XLOC_033251 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033251
Unique NameXLOC_033251
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_218:576681..603400+

Legend: gene
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tgtttgaaaaagtttctattgtctgataattataGCTGACAAGATttaaa atttcccaagcttcttctttcacgcagatttacagctgagaaatatagtg cactataagggggGTTGGgcaaatcaagagaaaatgcactgaaagggtac cttttcagccatattgaacggcactgtaagggtacgattttgaaaagcag attttgcgcggtaCATACTGTCatttcgaaatcgagtgcccccgggtcat tcattcatttattcatttattacACTTTTTGGAAAGTAATTTTTACTGAG GCTTGGGCAGGCTTTGAAAAGATTATAACCATTGTCTTTAAGCATATGAA AAGCATATTTCAGGCTCAAACTCTTATTTGTTAAGCGCAACGATCAATTT ATCTCATGCTTATAAGAAACCTACATTCCATTCCACGAGGGTTGAGTTTT GTAAGTTTTGGATCCACCTCTTCATCAttaaattttttctcatatttagt gCGTCCATCGCGACGTAGCTGCACGTAACGTGTTGGTCGGTGAGAATTAC GTCATGAAGATTGCTGATTTCGGGCTGGCTCGTGATGTATACGAAGATGA AAGATATGTCAAAGTATCAGGGGTAAGCACACATTGAATTTATTTCTTAT AATTATATCTTGTTAATTGTGGATTTAACTTTCAATTTGCGTGTTGGTTT GCGTTATGGTTAATTGTATATATACCCTCAATATACATAAGCAAGAAACA ATTTCGTAGAAAATCATTTACAATGATTGTATATTTATTATCAAAAGATT GCTTGCATACCTTTTACATAATTATGATTCAATTTTCAGGGTTTATTACC TATCAAATGGATGGCCCTTGAGTCGATCGTTGATCGTGTTTTCACTCATG CTTCTGATGTGTAAGTTACTATTTCTAGAAAACATTCTTCTCTGAAAACG CTAATAGTTACCTGTTGTGGATTTTGCGCCCTCTGATCCCTGGTAGTATC TAAATGGTTGTtcagtgttgcaacttttccATCTGTGGACGGAAATCCGT CCAGTTGAGATTTCAAACTAGCAATTTTTTGGAAGAAAACTACGTGAAAT TGCTGTAAGTTTCCAAAGGCCTTTCGTTGAGATTCACCTAAAGCAGTTGC TAgctatttaaaaaacaaaattgggTGCAAAGTTCTGTTTCTTTTTGGGT GTCTCCATAGAAATTAGAATTAATCAAACACTACAGTCATGAATTTGTAT TTCATTTTAGATGGTCATTTGGTGTTTTGATGTGGGAAGTCATGACATTA GGTATAATGAATTATCTTTGAACATTTTGCTTTCGACTAAGAATGATGAT AAGATACTAAGGATAAAATTAGTTTAAAGTATTTTGGAATCTTTCAAAAG GTAGtgtttaaaaaatggaaatttcaaTAAATCTCACGCCATTTTCCATT TAAAAAAGTTGCAGTTTTAGTTTCTTTCAAATCGGCAGTAGAAACATTCT AAATTTTAGTGATCGTTTTAGATTTAAATTAAATTGTTCTTTGTGTTCAG GTGGAGGGCCATACCCAGGTATTGCTGCAAGAGAATTACCAGAGTTCTTG AGCTCAGGAGGTCGAATGGAACAGCCACCAAGATGTCCAAACGAAGTGTA TGTATCGAATCTTTCAATACGACTCATCTGTTTCATCATTAAGTGTACTA CACTTTAGCTCTATGTCTATGAGTGttgtctatgagtgtggtcgctcgtc tcgcttaataagacaaaaaaaattcattactTACTCTACTCTAAGTTTAC AACGTATAATTCCTCATTCATTTACAACAAAGTATATCTAAATCATTTAT ACGATATACCCTTTTCTGAAAATACCAATCCCTGGAGCTTGACTAATGAT ATAAGAATCTACCAAATATAAGAATTGAAGTGGATACTCTTTTGAATATT CGTGACCAttcttcttttaatttttctaaaggtTTCAACTGATGTTAGAG ACGTGGAATGAACTTCCAGACCACCGACCAACATTCAATGATATTGTCAT GCGTCTTGCAAGTGTCGTCGAAGCGCATTGTAATCCTCAGGTATCTATCA ACTACCTTTTAAAGATGCTAGTAACTTTCATTGTATACGACTAATAAGGA TTAGCGAAATTATTTTCTTGTGCCGCCAAGCAAACACCTCAAAGACCCTT CAATATATCTTCCAGTACTGTTCGAGACTCGATCAATTTTAAGAAGTACT CCCTCCTTCCTCTAGGATATCCCTCATTACTTGGACAAAGAACACGTCAG TGGCAACAACTCCGACTATTTACGACCCGTCGATTCCGATGTCGGATCAT ACAAAATCAATTCATCATCCTCATATGCGTCATCGCTTGGCCGTAACGAC GACGTGTTCCGCCGCCATGATTCGAGCACGCAAAGTGAACGATACGTCCC CGATAACAGGTTCAATGATAATGAAGTATCGGAACGACTGTTGGGTGATT TCAGTAATAAAGACGTGAATGACGGAGCATCAGATAAATCAATCGAAGCT AAACCGAAGGTATATTCAGTATTCTCGAACAACCCTGTCACGGGCTCCTT CCCTCCTTTTGACATAGGTAATAGAATGGCAgtctgaagaaaaaagaaaa ttgatatgatACCATTCCATTGTGCAGTTTATAACTATAAGGAGGGGTTG GTCGTGTTTTAACAGATAAACAAATTCTTTTCAGGGTGAGGTATAGAAGA GCCTGTTTTTGTAatgatttcagaattttttgacCTATTCTTGCATTCTT ATGATGCTAATTCCTTCTTAGGAATacgattttaaaagatttttattatg gaaaaagtatttttctgtttttttttcttgaagatgGACGAAATGGTATC AGAGAAAGATTACAAGAAAGTGAACGGCAAACAAAACGGCTACGAAAACG ATACGGGTAGCCTAAAGAAGaagaacaagaaaaacaaacaaaaatctaAG GAAACCAAATTagaaatggaagaaaatgaaaaagacatTAATGAAAAGGA TGGTTTGTTAAATGGTGGAGATCGAACGCCGTCTGAAGTTGAAGAATTTA GTTCGTTTATTGATGGTGAATATGAAAAAATGGACAATAATGAAGGATAT ATCAATGGTTGATTTAATAATGATAAAATGATCATTAGGAGAAAACTTTT CGTTCACTTTTGATGTTTTAAGATACCAAGATAGAACGTTTTGCGAATGT GCTTATCAAAGATGTCTTTTGGTGCTCTGTTAATTCTATCGACATGTAGA AGGGCTTGTTTATTAAAGATAAGTGTTTGCACCGAAGAGTGGGACACTTT GGGAAGCCTCACAATAGGATGAAAGGGGTTACTCTTCCATGGTTGATACT GATAAATTAANCTTTAAGTCGATGGACATGTAGAAGGGCTTGTTTATTAA AGAAAAGTGTTTGCACCGAAGAGTGGGACACTTTGGGAAGCCTCACAATA GGATGAAAGGGTTGTACTCTTCCATGGTTGATACTGATGAATTAATttat aaatttaaaatattaaatAGTTATTGATTCGAAAtaattttgatataatt ttctATTAGATTTCTTAAATtatctttaaattcttttttttttgtacagC ATGCTTTTTAGTATATAATAAATTCTTATATTAATATAAACCTTTTAATa tattttagaatattttaagTGAACTTTATTCGCAGTATTTTGATACATTC GCCTCCAATCAAGTCGAATTTTTGCAAGGTCAGAGTATGTGTGAGAGTGC CTAGAGTTTTTATATGTTCtctatatttcaaaattattgaaaagatTCCC ATCGATTGTTTTATCATTATGCTTTTAGctctgttttttgttttgttttg ttcgtTTTGATTGTTTTTNN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052593TCONS_00052593Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052594TCONS_00052594Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Incomplete threonine/tyrosine kinase proteinTCONS_00052593-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_218supercontigscaffold_218:576681..603400 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (0.48 tpm) - - (60.77 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.98 1.51 0.63 0.48 60.77 49.56 34.23 39.24 20.92 36.17 28.33 15.13 35.31 35.56 20.11 31.78 33.82 59.28 26.69 32.37 19.56 18.81 18.56 21.76 30.59 34.46 44.55 32.34 30.97 32.04