TCONS_00069240 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069240
Unique Name	TCONS_00069240
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	10916

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_496:351945..407284-

transcript sequence

>TCONS_00069240 ID=TCONS_00069240|Name=TCONS_00069240|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10916bp
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GTGAATATCAAAGAAGGTGAACCATTTGAACTCAACTTTGAAGTATCTGA
TGACTCTAAAGCCATCTTCTACAAAGGTGATAATAGAATCGATGATATGG
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ATCCATTAAACCCCACATACCTGTAGAATGGTACCACGATGATAAACCAG
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AACGGTAAACCAACACCCTTAGTTGAATGGTATAAAGAAAACTCATTACT
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GCTCGTAACGAAGCTGGACAATGTACTGTCGAAGTCAACATCAAAATCGA
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CCTGGCGCATGCGGTATTGATGTCGTTGTAATGCCTGCAACTCCGCGAGA
TTCACCAGTCAGTGGTGCTCAACcagtaatcaaaacaaaacctgaAGACT
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GATACAGATTTAGCCAAAGTCAATGTGTCTTGGTCGAAAAATGGACAAAT
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TAACGAACTCGGTAAAGATGAAACTGAAGCTGACGTCTTTGTAGATGAAA
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gAAAACGAAGATTCCAAAGTCACTGAAGCAAAGGAATCAGAAGATAGCAA
AGAAGCACCAACTTTTAAAGAGGTCATCCAAAGTCAACAAGTGGTTCAAG
GCTCAAATTGTCGTTTTGATGCTCGCCTTGAAACTCACAGTACCCAAACC
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GGATGGAGACAATTCAAACAGTCAATCAGGCTCAAGAAAGTTTTCGCTCA
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GATTTGTTGAACCCAAAGCCTTGAAAGAGGTTGAGACTGGAACAGTTGAA
AGAAAAGGTTCTGGTGATGCCAGCAAAGGAGGATTGGAACCCATAttgga
tgaaaatattttgagtaTGATTCAAGAAGAGCAGAAGAATCttgttgaag
aagaaaaagttgaGCCAGAAGAAGAGaaacagcAATACATAGCTATCGGC
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CGTCCTGCTGGTTGATGGTTCACTGAACCAAGAGTATTGGTTCGTACGTA
TTCTATTGGATGATGGGAAGCCTGGGTCCGAGGGCCTGGTACCGAACACG
TTCTTGCAACTGCTTGACGAACACCAGAAGGAAGAGGCTCAAGAGAAACA
taaaagtttagaacatttaGAgaaaatagTAAAAGAGGTGTTGACGACGG
AACAGACGTATATTGACCAATTGAAAGAAGTTACTGAGGTCCACATGGTC
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TGCAAATCTTAAAGATATCCAACAATTTCATGCAACGAAATTCATGGCAG
CTTTGGAGAACGCTCACCAAAGTGGAAGTGACATTGCACAAGTCTTCCTC
GAAAACAGCGATGAATTGGAGAAGATGTATGTGTATTATTGCAACAGTCG
TCCGACAGCAGATGAAGTGCTCGATAAACAAGATATAATTGAATACTGGG
ATGAATTCCAACAAAGTACAGACAGTCCTCATACATTACGTGCATACCTC
ATCACCCCTGTGCAGCGTATCACTCGATATCAATTATTGCTGAAAGAAAT
ACTCAAATACACAACGCGTGCCAATAAAGATTCAACCTGTGTCGAGGATG
CGCTATCGAAGATTAGTTACATCATTCGACATGCAAATGATACAATGCAC
ATCAAACGTATTGTTGGCTACGAGtgtGATTTACCATTAGATCAAGGTGG
AAAACTATTGAAAATGGATACAGTCTTGACTTGGGATGGAATCAAGGCTA
AAGGAAAAGGCAAAGAGAGGCATTTATTCTTATTGGAGAAAGTTTTGATT
GGTACTAAAAAGACTGAAGGCAAAAACAAAGATGACTTCTCATACAATGT
CAAATTTCTTATGGAGATATCAGATCTTGGTCAGACAGAATTTATTGAGA
ACTTCCCAACACGATGGGTATTATGGTCTGGAAAATCTGCAGCGTCAGCA
AGTATTCAGTACACTGTTGAGGCTAAATCTGAATTGGATAAAGATTGTTG
GGTGCGAGATATTCGTGAGATGTTAGCACGACAGCTAGCTGATCTCAAAA
ACACACAAGGTAAAAGTTATGAGAAACCACCACAAAATGTATCACCAGAT
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TGGTCTCGCTTATTCGTGCAGGAACTACACTTTACCTCGTTGAACCAGCT
GGCTGTGAAGACCCATTCAAACGTACTTGGGTCCCAGGCTCTTTTTTGGT
TCCTTTATCAGAAAGTGTAGCTGAACTTGATGAAGAACAGGAGGAAGacc
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AACATCACATTAGAATGTCAAGTTGTAAACAGTCTGATTGTCGAATGGTT
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ATAGAGAGACTGGTATTACTAGTCTATCCATTGAGAATATTTGTCCTGAA
GACGCGGGAGATTATACTGTCCGCGCGATCAATGACGCGGGCGTTTCATC
AAAATCAGCCCGTTTGAATGTGGAAGCACCACCAGTAATCCTGGCTGACA
TCAAATCACTAACACTAACCCAATACGATAACGCTACATTCAAATGTAAT
TTCCATGACTCACAAAACCCTCAACTGACACCAACATGTAAATGGTACTT
TAATGACCAAGAAATTCAAGACGCTGGCAAATTCATCATCGAGAGTAAAC
CAACATTATCCATTCTAGATATAGCTGAAGTGGATcttgatgattctggt
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TAACGTCGAGTATGGTCCTGACGCATGGAAATTAGCTTTGGACAAGGTTG
AGACAAATTCTTGTACCGTGAATGATTTAGCTAACGAGGACGAGTTTGTG
TTCAGAGTGTTTGCTTATAACAAGACGTTGGCTAGTGAACCAAGTCAATC
ATCTGAAAAGATTCTAATAGAAGcACCACGCAAAAAGAAGTCAAAGAAAC
GTGGTGAAGACACTAAATCACCGGACCCACAAGGCCGGTTATCTCCATTT
CAAAAGCGACGTCAATTCAAACAAAACGCAGGGTCCAGCTCGGATGAAGA
TGATGACGATGATAGCGGGTCAAGAGGGCGTTTATCTCCACGTCAGGGTG
GCCCTCTATTTACAGCAAATCGTAAGGGCGGACGTTCAAGATCTAAGAGT
CCAATGAGAGCCAAACAACAAATGATGGCGCAATCTCCAGATGGTAAAGG
AGCTCCATACTTCACACGAGAACTTGAAAACTCCTTCGTCGTTGAAGGTG
GGGCCGCCAAATTTATTTGCCGATGCCATGGAAATCCAGATCCAGAAGTC
GTATggtacaaagaaaaagaaaaaatcgtcGAATCGAAACAATTCTCTAT
CTTATTTGACGCTGACGAAAATTGCGTGTTAATTATTACTCAGAGTAATC
ACGACACGGCAGGCTCTTACATGTGCGTTGCGTCGAATTCGTACGGAACA
ACAAAGAGTACCGCTATGTTGTACGTTGAAGGACTGCAAACGGAGTACGA
TACAGAAACGGAAGACGAAATTTCGGACCCCGAACCACAACCGGAACGGG
AACAAATCAACGTACGGAAAGATGCTGTTGAGAACCATTACATACTGAAA
GAAGAATTAGGAAGGGGTAAATTTGGTGTCGTCACAAAATGCCAATGTAA
AACGTCTGGTACCGATTTCGCTGCAAAATTCATTAAATGTCGGCCGACAG
AACGAAAAAACGTTTTAATGGAAATTGATATCATGAACTCGCTTAACCAT
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GCTTGTATTAGAGTTGGTAACTGGAGGTGaactttttgagaaattaaCTG
AAGAGGAATATATTTCGGAGAAAGATGTGACTTTTTATATGAAACAAGTT
TTACAGGGTGTTCAACATATGCATGAACGAGAAATTCTTCATTTGGATTT
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TTATTGATTTTGGTCTGGCGCGTCGTTACAAGAAAGGAGACTCACTAAAA
GTGTTGTTTGGTACACCAGAATTTATGGGACCTGAAGTCATCAATTATGA
CCAAGTTACCACGGCAACTGACATGTGGTCTATTGGTGTTATCACATACG
TGTTGTTATCTGGTCTTTCTCCTTTCGCTGGTGACAATGACTCTGAAACG
TTGACCAATGTTACGTCAGGTGAATGGGATTTTGACGATCCAGTATTTGA
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ATGttcaaaaaattcaagaaaaagatcAGAACTGATCGGTTAAAGGCTTT
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ATTTCTTAACACGCCTTCTTACGGGCATCAAGACATCACAAAACGCCACA
ACGCCCATTTCAGCGCCAACCACGCCACAATCAGAATTAAAGAGAGAGGA
CAGTGCTCCCACCAGTCCGGTCTCAACCAGTTCATCAGGACCAGCCTGGA
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ATTCCATGGAGTGGAAGATGAAAGAGACACACCTGAGGTTGCATGGAAAC
GGGAAGGGCGTATCTTGAACGAATCTAAACACAACCATATGACAGTGATT
GGTAATGGAATGCATTTAAAGATCTTGAACTCTCAACTCGATGATACTGG
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ATCAGGAGTGGTCAGTCTTCTCAGACAGTATTCAACAAACAATCACAGTT
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GCCCGAAGGTTATCCCGATCACTCTCGATTACAGTACCACCTTCACGACT
TCGGTCACGTACACTTGGATATGAGatcaaattaaaagaaacaAACCCTG
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GTCAAGAAAGTTGGCAGTAAGCACAGTGGAGAGACGTACGCCGCCAAAAT
GGTCAAATATGATGAAGATACGGtcgaaatcacaaaaaaagaaTTCGATA
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TTTGTGCGAAAATATCTGATTTTCATTTGTGATTTGGTCAATGGTCAAGA
TGTATTGTTGTTTTTGGCAAATTTACCGTCACCGACAGAGGATGACGTTG
CTGGATGTATGAAACAACTCTTAGATGCTCTTGACTACCTGCATCAAATG
AATATTTGTCATTTAGATATTAAGCCGTCGAACATGGTGATGTTAGGGTC
CATGTTGAAATTGATTGATTATGGCTCGGCAAGAAGGGTGACGTCAAAAG
GTGGCGAAGTTGGTGAAATGgtcggaacaatagaattcatgTCACCTGAA
ATGATTAGTTTTGATGCGGTCAGCAGTAGTACAGATATGTGGAGTGTTGG
TGTTCTAGTATATTCACTATTGAGTGGATTATCACCTTTCACCAGCGATG
ATGAAGATGAAACAATGTCTTTAATCACCGCTGTTGATTATCAATTCGAT
CCGCAAGTTTTTGACGCCATCAGCGAAGAGGcgaaaaaatttattaaaaa
ccTTATAGTGCGTATTCCTGAGAAAAGACCTTCTGCCATCGTCTGCCTTG
AAGACCCATGGTTATCTGACGCATTAGAGAAAACTCGATTATCATCGGGG
TTGATTCCGGACAGTTTATTGGAATTATCCGATTATTTGGCGGAGCAAGA
AGAAATGGAAAGTGTGCGCGCGTCTTTGGTTATGCGCACGTTTTTACAAT
CTCCATACGAATCGCCCGATGAGAGTGAATCAGAGGAAGAGGAAGCATAG
TATTCAGGTAGTCATCAACAACTTGTTGTTTGTCTTTGGTATGACTGATG
ACGTCACTTCGACTACGTTGATCGACATCAGAACATGACAAAAATGGTAT
CTCTTCCTACAAAGCGAAAGTAGCTTACTGAGTGCCTGTTCCTAACCAAA
TGTTCTGAAAGCAAAATGTCGAAAGTGATCTTACCAACAAAGCAAGTGTG
GGATGAAAGATAACAAAGGTTGCTCTTAGCTCTCTGTCCTACCATGCTTA
CCTCAAGATTAGAGCCCAGTTCCTAACTAGTCGTTGCGAATGGAGAAGAA
ATCATCGCAAGGTTATCGAAGGGACGAAACAAATTCCATAAGCAAAGATG
AAAGAGTAAactggaaatgaaaatgaaaattttagttaattttatttttg
taaataaacaaaTTATGTTGAATTTCCTTATTGGATTTATTCAAATCATC
TCAGAGGTGAACTTGGGTCCTCGTTTTATTGTAAAGAGTTTTAAAAATCA
TATCGAACTAGTTTGCTGAAAAATGTCATTCTTTACCAGCAAAtacaaaa
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TATTTAAGAGCTTTTATTTTAGCCGCAAACCTTAAGagtatataaatatt
tttttctcttaaacCATGTATTAAGATATTTTAATTTGATTACAATTTTT
GTATGATAGAACCAAAATTattgattttagaatttttatcaattttttta
ttgaaagtaatttttttctttcacaatattttataaatggaATCCAGAAG
AATTTTTCTATAACAG

transcript from alignment at scaffold_496:351945..407284-

Legend: exon

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>TCONS_00069240 ID=TCONS_00069240|Name=TCONS_00069240|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=55340bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_496:351945..407284- (Clytia hemisphaerica)
AACCGAAAGCATTACCAACAGTGAATGTCAAATTGCCCAAGGATGGAATT
GTGAATATCAAAGAAGGTGAACCATTTGAACTCAACTTTGAAGTATCTGA
TGACTCTAAAGCCATCTTCTACAAAGGTGATAATAGAATCGATGATATGG
GTCGAGCTGTTGTCACCAGAATGGGTAGAACCTTTAGATTCTACATTCCC
GAAGTCAAGGAATCAGATTCTGGTCAATACATCATGGAAGTCCAAGGAGA
ATCTGGAATAACCAACAAATCATTCAAAATCAAAGTACAAGGTATGCTCC
TCATTGATGCGACGTTAAAAACCAAGAATTTGTCTTCATTATTTAATTCA
TGCCACGTGTTTTCACAATCAAAACTTCGCTCTTAGATACGCACAAAATA
AAAAAATAATCTTTTATTATAGCAGGCTTTACCATGCAAAATGAACCAAT
CGAAAAGCTGTGATAGTGATAATATAATAGCGAAAATAACTGATAAACTA
CTGAAATTTGACTAATACATATGCAGCTAATACACATACAATAATAGATA
CACCACATACACATGATACACTATTATCCTCCTCTACATACATTTTGCTA
GTTGCACGTTCGTCACTCTAAAATCTTCGATCATAAACACACCTAGGATT
GGGTTCGAGCTGACCAAGGCCGTCTGTCAGACGCAAAAACATCCAAAATT
TAGACCAACAGAAAGTCATTGCTTCAAGTGTTCGAATTCATTGCATTGAC
GCATTCCCAGCTAAAGGTCATTTCACGGTCGAAAGGAATCATGGGTAATC
AGGACCACTACGCTCTGATAACGACTTTCTGTTGGTCTAAATTTTGGATG
TTTTTGCGTCTGGCAGACGGGAAGCCATTATCCTTATCGCTAGCCTTATC
AGTTTATATTACTCATGATTTATTTCGACTGTTAAATGACCTATAAAGCC
TGAGACTTTTGGCTCTTGTGAACTGGAACGAATACGCTTTAATTTCACTC
TTAAGGTTCATACTGTTGGTGTATTCAATTCTCAGGGGTTCAGTTTTTTC
CATGTAATTCTAGGAAGAGGAATAGATAGATGTATCAAAAGTTGCATTTA
AAACAAAGGTATTTGTCTCAATTGTAGGAAAACCAAAGAAATCACCCATC
CCGACCATCGACGTCGACCTTCCTGACGAACCAATCAAAAAGAGGGAAGG
TGACAAATTTGAAGTCCGTTTCAAAATCAGTGGCCAACCACACCCTGAAG
TCTTCTTTTTTAAAGATGAAAAACCCATTGAAGAAAAATCGAAGAAAGTT
CTCATCAAGCGGGAAGGCGAATATTATAATTTCACCATACCGAGACTGGA
ATCTTCAGATTCTGGATTGTATGTTGTAGAATGTGAAAATAAAAATGGTA
CCGTTGAAAAAGAATTCGAAATCGAAGTCGAAGGTATTCATCAACTTCTA
TATCATTTCGTTAAATTAAAGAAGTTTTGGTTTTCTGGACATGGCCTGCT
TTGATTTGTCAGATGAAAGAGGGTTTAAACTAAAAAAAAGTCCATGGTCA
TAATAATTACGGGCTGATATTTGTGTGGCATATCAACTAAAAGTTGCTAC
AGGCGTTACTCGAGAGATAAATCCAATATAAACTATCATTGTAAAAATGA
GCCCTTCACGCTAATGGTGAATCAATGGTAAGAATTGATATGATGAAAGT
TAAACTCGATATTAATTCTTGATTTCAGGCAAATCGAAAAAAGCTCCAGT
AGCAGCACCAAAACCACAACTTCAAAGTTTGGTGAGCGCTTCAACTAATC
CCAACAAACCAGCATTCAAGATCAAGTTACAAGACATTGAAGTTGTTTCC
TTCAGTGCTGTCAGATTCGAAGTCGTCGTTAAAGGTGAATTTTTGATTTT
CAAAATGGTAGAAAGAGTTGTTAGCGACTCCATAAATAAAATAGGCGTTC
ATACGGCATGCATTTTGATTTTTGGGGACATGTCACATGTCATACATCGG
GGTTTTTCCAAGCGGAGAAGAACTAGCTCTGTTGTTTGTTGTTTTTTTTA
CTTTGTCCGCATTAGAACAATTGGAACAGTGTTTTTTACTATGTTACATA
GTATTCGATTTTTCAGTGTTTCAGAAGCATATGGAATTTTTAAATTAAAA
ATATATCTATCTTCTTCTTAACACAGGTGACCCTGAACCAGAGATCACGT
GGTATAAGAACAATGAAATTATCGACGATGACGATCGCAACTTTTTACAA
GAAGAAGAAGAAGATGGAACTTGCGCTCTTGTTATTCGTGAAGTATCCAC
TAACGACCGTGGTACTTACAAGTGTATGGCTAAAAATCGTTTCGGTAAAG
CCATGACCACTGCTGAGCTCTTCGTTGAAGGTATATATAAGTGTTATTTA
CACAGCGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTCTGTGGACCTTGTATAAAC
GTTAGATTAACGTTGAAGCAACGTTTGCCAGGCTGTCTAGTATTATATTG
TAATATAGTCTGAATCGCAGACCTCTACTAAACCGCTGGTAGTTTATAAG
GAGCACGAATCCGTTAGAGGATACCAGCAGCCTAATTGTAATGTTTTTCT
CCCTTCCTTCTGCAAAGTCAAAGACTTATTTACACATCTATCGATGCATT
ACCTCCGTCTCTTCGCAGTTACGTTTGGTATAGACTTAGTTACGAAGAAG
AGTTTTTGTCACGAAAGACGTCACCATGTTACTTATTATTCTGAACATTA
CGATTAAAAACCTCATGTTTCAATTTGTTTTTATCCATAGATCATGGATT
TGAGTCTGACGATTCAGAATCTGAGCTTGGTGGACGATCGTTGCCAAGGT
AAGAAAGCAATAAGCAGATAAAAAGACAAAGAAAATAGGAGAATGCCGTA
GAATGCATGCTTTTGATTGTTTCTTACATTTAAAAACTGTTTGACAGGAT
TCTTGATCCTCACACTTCGAGAGAGTCTCCTGTATGAACAGAAACTCTTC
TATAAAACGCTTCAGTAGAATCCCCATCAAAGGGAAATCCTTCGGGTCTT
TCGAGCTGTAGAGGTCCGACTTGTGAAAATCAAGGTTGATGTCAATTCTT
TCTTTTCAGAACTGATGATGACGATCTTACAGATGATGACCTCTTGGATG
AAGAAGACGAACTCGATCACGCTCAAATCATATTACCCATGCGTGACCGT
CACGCTACCATCGGCTCCTCCGCTAAATTTTCATGCCGTGCACAATCCAT
TAAACCCCACATACCTGTAGAATGGTACCACGATGATAAACCAGTCGACC
TTGGTTGTGGACGTATAAAAGCTGCCGTCGCCGAAGAAGGAGAACTGTTC
ACGTTGAACTTGAGGAATGTACAAATGTCAGATGCTGGCAAATATAAGAT
CGTCTTCAAATTACCCAACGAGACGTTGACATCGAGTGCTAACCTTAATG
TTGATGGTATGTTTCTAGACAATTAAGTGCATGCTGTGTTTGTTCGTTTG
TTTTGTTTGTTTTGTGTTTATTTTTTGTTAGTATCGCGTTGTGCTCAATT
TGCATTGTTGACCAACTGACAACCTCGTTCCCAGCGTCTAATCAACTTTT
CTACGTTTACTATGGACGCCGGAATATACCCTCTGGCGTATATCAGTAAA
TTATTAAGGGCTACACGGGACGAGGTTAAGCGAGTTACTCTAAATATTAT
TATTACCTTAAGACGCAGCTCAATCAAGAAAAGTGCACAGAACACTGCAC
AATTTTTTTTATTTTTTTTCACCTTTTAACGCATTACTAATAATGACATA
CCTAACATTAACTGCACTCAACGTCTTTGTGTGTATGCCCATATTTAGAG
TCGCATGATTTATTGTATTTTTCTAAGTTGGCTTGAAATGAAAGCTCATT
CAACCGTTGAAAATATTTTTTGAAAATGTTCTTCTTTTTCAATTTGACAG
AGGGTCGCAAAACAGAATTTGGTGTTTCAAGCCGATCTTCAGATACGAAG
AAAGAGCCAAAAGCAACACCACCAAAACCCGCCCCCAAAACACAAAGGAA
ACCAGGCCAAGAAGAACCGACTTTTGTTTTGGAACCAAAAGATAAAACAG
TCGTTGAAGGTTGGTAAAGACTTTTTGTCCAGTTAATTTTTATTGGCGCC
TTATTTTCAGAGGCGCGTGGGTGTTTTATAATGAAAGATATTTCAGGCAA
AACTTCGGTAAACATTTAACTGCGCTCTGGCAATATATAGGCAATGATGT
ATTATTATGACCTATCCCTAACATCTACCGACAAATGGAGGCTTCGTGGT
TATGTAAGCTTATCTCTGTTGCACATGTCACGCGAAAAAGCAGAAAAAAG
CATTTTATCGCAGTTTCGAATCAAGATTCTATTTGCTAAGAAACGAAATT
TTCGATAAATGTCACTGACCTCTTTTATGTAAAATCAAGATAAATTGCTC
CTAAACTGGATAAGTCAGATTAATCCCTTTTTGAAAATTAGTATAATTCT
TTTTTAATGCTCAGTTCAGACGGTTTTGAAACTGCTTAAACATAGTTTGA
ATGTTACATTGGCGTGAATAATTTTGTATACTAATTTCTTTAAAACTGTT
AGAGTTTCACGGATTCAATCTATGCTTATCAAATTCGGTAACATTGACTC
CATAATCTATGGTCCATTTTCTTTAATTGTACACGCTCTTTTATGCTACA
ATGTGTAAACCATGTCTTTGTGATCGGGCTTATTCCGCTGTGATTGGTTT
CCATAGGATTGCAAGATAATTGTTCACTGTTAAAGCAAATGGACTTGACT
TGAAAAAAAACGACCTTAGACCGTTGCAGAACAGTTTTGTTGTTACTTAA
TAGTAATGGATTCTCAAATATCTTTCCTTTGTTTAATTTCACAGGTAATC
AGCTGAAATTAACAGCCAGCGTTAACGGTAAACCAACACCCTTAGTTGAA
TGGTATAAAGAAAACTCATTACTTAAATCTTCCTCTACCATTGATATTCA
AGCAACGAGGAACCTACATAACATGGTAATAAGAAAGGCTACCACGAAAG
ATGCTGGCGTTTACAGATGTACTGCTCGTAACGAAGCTGGACAATGTACT
GTCGAAGTCAACATCAAAATCGATACTAAATCCAACAAACCTAAATTATC
GCCAAACCACCCAGCATTTACGAGAGAATTAGAGGATTTTTACGAAGCTG
AAGAAGGAAACGATGTCGAAATGAAAGTCGAATTTACCGGCAAACCGAAA
CCACGAATCCATTGGGAGAAAAATGGAAAGAATATTGTCTCGATTAAACG
TGTCAAAATACACGAGGAAGATGGAGCAAGTCAATTGTTGATCAAGGCAT
TGAGAGACACTGACTTTGGTGATTATTCGTGCACCATTTCCAATTTCCAT
GGCAACACGAAATCCACTTCATGTCTTCGATTATGTAAGTTAACTAAAGG
ACAATTTTACAAAAAAACTGTTGGGAATAGAGAGATTATCAAGGCACTAA
CTTTATCAAATTTAGTTTAAATACTTTGGTACTAAGATAGTACTATAACA
CCAATGACCCTTCAGTTTTATTTGCACTAATGATAGCTTATAAAAGTAAA
ATCTTAAAGCCCCAAGAAGTGGGTGAAACTTATGAATTTGAAACGCCAAA
ACGGTCAATAACTCATTGTTTATTGCACAAGAAACATCTTATTGTTAAAA
TTCAACTTCTTCAATGCCACTCAAGAAAGTAGAACTCGTATTCATTTTTA
TAAATTTCCGATACTTTCTTTGTTTTCAGGCTCTGATGGTACACCCGACA
TTCACATAAACACGCCCTCTCCACCACCACCCCCTATTTCTTCCACAACC
AATCAAGAATGTTCTAAGTAAGTACCCTAGATTATTCTTCTTTATGATTT
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GTTGTGCTGTGTATTAAATCGTCTTATCTTGGGGTAACATTATAGACAGC
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GACCTTAATAAAACGTCATAACGACGCTATTCATATACTTTTCACAAAAA
AAGCCTAATCTCCTTGGGGAAATCATTTCATTGTTTCAAACTTTTTTTAA
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TGATTTTTACCGAGATTAGGGCTTTGAAAGGTGAAATACTCTTCTTCGTA
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TTTTAAATTCTAAAAAGGTAGGTTTAACAGGACATATAAAAAAAGTTATA
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CAGAGCCCTTAAATTAATTAATGGTGAAAAAAAGCCACTGGCATCTCATT
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CGAAAATTGCGTGTTAATTATTACTCAGAGTAATCACGACACGGCAGGCT
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GGAAAGATGCTGTTGAGAACCATTACATACTGAAAGAAGAATTAGGAAGG
TAAACAGACATTACTAATTCATTTTAAGTGTTCGAACTATCTGCTATCGT
GTGGAAACCACTCCCAAGGAAATTATTCTGACTACGATGGCATGGTTTCC
ACATTGTAGCAAACAAAAGTACACACTTAAAAGCGGATAGGTTTTAATCA
TTCAACTGTTTCTCCTAAAGTTAAACTTTCCAGTGAATATATATGGCTAT
GCTATTGTGTATTTTTGCCTATGATGTAAAGAAAAGATTATCCCTACCTT
CGGGAAGATATTTGCACTGTGACTTCTCCCGACAAATTCGATCTAAGAAG
ATTTGAAATATTCTTATTTTTTCACTCCACACTTGAAGTCTTTCTACCAT
TGTTTTACTTCCCACGACTCACACCTTAACCCAGATTAGATTGAATGAAT
CTTTGATTTAGATCTGGGAAATTTCATTCAGGCCATTAGCTCAACTTTTT
ATTCCATCTTTATCTTTACAGGGGTAAATTTGGTGTCGTCACAAAATGCC
AATGTAAAACGTCTGGTACCGATTTCGCTGCAAAATTCATTAAATGTCGG
CCGACAGAACGAAAAAACGTTTTAATGGAAATTGATATCATGAACTCGCT
TAACCATAAACGATTGATAAACTTAGTAGCAGCGTTTGAATCATCGAGAC
AAATTGTGCTTGTATTAGAGTTGGTAACTGGAGGTGAACTTTTTGAGAAA
TTAACTGAAGAGGAATATATTTCGGAGAAAGATGTGACTTTTTATATGAA
ACAAGTTTTACAGGGTGTTCAACATATGCATGAACGAGAAATTCTTCATT
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GTGGAACTCTTGAACCAAATATCATAATAGCCAAATATCAAAAAACTATT
TAATTTTCCATTAAATTTCTAACAAAACTCCAATACATATACGTGTAAAC
CACTGTACGCATTAGAATAAGCGTGCACTGTCTATCACTTGTTAAACCAG
AAGACCAAGAAATTTTCCCTCGTTAGCTGTTTTCAATATTCAACTATGGC
TTAAGGTTCAAGACTAAATATTGAACGCCATAAAGTAACAATACAACAAT
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GCCGTTTTCGGGTTTACCCGACATTTAAACTCCATTGGCCGATGTCCGAC
ATAAAATGAAAGGTTAATATATAGGCAAATTTTTAAACTGCTGGAAAACT
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ACCTTATCGGCCTTTTTAACGCGCCCAAAAATAACGCCAATAAGGGCTGG
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TGATTGCTTTTGTTACTATTCATAAGTTCATTGTTATTTATCGCATTGTT
TCTACTTTTACTATTACAGTGATCGTGCCACTGTCAAAGATTGTCTTGAT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00069240 vs. Swiss-Prot (Human)
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            A N YGT++ +  + L   G + E + + E E+SD    EP+ +   + +  +  V + Y ++E LG GKFG V +   K +   +A KF K     E++N+  EI IMN L+H +L+  V AFE    IV+VLE+V+GGELFE++ +E++ ++E++   YM+Q+ +GV+++H++ I+HLDLKPENIM VN   T+IKLIDFGLARR +   SLKVLFGTPEF+ PEVINY+ +  ATDMWSIGVI Y+L+SGLSPF GDND+ETL NVTS  WDFDD  F++ISD+AKDFI +LL     +R     CL HPW M K  K    KK+  DR+K + ARRKW+KT  AVR+   L+   +++G+   +++T    +PT+P +  K E     S     +       V+       P F K + DL++  G  A F     G  D    PEV W ++ + + ES+H  +    +G   L I +   DD  +YT +  N  G   C+A LIV
Sbjct: 1406 AINVYGTSEPSQESELTTVGEKPE-EPKDEVEVSDDDEKEPEVDYRTVTINTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRKVWAGKFFKAYSAKEKENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGLARRLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWLM-KDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSST---GSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVK-------PYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPD----PEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIV 1899

HSP 2 Score: 218.394 bits (555), Expect = 2.447e-56
Identity = 151/493 (30.63%), Postives = 264/493 (53.55%), Query Frame = 3

Query: 8307 DLKIRRGEVAHFQATFHGVEDERDTPEVAWKREGRILNESKHNHMTVIGNGMHLKILNSQLDDTGRYTVRLENQHGAVECSAHLIVRDAPSPPAA-PVITQVLSTSALVQWRAPS-DGNAPIMSYRLQYRKLGDQEWSVFSDSIQQTITVVEDLEPDSSYRFRVSATNEIGSSEMGEQTDLVKTLAEDEGSKRESIDAPGARRLSRSLSITVPPSRLRSRTLGYEIKLKETNPENNYNFKEEIGRGKFAVVKKVGSKHSGETYAAKMVK-YDEDTVEITKKEFDIWKDLDHANLVLLHESFFVRKYLIFICDLVNGQDVLLFLANLP-SPTEDDVAGCMKQLLDALDYLHQMNICHLDIKPSNMVML---GSMLKLIDYGSARRVTSKGGEVGEMVGTIEFMSPEMISFDAVSSSTDMWXXXXXXXXXXXXXXPFTSDDEDETMSLITAVDYQFDPQVFDAISEEAKKFIKNLIVRIPEKRPSAIVCLEDPWL 9764
            D K+R GE         G +    T    W +  + + ES+H  +    NG  L IL ++ +  G YT+ +EN+ G+ +   +L V D P PPA  P  + + S+S  + W   S DG + + SY ++     ++ W   + + + T   V+DL PD  Y+FRV A N  G+SE  ++++L  T+ E     ++ ++               P    R+ T+  E K+ +      Y+ +E +G GKF  V ++  K + + +A K  K Y     E  ++E  I   L H  LV   ++F  +  ++ + ++V+G ++   + +     TE +    M+Q+ + ++Y+H+  I HLD+KP N++ +   G+ +KLID+G ARR+ +  G +  + GT EF++PE+I+++ +  +TDMWS+GV+ Y L+SGLSPF  D+++ET++ +T+  + FD + FD IS++AK FI NL+ +  + R     CL+ PWL
Sbjct: 1246 DQKVRAGESVELFGKVTGTQPITCT----WMKFRKQIQESEHMKVENSENGSKLTILAARQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSIEIWDSANKTWKELA-TCRSTSFNVQDLLPDHEYKFRVRAINVYGTSEPSQESELT-TVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKE-------PEVDYRTVTINTEQKVSDF-----YDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRKVWAGKFFKAYSAKEKENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGLARRLEN-AGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWL 1719

HSP 3 Score: 92.8189 bits (229), Expect = 3.460e-18
Identity = 44/94 (46.81%), Postives = 57/94 (60.64%), Query Frame = 3

Query: 6855 PYFTRELENSFVVEGGAAKFICRCHGNPDPEVVWYKEKEKIVESKQFSILFDADENCVLIITQSNHDTAGSYMCVASNSYGTTKSTAMLYVEGL 7136
            PYF++ + +  VVEG AA+F C+  G PDPEVVW+K+ + I ES+ F I +D D NC LII+    D    Y C A NS G    TA L VE +
Sbjct: 1809 PYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETM 1902

HSP 4 Score: 85.1149 bits (209), Expect = 7.174e-16
Identity = 40/94 (42.55%), Postives = 61/94 (64.89%), Query Frame = 3

Query:  675 KPAFKIKLQDIEVVSFSAVRFEVVVKGDPEPEITWYKNNEIIDDDDRNFLQEEEEDGTCALVIREVSTNDRGTYKCMAKNRFGKAMTTAELFVE 956
            KP F   ++D+EVV  SA RF+  ++G P+PE+ W+K+++ I +  R+F  + +EDG C+L+I +V  +D   Y C A N  G+A  TAEL VE
Sbjct: 1808 KPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRES-RHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVE 1900

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069240 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069240 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
MYLK	2.142e-94	42.16	Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo s...	[more]

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TCONS_00069240 (transcript) - C. hemisphaerica