TCONS_00067864 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00067864
Unique Name	TCONS_00067864
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2422

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_477:39853..49724+

transcript sequence

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_477:39853..49724+

Legend: exon

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>TCONS_00067864 ID=TCONS_00067864|Name=TCONS_00067864|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9872bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_477:39853..49724+ (Clytia hemisphaerica)
AGAAGATACTGTGATGAAGTAACGTGACGAAGTAACGTGAATTATATCAA
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atCTTAGAGTAGGTAAGGATTGCtatatttgaaatttatagACCATATTT
AGATGTATTATGTATCCGAAAT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_042389	XLOC_042389	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_477	supercontig	scaffold_477:39853..49724 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	2.86681e-05	0	5.15566e-08	0	0	0	0	1.87084e-07	0	0	0	0	0.00290312	0	1.67561e-07	0	0	0	7.14478e-08	3.43534e-07	4.52139e-05

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00067864 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00067864 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00067864 (transcript) - C. hemisphaerica