XLOC_030927 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030927
Unique NameXLOC_030927
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_145:189781..200738-

Legend: gene
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>XLOC_030927 ID=XLOC_030927|Name=XLOC_030927|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10958bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_145:189781..200738- (Clytia hemisphaerica)
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NACTCAGTGAAAAAAACGTAATTAACAAAAAATGTAACAACGTTTAATTC TCTGTGTGATTTAGATAAGAAATGTTTTGAAAAAATTTTCTGACTGTCTG TAATAAAACGTGAGTGGGAAGTTTTGGAGTTTCGGATCGAATTACAGTAA AAAGGCTACTTAACAACTTGGTGTTGTTCTGTTGTATATTTTGTGTTTTT ATTTGAAAAGAGAAATTGCATGTATTTTTGTTGACGTTTTGACGCGTCAG AAAAATCACACATAGGACGAAAAAAGTTTTGGCAATATTATATCGATTCG TATGTCAAATTATAATTTCATTGAAAATCTTTTGGCATTTATTTTCATAA TAGTACAAGAATGAAATAGTAAAATACGTAAATTGAATTAATGGAGTTTT GATTTTGGAAAGAAAAATATATTATTGGATTGTTGTAAGTTGTACGTACT GGAAATTATATCATGAAATTATTTGGGGTCTGGTGACGAGAAGAAAACTG GGAAAGATGATCAAGTTTGCTATAATGTGTACGTAAATTTCGTATTACTT CCACGACCTTGCTATATTCACGATGACTTATATAAATTTCGACTATTTTA GACAACCTCCCTATCATGATATACAGATCAGATATTGACATGTTTTAATG ACAATCATATCTAAATCAATCATAACATCACAGAACCTCAAGCGTTTAAG GTCAGATGAGGACCAAGAGAGTTTACTGATTATACACCCCTGTATCATGA AAAACAAAAAAGGAAAGAAATTTACCGTACATCGTTCCTTCATTTGAACA CCCCTGTGCTGAGACCCCAGCCCCACTGGAAAATCTAGCAAAAATTTCGT CTCCGGTGGGAAAATACCCTGAAATTTCAGCCCCACTGGGAAATTGACTT TGATTTCATCCCCATTTGAAATTCAATGTTTAAAAATTCCTCTCAAAACC 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TAGCTGAAAGCTCTGAAAACACACCTTTTCTCTCAAAGTCAACTACTTAG ATGAGAGTCTCTATTTTAATTATCAAGCAGAGTTCTCGCTGACGAGTAGA GAGTTGGAGGTTATAAGTTTGTTTTGAAGATATAACTTTTTTGTTTTGTA TTTAATCAGAACGAATTATAAAAGCTAGTCATGAAAACAATCTTCGATGG CTCACCTTGGTGACTCTTAGAGAGAGAGAAAATTGTGTAAAAAATGATAT GAGGAGAACTATATATCAGAGTTATGTCCACTATCTCTCTTCTATTTTAC ATCGCTCTTTTATAAGCGTCATATTTGATATAAAACATGAAAATATATGA TATTAAAAATTAAAGATATGATTTTTTAAAGAAAATAGAAGGAACTTTTT AAAGAAGTGGTGAATAATTCGTTGTGAGGGAGTTGAAATTTGTGAGAGGT GAACATCAAGAAAGGTTGTGATTTTGATGAGGAAATTATAATATTTTGCT TGGCATAAAACATACAAGGAATAATTCAATTTTAAGTGGAAAAGGTAGAG TTCTTCAAAATTATTTGAGTATGAAATATACTTTTCTTGGAACTAGAAAA ACCTTTTAAAAATTGTTTGGGTACTGTTAAAAGTTGTATCTTTATTAGTA AATTGTAGTATTTGGATAGGTATTCAAGCTTGAAATTAATAACGATCTAC TAATGAAGATCAATTCCTTAACTGTAAACAAACATGAACATGAAGGTTTC TTTTTTTTAGAAAGCAGCTTTAATTTGTATTTGTTAGTGTTTGAAACAAA CTATGCTCAAAGAATATGTTTGGATGGAAACAGCCATCAGTAGTGATTTA TCTTTTAACCTTTGTGTTTTCAATTTCTTTTATTCCAATACAATACTCTT CAGTTCTTGCTAAAACTATAAAAGTGTAAGAGTTGAATATTTTGGCTGAG GGATTAGTGCAACTCAGTTTTTGGGATTCTGAAATAGAGTATTCGTTTGA GGCTTGTAATTTTTACCGTTTTTGGGCATTCTTGTGATGAAACACTAGTG AAGGTACAACCAAAATTTATGTTTTGTACGAGAATTTTCTTCTTCGATAA AGTCTTGATGACTCTTTCGAAAATCATCTGCTAAGAGAGGTTTCCCTGTT GTTTCTTTTGGAAAAATTTCTTGAAAATTAAATAACAAAAGAAGTTTTCA TAATATTTTTTCCTTTGTGAATTTTTTGAGGATTATAATATTTTCAGGGG AAGAGATTATAATCTCTAGCGAGTTCGTTTAAAAACGGAAATTTTGAAAA AATTTTTGTGTAAAACTTTTGACTAACATATTTCAGAGTCTTTTAACATC TCCTTCTCACAGACCCGGTAGGATTTTTTCAGCCAGTGGGGATAAAAGTA ACGGACTGAAACTCGATGGGGATTGATATTCGGAAATGACATTCCCATAT TTCCCATATTTTCTTATGAATGGGGATTCGAATTCCATTGTTTTCAAGTC AGAAGATTCAGTGGGGATGGAAAAAAGCATCGTATTTTGCAGTGAGGATT GGTTTATTTGGATATTCTCTGTAGGGACAAAAATTTGAGTATTATTTTCC ACTGGGGACGATAATTTGACCAATTTTTCCAGTGAGAAGGGGTCCCAGTG GGTTTGTGAGAAAGGGGTGTATTTTACAATGATAATCCAAGTGGTGAGGG GGTCCAAATGGCCACTTGATTAAAAAACGACCGTACGTGCAGCCTAAAAT TAGGGCTTTGAAATCGAACCCTTAAAAATTAGAGTAAATTTGGGCGAAAA ATCGACCCTTACAGTGCATTTTCTTTATTTTCTTGAAAACTTTTGACCAT TTTAAGGCAGAGTATGGTCAGATTCTCTAAATTTTACACCCTTTTACACT TTTTCTCATCTTTTCTCATTTCGACTCTTATAGTTAACTTTGGGCAGTCA AAACATGTGACTACTCAAAAAAATTTACGTGTTTTTGTTCCCAAGTTTTG CAGATAATGGCGGGAACTGGAATTCTGAATTCTGGGACAAGTCTCGTTAG AACCGTTTCATAACCATTTTCTTTTCTTTTTTCTCCTAGATGAGTGGGCC TGAAGACGGATTTCCTTATAACTCCATAATCCGCGAGACCGATTTGAGAG AGCTCAAAGAGACTGACCTACTAGACTACGAAGACGATTTCCAAGAAGCG AATTTGACTTTATATGATTTCATCGACGAAGAAAGTATGAATCAATTAAA TAAAAACAAAGATATGCCCTATCTACCGAGGGAGAAAGAAGCGAAGGCAG ACAAGCTATCAGACAATCGTAACATGGAAAGCTCTACACTGGATATCAAA GAGTTAAGGTCAACCGATATTTCGAAAATTGCAGCGATAAAGGAAACGGA TTTATGTAGTAATGATGATGATTCGAGTACAGACGTCGAGCAACGTTCCC AAGAGGAAAGCGTGTCTCTGTCCTCAGGTGATACCCTTGGACATAATGAT GAGGATTCAGAGCTATGGAATTTAGACAATGCAGAAAGTGTCAGCTTAAG CACTGACAGTGGTATTATAAATGAAGATTGCTCTAAATTGCATTTAGATC TTGATTACAATCACTTCAATTCTGCAGCCATAAAATTCCAAGATTTAGAA AGTGATTTTTTTGATACCGACTGTGAGGCCATGGATAAATCACCAACCGA TGATTGTTTTGAAACAAATCGTGGTGAGACCAAGGATATTGTTCGTTTTC AAGATATAGAGAGTGATTTTTTTGAAACAGATTGTGAGGGGGTGGACACC AACACAAATGATAATACGGTGAAATTTCAAGATATCGAGAGCGACTTCTT CGATGAAGACGATGAGATCTCACCTTCTAGTCTAGCTCTGAAAAACAAAA CAAAAACAACTGTGGCCGGGTCATCTAAAAAAGAACCATGCGAAATTGAT CAACAAAAACAAATTCTGACTCGATTAACCAGTGCTAAGGATAAGCGAGC AACGATGACGAATAGTTTGTTACGTACCACGATTGAAGAACTGGAACGTG CGTTGAGTAATAGTAATACTTTGTTGATTAAGCGAGACAAAAAGATTCAA GACCTAAGGAAACATAACAATGAGTTGAAGAAAAGTTTGTCAGAGGAGCT TGAAAACAGCGCACAATTAAAACTACTACTTCTTGAAAAAGAGGCTGTGG TAAGTGAAAAAGAGGCTAAAATTGCGTCATATCAAACTGAATGTGAACGT TTGAATCAAGAAATTACAGACTTGAGGCTATATCAATTGAACAATATGGA AGACTTTTCGATAAGTTGCGATCCTTCTAATCTCGATAATTCAGTCGAAA CTGACTTATTGGGTGATCAAGACATTACGTCATCACCAAATGTAAAGAAA AAATCGTTGAATAGAAACCAGTCTTCTTGTTCACGACAAGAGACGCCGAT TTGTAAAAGTAAGCGAATGAGTAGCCCGGACACTACTTCACAACAAAAGA CTAGCCCGTTTACAACCTCGACGACACCGAAAAGTACCATAGCTTCTAAT ATAAAAACACGACCGGGAGCTTTATCAAAATCAAGCCCAGCAAGCCCTAT GTCCCCACAGGGTGGGAAAGTTGGGAATAACCCAGACAACGTGAGTAGTA CGGAACTTCACGCACGCCTACAAATGAAATTCATGAGGGATGCTTTCTTT TATTACATGATTGGTTTTCATTCAGACGAACAAATAAATGCTATTTTGGC TATATTAGATTACGGCGATAAAAGACAAGATTTTGTTCTTGAAGCTCACA AACTGAAAAAGAATGGTAAGAAATTTAATGTGAGTAAAGTTTCGACACGT GGGTTGACTTTTGTACAAGATATTCAACCTAAATGATAAAAGTACAGTCA AAACAACGTTGTATGCCAACTCGGGACATTTCTTGCTACTTGAACTTTTA TTTTGTTATGTAAAATATTTTTCTTGAATTATAATTTATGATAAACTTTC TTGATGCATTTTCGAAAAAGAAAGTTTCTGTAGCTCAAAACACCAAAAAA AATTATGTAGACTGCAATCAACCTNGATGCATTTTCGAAAAACAAAGTTT CTGTAACTCAAAACACCAAAAGAAATTATGTAGACTGCAATCAACCTCGT TCCCTACATATTATCAGCTTTTTGATGTTTATTGATAGCGCTAGATAATA CCCCGGCTAGATATTCTCTGGCGTCCATCAGTAACATAAATAAAGCCTGG AATACACGGGGACGAGGTTGGACTGCAATAATCAGCCAGAATCAATAGCC TTTCCTCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00048675TCONS_00048675Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00048674TCONS_00048674Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00048673TCONS_00048673Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00048672TCONS_00048672Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00048671TCONS_00048671Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00048670TCONS_00048670Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00048674-proteinTCONS_00048674-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_145supercontigscaffold_145:189781..200738 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.07 0.04 0.11 0.14 8.09 7.25 12.37 12.07 6.93 9.84 7.94 7.11 11.72 10.15 7.76 9.18 13.58 17.66 11.95 12.21 10.74 10.56 3.79 5.82 7.74 7.24 9.43 7.33 6.85 6.04