|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_154:211020..217821+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031249 ID=XLOC_031249|Name=XLOC_031249|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6802bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_154:211020..217821+ (Clytia hemisphaerica)
GAAATTTTCACCTTTGAGGGTCTTTCGCTAAAATTTAGTCATTTAAAGGA
TCAGACTTCAGATGTCCGGTTAGCACCATACTTGACATTCTCCGAACCCT
GGTGATGATGGTTGGGTTGAGGTGGAGGAGAGGTGAAGGAATTCGTATGG
CTTGGTTACCTGATTGGTTaatattttactgaccagaatGTGAACATTGC
TTAGATGTAACGAAAATATGGcgataaaaaattgtttcaagTTGATATTt
ggtactttacagaccagTTCTATAAAATACCTATTCGAATTTTCAGAAAC
ACGGGACCTATACTTTGGTATTTGAGTTANAGTTGATATTtggtacttta
cagaccagTTCTATAAAATACCTATTCGAATTTTCAGAAACACGGGACCA
ATACTTTGGTATTTGAGTTAAAATTTGGACTACATATGGCAAGAGTAAGT
GCAAAATCTAGATAAGTACTTAACAGACCTGCCAGTATTGAAGGAAGTTG
CTTGTTTTCCTTAGGCCTAGCGGAACAATCGTAAAAGTGAgaaggctgaa
ggctcaaattgacataaaattcgctaggaatttgagaaaaaaaaatctca
tttgctcaaaattgAGGAGGTTGAAGGCTCAAATagagataaaattcgct
aggaatttgaaaaaaaaaaatctcatttgctcaaaagtgagGAGGTTGAA
GTCTCCCAGTCTCCCCACTTCCGTCAGGCCTGTTCCTAAATAACCATTGG
TTTTTTTCCTATTTAAGTGCTGTGAAATTGACAGCGAGCTTTTATCACCA
ATACCGATAACACTTGAATTGAAGACCGAACTTGTTTTTCTTAAACCCAT
CAAGAGAGGCTCAAGATTGTTTTTCCGCATTTATGGATCGATTTCAACAG
TTACTGCGTCGGCGTTCAACAAATATTTATTCACATAATATCGTTGTCTT
TCCAGATAACAATAATAGTCTTATTACCACTTTCCATTTTCGTCATACAT
AAGGGCTACTTAATATATTGTGTAGCATACACTACACATTTATAGTCCTA
TAGTTATGTACTCGAAAATAGTACTTAGCTCGCATGTTGAATGACGAAAA
AAGAAAGggtttattattgttttttgattttctctacTTAGTCATCGAAA
CATTGCTATTTAATATTTAAGTGCCATTGTCGggtatatcagacatgggc
tatgtaggagggcgaagccctgctgtaatgcccagtttgagttagaaatc
gtcatttttggtctaactcgttgAAATAGGCTTCAttgttaagcaaaaaa
aatcaaaagtgagtctttccagcgatattttaagccaaaaaatcaaaaga
atgcaaaaattggacaaaaatccacttttttgagattttgaacGTTTTTG
ACCGTATTGGTCAACGgtgagtgatccaagaacctccaaaatgGGGGAGG
GGGGAGGCGCgaacggggtttgcgatttccaaaataccgaataattttgc
caaaatttccgaattTCCGTAAAAacatacttgcaattccgagaccgatt
ttttgggtatttttcctcgttttgactaatttttcatcaaatttgatttt
tcatgtatgaataccgaaaaagggggataaaaactttataataccgaaat
ttcaaagcaaaaattcatggatttccgataccgaaacaattgcagaattc
cgaaataccgaaggaattttgaccgatttccgaagaaaaaagggtcgatt
tccgcccCCACCAAAATTGGCCCTGCTTTACCTGATTCTGTCCTCTAGTA
AatgaatttgaagttttaccactggtcACCTTTCcgtcattcaggcaggt
ccgcgcAGAGTAATGTCCGTCGGGATAATGTCTGCCGGGGGAAACATCGT
CTAGGTATAGTCGTACAAAGTACAAAAACAGTAGTACAAAAACGAATGAG
GGAGAATCGTCCATTCGATAGCCGTTCGTCGGAGAAAAACTCGTTTGGGA
AAAGTCGAGTTCTATGAGTTCTCTACAGGTGGTtcacaaatattttttgt
gttttgagcCATGGAAAATGGCCATTTATTTGGCCATAATAAAACCGTTT
CATGTATAGAAAATGTATTTTCGTAAACATATGTGTCCTTTGAGAATTTA
ATTTGCTGCCAATCTCGGTTTGAAATCTTTCAACCCGACTAGACAGGAAT
TGCCTCTTCACGTGTCCTCAAAGAAAGTACTTTTCaactttaagggaaga
aaagCAAAGTGCAAACAGTGCATTGTTGTACACCAaagtatatttttcat
tttaatgatCAAATGCCTGCTGTAATAGAGCGTCCCCCAGTATAACGCCA
TaacaccaaaaaaaattcttttatcaatcacttatCACGCTTTTTGGAAT
CATAGTTCACATCATCACGCCAAAAAAGGCCCAGTCACAAcgtcacgcaa
accgctggggggacTCTGTATTAGAAAAACGGATCTCGATCGTCTCTCAC
AAGCAAAATGTTAGGATTGAGAATATAAACAAAGCAATTACTTACGTACA
ACAACCATTAGCTTAATTTGATTCCATCTGTTGGGCCACCACATGCGTCT
TCTGATGAAACAGCGTATATCTCTTTCACAACCTTTACGTAGAAATATAC
AAAgctattttaaaaactttacagcTCGGACTTGGTGTCAGGTGCGAGCG
CAAGGGTATCGAACGTACGCCATTTTTCAGAAAGAGTACCACAGAACCGC
AGAATGATACAAAAATAAAGTCCTTCTCGGGGATGACTTAAGCCTCAACT
TTGGTGCCACAGCTTCCGTGAATCTCACGATATGGAAAGAAATTAAGAGG
GTTTCTGCTGACGAAAAGGCTTCTTATAGGAACTCTAGGAAGTATAGAGG
TCTGCAAATCAATCTATGAATTAAGTTGGTTCATTTCCTGAACCAAGAGC
TTAAAGTTTGATGTTACATCCTTACATGGATGGGAATTATGCACCAGCTT
CTCTGAAATCTAGTAGGCcaatacaaaaataaacatcAGACCAGAAATTT
CGTGATTCGAGAAGAAAGTGTAAGCTGACGAGCTTTTTATCTCCGgagat
ggggggggggggtcacttAAATTAGGCCTATAAAATCGGAGCCTTACAGA
GCAGAGAGAATTTAACCAAATTTGAGTAAAATCAGCCCTTATTAAGGTGC
ATTTTCTTGCTATTCACGTATGAAATATAATTCTACCTAAAGTTAGTTAG
TTATattaaacaaaatcaaattaaatattttaacACTAGCTTAAGAATAT
CATGAATGTTTGCTTTTcagttaaatgaaaaaaaaagaaatctaaagATT
TCGCTTAGTTTTGTGAAAAACATGTGTATAAATCACACAAGCTAACGGTA
gtgaaaattaaatgaaatataTATATGTTCCGTTCAtcgatattttatta
ttttgaaaattcaagattgggctcttccagaaaaaatccgttcattgGGT
GGATGATTATTATTTCTTtaatgaattacccctggacattttcatttttc
accccatggacatggGTTTTACCCATTGATTGACAATTATcaatttaacc
ccctggacaccaAAATTTACTCTTGGACATCGCAGATTTATCCCCTGGAC
AATGCATTTTTTAGGACTTTTTTCGggacccctggacaattcatcttcca
cccccccccctatgAACGGATTTCTTTTCTGGAAGAGCTCATTTCTTTCC
TATAAAGGCATCATTATTATCTACGTTTTTTAATTATATCTTTGGTTTAT
AGGTATCTCTACAAAAAGCCAtggttaaattattttcaattgcaGTATTA
ACGTTTCTTATGGTCTTATCAGTGGATGGAACTAAAAAAGGAAGCGATGG
AAACAAGAATGGCCCACAACATCCTATTTGTCAAGGTACacgaatttcaa
atttcaaaaattttgatttagtgCAGTCAAATCTAaccttttttgtcatt
ctaagAAGATTGTTGGTCCCTTTTAAGGTCCAATTTGGAGAGAATCAAAA
ATCCATATTAATTGAGAATGTGTCCATTATAATACATCTATTACAAGGGG
TACAAGAACCATATTTTCTATCATGTGGAAACCATGCCATCGTTATTGAC
TTATATTCTCTTGAGGAGTGGTTTCTACACTACAAAAAtgagtgcacact
taaagctttttcaaTGTACCTGATATGAGCAAAATATCACGCCGTCTTTA
CAAGCAAACCACAtttcggtgccggcaatttgatcaataAAGTCCATTCT
CTTGCCTCCTTGTTTCCAACTGTGCCAGTTATTTGTTctggttaaaaaaa
ttgccggtaccgaGCTCTGGTCTACTAATGTGATCTACTCAGCACAAATG
GCTAGAACTGCCGAGGAAAGACAGTAGCTCCTCTAGTGTTTGAGATATTT
GTGCTATGAAATAGGGGTGTTAAATAAGTTAGAGCTCCCAATATAGATGT
CCATCTCACTTTTTGAATCATTCGACACTGTCTTCAACCCATGTTCAGAT
GTCAGATTTTAGCCTGTAATTTTTTCATTGCCATTCTAATATTTAGTACT
TCCACCAACCCAATTACGAAGATTTTTGGGCAAAGGTCGTATCAAAAATG
GGAAAGTAATGAGGTTTGGTATGGGAAAGAAGACAATCTGCATGATCTGC
AAAGATGGTGAGTGAAAACTTATAACCTTCAAGCCACCAGGAATAATAGG
TTTGATAGTAGCccagggtccacttaaagctttttttatagactgaaCGG
CGCGACTAAGTGGCTCAGTAATATACGGTAATTTGCTTTTGCTTAGATGC
ACTGTAaaccagattttagttgtttttggaaggtaaaaatagTATGAGGC
Aacgtttttatttgagaataagggattgcaaatctgttattgatgtttgt
ttctcatttttgattatatctttcaactccaagtaattttattgttattt
ggatttttaacattttctctcaaaatggcaacctcgccaaacgctcctag
tctacttcactggactcagcgtcaaaTTTTAGTTTGATAGGAGGTGATGG
GTACGACAGAGCAAAAATTCGGGACAAAATTTGATCCCTTTATAGTCAAG
ttaatacatatttttttagtttttggccgaaaatttctaatttcctACAG
AAAATGTATGCTcttttgagagaattttttagcttttgatCAGTAACTAT
AAAGTTGATTCTGGGTATCTTATGAGTTGTTAAAAGATTCTAGATCTGTT
GAAGAAGATACTTAACCTATATTCTTGCATCCACCCTCACTTCCCGGAAA
CACCACTATTCATGAATCGGTCAAATATATTGCTGATAGAgtgaactctc
tctaattcgaacctctattattcgaatctttctgtagttCGAATAATAGT
ATTTCATCCCCTCAGATTGAGAGTCTTATAAAacactctctgtaattcga
agaaagttttttgtcccttgaagatcgaattacagaaaattataacaaaa
tCTTCNAATTcgaagaaagttttttgtcccttgaagatcgaattacagaa
agtcaACTTTATAACAAAATCTtcggacgagatggagtttttacaagctc
ttatttgatttggttggtcgttaaccagtaataaaacaattttgttactt
tttctaaagaacgcatcatGTCTATtatacttcaaatgaccaattattaa
agtatcttaaaaacttcatctcatctgaaaatcttcatttctttcatttc
aaaGGTAATTTATTGCCAGTCAAATGCAAGATGACCAAAGAACAACGATG
GTACAATAAGAAGAATCAATAGAAACATAGATATTAACACCAAATGTAGA
CCGGCTTTATATCACGCGGGACATATCAACAAGAGTTATCAATAATTTCA
ACTgtctttattttcaataaagatTTTACACAGTATAATTTCTTTCTTCt
caattttgatataaaatttcgtcacttttgatttaaaaaataaatatgct
acTGTAATCCTTAAAAGTTAATTTCTACATACAATACAATTGTGCACCAG
GTGAATTATGAAAATTAATGTCagcgaaaaaaaaactttagagGCAAAGC
TTATTTGTATCAACGCTTTGGTTGAGACATATACATTCTTCTCcagatga
aaataataaaaacatcGATATACATCTTGCAAGTAAACACAGCCCTGTGT
CACGGTCTTAGTGGGACAGGACCCGGCccattggaaaatttggccGAGAT
TTCGTCCCGGAGGGAAAATACtcaaattgactttgttttatACCCATTTA
ATaaatcaatagaccttttcataaattacgtcacgaacatcacttgcctc
gttttgaagttattgccaaggtgattaactcccagcggattttatttgaa
ctactttctatttttgaaaaatcatttaatgtctcaagggacataatcac
catggtaattgtttgaatacgaggcaagtgatgttcgtgacgtaatttat
gaaaaggtctattggaaaaaaattgcatAGCAAAACACATGAAAACCATA
GCATTTTtaagatttcgatagaaattttcatcctcaCTCTGGGAAGAAGT
TCCATCGGGGCTGTGTGATGGAGGTATGTAAATCTGTAAACAGAATCATT
ACTTGAGCTCCAGGTTGTGGGGAAAAAACGAGACTAAAAATCAGACCACG
CAACACTTCCACTGAGCACTCTTTGTCCAATCAACACTTTGACTTGGTTT
GA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_154 | supercontig | scaffold_154:211020..217821 + |
|
