGAAtcaataaaattaaaacaatttttttaaattaactttta aaaaaatgaacacAAAAGTATACAGGCATGGTTATACAGGAGCCAATTAT ACGAGTATATCTAAGGTTTCAGAACATTAAATAATTAAGACGAGTTCATT TGTCAAGCTTCAAACTAAGGACAATTTATCTTCTCTTTATGGGATGGCAA CCGTCTTGTGGGATCTGGGTCCAACAAACAACCAGTCAAATCATCCAGAT TAGCATGGCCAGTTGATTTAAACAATTGTGAGAGGAACTGTCAAGATTGT GGTATTAAACATTTGAAACCATTAATGAAATTGGGATTGACAACCGGCAC AAAATGTATCATCAAATACCCTGATATGAAGGTTGGAGATCGGTACAAGA TCATGTTACAGCGAGTTGAAAAGGAGATGGAAATAAATACGAAAGATTTC GGTGGAATGCCAAAAGCCCACAAAGATGAGTTGGACGAAATTGATAGAGT GGTTAAAGGAAGCTTATGGAACGTCCTAGTCAACGATCCTCAACGATTAC GAACTATCCTTGTTGGTCAAATGATATTGGAAAGTCCATTACCATTCATG GATCGATTGGGTACGTTCGACGAGATGCTTGGGTGTAACAAATGCAACGC GATCCATCATAAAGACACTAGATATGGACCCATAGTGGGTGCAGAAGATG GAAGTTTGAGATTCCCGAAACGTATAGATGCANN Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_36:1487104..1498925+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00061637 ID=TCONS_00061637|Name=TCONS_00061637|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11822bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_36:1487104..1498925+ (Clytia hemisphaerica) AAAAGCACTACTAATCTACAGAGGCGTACATACTCATAACTTTTTAGAGT
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ATCCATGCTGACTGACTAGGACTATCTTTCTAAAAATTCTAAGAGCTGTA
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CTTATGGAACGTCCTAGTCAACGATCCTCAACGATTACGAACTATCCTTG
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AGACACTAGATATGGACCCATAGTGGGTGCAGAAGATGGAAGTTTGAGAT
TCCCGAAACGTATAGATGCANN
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1491911889:1487104..1487322 | TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1491911889:1487104..1487322 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1510915933:1493677..1493888 | TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1510915933:1493677..1493888 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1575043694:1493677..1493888 | TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1575043694:1493677..1493888 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1575043694:1497699..1497825 | TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1575043694:1497699..1497825 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1491911889:1498700..1498925 | TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1491911889:1498700..1498925 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1510915933:1498700..1498925 | TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1510915933:1498700..1498925 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1575043694:1498700..1498925 | TCONS_00061637-exon-scaffold_36-1575043694:1498700..1498925 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_36 | supercontig | scaffold_36:1487104..1498925 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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