XLOC_036364 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036364
Unique NameXLOC_036364
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_296:14084..23795-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036364 ID=XLOC_036364|Name=XLOC_036364|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9712bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_296:14084..23795- (Clytia hemisphaerica)
TGAAGAGTTTGATGGTGGAGTTCAAATGGTAAATATCACCTTCAAATTGA
TTTCATATTGCATATTACAGTCTAATTATTAGAGGTCGATAACTATTTGA
TTTTGTGTACTTTATCTTTTAATTGGTCCTTGGCTTTTCACAATTTAGCA
AACTGAAGTTGTTTCAGACCCTGATGTTTTGACTGGTGTTATTGAAGAGT
TTGATGGTGGAGTTCAAATGGTAAATATCACCTTCTAATTGATTTCATAT
TGCATATTACAGTCTAATTATTAGAGGTCGATAACTAGTTGATTTTGTGT
ACTTTATCTTTTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT
TGAAGAGTTTGATGGTGGAGTTCAAATGGTAAATATCACCTTCAAATTGA
TTTCATATTGCATATTACAGTCTAATTATTAGAGGTCGATAACTAGTTGA
TTTTGTGTACTTTATCTTTTAATTTGGTCCTTGGCTTTTCACAATTTAGG
AAACTGAAGTTGCTTCAGACCCTGATGTTTTGACTGGAGCTATTGAAGAG
TTTCCTAATGGAATACAAATGGTAAGTCAACCTTGATTCCCTTGATTCTT
GTCTGGAAGGTCAGAGTTCAATTCTCACTCGGTGCTATGATTCACCTGTC
GAGTCAATGTTCCTTCCCCTAGGTTTACTCATGCCTTGGGGGGGGGGACT
GGATACAATCACTCTGATAAAAGGGTATGGGAAGTCGAGTATCAGGCATT
GCTTGCAGTTTGGTGAGGATACTCATAGGTTCAACACCTGCGAAGATGTA
TGCCCGCCTGTGTAGTTTGAGTAAAAACAGTAAAAACAGTACCAAATGAC
GTAAAAAATGCCTAAAGTTAGGTTTTTTAACTCATTTTTATAACGATTTA
AAGGGAATTTTAAGTCTCAAGTAATTTACTTTGAAAAATTGGTTTTCCCC
TCCTGGGAGTTCAGCGAAATTCTATTCCTCCCCCTGAATTTGTCCCTCAG
GCTCCAAAAAATCTCTCTCTCCCATACCTGATCTTTTCTGAAAAATCTAC
CCCCCCCCGGAATCCAGGGGTGAGGACAATATGAAAATCATCTGTCTTTA
GAAGAAAAAAGGAACTGAGTAACTGTATGTCTTTTAGGAANNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATGATGCA
ATTTTTGATTCCCAATATGACATATCGTGTCTAGCTGTCCAGTAAAAGGT
CTATCGAGGTTTGATTGCATTCAACACTGCAACAACATTTTCATTTAGTT
AGTCACACTAGGAAATCAAGCTTTCACTAATCTACAGGATGTATTTGAAA
CAACAAGGATGAGAGTTACCTGAATCAAGTTCAAGTTCCCAAGACAATTA
ATTAAAACTTGAAAACTTAAAATGAGATAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGGTACAGGCAC
AGGGGGTACAGGCACAGGGGGTACAGGCACAGGGGGTACAGGCACAGGGG
GTACAGGCACAGGGGGTACAGGCACAGGGGTAGCACAAAGCTGAAAGGAA
CCCTATATTTCTGTGTATGGTTTGCATTTTGGTTGAATTTATGCTAGTTT
TATGCTTTCCTTTAATTAAAAGGGTGGTGGCTAAGTAAAATTGGTGGTGA
GTTTTGCAATGATATTTGATACTATAACAATTTCATTTATAGTTACTACT
CTTCCCTCTCCCTCAATGCTCAGCTAACACAAACAGGATAAATCTTGTCC
CTCCCTCCTAGTAGTAGGTATAATGACTCTTGTGTAATCAGGTGTAATGA
AAAAATCTGCTGATGGATGGCATCATCATTTTTAAAAAACTTCACTACTG
TACTCTCTTAGTCATTCTTCTAACTAATTACTAGCTGTTTCCCCTATTTC
TATTTGTATTTGTTTGATTTGCAGGCCAGGAAGCTTTGAGAGACTCCCTT
TCAATTGCCTGTTCAGCAACCAGACGGTGTCAATCGAACAACTTCGAACA
AAAATTGCAATCGAATCAATCGAACGTAATCGAACGCGATCGAAGAATTG
CGATTCGATTGTCGAACGTAATCGAATCTCAATCGAATGGCCGATTCCTG
GGTAATATTCGATTGCGTTCGAGTAAGGTTAGATTGGTTCGATTGATTGT
TGACTATGTTCGATTGGTTCGATTGATTGTCAACTACATTGGATTAAGCT
TCGATATCGTTCGATTACGATTATGCACGATGAGTTTGATTGCGATTAAA
TTAAATTGGATCACTCTGTTAGAGCTTCTTAGCGAGGGCGGCCGAGCGCC
TAAGTACCATACTAAAGCGAATAAAATCTAATACAATTGAATCAATCGAA
CGTAATCGAATACAACCGAACGTAATCGAAGCAATCGAACAGCAAATCCT
GGGTAATATTCGATTGCGTTCGACAATCGAATTGCAATCATTCGATTGCG
TTCAATTGCGTTCGATTGATTCGGCGTTCGATTCGTTCGATTGACATCGT
CTGGCAGCAAGCAAGGGTGTTTTTTTTTAATGAATACACATGTCCTGTTG
AATAATTTTATAGTAGTCGAGTAGGAATTAGCAATAAGCAAAAAGCTCGT
CCCAGCTGTTGAAAAAACTACTTAAAGCACTATAGCTCTCACCCAACAAA
ATTGTGAATTTTAAGAATTAGATATTCAGAATCTATGAAAAATTTTGCTT
TCAATGATATATAACATCATGGGGTTTTGTGAATGTGCTGGAAAGATATT
GGTTCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAAT
ATGAATAATATATTATTCTCATCGTATTTCAACATATTGCCATCAAAACA
ATTATTAAATATTTCCCAAGGCATGTATTTTCGAAGATCAAAAACCATAT
ACTGAAATATTAGCACTGTTTAAAAAATATGGACATTTTTGGAAAAAAAT
GAGAATGAAACATTTTCGAAAAAAAATCTGTTAGTATTTTTCCATTGGCT
ATTTCTAAGGTATGACTAAGTCTAAAATTAAATTTTAGTAGCTAAATATT
TACCAGATGACTTGTTTAAGCATGTCATATAAACATCAAGTTGATTGATA
AACAAGTTTTGGAGAAAAGATAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAGTGATTC
TCAACAGTCCTAATAGGTCTAATATTTTAAACATTTAAAAACTGAAAAAA
TTCTGCTTTGTTCAATTTTATTTAGAAATTATGATTTTCCGTCACGGTGC
AACAGAATTTTAGACCCCCTAAAAACTCCATTGGACATCAGAAATGACAT
AATTTCTTCAGTAACTTGAAAATTATCAATTTTTAAAAACATTTGGTAAG
GTAAACTACTTTGTAGCCTTTGTATGCCCATTTTGTAAAAATCTTGATTT
TTGTGAGCTTTCCAGGGATTTTAGCCCAGAAATCGGAAATTTGGTTATAA
CTTTTCAATGGAGCATGTTCCTGCTCTGATTATTTCACATATTGTTCATG
AAATGATATTTTTTATGTCTATATAAAAATTTTTGACATTCTGAAAACTT
CATTTTTTGCCATTTTTCAGATTTTTTGGGACGAGCTTTTTGCTTATTGC
TAATTACGTAATGAAAAATACCTTTAAAAGCAAATTTTTTCTTTTGAGAT
ACAATCATTTCAGGTTTTAAACCTCGCACCACAGTCGTCAGGGATCAAAT
TAGCGAATGGAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAGCGAGTGAGCTACTTC
TAAAGGCTCTAATTAGCATATTTCCATGGTGCTGAAGTGATTTAGAGGGG
TTAGAACCGGCTGGGAACAGTGGTATATGACCCTTATTAAAAATAATGAC
ATGATCATTATTGATGTTTTTATTCCAAATATTCTTTAACTTTGATTGAT
TATGTATTAAAATTTTGGCTTTTAGGAGACCCGCTCTAAGAGACAGAATG
CTGGCATCATTGCAACTGAATCTATTCAAGATCGTGTTTCAAATGTAATA
TTTCAATAAGGCTAGATATTTTTATCATCTGACTACTAAGCTATTGAGGC
TGTGAACTAAGTTTTTTAAAATATTCTTGTTGCACATGCTTTGCAGCTTC
CATGTAATGATAATCAAGCCAATTGTCCCTGCTTATGCCTCCAGAAATTT
TATTCCTCANGTATGCCCTCCTGTGTAGTTTGAGTATGGTCTAAAAACAG
TACCAAATGACGTAAAAAATGCCTAAAGTTAGATTTTTTAACTCATTTTA
TTATAACGATTTAAAGGGGATTTCTAAGTCTCAAGTAATTTACTTTGAAA
AATTGGTTTTCCCCTCCTGGGAGTTCAGCGAAATTCTATTCCTCCCCCTG
AATTTGTCCCCCAGGCTCCAAAAATTCTCTCTCCCCCATACCTGATCTTT
TCTGAAAAATCTATCCCCCAGCCCGGAATCCAGGGGTGAGGACACTATGA
AAATCATCTGTCTTTAGAAGAAAAAAGGAACTGAGTAACTGTATGTCTTT
TAGGAAACTGAAGTTGTTTCAGAACCCTCTTGTATGTCTTCCAGTTCTCT
CAGAGNATCCAGGGGTGAGGACACTATGAAAATCATCTGTCTTTAGAAGA
AAAAAGGAACTGAGTAACTGTATGTCTTTTAGGAAACTGAAGTTGTTTCA
GAACCCTCTTGTATGTCTTCCAGTTCTCTCAGAGAAACCAGCAGTGAAGC
TCAAATGGTAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057649TCONS_00057649Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_296supercontigscaffold_296:14084..23795 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.74	0	0	0	2	6.33	5.73	6.26	3.76	6.98	6.02	6.93	4.94	10.26	5.91	10.41	9.48	10.86	1.58	4.96	4.31	6.31	2.56	4.65	0.8	6.41	2.04	2.17	2.47	1.68