XLOC_035877 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035877
Unique NameXLOC_035877
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_284:1290317..1315163-

Legend: gene
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TTTAAAAAAAGGTTTTATTCCTCCTTCAATCGAGACTTTGGTTATTCTGT GAGTCGTATAGGCTTCTGTTCAACCTCCATACAAAAAGTTTCTATAATAG AGACTGCTTAATACTCAGTAACCAATATTTTGATGCGATTGTTTTACTTC AGTTAATCAACTTGCTATGAAATCTTAAATCCAATATTCATCCTAAATCT GCATCAGAAACTTGAAAGCGACACCGCCAACCAGGGACAGATCTTTTCAC ATTTAGTTTCACGATCAATTTATTTTCTCAACCTTTTTAAAAATAGGAAA CCGATTACCTGTGTCAACTCCATCATTTGTACGACTCCAATGAAAGTGAA GAAGTCATCTTGGAAGCTGAACGCACGTCTGCTCATTTAAAAATGTTAAG GTCAGTTCGGTATGAAGCCGTTGAAATTAGAAAATCGCAAATTGTTACGA ATCTATGAATTTTTATTTATATCGAAATTAAAAACCTCAAAATCTCAATT CTTGGTCAATCTGGGTCAATAAAGGTTTCAATGGTTGCTCATTTTTAGAG GTTAATATAATATGTTCTCTTTTGCATCACTCTTTTGCATCACGTGACCG GGCAGCTCAGTCGGTAGAGCATTTNCGAGAAGATATGCTTAAGGTATTAA AGTTTCCATTACTGATGGAAACTGATGTTATCAGATCGTTTTTCTTGCAT AGTTTCTTTTTTTTCAAGACGAATCATGATTTTATTTTAATAAATTTACG CAGACTTGTTGCAACATTGATTTCGGGTAAATAGTCCGCCATTTTTTGCA GGTTGGATGCCCTGGGACCAAGTAGGCTTGTAAACAATTACATGGGCCAA TCAGATTGCTGAGTGTTTCCAGATCTCTCGTCTCGTGATTATGTCGACAG TAAAGCTTCATCTCAGTCTATATATCCTTCCTTCCTTTTATTTTAAGATT CAGACCANGTCTAGCGCAAATAGAAAAGGGGATAGACTCCCTCACTCCCG GCTCCGCCGACAGCCACCAGATGAATATACTTACTTACTTACTTACTTAC TTACTTGCATCACNTCTATGAATTTTTATATCCATCGAAATTAGAAACCT CAAAAACCTCAATTCTTGGTCAATCTGGGTCAATAAAGGTTTTCGATGGT TGCTCATTTTTCAGAGGTTAATAAGTTCTCTTTTGCATCATTTTCTTCAG AGAACGTGAAGAAATCCGTAGGAAGCTACTGCAAGAAAAATGCGAATACC ACAAAGGATTCTGGAATGCGCAATGCATTAATCTCGGAGGATTGGGGAGA GAACCAGATGTTGCTAAAATACCGAGTGGTAATTAAAATTTCTTTATGGT CTTTTCATTTCAATTTCCGAGATTTCATGTAGATAGTAGATTACCCTATC CGTCTTTTTACGCCGACCCCTATTACGCCAGATTTTTTTTCATTTTTAGC CTAGCCCTAATTTAATTTTGATCCTTTACTCCAGCCCTTATTACGCCAGC GACGAAAAGTAAGGCCAATTAGGGCCGGCGTTAAAAGGTTCGATAAGGTA GTAACAATTTACAGAATTTTTTTTCAGTCATACAGTTTACATTTTTTGGA ATATCAAATTATTATTTTTTTACAGATACTGACAAAAAAGGTCCTGAGGA ACCTGATCGAGTAAGAAAATCAAATCGTTTGTTCGACTTTTATACATTTC TTTTTTCTTGTGAACAATCAATCATTCAATGTCAGAAATGTTCACGATTT TTGCGAATTGCTAGAAAATCAACTCCGCGAAATCAAATTCCCAATGTATT GACTTGAAATTTCTGACATTAAAGTATTTCATTCACTTGTTTAATTTGTA TGTTCTATGTCTACTTTCGTGTGATGTATTCTTTCACTCATTCATGACGT AATACTTTTGCCAGTAGTGGCAAGTTTAAGGTAGAGAAATTTCCCATTAC TGGCAGAAGCCGGGGTGTATCTGTAGAAAACTTAATGAATATCATGAATT TTCCCTACATTTTAAATTTCATACTGTACCATTACCAGCACACATCCTTC TTATATCTACAAAACCGTTTGGAGCAAATTTGGAAATTACTAAGGATGCC TGATGGGCAACGAGTTGATATGGCTATCAAACACAGCTCTGACCCTACGC TGGAAAAACTGAACAGGGTATGAAGGTTTTTTTTGTCTGGTCTGAGTTGC ATTCAATATTTTGGCTCCAAGATATGTTTCTAGAAACTTATTTGAATTGA AATTACAGTAGAGTCTACATAACTCGAAAAACCATGAGAAACGCAAATTT CTTCGAGTTGTAGAAATTTCGAGTTATAGAGACTGGTTGTTTAAGGCATT GTTAATTAAAGGGACCAGCAAACTTGTTCGTGTTAAGGAATAATTTGAGT AATAGTGGTTCTAGTTATGGAGACTGCATTGTATATGGTTAAGATTCAGG CTCAATGATAATTAATAGTTATCGCACAATCGAGTGCAATATTAGATATA TTTTTCGAGTTCAGATTTTTCGTCATATGGAAAACTGTGAACGAGAGTAA ATGTTGATGTAATGAGTTATCGGGTAAGTTAATATTTTTTTGGTTTAAGA TAGGGCAACCTTAATGATGATTGATTAATGCATAGCTAAGCTTCTAGCCT CTCCATTTGCTTCTGTTTCTTTTGAAGGTTGTCCAGGCGTGGGATAGCAT CACCAAACTGATTGTGGAAAGAGAAAATTGGATGGCTAAGCTAGAAGCCT TCGAACGAAATGCTTCCGATCCTAATCGATTCTTCGAGAAAGGTTTTAAG GGCTTACATACACTATAGTAGGGGGAAATTTGTAAAATCGCTCGATTTTT ATAGCCAAAGCACTTGTGATACATTTTTGGAAAGCTAAGGGGTAGGGGAA TCAAAATAACTTGGGTGCCAATTTTTTTTCGGACACTTTGGTGTGATTTT CGGACAAATACGACGGTCTCGGGCAAAAATCATAGGGTGGAAAATTAATG AAAATTTTAGCTTGAGAAAACGGAGATCTGTTGTATATTTTTGGAAAGCT CTCAAAAAATCAAGATTAGTGATATATTGCGAGTATAGGTGATTTCAGTA CCTAACTCGAGATATTGGAGATATTGAGCTTCCGAAAGCGCAAAAACTGG ACAAAACAGCTGTTTCTGGCTGAAAAACACTGTTTTTAAGGATTAATATC TCGAGTTAAGTAAAGAAATCACCTATACTCGCAATATATCACTAATCTTA ATTTTTTGAGAGCTTTCCAAAAATAAACAACAGGTCTCCGTTTTCTCAAG CTAAAATTTTCATTAATTTTCCACCCTATGATTTTTGCCGGGCGAGACCG TTGTATTTGTCCGAAAATCAAACCAAAGTGTCCGAAAAAAAATTGGCACC CAAGTTAGTTTGATTCCCCTACCCCTTAGCTTTCCAAAAATATATAACAA GTGCTTTGACTAAAAAAATCGAGCGACCTCAAAAAAACGAACAAATTTCC CCCTACTACTACACAATATATTGTCGGGCAATATATTGATAATATGTTGC TGAATACCGGCAATATATTGAAAAGGTGTCCGCAATATATTGTCAGCTCG ATTTGCTATACACGCTTTTTTTTATAAGAATACACTTTATAAGAATGTCC ATGATGAAAATGGCCAAAAAACTAAGAATATGCTAAGAATATCACCATCA TGGAATTTTGCTACTAAAGCTAAGAATGCCATTTTAAGAGCATTTTCAAT TATAAATTATCAATTATCCCCAAGTTAGGCCCAAATTAGGCTCACTGCTT TTACAAAAGTGCCATTTTATGCTTGAGACGTATGTACTAAATGTTAAATC TATTACGAATTAGGATCCTAACCTAAGAATGTGCTTTAAGAATATTTTAG GATGATTTTCCCAAAAACGTTAAGAATATCCATGATGAAATGGATTTACA CCATTCTTATAAAAAAAAGAAGCGTGTCTTCCAGGGATATAGGGGAATTG TTTACAGAAAGAAACCTGTTGTTTACTTCGTTCTTTACGGTCCGCAAACT ATAGTGTCGAATATTGCAAACCAATATATTGTGTAGTCTAAGTAGCCCTC ATCACTTTCAATTAATTCTCGCGGCTGTTGTTCATCACAAAAATTGCGAG GAAATTCAGATTTTGAAGAAATCGAAGTATTTGTGTTTGCATGTTTGCTT TAACTTGCATTTCAAAATTACAATTAATGGCTCTGATAAATTTTTTATTT TATTTCTAGGAGCCAAAGGATCATCCATTGTCCGTTTGAATGAAAGCCGT GTCCGTGAAAAATTAGAGAAGGTATTCCTTTGACTAAACTAGTTGATAAG TGAAACCACTTAGATAATACTTAAAGCCTTGAAATTAAATAATAGGTCCA TGAAAAAAGGTTTGAATGCACTTATCAACACTTAGTGGCGTGGTTGGCAT TTGAGGAGAGTGGTGAATTTCCAAGGACAGGTTTTTCTAGGTGAACGGCT TTTTCAAGCTGCCTCTTAAACAAACTAAGCACATTCCCGCCAAAACTCTA TTTCATTTAAGAGACATTTTCCTGAGTCTCTAAGGTGCAAATTATTTTTA GCATTCAAACAGCGAAAAGTCACTTTGTCACTTCAATGCTATCATCTTAC ATTCCTCGATACCGTCGTCGAAAGAAATGGTCCTTGTAAATTCAACGACA GTCTCCTTAAGAGCTGGCCGCGTCGCTAGGATATATGGTCATCAATAGGC TCTTTGAGATTGCAATATTTCATGGGAACTAGCATTTTCACTTTTTATTC CCCCTGATTGAAAATGTCGATCATTTAAAAAAGCTTTTTAAATTTTCAGG AGATCAAAAGATTAGACGTGGAAATCATACCAATGCTTGAAGATATAAAA CGAAAATTCAATGATGACGTCACTTATCAGGTAAAGCTTAAGCTGGGAGC AAACCGTCAAACATTGTTCTTCAAACGTCGTGACGTTTCATGTTTGAAAT CGATGTTTGACGGTTTGCGGAGTCAAAAATCGTATCTTTTCAACAAAAAG ATCAAAAAATATGTTTGAAACAATGTTTCAACAAGTTCATAATTCTTTCA AACATTCAACTCGGGCTTTTTCTCTAGAAGGAAGACATTGCATTGCTAAT CGAACATTGAATATGATTTCGAACGTGTGATTTGAAAAATAAACAAAAGA AAGAAGCCGTTGTAATGCAACAAAATAAATGTTTGAGACAATGTTGGAAA ATGCCGCGCAAACCATTCAACAAGAAAGTTCAAATGTTTGAAGAACCATG TTTGATAGTTTGCTCCCAGCTTTACTTTTGTTGCGTTTGAACAGGCTAAA ATATAGTTTGGTTAATAATAGAATAATTTCTTTTTGAAATAATTATTCCT TATTTCTAGCACCTTAAAATAAAACTTTGACAATTAAATATGTTTTCGCC ATCTTTCCTTCCATTTAATTACAACCCGGGGGGGGGGTACTAGGGTTGGC GAATGAGGGGTATGTGCGGACGGGACCTCCGAAAACCGACCCTTAGAGAG ACTGATTTTTACTGAAAAGGTGATCCTTAGAGAGACTTTTTGAAATTCTT TTTTCGATTTTTGAGAAAAGTCATACCCTTAGAGAGACTTTATTACAATT TTTTCTTTGGAAATAAAAAAATTTCCTAAAAATCTTCAATTTTCCGACCC TTAGAGAGACTAATTTAAAACTTTCTGATTTTTCCGACCCTTAGAGAGNA CCAATGCTTGAAGATATAAAACGAAAATTCAATGATGACGTCACTTATCA GGTAAAGCTTGCTTTTGTTGCGTTTGACCAGGCTAAAATATAGTTTGGTT AATAATTGAATAATTTCTTATTGAAATAGTTATTCCTTATTTCTAGCATC TTAAAACTTTGACAATTGAATATTTTTTCGCCATCATTCCTTCCATTTAA TTACAACGTTTTTATAAGACTTCTACCTTCGGATATGCTTTATTTTTTGG GGGGGTTTAAAAAGGAAGATTGAGAATGATCCTTCTGATATTTAAGTTCC ATTTTTGTTCAATTTCAATTTCAGGGGCGAAATTACATGTTGAAGATCCA GTCAGATCGAACAGAAATGTTGTACTGGCTCCAACAGGAACGTCGCACGC AACGCATTCAAGAATTGAACAACAAATTCCAACTGACTCCTTTGTCGACT GTCGATCTCTCGGCGCCTGTTAATTGATCGCAAATTTTTGATTGCTTTTA GGAGATGTCTGTATGATGTTACCCGGGACATGGAATCGTGTCCTGTCAAA GAGGGATGATCGTAAAATTATTCGAGATCTTGGAATAGGTTTATAATGTA TTAAACAAAGAACACAAAACACAGGAGTATCTAAAGGCCGCTACTCACTC AGCATTTTATGGTCGGCAGCACATTTTCCCTTTATTTTGTTTGAGCGGAA TGAGAAAAGCGTTCAGCGACCAAAGCGCTCTAGCCGTGCGCCTTGTTCGC CGACCATAAAATGGTGAGTGGGTAGCGGCCTTAATGTTAATTATTTGTAC ATTGATATTTTTAATTCGGATAAATTGTAATATATATTGATGATTAGTAG AGTGTACTCACGGAGTTATTATTTTCTTATTTATAAATTATATTTTAACT GTATATAACATTTTTTGATGATTGATTGAAGAGTGGTTTGTCGTTTTTCA CTTGTTTTCCAATCTTTTCCCAAAATACTTGGCTTACATCATCAAACAAC CAAGACAAACAAATCAAAGAGATAATCAGATGGTTTGAGATCTTTCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056972TCONS_00056972Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056971TCONS_00056971Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056972-proteinTCONS_00056972-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_284supercontigscaffold_284:1290317..1315163 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
17.67 16.09 49.13 55.15 103.21 81.49 45.78 48.25 33.86 33.21 27.05 31.44 11.23 10.68 7.45 8.13 13.66 15.41 12.88 15.69 15.47 16.69 14.79 14.32 74.55 61.61 16.74 13.59 12.51 13.02