XLOC_033743 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033743
Unique NameXLOC_033743
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_231:87221..98816-

Legend: gene
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>XLOC_033743 ID=XLOC_033743|Name=XLOC_033743|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11596bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_231:87221..98816- (Clytia hemisphaerica)
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TCATTAATTCAATTTGAAAAGACGAACATATTCTACGAAAATTTTACAAA ATTTCAATCCACAAGGCTTAGTACTTTTCAAGAAGTGTTTTTGCATTTTA ATCTGCAATGAAGGAAGTATTAACGACAGACGTTGATTGCACTTTCAAAT GTCTTGCTCTTTCCTCAGTTTGATCTTTCCTTTTTGCAACATTGGCGAGC ATAATATTTCTTGATGTCTTTATCCTTGAGCATGTACATCAAAGCATTAA AACCAGAGCAAAGAACCTCAATGGCATATGTATAAAGTCATACAAACTGT TCGTTCCCTTCGTAGAAAATCAGTGAAAAGCCAAACAAGATGTAAAATAA ACTCGCCGGTAATGAACAAAGCACGTACACTATAGATAAAAAGCTCAGAA TTCCAACAGCCTTTTGATTGCGCTTTCGTTTTTGCTCCTCTATTTTCTCA TGAGTTGGTATCTGTTTTCTGGTTAGTGTGCTTCTAGACAAGTGACAATA ATTGAGAGTGGAATCAAAATGGCAACTCCAGAAAACAACGAAGAGAAACA ATAGAGAAGAGATGATGTGTATTCAATCTCCTTTGTAAAATACGATAACA AACTTCCCAGAAAAGCATATATGTTTAATACTATCATCACAAGATAGATG GTCTTATTTTGCACAATATTCAGTGGTTTTCTTATGGCGATATTGCGTAA AACTGAAATGACGGTAAAAGTACCCAGTCCAATGCCAAACGAATAGACAG AGATTGTCCCTCCAATATTTCGAATCTTGCATGTATCAATAGAAAACACA TTGACAATGGCAAAATATGGCAAACATATCAAGCCAACGATACTATCAGT GAAAGATAAGTAAGAATAAAGCTTTTGCGATATTGTCAATTGTACTTTAG TCTTTCTCAAACCAACAACTAAGGTTAAGTTAGTAGTGGCAATAAAAAAG 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TCCTTTTATCTATGAATTCGAGCTTTTTGTGTCTTTTTGTTTTCTTGTTC GCATTCTTGTCAAGACGTAGTAGTTTTTGCTGCCTTTTTAGGAGATTTCA TAGGTGAAATTCTACTTTTATTTTCAATTTTTCACCGACCGACCGACCGA CCGACCGACCCTCTTTATTGTGTAGCTTGGACAACAAATTAAATTGACCT TGCCTTATAGAAAGAAATTGTGTATTTAAAAAACAATTCACAAGTTCAGG ATCGAAATTATTTATTTTGCCGAATGCTTGTGTTACGCATGATATTCAAT TATTTTCGAAAAAAACACTACCTTAAAGGAAGAAATTTTGGCGGGAATTT AATTTGGCGGATGGCCAAAAAAGTTTTTTAGAGGGAATTTAATTTGGCGG ATGGACGAAAAAACTAAATTTGGCCGGAATTTAATTTGGCGTTTGCTGAA AAATTTATCCTTAAAATGGCCTAAAAAAAGCAAAAAAATTGCAAAACCAC CTTAAAAGGGATCATATTTTCAAAAAGTTTAATTTGGCGGGAATTTAATT TGGCGGATGGCGGAAAAAAGAAATTTTGGCAGATTCTGGCAAAATCCGCC AAATCCGCCAAAATTTCTTCCTTTAAGGTATCAAAGGCTTATGAAAAAAT AATGGTCCTATTATAAACAGTTGTACTAACGAGTACCAACTTCATGGAAA ATTGATTTCCAATATAGCTTGCAGGGGATAACTTTTCATGGAGAAATGTT CTTTATGTACATTTATCCTTGAAAAACGTTACTGGTGAGTATTTCTATCC AAAAATAAGTTCTGCTTTATTACCTTTTTCATGTGACTCAACAATTTTTT TTCTAACCGACAGAAAGGGAAAAACCCATCAGTGGAGGTTGGCAAGCCTA CTCAAGGTGTCGTGTATGTTGCTAAGGAATATCCACCCTGGCAACAAGTG GTGTTGAAAACTTTACGTGAGATGTATACACAGAACAACAATACCTTCCC TGAAAACAAGGAGATTATGAATGCTTTGAAAACAAATGCTGATGTCAAGA AACATATGAAAAAACTGATGCCATTTGTTGCTCATTTGAAGGTATTTGAT AGATAAAGTGTATTGTATATAGAGAGGGCACGATTTGGTGGATTTGGAGG TTAAATTGATTTATACACTGCAGTACACTGTCTACTTTATACAACTTGAT ATTATATATATTCTATCTCGTTCTTTCAGACACGTGTGGCAACTGAGGGA GTGTCAGCGATGGATTTATCTGTTTCTTTTGACGAGACGACCGTTTTGAT GGACAACTTGACCTACCTTCTGAAGAGCATCGAGGTTTGTAAACTTCCTT TTTATAAGAACCAATGAGACTAAAATTGTTCTCATTTTGTGCTTTGGTTT TTGTCAATAAAATCGAGCCTAATGTTCTCATTCATTCTTACAAGAAGATT GTATGATTTGTCCGAAAGAATAAGATGCCGTCCATGCAGCCCTTAAAAAA TACTTTAAAGGTTTTATTTTACGTAAGTGTTCCCGTTTTATATCAGACAC ATGTTTCATATCAGGACAGTGCCTCCCTATTGTTATATTGTGCTGAATAA ACAAAAAATTGTTTTTCTTTTCCTCTGTCTGACAAATCTTGCTCCACATA TGTGTCAATTCAATGTGAAAAAGCTTGTATGTTAAAATTGAGCAAACGAT ATCACTCTTATTTGAAAACAAAACCTTTAAAAATATTTTTGTTGATAAGT ATCTTAGAAAGAATTAGATTTCGATTTCGACTTGGAGAAAGAGTCAACTG TATATTCGTTAAATCCATTCCGTCGCTTCAACAAAGTATTATTCTCAATT TTTTTAGCTGGAGAACATCGAAATCAAACCATCTACTGAAGCTGAAGCTA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053449TCONS_00053449Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053449-proteinTCONS_00053449-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_231supercontigscaffold_231:87221..98816 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
LARSleucine--tRNA ligase, cytoplasmic Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
165.42 162.41 236.12 241.83 93.8 71.33 100.06 102.44 113.28 104.99 146.69 134.25 143.13 146.26 116.18 142.5 125.73 120.92 49.77 57.27 86.41 87.32 115.72 116.63 117.53 97.27 68.44 66.8 87.47 88.31