XLOC_036217 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036217
Unique NameXLOC_036217
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_289:94447..120989-

Legend: gene
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TATGTCCATATAGACAGGATAGACAGATTGCTTGTCTCCGGTGTTTTGGT TGTTTTGACTGTCAGTGGTCGTGCCATTGGTACAATATTACGTGGAAACA CTTTCTTATTTTCCTTCTCTTTGAGACCTTTATTGTCTGATCTAAATTGG CATTATAGTGCTTAATTTAACTAAGAGTTATCGAGATGAGATCACCATTT CTTTCGGTGAGGTGGTAGTGTCATTTTAGGTATTTTGTTTGGATAAATAC TGTCCTGAAAATAGCAAGGAAAGGCTAATTTGAGTGTCGTATGATTTTTT AGGTTAGTAAGTTAGTTCCTTATTTCATTTGGGAGACCAACCGACTTGAC CACAGATATCTGTAAAGCCCGAAGGGCTAGATAGGCAACTCTAAGCTTTC TCCAGCAAAAAAAAGTGAAGCAAAAATTTGACTTTTTAAATTTCGTGCCG ATGGATAGGATCTAGCATTTTAATTGTTTTCGGAGCGCGAGATCAAAAAA AGTAGGCGGCAAACGCTATTTCACATCTCTCAAACCGGTGAAATTGCATA GTTTAGTCACGTGACTTTGGTAGGAAATCCTTCCAAACCTAGGCTTCACT TTTCGATAAAAGCCGCAAATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATATGTGGA CTTGACTGATCATTGCAATAGCCGAAAGCTTATTTGGAGGTTGAGTAAAA ATAGTCTGAACTCTAACTCGAACCCAGGTTCTTATTTCATCTTTTCATAG TTCTGATAGCGCTCATGATTGTACCAGCGTCCATCAGCAAGGTCGAAAAG TGGTGCAAGTAGCTCTGGATACGAGATTATGATCTGAAAATTAGTTCAGC TCAGTGATCTGACTTCCAGCTTTTAATTAGTGCTATTTTTAATGAGCTTT TCTTGTTACTCGGGTAAGTTATGGCATGTCTCAAAAACTGAAAATTACCA TAATTTTTAGATCGCATTAGTCGACAGAAAATGACCAAACAAATGACTGA ACCTGAAGGGTANNNNNNNNNNNNCTGAAGGGTACTATGATGAAGTTTCT AACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATGTGTAACCTAATTGTTTTTTCG CTGATTTTCGCGAAAAACTGCAAAAACTGATTATGACGTCATAATCGATG ACGTCATAAAAACTAAAAATTGAATTTCTCGAGAATGGTTTATCCAATTG TCTTCAAACTTTCACCATAGATGTATCACACTAAGGTCGATCATTTGAAG AAAGAAATTTTTCGAAATTTTGATGACGTCAGCATAAATTAGATAAAAAT GAAAAATCCTATTTTTTGCTGACGTAATCAGAATTTTGAAAAAAAAATTA TTCAAATGACCTTTATGAGATACATCTTTGGCTAAAGTTTGAAGATAATT GGATAAACCATTCTCGAGAAATTCAATTTTTAGTTTTAATCAGTTTTTGC GGTTTTTCGCGAAAATCAGCGAAAAAACAATTAGGTTACACATCAGGTTA GAAACTTTATCATAGTACCCTTCATGTTCAGTCATTTGTTTGGTCATTTT CTGTCGACTAATGCGATCTAAAAATTATGGTAATTTTAAGACATGCCATA ACTTACCCGAGTATAAAGTAAAAAACACGTTAAAAAGAAGTTAACTCCAA AGTCAGACGCGTTTAGACAAGAGATAACGAATTTGCTTTTAACCATATTT GGATATTCCATCTATCAGACATGCATGAATGGAATTTAGTAGAAGGATGA AGAAAATAGATATTATGACAAAAGAAAATTTGAAGAAATATAATTGCAGT GATTATCGATTCCGATGATGGTACAAAAAATTCGATTATATTTTTGTTTT AGATACACACAGGACGATGTATTCTTTTTATTTTGTCATTTGTAACCATG AATTTCTATCACGAAAAACGACGAAGATGACTTCCATTTTCTCATTTTTT TCTGATTGTCTGTTGTCAAAGGAAGACTATGATTTTTTTCGAAAGCGATA GGTAATATACGTGACCTGCTGAGCATTACAGATGAAATGAAAGTACTTCC TTGGGTAGGTTTATGTAACAATATTGTTTCTGTTGAGAAATTCGGTAGTT CTTTGGTCAGATGGTTGTTTGAAATATTTAGAACGATTTTAGGGTACCTA CCACACACAATATTAATACTTATTTCATAAGTTTAGTGCCCTCTACAATC ATGGTCGTAATATTTGAGAAAAAAGGGAAATCCACCGGGAAGTTTTGAAA CCACAATCAATTTGTAAGTGCTCTAAAGTAGGTTTGAAGGGTACTCTGAG ATTTAACACTAGACTTAGCATCTTAGGATCCAAAAGTTCAAAAATAGTCC AATAAGGCTCAGAATATAGCCTGGAAGTCTGCCAACCCCTCCCAAATTGA AATATTCGATCAAGTTAAAGAGATAGCCCAAAATCGACTTTCTCGCCAGA ACTTTAAATCTTGAAAAACGTTAAAATTACCGGAATTCTCATTCTATTTC GACCATGATTGTAGAGAGGCAGAGAAAGGCTACCCATTCTCCAAACTCTT TATGAAACATAGGATTTCGATCAAAATTACAAATATTTCCTTGCCCTAAT CTCCTCATAGCCAGTTATTCCCTGTCCCCTACTTTATGTATAAAAGGACT TTTTATGGGCAGAATTATACTTATAACTTCAGGCTGGGGCTTTCAACATA ATCTACTACCACACAACAACACAAACCTCTGACGAAAAAGCTTCCTTGTT TCTTATCTCAGTTAGATAACCTTATCAAAAGATTTTGGCACAGTTCAACA AAAATCACAAAGTCACGAGTCGACAGTGTATCAAAGATAAGAAGAGGAAG CCCGATCGAAACGAGGATTCTTTTATTGTGAGTTTTCGAGATATTTAATG ACGTCGTTAATTAAATGAGAAGATTGTCAACCTTCTTTGACAAAATACGT TAAGCTTTATTTGGAAAACTAACGACTTTCTCCTTCTTTTTGATTTATTG GATCTGTGACGACTAACTGCAATGTCCATTGGAATATGAATACACGTTTT TTTATAAGAACATTCAAAATTTTTGAAGGCTTCGGAACTTTTTTTTCACC ATTTTGTAAGTATTTTTATCCATCTCCTAGGAAATCGGGTGTTTTACAGT CCTCAAAGCCTTAAGATATTCATAACTTGTCGTTAATATTATACTTACAT CCATCGAAGCCTTACGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAGAAAACGTG TATCCTATCATTTTCACCACGATTGATTAAAATAATCCAGAGTGATCAAT GTTGTAGGGTTTTTAAGAATTATTACATTTATTGGGCAAGTTATATTTAT TCAAGTGTTTAAGGGTGTGGTGTGTCTATAACGGACGATTCTTAAAAGAA AGGAATATTATTTTCAAAATGACGTCAATGCTCATCGTAAAAATATAATA GGCCTTTTCAAAATAATGTTTCGATGGCCACATGATGACGTTCGCGATAA AAACATTTATTGCATTTAATTAACGCATATATATGTGTCTGACTCAGTTA ATGATCGTGAAAATTAAAAAAATTGCAACATTGCCATTTTCCAATCTTCG AAATTGATTAATAGAGGCTGTATTGTATTTATTTTCATGGATTGTCATCG GATAATTGGTGAAGATTTAAGTATGAAATAAAGTAGTAGTTTTTTGAAAG GATATCTGTAAATGAAGGCAAATTATCCAGGATTAAAATGTAATATTTGA TCTAACAGTAGAGATAAGCGAATCGAAAATTATGTGGAATCACCACACAG GTGGAGTATATTTAAACGGAAATTAATGTAATGCAAGGGAAGGAATTATC TTTTCACTCTTCTTCGTTGAGATTTATTGTCTTCTTCTTTTGTTTTGTTT TGTTTTTTTAAAGAATTGAACATACATTCTTTTGTAATAACAATATGTGA AGAAAACAAAACTGATTTGATGATTGCAAAATGACAATATTTTTATTTCA CTTTTGTCAATGGTGACGTTCAGATGTGGCTGTCTAACAGACAATATATT ACATTAACAAATTATAATGTTTTCAGTTTTGATCTATAATTTGACAAATT AACAGTTTTTCTTTCTGTTGTCCTCTCTGTTTTTGGCATTTCTGAGATTT CTGGCATACCTGTCCAGTTTATAAGGACTTGTCAAGAAATTGTCAATTAT GTGTTATCTCATTATTAAGATTAAATTTTAGCAGCATAGCAATAAATTGT TTATACCATTCAAATCAGGGAAGTTTTAGTCTGAGGTGTACCACTTGAAA CTATTTCGTTAGAGGGTGAGTAGAAGCCTAGAAAAGTTTATATCCATATT TGGTTGAAAAGTATAGGTATAAGAGGCCTGACAGTTGGTCTGTCAAGTAG GATACAATGAAAAAACGAATGCCAATGAAAACGTAATCTCAAGGTCTTGT TACAGATTTTCGACTTTTTGACATGTCAACCTCGTGTCACGTTTATAAGG ATTTAAAGATATTGCATCTAAAGTGGTAAAAGTTTGTGGGTAAGAAGTCA TGCCTACGAGCAAACAACAAAACATTAGACGCGCAATCAATTGAAAATTG GTCAGCTGTAAATCGACCTTAGATTAATGCTAATCATCATTTTGTGTTGT TAAGTCAAATCTCTTTTTTTTTGTTGAACGCGTAAGCATTGGAAAAAGTC AGATTAATTGATTGATTGATGTTTAGCTTTTGATCCTGGTATGAACAGAG CGACTGTTCTTTTGATGTTTCTTTTGTTAAAAGACGGAACATTACAAGAA AATTTAACTGTGTCCGATGGTGCTGTGTTTTGATGCAATTTTGTTGCATG CATTAAAAACGTGAGAGCTTTTTAAAACACAATGTTTACGATTTTAGGAA TGTGACTTTAATTCTTAAGATTTATCAAATGTTTTGGTCAATATTTAAAA TACGTATATTAAGTGCGTAATAGCACTTTAAACTTAATACAGGGGGTCTT TCTTACAAACGCAAGAGGGTTTAATATAAGGCATTGGATTAGAATCATAA CCTCGTTAAAACCTATTATAAAACACAGCGTGATACTGCAGCAAAATCGT CAATGCCTTTTCTTTAAAAAATATTTTCTACTCTCAATTTTTCTCTCTTC TACTACCTAATATTAAATTCTTTTCTATTGTTTTCTATTCTTAGTTTATC ATTAAAAAAAGACAATAGAAAAAAAATAATGAAATCAGCATCACGAACTA TGGACTGGATGCGAACAGAACAAAAATACAAAATTGAGAGACGTCCACAG ATTTCCTGTTTCAATGCTCGCATCGATTTTCTGAACAACTTATCGGACGG AATTGTCAAGAAGTTACCAAAGCAACGGAAGATCAGCAGTAGTAGTAGAC AATTGGAAATGCCATTACCTCCTGGGTGTTTCCCAGAGAAAGTTTCATTA GCCTTGAGTAAATCATCAAACAGTTTATGCGAGTCTGATACTTCGTCTAC TATTCCGAATCGGGGTTTGAATACAATGTCAACGAACGTGGAATCTATCC CTGAAACTGATGTCGTTGCTATGGAGAGTCGAATTGATACCTGGTATGCT AGTCTAAGTAAAATGTCGGATAATGAAGATCTGAACGAGGATGAAGTTTT GATGATCAAACAACCGTTNGAGTAAAATGTCGGATAGTGAAGACCTCAAC GAGGATGAAGTTTTGATGATCAAACAACCGTTGACACCAGCTCCTCGTCG CGTCACACAATCACCGTTTAAGAGGCTGACTAAAACAGGTAGTTCATTGA AACTTCAAAATGGTAGCTATCCGACGCGATATAGTACGCGTCATGGCAAC AACAATAACAATAACAACAGTGTTACGAAAAATAAAAATGAAAAGAAGAA GAATCTCAAAAATAAGAAGAGCCAGCCAATCAAAAAGAAGAAGATTATTA GTGAAATCGATTGTACCGAAAGTGAAGTCAGTTTCGCTTCTGAATTCCCC GATGACGCTATATCGAACGTTTCCTCGGAGCTTTACGACGAATCAATGCG TAGCTCTTCGCCTATGAGTGACGTTCCGTCTTTACGTTCTGAGCAAGCAA GCATGGTCTCCGTTGATAGCACGTACGGAACTTCCGAGTTCTCGTCCTTC AGCAGTGCTTCGAAAGCTAGCCGCGACTATATGTATGATTTTGAACGATT AGCAAATGTATTGGATCATATTGACGGAGAAGTATTAAAAGAACAATTAA AGTCATGCTTAATGTCAAAGAAACCTCGAAATATTAAAACATTGAGTTCA CTATTACCGGCGAGTAAATTCAGCGGTAAAACTACGCATTGTTTTCGGTG CCATAGTGAATATGACGAAAAGCACGGTTGCCGAACATGTATAATACGTC ATCCAAATTCGGAAGTTTTGTTAATATCAGAAGACGGTACAAACGCTGTT TTTCAATGTGAGCGTTGCGCATGCGTGTTCAAACTAGACAATAGTTTAGA GTATGATGAGCAGACCACTGACATTTCAAATTGCGGTGCTTGTTACGTCG GTGAACATACTAGCAACTCTAAGAGTGTGGATTATTTACCCAACGGGGTA GCTAAGACTTGCACTGAAAAAGGTTGCGCTATTTTCTACGTATAATAATA GCTTTATATTTTAACTTTTTCTAGTAATGCTTACCTACTTATATTTAATA CTATACTTTAAAGTATTAAGCCATAGCATTTTTTTCTTCCATGACTTTTC AATTTTAGCATTTTTAAAAATACTTTTTCTCCTTTAATTTATGCTTATTT TATCCTTAATTGTTGATTTTTTTGTAAAAAGTAAAAAAGTTAGTAAATTC GTGTACATATTAGAATTAAAGAATTTCCTCTAACATTCGTTAAGCCTCCT GATTTGCAAAATTATGTCTGGTCATAGTTGTCTACTTCTACATTATTGTC AAATATTTGATTTTGAGAATTTGGAGGTATTTTACTGAAATCTGAAAATT TGAATTTTCTTTTTTTTTCTTCATTCGAATTTGGAGCAGTCTTGAAGTCG CTCAAGAACAATCAAGCTTTGAATTTCCCAAAATCTAATTTTCAAATCAC CGTACGTGAAATGGATTGCCCAAAAATCTATAAATTTTGATTTCATTTTA TTTTTCGTTTGAATTTTGAGTAGTGTTGAAGTAGAGCTCAAGAAAAATCA ACCTTTGAATTTCTCAAAATCACCGTATGTGAAATGGATTGCTAAAAAAT CTATCAATTTTGATTTTATCTTATTTTTCGTTTGAATTTTGAGCAGTCTT GAAGTAGTTCAAGAAAATTCAAGCTTTGTATTTCTCAAAATCACCGTATG TGAAATGGATTGCTAAAAAATCTATAAATTTTGATTTTATTTTATTTTTC GTTTGATTTTTGAGTAGTCTTGAAGTAGCTCAAGAAAAATAAGGTTTTGA ATTTCACAAAATTTTTATTTTCAAATCACCGTACGTGAAATGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057471TCONS_00057471Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057470TCONS_00057470Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057471-proteinTCONS_00057471-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_289supercontigscaffold_289:94447..120989 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (0.07 tpm) - - (4.94 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.79 1.3 0.11 0.22 2.86 2.27 3.58 4.94 1.54 2.63 2.01 2.17 2.47 1.47 1.69 0.87 1.04 1.41 2.74 1.49 0.9 0.45 1.07 1.7 0.85 0.92 0.07 0.22 0.55 0.56