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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00061860 ID=TCONS_00061860|Name=TCONS_00061860|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=805bp
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ATTGT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_361:196449..217759+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00061860 ID=TCONS_00061860|Name=TCONS_00061860|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21311bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_361:196449..217759+ (Clytia hemisphaerica)
ACTCGATGAAGTTGTTTGCAATTTGAAGATTGTTCATTTAAcggttgaat
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GTAGATTTCGTCAACGTTGTCTGTATATTTACTTATTTGATTCATTTGCT
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TGATTGGCAGTTTTAGCCAATCTGGAGGGTATAAAGCTTCAAAGTTTTAC
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CTTGAATGTTCTGAAATCTTCTCAATATGCTTACTTTATTCGCTTATTAT
TGACTACAAAGGGGCCTAACTTAGAATAAGCATTTTCTTAGCAGCCATTT
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CTGCTCTTGGGCAATCTCTGCCACCACAAAATGCTTGACTTCGTATCACT
AACATCCGATATTGTGTCCCATAGGTGCCACAACCTATACATGAACTCCA
GTCTGTGTAATAGTACGAACACGCAACCGGACAACATTTTCGATTACATG
ATTCAATTTGATATACTTTACACCAACGCCATGATTGGTCACAACATTCA
TAATTATATTGAAAACGATTTCTTCGGCCGTTGTAACCACAACTTTCCGA
GCATCTGCTCCAAACACTCCAACTATAGTAATCGCTTGAAAAGCAAGGAC
TTCGACATTGGTTCTGACTGTTAACAAAAGTTAAACTGTAAAAGACTAAA
ACCATCGTAAATGACTTCATCTTCTCAATAGTTAAACTataatgtatagc
aatgtgccctcccggttattacaaTAATAGTTAAACTACTAATCTGTTGA
GTTTTAAACCTTATATATTCCCTTTCTGTTTCCCAATAtggaaattttct
ttctttgttctCATGAACTTGAAGAAACTTGATGATTTTATTCATGCCAA
ATTTACAGCAGGATTATGGAGTTCAGAATGAACATGTACCTGTTGAGTTT
TTAGGTATCTTTCTTGTACCTTATCGTTATAAGTCTAAATTCAGATCTTT
GATGCTAGTGCACATTGACTCTTTTTAAAGTAATTTTACAAGAATCTTTT
GGCAGGATATTCATACTCTCTAAACCTGTACACACACTTTAAAATACTTT
TGATATTGTGATGTTGAAGTTATCAGATTGTAGAAGAAGTAGGTTATGTT
TCAAGGTTCAGCAGAAACTTTCGAACGAGATTTTTGGTAAAAGAGAGTAA
TAATTTGGTTTTGAGtgattattttttgtcaaaaaaacaaTAGCAAATAT
GGGATTCACTTGTGATTGATGTTCATAGGACTAGATTTGATTGGGAGCCG
TTTCTTTCGACGAATGGTTTATATGGTATGCTATAAAGCGACTTGCGGCT
TTTTGATTGGCTGAATGAAACCGATAAGTGTCAGTTTGTCATATGACAGA
CTTCTTGGCTTTTTTATATCACTAAATCTATTCCCTTATTGAAgcttttg
gatgggaaatggaGTCACTTATTTCTCATCGAAAGCGCTTGACCTGCGTG
GTTTCACACAAaggccagattgaaagtaaatcCTATCGTCAGGTTTCAAA
AAATATCCtgcttgaaaataatgaaagagCTAGATTCAACCCGTCATTCT
AAATCTTATCTTAAGCCTTgactttttcttgtttgagaaaggttaaaggt
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TATAGCTTCTAGTCTACTTCATTGGACTCAGCGCCATCACAATTATCTCa
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TTGCCCGTTTATCAATTCGTTGACGATGCACCCGATCAGTAATAAAGTGA
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TTCCCGCCCTCGGATATGTTGGGCCACCGCATGAAGGGTAACGTCGAATG
ACTAATCTACGATATTGAGTCCCACGAGTGCCACAACCGAGACGAACTCC
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CCCCCTCGTTGTAGGCTAATACCCAGAcccctttttaaaaaattcattta
ttaGAAATTGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1491911889:196449..196506 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1491911889:196449..196506 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1510915933:196449..196506 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1510915933:196449..196506 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1575043694:196449..196506 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1575043694:196449..196506 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1491911889:215671..215838 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1491911889:215671..215838 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1510915933:215671..215838 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1510915933:215671..215838 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1575043694:215671..215838 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1575043694:215671..215838 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1491911889:217181..217759 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1491911889:217181..217759 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1575043694:217181..217759 | TCONS_00061860-exon-scaffold_361-1575043694:217181..217759 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_361 | supercontig | scaffold_361:196449..217759 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
