XLOC_030626 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_030626
Unique Name	XLOC_030626
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_140:276797..285323+

gene from alignment at scaffold_140:276797..285323+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_030626 ID=XLOC_030626|Name=XLOC_030626|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8527bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_140:276797..285323+ (Clytia hemisphaerica)
CTTATGGTAATAAATACTAGATTTGAAGATCAAAGCTTTTTTGTGTTCCT
TCAATATCTTTTCTTTCTCGTGTTTACTTCAGGTCTTTGATCTGGGGGAT
GGATGTTTCGACCGACGATATCCGAAAAAGCTTAAGCTCGACCAAAAAAG
TTTCACGAAATGAAAGACTTTATCCTGGATTTGAAGGTAGACATTATTTG
AAACATTCTTATTTGGATTAAAAGTACTATTAGCTCTTTTCAAGGCTGAT
GAAAATGGTGAAGGGGAATGAACTGATGAAAATAGACCTACCCCGAAGGT
CTTTTAAGTTAACTTTTAAGTTCGTTCGTCNAGTTCTTTTCAAGGCTGAT
GAAAATAGACCTACCCCCAAGGTCTTTTAAGTTAACTgatgttcgttcgt
ctgttaccagcttttctcgggattggctcattagtttttttctgatccTT
TGAACAGTGATGTAAAtggtgattttccaaaaaaatattttttgggcaAG
TTGTGGGCTTtgtgaattcatgatattcatgacgtaatcttttatatgga
agcacccgagataacNcgtatttttgttcaaacttctAAGAAacctttat
tcatgatattcatgacgtaatcttttatacggaagcacccgagataatcc
ggaactagtggcaaaataacaaaagactagtggcaaattttgccactagt
tccgggttatcttgggtgcttccgtataaaagattacgtcatgaatatca
tgaatttgcttcattagttttttctgattttatgcaTAAAGATGGAGGGc
gaggttctctaaaaagtggctgaatcagtttttttcggaaaaccTTTTTC
GGCCGTAAAAATCTGAATTTCTTATTTGGGTAAATCCACTGTTGCCAcct
ttagggaaaatgagcattttccTAGATTAGCTTGGcatttctttcttatt
ttttgcatagtgatataaaatggtaatatttaatttcagatggtgcccga
ctttcgaaaaaaaagattttggggcaaatttggaccaaaaagtgcctaac
atGGATTTTTTTTGGACGCTAAGATATTCATTCACCCCAGTATCTACGAC
TTTAACTATACTTCACATATAGAGCTGTGATACTTCAagctgctcactac
actttcctactctcttgctatttgtcctatttttctcatcaatcagatag
gtccattcagcatgttgcttgttaatttcgcttagcgaaagtattacaat
agccttccgtgtgtctggctggcgagacattttttagggcgcaaattatg
gcgtgggcgtttggctgcgggcgtactacggtaaatattctaaaggtgga
ctcactcccaaagataaaaagtgataaaaaaacagggcttttcttaataa
ataaaatacgctagtgcaagaagagtaaccaagcctttgtaaacatttat
TGTGAGAACTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
tgggcaacaaggtaataaatcaaactaattgagcttcaatcaaacttcac
cgatcttgatacaccttttgctaattaggattttcattttgaaccaTGGT
ACGCGTTGTTACTAAaggaggtaacgagtggtaacgagtggtaaccagtt
gaaaGNNgaatgtgatggtaaagttggttgtttgggtgaatgaaatggtg
gaattgatggttctggtgaatgtgaatcaaagattgatggttctggaggt
tctgcatcAAGAGTTGGCGATTCTGGGGAAAGTGCATCAGGAggtggtga
ttctggtgaatgtgcagcaggagttggtggttctggtgaatgtgcagcag
gagttggtggttctgatgaatgCACTGGTGGAgttagtggttctggtgaa
tgtacagcaggagttggtggttctggtgaatgtacagcaggagttggtgc
ttctggtgaataNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNcaatggtggagttggtgattttggtgaatgtgcatcagga
gtcgatgcttctggtgaatgtacagcaggagttggtgcttctggtgaatg
tacagcaggaattggtgcttctggtgaatgtacagcaggagttggtggtt
ctggtgaatgtacagcaggagttggtggctctggtgaatgtacagcagga
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNgcttactcttaggttccaaataaacgcccccttgttaatt
ttccgaaaattgtCTGACGCTGCATGACCTCTTTGTTATCTTATACGCTT
TTGTCCATTCGACCGAGAATCTTTCCCATCGCCCACTGTAGTGGAAATAG
TCCTAAAACAAAGTCCCATTTGATTGACGTCATTTGGCAAAATGGTGAAA
CCATTGAAAAATTGGATGCTGTTTCAATCCCAATCCCAGTGGTAAAACAA
ATAAATTCTCAAATAATGNCAAAATGGTCAAACCATTGAAAAATTGGATG
CTGTTTCAATCCCAATCCCAGTGGTAAAACAAATAAATTCTCAAATAATg
acgaaaaagcaaaaaaagtttctgacctatctagaaaaaaaaaaaaattt
aacccaacacagcggcttctaaagttttgaatttgaatgcaCTGTGTTTA
TTTCTTCCACTGGAGCATAAATTAAGGGGTGTTCTGAGGCGTATAATTGT
AAATGTAATGTGCAAATCATCGAAGCatcctttttttttaacttgaagaa
aaaatcattaattatttaaaagaattgAATGACTTCTTTGAATAACTATA
ATTGTTTTCTTCGTATTGGCGTATTTTATGTATAAaatggatgaatgaat
gaattaagGAAAAAACAATAACTCCTGCTGCGCATTCACCATAAAtaacc
aactcctgctgtacattcaccagaaccaccaactcctgctgtacattcac
cagaaccaccaactcctgctgcacattcaccataaataaccaactcctgc
tgtacattcaccagaaccaccaactcctgctgtacattcaccaaaaccac
caactcctgctgcacattcaccagaaccactaacTCCACAAGTGcattca
tcagaaccaccaactcctgctgcacattcaccagaaccaccaactcctgc
tgcacattcaccagaatcaccaactcctgatgcacttTCCCCAGAATcgc
caactcctgatgcagaacctccagaaccatcaatctttgattcacattca
ccagaaccatcaattccaccatttcattcacccaAACNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNtcattcaaaatgcataatgctgcaggagtcacgtatcacgcg
tcttcgtcgttgatgttcaagtattatgcgaaattttcgactttaagtcg
tcttgtttttgttatttttaagtttattttctCTTCATTTTATAGGGCGG
CTCGTGTGGTCGTGCAACAACATAAAAATTTATCAGTACTCAAATTTATG
GCTTGACGGCTGGGCTCCCTGTCTGGTGTATGACTGTTCAGCTGCTTCAT
GAATACTCTATATACAAATGTAGAAGATGCAAATTTACACCTGTTGTCAT
GCTGCAATCGTATCAAGAAGACACAAACAGGAGAAACTCAGAGGCAGATT
AAGCGAGAAAGAAATTCTTCCTTCCCTATTCTTGTTAACttaaatctaat
ttctaaatAAATCAAGAAGAAATCATT

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00048112	TCONS_00048112	Clytia hemisphaerica	transcript

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_140	supercontig	scaffold_140:276797..285323 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.62	3.61	1.64	0.51	0.78	0.58	0.7	0.66	0.76	0.96	2.06	0.76	1.07	0.7	1.04	0.91	3.01	2.15	0.29	0.46	1.35	1.95	2.84	2.97	0	1.89	2.84	1.51	0.85	1.01

You are here

XLOC_030626 (gene) - C. hemisphaerica