XLOC_033852 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033852
Unique NameXLOC_033852
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_233:652093..662848-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033852 ID=XLOC_033852|Name=XLOC_033852|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10756bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:652093..662848- (Clytia hemisphaerica)
TCTCCGTCATTATTTCTGCTGTGTTCTTAATGCTGCAGCTGTTGTTTGCA TCCTAAAAAATGGTCCTTTAAGGCGAGCAAGACCTAGTATATAACCAAAA CAAAAAAATCTATTCTGTTTAGAGATAAAGATAAATTAACTGTTGTGTTG GCTGTTAATCACCATGCTTAAGATACACAGAAATCTTCTTCGTAAAGCTA TGGTAAGAATTTATTATTATTAACTCATACTCCCTGATACACCCCCTTCT CACAGACCCGGTTGGTTTTTTTATCCAGTGGGGGTAAAAATATCAGACTG AAACTTGGTGGGGATTGATGTTCCAATATTTTTTATGGCAGGGGATTTAA ATTATTTTTTTTTTCAAGTCAGAGAATTCAGTGGAGATGGAAAAAATAGA GGATTGGTTTATTTGATTATTTTCACCGTGGACCAGTGTGGACGATTCTT TGGCCAATATTATTCCAGTTGGAAGGGATCCCAGTGGGTCTGTGAAAAGG GATGTAGTCATTTATTTTGAGTGTGCTAGATGATAGTAGATCAGTTATTC CTATGTTTTGCCACTAACTATCTTTCTATTCCCATATAGATGAATAGTTT TGCTTTTTTCCCAATAAAATCATTTGCAGAAATAGAAAATTCTAAATTGA TTTTAGGTTGGTCAAAGGTTGTTAAAGGTATCTTCTAGAAGTCCTGCAGC AATGACCACGATGCGTCAAAAGGGAACTTTTTCAATGGATCCGGAATTGC CATCATTACCCGTGCCCCCTCTTGAACAAACACTCAGTAAATACATCAAC ACTCTGGAACCCATTCTATTTGATAGTGAGTATGCACAGACAAAGCGTGT TGTGGCTGACTTCATGAAACCAGGTGGTGTTGGTGAAAAACTCCAAAGAA AGCTTGAAGAGAAAGCATCTAAATCAGACAATTGGTTGTCTGAATGGTGG 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GGACTCTCCATAACTCCGACACGCACGAGGAAAACAAATTTGCTCGAGAT GAGAAAATTTCGAGTTATAGAGGAAGGTTTATAAAGGCATTGCTAACTGA AGGGATGATGAGAAAACTTGTTCGAGTTAAAGGAAATATTCGAGTGATAG AGACTTTACTGTATTTAGTATAGCCTATACTAGCAGGCAAAATTCCAAGC ACTCTGGTCACTGGCCGTTTTTTGACTTAGAAATTGAGTTTTGGCTTTCG AAAGTAACCAAAATTTTTTATGAAACCCCTCAAGGCCACTTATGTTATGA AGGGTTTATTTTCAAGGATTAAGCATTGCATTTGCGAAAATAGAAAGAAA TGTATTGAATTGAATTTATTTTCAATCGTCATAGAAAGAATACATTGTGA TTTTGCTCACTATCTTCATCTTTTTGACAGTTTTGTACACAAAATACGAA TTCTCCAAATATTGAGTTTTGAAACTCAATTCAAAATTGAGTATTTTGGC CGTATAACGGCCACAAAAAAGTGCTTGGAATTTTCACTGTACTAGACGTC ACCCGCGTTTTTTCTACACAATTGACGTCTATTCCACTTTACAACTTTTT TGAATGTTTGAAGCCCAGGTTTTCCTTCGGGCTCTAAACATTCGATTTTT TTACGTCAGTTTTAACTTTTGAAGTATGTAGCGAAAAATCGAATCTGCGT AAAAGCACTTGAGTTGAAAGGCTTCTATTTTTCAAAAATTATCAAAGGGG AACTCACCAAGAAACGGAATGAAAAATCCCAGTTTTAGGTGAGGTGCTCG CTATTTTTAGTAAAGCTTATTTGAAAAATTATAATGAGACGGTGTGATTA ATTCAAATTTTCAAAAGGTAACTGTGCTTTGTCATTTGAATACCTTTAAT TATTTTCTTCGTCTCAGTTCTTCAAGATGGAAGTGTACTTACCAGGAACA AACGAAGTGATGAGTGAAGGACAGCTCATGCATCAATTGAATCATATCTT GAATAGTTCTCGATTTGAAGATGACCTACCTGTCGGTATCTTGACTTGTG AAGATCGCAATGTCTGGTCACAGGGGTACAAAAGACTAACTAGAGGTATT TAAAGATATTTCGTCATTGACATTCCTTCAAAGCTGTATCAATCCGAGAC AGTGAGAGGTAGGAACGCTCATTTCAAAAACTGAGAATCTTCTCCATTGC AAAATATTTTCACAGATGCCGAAAATAAGGAGAATGTGGAAGAGATCATT AAATCGATTTGTTTGATATGTTTGGACCAACCTGTCACTATCCCTCAAGA GGAAACACCTCGCTTTTCGTCGCAAGAAGGATCTGAATCACTTCGACAAG TTCTTCATGNACACCTCGCTTTTCATCGCAAGAAGGATCTGAATCACTTC GACAAGTTCTTCATGGTGGCGGTACACATCAAAACAGCATGAATAGGTGG TTTGATAAGATCTGTCAGGTTTGTGCGTTAAACTTGTGCGTGCATTGTTT TCCTGAGAAAATTAAAGTGAATGTGTGTGTTAATAGGAGCACTTTGAAAC ACAACGTTGAAACGACTGTTTTAAGGCAAAGGGAGGCCCCTGGCCTGAAG GGGTGGATAAAACCTAAAGCGGCCCACATTTTGACAACATGTGTAGGACC CTCTTGAAATATTTTTTAAAGCTAGGGGGTATATTAAATGGTATTTTTTA TGTTTTATTTTTCAACTTCGAGCAGATTTATAACTTTAAATTCGCCATCT TGGTTCGTTTGAATATGGAGCCTCTTAAAAGTTAATGTTTCCCACGCACT ATCTGATAGAATCAATCGTGTCTGTTGAATTCGACCTGCTTTTGTATCCT TCCCTTCATCTCGTTGCCGGTCAGTCGAAAGATTTTACCCAGACATTAAC 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CACCCTGCGACCCCGTTCTTCGTTCAAAGGCAAGCCTTGTCAAATTTAGC AAGGGAAAAGCTGTGAGACTTTAACTACGTTGCTGAATTTGACAAGGCTT AAATGAATAGCTGATGTTGTCGACTTCACACATGCGTAATACAAATTGTT TAAATTTTCTATAGGATGAGCAGTGATGTCGACACTCGACTATACAACTT CGATTTGTTCGGAAAGAGTGTACCAAAGAAGTTTCGCATTAGTCCTGACG CCTTTTTCCAAGTGTCACTTCAACTAGCTTACTACAGGTACGTATTGAAA CACTGTAATAGCGAGATTATGTATCGGAGATATTCTACGGCTACGGTTGC GGGGCTGCCCATACGGGTCGTCACCAAAGGCGACATGTCGTTGTCTACTT TGCTCTGTACGGGAAAAACACCAAAACACCGTATAAGCAAAGTCGACATA ATGCCGCACGTCAAATATCGAATTTGCTTTCACCTGCCATTACTTGCCTT ACTCGCCATTTCCCTCGCCACCTTAGCCGTAGCCGTAGAGAATTCCAGAT ACATAATCTCGCTATAGAGTGGCTTTTGGCTTTTTTTGGGATATTCTATC GTACCTTTGACTCCCTGATAATGTTGTTTGTTTGTCGAAGGCGTCCTTTT TTTATATACACTGATAAGTTCCCAGGCGCTGCAAGATTATACTGGTAATG TAAATTAAACTAGAGGAATTTTGAGAGGAAACGGAACATGTAATTTGACA AGGTTTTTTACCTCCGAATCTTTTCTTCATAGGCTACACAGTCATCATCC TCCCACGTATGAAAGTGCTTCAATCAGAAAATTTAAGAAAGGAAGAACAG AAACTATTCGATCTGCAACACCTGCTGCCGCTCGCTACGCAAGAGAAATG GATCGAACTAACTATTCGGTATAATTAATGTGATACTGTATTTTTGTCCA AATGCAAATTTTAATTCCCTGTGGCTAAAGTAATTAANTAATGTGATACT GTATGTTTGTCCAAATGCAAATTTTAATTCCCTGAGGCTAAAGCAACACC GAGTTTATGTATCGGAGGATATCGAGGGCGACGGTAAGTGAAATCGATAC AAAACAAAGTCGATAGTTGATGTACGTGGCTCTGTATCGCCTTTGCTCAC CTAAACAGACGACGGTATCTTGGTGTTTTTACCGTCGTCGAGCATGGACG GCGATTTCGGCCCCATGTCAGCTTTGCTTTATACCGTCCCCCTCGATTTA TCTCGAATACATAAACTCGCTAATTAAAGGCCAACGGTGGATGGTAATGG AATAATGAAATGTTCCACCATGAGTAAAATGAAATTTACAACGTGAATAT TACATTTTGTCATTAAGAGCTAATCGATTTAACCAAATCACTAAATTTTG GTTTAGTTCTAAATGAATTCCTTTGACTATCGAGGATTTCATGTCTTAAG ATGGTGCTTTTAGTACGTAAAGTCGCAAATAGCTTGTTGAAATCACGTTG TCGGGAAGTTTTGTCGTAAATATATTTTTTTATCCTATAACAATAGCGTT CAGTTTGAGGTCGTTGTTGTGATTTTCTGCCCGCCTAGTTTGATTATTCG CCCGATAGTGTCATTTGGGCCCGACGCGAAGCGGAGGGCGAAAATGGCAC TAGAGGGCTAATAATCAAATTGCAAGGGCAGAATTAATGACAACAACGAA CGAAAACTTAACGCTATTACTATTATTATCCATATCCGATATTCAAACAA CGTTTTTTTCTAGCGTCAACCAATTCTTTTCGCTTCAATACAATGTCTTC AACAAATTTTTAGCACTTTGCGAGCGGGCCGCAAATGACCAAAAAGTGTT TTTTTCTGACGTTAGTTTAGTCTCTTCGCTTCAATGCAACGACTTCAATC CAATTCCGAGCGGGCTGCAAATGACGTTATTGCCCTATACCCGGTCCGTT AATGATATTTTAGCCCTCTGAAGCCTGGCGCTTTAGTTTCCTCAGCGCAG GTATGACAATTTGAGTCACAAAACCTTTCAATACCGCCCGCCGATTGAAC CTTTAATGGCTTACTTAATGACCGCTATGGATAATAAGTTACATTTAAGT TCTACAGTATACGTACAGTAAGCGTTATGCTACGTCAACATCAACGCGAC ATTTAACATCTTTCATTTTTCTTGACATTTAGGACGAAGAAAAGAAAGGA CTTTTCTTCAACGCTGTCGATGCACATGTCAAATATACTCAAGATGTAAG AAATCTCTCTCCTGCCTTTACATTGCCTACTAATAAAAGACAACACAGAC AAGAATTAAATATTTGAAAATTGAATTGACGATGGTGACCAAACTAGGGA AACGAAAAAGGTTCTATCAATGAAGAAATTATGACAGTTGTAAATAGTAT TTGGAAAAACCTTATGTGTAACTTTTAGTCCCTGATAATTTCACTATCCA CATTATCTACATACTTTAGCTAATAAAATAATTTCCAGTCATGTCTTTTT CCCGTTAACCGAATTGAAAAGGCCTTTTCATACAGCGCCTTGTGATTTTC AAGTCTGCAAATTTACTTTTCTTGTTTTGTAGGTGATTAAGGTAAAATTA TCACAGTTATAATGGCTCATGGAAAATGTCCAATATTTTAAGTTTATAAC TTTTTTGTCCAATTCTGCTCTTGATTTTAGGCCATTAACTTCGAAGCTAT CGATCGTCATCTGCTGGGTTTGAAATTGACAGCTCTTGAAAGTGGAATAC CGTTACCGGAATTGTTTCGCGATAAAGCTTTTGGTTACGCCATGCATTTT CGATTGTCTACGAGTCAAGTAAGTAAAACGTGATACGAAGCTTTGATTTC AAGAATATTCGAGTTATATATTGATATTGTGTGTCAAGCATTTTCCCATT TTCAATTACAATATACTTTTCCAATCTTCCATTGTATTTAATTGTTTTCC TTTTTTTAGGTACCTGCTAAGCGAGCAGCGTGTTTATGTTTTGGTCCAGT GGTTCCTGATGGTTACGGCGTGTGTTATAACCCGATGGAATCACGTTTCG TTTACGCTGTCTCTTCTTTTAACAGCCATCCCAAAACACAAGCCGGTGAT TTAGGAGATGAAATTGCCAAAGCTCTGGAAGATAACCATGTCTTGTTGGC CTCACAATCCAAACTGTAATGTTTTTTGGAATAGTTCTTTACAAACCTTA TGATTGACAAATGTCAAAAAAACAGTTGTTTTTTTAGTATACTAATCATG GGTAATACTTCATGTTAATAGATATACAGCCCATTACGTCATTCGCCCAG GGATATCACCAGTTAGCGATGATGTACCACTGAAATTAAAGCTGACAACG TAAAGTTTTTGAAAAAAGACACCACTCCCAATCGTCCAATTAATTATCCT GATTGCGTAGTAGCTTTAAAGGCTTGATATTCACGATTTATTTGATTTTC TCTCTTGTCAATGCGCATCCTTGAGGAGCCTGACACTTTTCTCAATTTCC CTTCTACATTTAACTCGCTTTATCTTTTAGTTCCACGTAATATTCTAAGA TACTAAGTAGGTATAACTTAAGTAATGAAATTTTGATAATGACTTTTTGT AAATATAATATTTTTAAGGAATACTTTACCATTTTTATTGTTGTCATGTC AGCGTTACTTGAAACGCAGCTTCGATCGTATTTTTTTCTCCGATTAGAAT TTTTAGACCTACCTGGAGGTCCTATAAGTTAACCTGTGTTCGTCCGTCCG TTTGTTCGTCAGTCCGTTCGTCTTTTACCAACTTTTTTCAGAATTAAATG ATAGGGATCTTTTGATTTTTGATGCAAAAGTGCAAAATGGTGGTGCTAAA ATGTGACGGAGAAATTGAAATTTTTTTGAGTAAATTTCAGCCAGAAAATG GGTAAAATTAGGGTTTTTGGCAGATTTTCATAAAAATTTTTTTGGCAAAT TAAAAGAAATCTTTATCTATAAGCATCACAACCATTTGTAAGCATAGATC AATGTTCTTAGCCAAATTATTATTTTTGTTGTTATTGTTTTTTTTAAGAT GAAAATGTCTGTGAAACACCACAAATGATTTTTAAGCGCGTTAAACTAGA GTTGGAAAGTTAAGATAGGACCTTAGGATCTCAGGAAGTTCAAAATTGTT TCGATTATGCTTGGAATATAGCCTAGAAGCCACCGAACCCCACAAAAATC AAAATATTCAATGGAAGAAAGTGGATATGCTAAAATAGCAACTCTCACCC GAACTTTAAATTCTGAAAAACGTTAGAATACACTAAAGTTTCAATATACC GAGTGCGCCACAAAAAGGTTTCTCTCTTTAAATTAGGTCGATAGGTATAG GTAGGTCGATTTTCAACATTTTCGAGCACTTTCATAAAGTAACCTTTTTA TTCAATTGAACATAACTTTTGATCTAATGAATCGAATTTAATAAATGACC CATCAAAATTTAAGTTTATCTTTCTTCTTTCCAGTAAAATGAATGGTTCT TTTAAAATCTTTAGATTTCTAGAAAATTAGTTTTAAAGAGAGAAATTATA TTTGTGGCGCACCCGGTATTTCGAGCAAGATTGTAGACTCACTTAAGCTG TGCATTTTGATAGTGGATTGTTTTTATAAAAAAGGTGTTTAATAGCTTTT TTATTTCTTTAAAAACAGTTTTTTTCAACAGTGCTGATAGTTTCTCCCAA TAGATATGCTTTTATTATAATTTCCAAATTATTTTTTCCAAAAAAATCAG GTAGGTCGATAAAAGTATAGCTTGTTATTGTTAGATTTGAAAAAGATAAT GCATATACACTTTTGTATTGTAATTGAATGGTGTTAATTTAATATTTTTG TTCAATCCAAGTCAGTTTCCCGATATCAAAACCAGACCCGACGAAACGTA CAATTTGTATATATATAATCACATGATAACGAGTGCAATTCGAGAATACA GCACCTGACCCCGAGAATGTAGGTTTCTCATTTTTTAGCATTGTAGCCCT AACGATAGTTCAACTTCATAAAAAGTTGTTTCAGAGCATACTGTTACATC TTACTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053672TCONS_00053672Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053671TCONS_00053671Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053672-proteinTCONS_00053672-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:652093..662848 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.99 9.69 24.95 26.32 15.9 13.68 29.41 33.58 40.83 48.28 54.02 39.69 27.98 27.3 27.4 37.87 36.42 33.56 9.94 18.15 16.26 19.04 14.59 15.95 24.84 25.55 32.32 24.93 30.18 19.95