TCONS_00069592 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069592
Unique Name	TCONS_00069592
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1678

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_502:166103..182793-

transcript sequence

>TCONS_00069592 ID=TCONS_00069592|Name=TCONS_00069592|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1678bp
atttggagttgaagattttattttatgtatGGGACTTTGAAAATCGTTCT
GACCATCAAGTTTGAAgtttaaagaaaatttattgGTACTGAGattTCAC
CGAACTCCTCATTTCGTATTTGCTCGCCAAACCAAACGTTCAGcaataat
aacaacaacgacaatAACAATATAGTACGAAAGTCCAAGAAACCACATTG
GAACACAAGCACTCGCTTACATCACATGGACCCTCATTTATCACAAGAAG
TCACTATGGATGTTTTCTCATTAACACGCGAAATCCACACGCCCATCGGC
CCGCCCATGAACGCCTCTGAACGCGCCACAACGCCCAAAGACGATAAACC
AATGTTACCTTTGAAGAGAAGTGATATTTTACCGAAtgtaaaaatttaca
atttgtgGAGTCAACACTTGTCTAAAGATCAGATAACAGCAGAAGCGGCT
TGGAACAGGTGTCGCTTGATCACCGAAGAAGCGTTGGAGAAGTTTGGTGA
ACGGTTAGACTTCTTGGAGAATGTGGCTGCATGGGAAATCACAGCTGAAA
TCTTATTGGAATTCCAATCGCTGGAAGAAAAGAAAGGTGAAATAGAGGCT
GGTTTGTTTGAAGTTGAAGATTACGATATTGAAATCAAAGAAGTTGCCAA
AGCAACACAGAACGTCGCGCAGTATCTCGCTCCCATTGAAGAGAGAGAAG
AACTCAAAATGAAGATCGTTACTCTAAGACGACgttatttcaaagtttta
caaGAATTATGCAAGAAGAAGGAACTTTTCAGATGGTTGTTACCCTTGTT
AGAGCAGTACCGCGACCAAGGATGTGATATTAAGAGTTGGCTTGATGTCA
CGGAGTCACGAACTGAATTTCTCACATCAAATTTCAATAATAATGAAATT
ATTgtcaaaaatgaagatttgatcGAGGAAATCAAAGAAGAACTTTTCGT
GCAAAAAGATGCTTACGAAGACTTCTTAAATGCCAGTGAAGGAATCATGG
ATTTGTTATCAagtgatgatgacgtcatcattcaaATTCGGACAGACCAT
GACCACGTGGTCTCAAGATGGGACACTTTGTGTAGCAACATTGAGAAGTG
TTTGAACAGATTGGTATATGCAAAGAAGGTGTTATCAGAACAATCGAGAA
CGATCAATACCGACCCTGAGAAGATCGAGAAAAAGATTCGTAACGAAGCA
AAACAATGTACTTGTCATAAACCTTTTCAAATCACTCGTGTTGGTGAAGG
GAAATATACATTTGGAACTTCCAAGATTGTGCGGTTAGTTCGTGTCCATN
TCGACGAACTCTTACTACGGTAAAAATGTAGGAAAGATGTTTATCACTAA
CCCCAACTCTGTTCGTTTTATAACTTCTTGTAGGTTATGAAGTTCTTGAT
GTGTATTTAGAGTTNGTGTTGGTGGTGGATGGGAATATTTGTACGACTTC
CTGTTCAAAGCTGATCCATGTCGTGGTAAGTCCAAactctttctcaaaaa
atatttttgttctgatttcataagagcatgaacatataaacgactggaca
tccatctcctttgtctttttgtagaaagggctgctagcttcattgccgcc
tcgttaaaagcataaaatgaaacaatagattttgatgatataccacttgg
gagtaccttgctaacaacgtcaaaactt

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_502:166103..182793-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00069592 ID=TCONS_00069592|Name=TCONS_00069592|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16691bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_502:166103..182793- (Clytia hemisphaerica)
ATTTGGAGTTGAAGATTTTATTTTATGTATGGGACTTTGAAAATCGTTCT
GACCATCAAGTTTGAAGTTTAAAGAAAATTTATTGGTACTGAGGTAAAGT
AATACAATGTTTATTCTTTGTGGGCGTGAGGCGGGTGTGGTTAGTTCTGG
GGTGTAATATATACGCTTTTTTATAAGAATGGTGTTTTTCGATTTTATCT
AGTTATTCCTAACCTTTTGGTAAAAACAATTCTAAAATATTATTGCGATT
TTCTTAGGTTAGGATCAAAATTCAACACAAATTTAGCATATAGTACATAC
CGGAAGCATAAAATGGCATTTTTATGAAAGTTTTGAGCCTTACTTGGAAT
AATTGACAATTTACAGTTTTTAAAAAAGCTCTAAAATTCTTAGGTTCTGC
AGCCAAACCCCATGAAGGTTAGCATATTCTTAATTTTTTGGCAAATTTCG
TCATGAATATTCTTATAAAGTATATTCCTATAGAAAGAAAATAATTTATT
TTAATTCTTCAATTAATGGTCTGAAACAAATCTTGAGAGATTTTCCCAAT
ATTTTAGTTTATACACTTTGGATTGTCCGAATCGATATCGAGAAAATTGT
TGTCTGTAAGGAGATGCGAAATGCGTTTATGTCAACAATTGTATTCGGAT
CATATTGTAGCTTACCCAAGTCAAACTTAAGTTGACATTTTGGTGTCAAT
ACAAATCTTGTCTAGTTGCTTTCGGAAGTAGCTGCATAAACAAAAATTAT
TTTCCTTAAATGTCATTCAAACCATTGTTTCTGAAACATCTCACTGTTAC
AATGGACAACACAACATGATGCCTGACTTGATATTGTAAGCTCTCTAAGA
TTGAAGTCATCCATATTTTGGTGTAGTCTTAGTTTATTGAAAATTTGAGA
ATTTAAAGTTTTTCAAGGAAATAAACTTGTCAAGTTATAATCTACTTACG
AGTTGTTTTCCTAGTATAAATAGCTCTAGATATGTGATAAATTTCAAACT
GGGTGTTTTTTCCAGATTCGAAAGTTTTTGGAGTTATGGTGATTCGTATG
AGGAGTAGACAAGTAGTCTTCATTTACCAGCTATGAACGAGTTAGAAATG
TTATCACTTTTCTGTCTTATTGTGGTTCGAATTATTCAACTTTTGTAGAA
AAAAACTTAGCCGTCGTGTTAATAAGATTGCGTTGAAGAATTATTAGAAG
ATCGTCGTTTAATTTCTTGGAATTTTAGAATTGCGTAGAAAAGAAGAAAA
GTCGAAACCAGAGAACTGTTGATTGTTACCGTATACCTTTGTTTTGGTAA
ACTCAAAGTCAAATTTCTGCTGAGATACTACATTTTGCAATACTTAAAGT
AGATTTTCAAGCTGAAATTTTGTTATTTGAACCGAAATCGTAGCAAGGAA
AAAATACCTGGACTTATTGAGTCAAAAGTAAGCAAGAATGAATTGGGAAG
TCATTCTATTGTTCTAAGAGAAGAAGACGTTAATATGACGTCTTGCTAAT
AACGGTTACAATCGCAATATCTTTGGATATCAAGATGAACGTTGATCTTG
ATACAATACTTCAGTCGCGTGTCCCGTGAAAAATTACAAAAATGCGCTAT
CGGGTTGTTTTTCATCTTTGGAATCCTTTTGAAAGGCGGTAGGCTTCTGC
TCATCCTCTAGCGAAAAAATTTTCTATATAGGAGATATATCTATAGAGGT
TTGCGAATCAAACTAGAAAGGCGGACACTTTAATTCGTGAAAGGGTATTA
GAGTAGTTTGTTTTTTTTGCAGACAATTTTTTGTACTTTTTGGTACAATA
TAGTCTAGCATCAGTCGGCCCGTACAACAACCACAAATTTAATTTTTTTC
GCTTCGCCTAAGATAATTTCAAAGTGCAAGTTTCGATGCAATCAGTGGGC
ACCAACAGTTTTTAGTTTTCTAACTCTCTTCACAGGGTCAGCGGGCAAGC
AGTTAGGATTGGACAGTATGACGATTAATACAGCACACAGAAATTTTGAT
CTTCGAATCTCATATTTTTTTGAATTTTTTTAAAGGCTCCTTTTTCTAAT
ACAATTTTCCAATTTGAGTCAAATGATGGATCGTGACTTTGATTTGTTTC
AACAGCTCTGTTAATAATTCGGTTCCAAGGGTCTTCTTTTTTTTTTTNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGG
GGTGGGTTTCTTCGGATCTAGAGAAAAAACTGTTTAATACCGAACTTTCA
ATAAAACAACAAAATAATTTATTTCCCATCCAGAACACCCGCGCGTAGTT
TTTGCACAAACGCCGGATTGAAACTAAAATCTATCGCTAGACTTCAAAAA
ATGTAGTCCTCCAAAACAAAGGAACTGCTAGATACAATCAATCGTCATGA
TTACGGCGCGTTCTATGCGCGTTTTGGATGGGAAATAAGTGGCTTCAATT
TCTCTTGACTGAGAAGGGTTAAAGTTTCGCCTCTAGCACTTCGGGCTTCA
AACTCAATGTATCCGAGTCGGGTAGCCTAGTTATTCAGGCTGTAAATTTT
TTTCTGATGTTTTTGGTTTACCGTCTTGTTTTTCTAAGGCCATTTGAATT
TCAAAATCAGAAGACAGTACATGCGTAATTTGTCAATTTAAACACGATTG
CGTCAAGCTAGAACTTTGCCAAGTTGTACACGTTTTTATAAAAACAAACT
ATATCATAATATAAGGCTTCGATGGTAACATATTTAGAATAAGTTACGGA
TTTAAAGGCTTTACAGAGCCTAAAACACCCAATTTCTTAGGAAATACTCT
TAAAATACTCAAAAAATGGAAGAAATAAGAACAATTTTAGGCTTAAATCT
CAAAAAGTTAAGAACATCCGAAGGCTTCAAAAAATTTGGATGTTCTTTTA
AAGAAAAACGTGTAAATAGCCAAAATATCANAGGCTTCAAAAAATTTGGA
TGTTCTTTTAAAGAAAAACGTGTAAATAGCCGAAATATCAAGATAGAAAA
ATAATTTACAGCATGGAAATTCAGGCTACGCTTCGAACAGTACCTCACAA
GTTTCATAGAAAAGATGTGTAATTCATAATCAAGTTGTGTAAATGAGCAG
AAAGTTTATCATATTATCAATGGAATTAAAGTCATTAGTTAGGGCTTATT
ATCGATTTAATGCGATTTTTGTATAGTGAGTTCCCTCGACGGTTAACGGT
TTCTCTCTACTCATTCATTGCGCTTAATTGTCCCGTGCATTTAAAAAAGT
TTTATGTGAGAATTCAAAAACACCAACCGCGATGACACAAAAAGTGATTC
TTGTGTTGCTTGCATCGAGTAATTTTGAATGGTGAGTTTGAATTATTTTT
TGTGAAAGGCATCTTTGAATGAGTATCAGTGTGTAACAGACAAGAACACA
GCTTGCTTGTCATAAGACGTAAATGGGTTAATGGTGTGTATTTTCTTGTG
ACTATGTTTATTTTGTTAACGTGTAGTAGAAGGACAGAAAGGGACATCTA
CTTTGAAGCTCTGCTCTTTGCTGGGGTGGTGTTTTTGAGAAATTGAACGC
GAATTATTTGTAGAAAATCTTTTTGTGAGGTATGTTTTTTTTTCTAATTG
TTTTTTCAAAGACTTGGAGTTTTGGTATTCTATTTTTGAAATGTTCATAT
TATTCTCATTCACAGTTTAGTTTACTGGATTTTTTCTATGGTGTTCTATA
CGTTATTTTAAAAAAGAGCATCCAAAACTGTTGAAGCCTTTGGATGTTCT
TAACTTTTCGAGTCTTTAACCCAAAAATGTTATTAACATGTTCTTAATTT
CACGATATTGTTAGTATTTTTGGGGAGAAATCGGTTTTTTCGAGTCCGCA
TAACCTTAAAGTGTTACTAAATTATTCTTAAGATTTAGGTCATTGAAGCC
TTATGATCTTAGATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTATGCCGACAGGC
AGTTAGGCTATTCTTATGCCGCCAATTTCAATCCAAAATCGAAGATTTGT
TTGTGCGCAGGCTTTTTGAAGATGATCTCGGTTATCCCAATTGCTTGCTC
ATTTTCCCACTTCATAGAGTTCACAGTGAATTCAACGAAATGTCTAAAAG
GAAAAACAGTTAGAATTTTAAATGAAAAGTCCAGGTGTTAAAAATAGCAA
GAATGACATCAATAATTGATCCAGCTCTTCGAGTTCTTCTAGTGTTTAAT
GTCAATTTGATTGAGAATGTCAATAGATGATCAGATTTTACTTATGAGAG
GTGCCTGTGATTGCTTCAGAAAAGACATTAGACAGTTTATTTTCGTATGG
TGCCCATTGAAAAGAAAATACTGACAAGTTAATCAGAAGATACGAAAAAA
CATAGACAAAGTCAGATTCTCATATCCAGTTCATACTTGTTGATGCTTCT
GAAGTAGCTACATACGCATAGTATTGTTTATAGAAGATAAAATTCCTTAG
ATAACGGCTTCGATATTTCTTCGAAGAATTTTTTAAAATTGTTATCAAAA
TGGTATCGAACGTTGATACTGAAGACNTCATTGCGCTTAATTGTCCCGTG
CATTTAAAAAAGTTTTATGTGAGAATTCAAAAACACCAACCGCGATGACA
CAAAAAGTGATTCTTGTGTCGCTTGCATCGAGTAATTTTGAATGGTGAGT
TTGAATTATTTTTTGTGAAAGGCATCTTTGAATGAGTATCAGTGTGTAAC
AGACAAGAACACAGCTTGCTTGTCATAAGACGTAAATGGGTTAATGGTGT
GTATTTTCTTGTGACTATGTTTATTTTGTTAACGTGTAGTAGAAGGACAG
AAAGGGACATCTACTTTGAAGCTCTGCTCTTTGCTGGGGTGGTGTTTTTG
AGAAATTGAACGCGAATTATTTGTAGAAAATCTTTTTGTGAGGTATGTTT
TTTTTTCTAATTGTTTTTTCAAAGACTTGGAGTTTTGGTATTCTATTTTT
GAAATGTTCATATTATTCTCATTCACAGTTTAGTTTACTGGATTTTTTCT
ATGGTGTTCTATACGTTATTTTAAAAAAGAGCATCCAAAACTGTTGAAGC
CTTTGGATGTTCTTAACTTTTCGAGTCTTTAACCCAAAAATGTTATTAAC
ATGATTTTAATTTCACGATCTTGTTAGTATTTTTGGGGAGAAATCGGTTT
TTTCGAGTCCGCATAACCTTAAAGTGCGTTACTAAATTATTCTTAAGATT
TAGGTCACCGAAGCCTTATGTTCTTAGATAGCTTCTTCTTATAAAAAACG
TGCATGCCGACAGGCAGTTAGGCTATTCTGATGCCGCCAATTTCAATCCA
AAATCGAAGATTTGTTTGTGCTCGGTTATCCCAATTGCTTGCTCATTTTC
CCACTTCATAGAGTTCACAGTGTATTCAACGAAATGTCTAAAAGGAAAAA
CAGTTAGAATTTTAAATGAAAAGTCCAGGTGTTAAAAATAGCAAGAGTGA
CATCAATAATTGATCCAGTTCTTCGAGTTCTTCTAGTGTTTAATGTCAAT
TTGATTGAGAATGTCAATAGATTTTACTTTTGAAAGGTGGGTGCCTGTGA
TTCCTTCAGAAAAGACATTAGACAGTTTATTTCCGTATGGTGCCCATTGA
CAAGAAAAAACTGACAAGATAATCAGAAGATACGAAATATCGTAGACAAA
GTCAGATTCTCTTATCCAGTTCATACTTGTTGATGCTTCTGAAGTAGCTA
CATACGCATAGTATTGTTTATAGAAGATAAAATTCCTTAGATAACGGCTT
CGATATTTCTTCGAAGAATTTTTTAAAATTGTTATCAAAATGGTATCGAA
CGTTGATACTGAAGATTTTGATGGACATGCTCCACTTAAATTTTCCATCG
ACATCAATATCATGAAAATTGATGAACGCATAATGGCGGACAGTGAACAT
GATTACCGATCTGTCAATGTTTTGTACCTTAACAATGTAAGTTGTATCTT
TAAACTGACCGTTTCTTTGGGATGTTACTGCTTTTCACTGGTGAACCCTC
GGAAATTTTAGATTTGAAAATTTACAATATTTTTAGCATTATTAAAGTTT
TTATTTATGGCTTCGTCTATTGTCCGCATTTCTCCATTATAGAAATACGG
TATAATTTAAAACAATTTGAAAGCCTAGAGAGCAAGGTGGTCCATTTTAT
CTAGTTGACCTTTAGTGTAGAGCTTTGGTCAGGAGTAAATAAACTTGAAA
GTCTCCTCCTAGTGACCTTGTATTGAATGACGCACAAGATATTTGTTTTC
GTTGCATCAAGTGGTGCTTTTTTATGCTAAAAATCCTTTTTATAAGAATT
TTATTATGATCCCTTTGCCTAAAACTTTCGAACAACCTCAGCTTTAAAAA
TGCTTAAAAGTCCCGGGGGTACCTAGGCGATTGGAACGGGTGTGTGACGC
CCTTTAGGGTGCTTTTTTTAAGAACAGTCCAATCTTAGACAAAATGTAGT
AGTGCCTTTAAAAAACTCTTATTTCGATTCTATTAGCTGTTCAGCTCTTA
AGAAATTTTCCGTTGTGTTAACATGATCTTTTTCTACGAACCGACTCTAA
TTTTTTGACAAGATTTGGCCTAATTTTTCTCAAATACCTTCTTTTCTGGT
TATGCAATACTATCAACTCAAGAAAGAACTTTTAACTATAAACATTTCAT
CTTGGAATTGGAATGATATAAAAGAATTTTGATCATCCTAAAGTGTACTT
AGGAAACGACTTCTAAGCGCGTGTCCTAACATAAATATCAGTGGCGACGT
TTTCTGTTTCGTCAGATATCTTTTAATAAATGTGATTTTGAAGTCTATTA
GCGATTTGCATTACTTGGCATATGCTCATTTTTGGGATCCAGACGGTTTG
CGTGAAAGATGCACGAATGAGATCTTTTAATTGTGATCATGCACGAATTT
ACAATATTTAATTGTCAATTTAGTTTCTGCTTACCATGGCACTTTCTGAT
GCTCCTTTACGTACGCCTGAACTAAGAACGACTTTTCAAAACACAGACGC
GAAACGTTGACTTCCTTACAAATCTTCCTAACTACTTTTGAATTCGAAAA
ACTATTTGAACAGTCTGCTTCCTCGTGCATTGATATCATGCTTGATCATG
CTTTAATTAATTGCTTGACCAAGCTTATCTTACTGCCCACTTGACAATAT
TGTTATGAGTCAAAAAGTGCCACAAATTAAATTTGGTAGATGTTTTTCAA
AATTTTCTTGATGATAGTGATGTTGGTACAATTCTACAAAAAATTGATTT
TCTTTTTCATTTTTTCAAACTTTTTTAATTTTTTTTTATATTTAATGATA
TTCCATTCCTGATTATCTTTCCAACGAGAACAAATCGGCTATCAAATTGG
AATTCTAACAAAAGTAATAGGCTTTTTTCTTTGCTCTAGATTATTTTAAG
ACAGACTTTGTTATTGTTACTTTATTGTTTATGTGACTTTTCTTGGGGAC
GTTTTACAGATTTTAGACAGCTTTTGTCAGCTACTCTGTACTACCATTGC
CTTTCCAATTTTAATATCATAACTCACCATTTTCTACTGTTACTTTCCAA
TCAATTTCTTTTTTTGGTATTGACACAGTGGTAAATTGTTGCCCACAGCT
TTTCATACTTTGAACAAAAATAGCATTATAAGAAATTTGTCGTAATTGTT
GAAAGGTTTAATTGGAAAACCCGTATGATTAAAAAAAATGCCACTGTGTC
TGTTTTTGTCAAGATTACGTCATTATATTGTATCAAAATGACTAATTTGT
TACCGATGGGTTTCGTATTTATGATGTTGATAAATTTCCCAGACAGAGGT
GATGAAATTCTGTCAACAATTCACTTATTTTGGTCATCATAAAAATCTTA
ATTAATGTCTGGAAACTGGATTTGATACCAATAGTGGATTCCAGGGGGGT
CAATATCGCCAAACTAGTGGAGACACGGACTGCCTTTAGAGCGCATGCGT
TGCATATATGAAGCAAGGGCAGCTGCTATTATATTGAATCTGATTTAGTA
AATGATTTTGAGCATCTGAAGTATTTTGATGTGATACAGGGGTGTCTAAT
AAAGCGAACTTAGCTTTTTTTTCAGACAGTGCTTTTGATTATGAAGGGTA
GAATATCAGAAAGCTGACGCTTGCAATAATTTGATGCCCCGGTTATTAGG
ATATTCAAACATACAAATACGGATCGTTTTTCCTTTGAAGCCTGTGTTTG
AATTACGTCATTTCAGAGTTTGCTTTTCTACTTTTTTATTACGAAATCTC
GTTTCAAATTCTTCCCCCTGAAAAACAATTAGAATTTCTTAAGCAATGTG
GCACGTTTTTTGATCATTTAAACATATTTTATGTGTTCTATAAAGAAAGC
TGGACATTTTTTTCATTTGTTTAACACTTGGATCAATCGAGGATAGCATT
TGAATTGCGCGGAAATTATCATTCCGTCTAGAGGCAAATTACTTTTGGAT
CAAAAGTTAATCCAAGTGAAGATTTTTTTGGAAGATTTCATTATGAAACG
CCTTAAGAATAATTACTTAAATGGCGCCTTGTCTGAGAGAAATAATCGTG
TTCTTAGCCTGTCATGTGACTCCAGCCTTCATACAATAAGCGATCGGAGA
TCGTCGGTAAGATTACCTCTTAATTATCATAACTATCCCTTATTTATTAA
ATTTAATGATTATTCCCAATTTTTTGATTTCCTCTATTCTTAATCCAGTG
TTTCCGTAACTGAAATTTAAATCATCCTATCGGATGTTTGAATGGATGAG
ATTTGTACTTTACTTCGATATGAGTTTTGTATTTTGTGGTGAAGAAACCA
TACAGCGAGGTTGTGTTAAATTTTAGAACAATGGAGGTCTTTGAATATAA
TCCAGAGAAAATAGCCACTGATCTACAAAATGGTTTTCGTTGTGATTCTC
AAATGATGGACTTGACGCAAATCAAGAATTTAATTTCACAAGATGATATA
TGGACTTGGTGTAGTACCAAAGAGCAAATAAAATTGATTGTTTTGCTTGT
GTTGGGCAAAAATCGTTTTCTGGAATTGGTAAGGTTGCCTAGTTTTTTCA
ATAGTCCTTCATTGGTTTAGCGAGGGACGATTTTCAAGAAAAATACTAAG
TGTGTTTTTCACTTTAATTGGTACAACAGTAGTGAGCTCTATTTTGATAT
TTTTGCAATAAGAAACAGTTAAAGTTTTCTATCCTTGTATCGGCAATTTT
CAACGTTTTTGGATCGTTCGGATTCAAGGTTGCTGTTCAATGATGGCGGG
TTTTTTTCTATTTGTCAAAAGAGTCCTTCACTGTATGGTAGATCTTTGAT
GCCTTTTTGATAGTATTGCTTATTAATTGTTCATTAAAAAAAATGTTTAA
TCGTCTCTCTGATCATTTTCAATACTCCGAAGCGATCAAAAAAAATTGCA
AAATTACTTTGTTTGGTACTTGATGATTAATCACTCTGTCCTTTTCTTCA
AATTAAATGAATAATTATAAAAATATTTTTGTCTCTAGTGTGCATATCGA
AAATTGCAGTGGTTATTTGTTGTCAAAACTGCTTGGTATGTCGAGTGTGT
TGATTTATGCAACGAATTTGTAGTGTTTCGAGTTGCTTTATCGATGGGAT
CAATTTGTTATTTTAAGTGATAAGATATACCATGTTGTTGATAGGCTACT
GTGTGTCAATTTTCATCTGCCTTGACATGCTTTTAAAGCGTTTTTGACTT
TTCGAATATACAATACAATAGCTGACTTATTGCGATAACTTTGTTGTCTT
CTCGCTCTAATAGATACAGGGTAGCAATGACCTCACCAAGACTGCTTTTC
TACCAAAGTTGAAGAATTCAATTTTGATTTTAGTGTTTAGTTGAAATAAA
GTTTAAGTCAGTTATATTGCTTCAGTAGAGATAGTTGGGAAAGACACCAA
AGTCTTAAGCCACTATAGTTAAAGACATTATATGAGATTGGTGTCTTGTA
TTATCAATTTCCTTCAATTTGAATCATAAATCTAGATTTTTGTTTCGGAG
ATCAGACAGGCTTAAGACGAGTCAATCATAATAAGAAGTATTAAGTCGAC
TTTGTTTGAAATGCTTACTTTCGAGCTTCCTTCCTCGTTGTTCTGTCTTT
TTTGATCTTCTTTTTGGTTTCTCATTTATATAGCTGGTAAAATATTTTGA
CAAAACTACTGAATCATCGTACTTTTCCGCTTTAGACCTACGCTTATGTT
CGACTTTTCCTTCTAGTTACGAAAACTCTCTATAGAGACCTCTTTTCATC
AGGATATGATACCTAAGTGTGATAAACCTGCAATCGACATTATCTAAGAG
ATTGAGTCAGACTCGTGTTTAACTTCCCAATGAGTTAAGCAAACATTTAA
ATTTGAGAGACATAAATTTTTTTGTGTTTTTCGATATCAAATTTTTACTC
TAGCGGTTAGTCTATAGGTTAATTCTTGGTGCTAGGATAGTCGGTTTTCA
AGTCTTGTTTTGACGTGGTTGGTTTCGTGTAGTTCTCTAGTGCTATTGCT
GTTAGATAACTGGTTTGAATTTCTTGAATATAAAACTACGAGTCTTTGAC
CCTTTTTAAAAGAGACTTGGGTCAGGTTATTACTTTATTATTTTTGAAGT
TAGTTAAGAAATGGAACGGACTTGGTTCAGAATTATCCCGCATAGTGCCG
AAACATATGTCTGCTTTTTTACAGGAATTCGTAAGAGCTTTAAAAACAAT
CTGAACATCACATTTTCAAAAATGACCTGACCTTTCTTAAATACGAGGCA
TTCAACCAACCCGTTTTTGAGCTTTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTC
AACGTTCATCTAACGTTATACGGACGTTGTTTTGAACATTAGATACACGT
TTTTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCC
AAAAATTTAAGAACATTCTAAGAACATTCTAAGGCTTTGGAGACTTAAAA
ACGTGCATTTTCTTAAGAAATTACATCAAAATGCTCATAAAAAATGCTGC
AAATAAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTTCAAATCCAAAAAACTAA
GAACATCCGAAGGCTTCGAAAATTTTTGACGTTCTTATAAAAAAAAAAAC
GTGTAAACGTTGAAACAACGCTGGGTTGAGTAGAAATAATGATCACATTT
GGAATGTATTTCACTTTGTAAATTTCGAAAATTAAGAACAACCAAAGAAT
TTACTGGTTCTCGTAAAGAAGCGTGTACTTTCTTTGAAATATCTTAACCA
ATAAGTAAAAACATCCTTTCAGGGTTGATTCTAAAGTGAATTTTTCTTTG
TTTTTCAACACACAGTTCTGATTTCCCTCAGTTGCTTTTGTTTTTGTCCG
TGTAGTGAAGATGTAATAATAATATTATGTATTACGGATATTCGTAGTTT
CCTCATAACATACTATCGCATAACTGTCCTCTTTTCTCTTTCAATTTTTT
TTGGCAACTTTGATGTAACGTGTTACACAATACTAAAAGAAGTTGAAAAG
GTGATGAAATTATTTGTAAAGATTTGAATTTGATGAAGAACTTTTACTGA
GAAAAGGAAATATTAATTTCCATAATTCTTGGAGTAGTCTAAGAGTTTAA
GCAGTGGTATCAACTAAATGACTAAAATCACTTGATTTTCTGTATTTTTT
ATTTTGGGGTACTTCAACATTCCCATTGCTTTATGGTGGGTAAGATTTGC
TTTTAAGAAAGTTTGAGACTTGAATTTCTGAAAGACTTGTTAGTCCATCG
ATTGAAAATGAATTTCTCTTCATTCGGCTATTCTCTTTGTGTCTTTTCTT
CATCTCGACATGAAAAGTCTATTTCCCTTTAGCGAACTACACGTTTTTTT
TTTTATAAGGAACACGTTTATAAGGAACTCGAGGGTGAAAATGGTTCAAA
AAATAAGGAATTGTTAAGGAACTGCTCAGGCTGAGAATAAGTGGATTTGA
AAATAATATACCTTATTGGGACTAATTTGACCAAATTTTCATCTTTCAAG
GAGCAAAAAGTTCAAAATTTCCTATGTAGAAAGGAACTCGATAAGGAAGT
TTGAGACTGAAATTCTCTGTAAAAATAAAGAACTCCAGGCTCAGAGCAAA
GTTAAGGTTCCTTATAAAAAAAAAACGTGTAGTGTTCTGCTACACGAGAT
CATTTTCTCTCACAAAGTTATATTCTTAGACCTCAACATGTTTTTTCTCG
GCACCGTAAGAAGTTCAAACCTTCTCATGTATGAGAACCATTTTTCTTCT
CTTTCTCGTCTGCTACCTACCCTTAATTCTTCCTTTGAGGTTGTCTTCTG
ACGTCTACAAAAGAGTTTGTCTTATAATAGTGGTTACATTGTCTCGAAAC
TTCAGTCCTTGTGATGGGTGAAATCGAAAGATTAGCTGAAGATTTCTACA
CCCTATCTTTCTCTTTTATCGAGGAAGTGTTATTTTTGGTAAGACGAAAC
TGTTCGAATTGTTTTTAAAGACATTGATAATTGCTGGTCGTTTGGGTTGT
TTCGCTGCAATTAAAACGTTTGAAACCTTACTTTGAAGGCAGTAGGAAGT
CAACGAATCTTGTTTAATTTTACTTAAGATTTTTCAGCTGTTTGCTTTTA
GTGATCTCTGATTTTGTTTATCGTGGGTTTTTAATCTTGATTACCCGTGA
AATAGCTTTTAATTGATTGCTAAGTACGTCTCGTGAAGCATCATTTGAGG
TTTTATCTGAAGTCTGGTCAAAATAAAGCAGAGTTTTAAACTGTTGTAAT
GTTCTACTTTACAATAGTGAATATTGTGTATTCTTGATGTTTTTTTTTTT
AAATAACCGAACGCATTTTTAGTATTGGATTTTAAACCTTCGAATACTTA
ACATGTTGTTTAAGCACTTCCTTATCCTCGTCTTTCAGATCATGTTATTA
AAGAAATAGCTTAGTAGAGAAATCCAGGGAGAGGAGGAGGAGGCCCTGGA
AAGCTGAAGGAAAGAGAGCCCTTGGATTACCCTCGACAAGGATGGCAAAT
TACCTTTTTTATTTCTTTTTCATTTCAGATTTCACCGAACTCCTCATTTC
GTATTTGCTCGCCAAACCAAACGTTCAGCAATAATAACAACAACGACAAT
AACAATATAGTACGAAAGTCCAAGAAACCACATTGGAACACAAGCACTCG
CTTACATCACATGGACCCTCATTTATCACAAGAAGTCACTATGGATGTTT
TCTCATTAACACGCGAAATCCACACGCCCATCGGCCCGCCCATGAACGCC
TCTGAACGCGCCACAACGCCCAAAGACGATAAACCAATGTTACCTTTGAA
GAGAAGTGATATTTTACCGAATGTAAAAATTTACAATTTGTGGAGTCAAC
ACTTGTCTAAAGATCAGGTACTATTTAATGTGATTCCTGGCTAAATATAG
AATTTCTACTTCAAAATTTGAAAAATTACTACACAACTTCAACTAACTCT
TTAATTTAAAGCTGCATTTTTGTATTTTTGGTTTATCACGTATTATAATT
CGAATTCTAATAGAGTGTGGCTTTTTCTATCCACTTTTTGATCCATCACT
GCATCTCTATTGCTAAATCTATGGTATTGGAAGATTAGGTATTGTAAACA
AAACAAAATTGCCAATTAATTAAATTAAATATATCCTCAGTTCATCAATC
TAATTATCGCGACAGAGCCGATATATTTTATTGCTTTTTTCCGTTTTGTG
CTCATGTTTGTAAATTTCTTTCTATTCATTAAATGGAAAAAATTCTCATC
TAGATTATCCGATTTTCTAACCAGGTTCTTTTGATTGATTCCAAGGAACA
CAAATTTCATTGAAGCGTGAAAACTTTATGTTGAAATAATCAGCATTTTA
GACCAGAAAACCAGGAGTTAGAACTAATCCGAAAATCACTTGCTAGTATT
TTTGAGACAGGGGTGTTATACCATCAATATGGTTTTCTAACTAACGGCTC
TTATCATCTGATAAATTTTAAGTCAATCCCCAAGTCGATTTAGATAGTAT
TCCTGTTTAGCAACAGTAGTTAAATCAGATCTTAAATCCGAAAAATTCAC
TTCTTGGTGAAAGATTCTGCGAAATGTTTTCCCATTAAGGGCTCTTCATA
GTGAATTTTAATATTTGTCATGTACAAAATATAAATTTCTGCCTGATGTA
GCTAACAAAACTTTGACATGTTATACATTTTCTGTTAGACCAACTATCAT
TGAGTCTGAAAATTTAAGAATCGCAAAGAAAAAATTTAATGAAGTAGAAA
ATTAAGACTTTTGCGACGAAGAGTATTTCAACTTATTTTATTTTAGCTTA
TTTTTGGCGAGAAGAAATATTTTGAAAAAACTTTTGTGGTAGATGGTGTA
TCTTTTGCCGAACTAAAAATATATTTTCGGAAAATTTTGAAGATAGATTT
ATGGTCATATTCTCTCGATTTATTATAGATAACAGCAGAAGCGGCTTGGA
ACAGGTGTCGCTTGATCACCGAAGAAGCGTTGGAGAAGTTTGGTGAACGG
TTAGACTTCTTGGAGAATGTGGCTGCATGGGAAATCACAGCTGAAATCTT
ATTGGAATTCCAATCGCTGGAAGAAAAGAAAGGTGAAATAGAGGTCAGTG
GTTCTTCTCTTTTCATCTTTCTATTTTGGCGCATTATCAAATTTCTCTTA
TACATTTGATGTTGAATTCGGCTAAACAGAATACGTCTTTTGTGTTGACT
CTCTTATTAGAGAAGAAAATAGAATTGGACGTATTTAATTGCATTCTTGA
AAACTGACAAACAGCTTTCAGGTTTTCAAATATGTTTGAATTAAGCCGAA
GCGGAATGAAAGCCCAGCAAAAGTCTAATGTTTGTTCGCGATGCGTATAC
TTCGTACTGATTGTGACATGGTGTTGTTTCTTCTGAAATGAACTTGAATT
GACAAAGCGCTGATTCTTCAAGACGGACTTACAGCATTGCTGACAGCGAC
TTACCAATGAAAGGCCTGTCTATGCTGATTGGCCAAAAATACAACTCGCT
CTCATTTTATGCTTAATTCTTCAGGCTGGTTTGTTTGAAGTTGAAGATTA
CGATATTGAAATCAAAGAAGTTGCCAAAGCAACACAGAACGTCGCGCAGT
ATCTCGCTCCCATTGAAGAGAGAGAAGAACTCAAAATGAAGATCGTTACT
CTAAGACGACGTTATTTCAAAGTTTTACAAGAATTATGCAAGAAGAAGGA
ACTTTTCAGATGGTTGTTACCCTTGTTAGAGCAGTACCGCGACCAAGGAT
GTGATATTAAGAGTTGGCTTGATGTCACGGAGTCACGAACTGAATTTCTC
ACATCAAATTTCAATAATAATGAAATTATTGTCAAAAATGAAGATTTGAT
CGAGGTACTTTCCTATGATACAATTTATTACCACAATCTATTTTCAGATA
CTATGACGATATATAGCTTGCTTAAATTAGTTCTCTCTCAAAAGTCTCTA
AATCCTATCTATTTTCGGACCAATCGCGTGCGGTTGCGTCGCACGGAAGA
TGCTACGGATCCGAAGGTCTGGTCCCCTAATATTTGATCTTTTTTTAAGA
AATTTAAAATCTTTTACTCTCAGGAAATCAAAGAAGAACTTTTCGTGCAA
AAAGATGCTTACGAAGACTTCTTAAATGCCAGTGAAGGAATCATGGATTT
GTTATCAAGTGATGATGACGTCATCATTCAAATTCGGACAGACCATGACC
ACGTGGTCTCAAGATGGGACACTTTGTGTAGCAACATTGAGAAGTGTTTG
AACAGATTGGTATATGCAAAGAAGGTGTTATCAGAACAATCGAGAACGAT
CAATACCGACCCTGAGAAGATCGAGAAAAAGGTAACATATATCCAAATTC
TTTTTCGAGATTGAGTGAACTTAATAATCAAGACGAGGCTGGACAGTTCT
GCTTTCATGACGGTTGACTGGTGAAAGTCTTGTAATGTCGATCGGCTTTT
TAAAATAAATAAACCATAAGTGATGAGTCATACGTGGTAACAGAGAGGTG
CTAAACCGTTTTCTCTACAAAAACCGTTTTCTCCGAAAAAAGAAATATTT
CTCATGGACTTATCTCAATTTAATCCTGTCCCTTCTTAACCAATCCAAAA
GGACTGTGAACTTTGTTTTTGACGATTGCATCATTGTTGCCATTCTAGAT
TCGTAACGAAGCAAAACAATGTACTTGTCATAAACCTTTTCAAATCACTC
GTGTTGGTGAAGGGAAATATACATTTGGAACTTCCAAGATTGTGCGGTTA
GTTCGTGTCCATNTCGACGAACTCTTACTACGGTAAAAATGTAGGAAAGA
TGTTTATCACTAACCCCAACTCTGTTCGTTTTATAACTTCTTGTAGGTTA
TGAAGTTCTTGATGTGTATTTAGAGTTNGTGTTGGTGGTGGATGGGAATA
TTTGTACGACTTCCTGTTCAAAGCTGATCCATGTCGTGGTAAGTCCAAAC
TCTTTCTCAAAAAATATTTTTGTTCTGATTTCATAAGAGCATGAACATAT
AAACGACTGGACATCCATCTCCTTTGTCTTTTTGTAGAAAGGGCTGCTAG
CTTCATTGCCGCCTCGTTAAAAGCATAAAATGAAACAATAGATTTTGATG
ATATACCACTTGGGAGTACCTTGCTAACAACGTCAAAACTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043342	XLOC_043342	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_502	supercontig	scaffold_502:166103..182793 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0.640695	0	0.612233	1.29166	3.95767	0	1.42296	2.79847	1.94039	2.52336	1.17635	0.415633	0	0	0	0.609657	1.27084	1.47439	0	0	0	0	7.67982	11.203

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069592 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069592 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00069592 (transcript) - C. hemisphaerica