XLOC_036725 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036725
Unique NameXLOC_036725
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_309:695613..708230-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036725 ID=XLOC_036725|Name=XLOC_036725|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12618bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_309:695613..708230- (Clytia hemisphaerica)
AAAAAGTATTTTTTTTCAAGAAATCGATAATTAGGATAGAGGTAATATTA GTAAGATTTAGCCTTTTAAATCTTTTCTATTTATGAGGCCCCCAGCGGTT TTCGTGATGGCGTGATTGCCGTTTTTCAAGTTCGCGATTTCGTGATTTAA GATTTTAAAGTGCGTGATTTGCGTGATCGGACAAACGTGATCAACGTGAT CGTGATAGAAAGGAAATTTAACTCTTGATAACGTGATTTGGATTTTTTTT GCGTGATTGAGTGATTTGAAAGGTGAATGGGGGACCTCATTTATGTCAAT AAAGACTCTTGGCTTGTCGACAGGTGGACAGACACACTCCTATAATTACA AAGGCCGTATTTTGGGTTAAAAATAATAATTAGATTGAATTCTTCTTGCT AGATCTACTGTAATTTTCATTGAAGAAGAAATTTAGGACACGTCGAACAA AGGAGATGACAGGATGCGCTAAAGTGAAGAATTTTGGTTATGACTTCTTG TTTAACTACCAGACAGTGAAATTGGCAGAAATCAAAGACAAAAAGGTGGG CTTGTCATTCCGTGTCATACAGTTGGCTATTGTTTGCTACATCATCTTGT AAGTTCACCTTTGTTTTATATTATGTTTTGTTAACTGGTTTTTTATTGAC GCGGTCTTTAAGGTGCCTTGGTATAGTGGTAGTCGACCTTGGCTTCTGTG CAGGAGGCCAGGGTTCAATTCCCACTCATGGAAGTTCACTTGGCCCTTCG CCCGAGTCAACCCATGCCATGTGAGGGGAATTGGGTAGTCAGTTCAAGGT GCTGACGGGACGCTCATTAGTAAGCGTCTATAGTTGCGAGAATAGGCCTC TAAAGCCTCCTGCAACTCAACCAAATAGAAATAGAAATAGAAATTTACGA GCTTTTACGCAATGATTATTTTCGCATAAAGACGAGCTTACACAGCTCAG 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ATATCTACCCTCTATTTTCCAACTCCCCCAGCCCCCAGGACCCCCGTTAA TTAATTTTTAAGACTATTTTCAGCTGTCAAAGAGAAGGCCCCTTATTTTT CTCTAAATAGGCTGATTTTAGTCTATATTTACCTTAATTTTTGGGTGTTC AGAAGTACAATTTTCAACCCCCCCGGCAGTTAGGTCCCNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTTTAGTTACA ATATTCCGAATACTAACAACAGAACATATATGAAAAAATGTCGTTATAAT GCAAAAACGGATCCCTTGTGTCCAATCTTTCGTTTGCAAGACATCGTTTC AAGTTGTGGCGACAATTATACTCAAGTCGCATTCAAGGTATCTCCTACTC TGTCATAGTTTCCTGTTTGGTTTAAACCCCCTGTTTAATCAAACCCCCTT AACGGCCAATCCCCAAGGCCAAAACTTCGTCGGGGAAAATTTTTGTCGGG AAAAATTTTCGTCGGGGAAAAATTCGTCACTTGCCGGTAGTTGGTAAACG CATTAAGGCCGGGGGAAATTTTCGTCGGGAAAAATATTCGTCACTTGTCC AAAATTTCGTCACTTTTCCCCGACGAAGTTTTCCCCGATAAGGTATATAT AAATTTCTCAGACCCATCTCAATAACCGAGGTCCTGAGCCCTGAGATAAA TTTTTGACGGGAATGGTATCAAAATATAGCATGCTATATAAACTGAAAAC 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TTTCTTCTTTCGAATGAGCCAAAAGAATTCCACTCCGGAAGTTGTCACGG GTCCTAAAAAATGGCCTCCTAGAATATTATATTAGTACATGTAATTTGCA AATCATCTCCAATAATCCATATCTATCATTGGTCAAAAGTTCAAAGGTCT TATTAATCTTGAGATTTTAAGCCAGGATGCTTCCCCTATTAAAAAAATAG GAAAATGCTTGTAGGGTTAAACATCCATATAACTTATGCAATTTTTTCGA ACTTTTTTTTTAAAGTTGCAAAGATTCTTTATGCAAAGTGTAAACAATTC GGAAATAAATACTGGTTGAATAAATAGTGTAATAAATACTAGAGCAAATA GACAATCGACGAAAAAAAAACAAAAAAAGTAGACCAAACGATAGACCTGC AAAATACCTGAAAAGGCCATGACCATTTTTTCGAACTTTTAGATACGTCA ATTATTACGTGGAGAAAGGGAAACGTTATCGAACGCTCACCAAAGCTTTC GGTATCAAATTCGAATTGCTCGCCCATGGGAAGGTAAAGAAAATCTTCAT TTGAATTCTGTTTCAGCCAATCTAGGTCGAAAAAATCAATTTTAGAATTA TCTAATTGGAAAATGTTATAAATTCTCTTTGCTTTTGAAATCTTTTTGCC GGGAGATTTTTATAATTTCATTATTTTTCAGGCGGGGAAGTTCAACATCA TCCCGTTACTAACAAACTTGGGTGCTGGTATTGGATTACTTGGTCTGGTA AAACACTTTCTCACTTAAGAGAAGTAAAGTCTGTCTCAACATAATTTGCA GCGGAGGTTTGATAATAATCCACTTCTGTTTATCTTTTCAACAAGCACAA AACCGCTATCTAATTCAAATTCGTTCAAAAGTTATAGCCTTTTTTGTCTC CGCTGCAAATTATATTGAGACAAACTTTAATCCAAAAATCACAAAAATTG 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ACTTATTAATGCCTTATAAATCAATCTTTATAAGTCGAAGGCGTACTGGT ATAGTGGTTATCGTGCTTGACTTCTGTTCAGGAGGCCCGAGTTCGATACC CACTACTACGATTCACTTGGCAAGTAAATGCTCCTTCGCCCGGGTCAACC CGTGCCATGTGAGGGGAATTGGGTACTATAACTCTGATACAAGAATATGG GTAGATATTTCAGACATAGTGGTGTGCTGAGACACTTAAGAGGTTCTACA CCTGCGAGGACATCCGTTCTCCCGTGTAGTTCGAGTGTCGTGGTATACAC CATGGCTCGGCAGCTCGCATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCTCGCATCTGCAGGGTTGCAA TGTCTGCTTGCGCTGTGATTCCTACTCCATCGTGGGTAGGACCCATTCCG ATGCATCGGAGGGCATATCTATCTATTAAGTCGAAATTTTCTTAGCTCGA ACAAATTTGTGTTCCCATGAGGGTTCGAGTTATAGAGGTTCCACTACATA CGCATTTTATATGAAAACAATGATATTCATAAGACTTTCTATTTCTAATA ACAGACAGTTTCGAATTAGTGAGAGTACATTCTTTCCCAAACATTTTCTC AGTTCTTTCAAAGTTAACCCCTAAAATAAAAGTTCGTTCTTTGTTTTGAA ATTCGACTTTTGTTATGTTGCTCAAAGGTTTTATTTTTACATAAGTATTC CCGTTTCATATCAGACACATATTTCATATCAGGACAGTGTCTGCTTATTG TTATATTGTGCTGAGATAAGCACAAAAAAAATTTTTCTTTCTGCTCTCTG ACCAAACTTGCTCCAAATCCGTGTCAATTCAATGCGATAAAGCTTGTGAA 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AAAAGAAAATAATTTTTTGCTTATATCAGCATAATATAATAATAGGTAGA CACTTGTGTTATTGTTATGTGTCTGATATGAAACGGGAATGGTGCTGTTC ATCCTCTAGCGAAAAGACTTTATCTATAGTTTCTATAGAAATTCAATTCG ATTCAAACCAATCAAACACCCCTGTCTCACAGCCTTGGTGGAACTTTTTT TAAATCCCAATGGGGATAGAAATTCTATTGTTCCAAGGTTGAAAATCCAG TGGGAATGGTTTTGGAGTGCAATTTTTAAACATGTAATTTCGAGTGCGAG GATGAAATCAAAGTCAATTTCCCAGTTGGGCTCAAATTCTAGGGTATTTT TCCCATCGGGGATGAAATTTTTGCAAAATTTTCCAGTGGAGCCGGGGTCC CAACGGGTCTGTGACACAGTGGTGTAATTACACGCTTTTTTTATAAGAAT GGTGTAAATCAATTTCATCATGGATATTTGGACTTTTTTGGGAAAATCAT CTTTACAGCATTCTTAGGTTATAGGATCAGACTAGATTTAATATTTAGTA CATTTTGTGAAAGGAGTGAGCCTTACTTGGGGGTAATTGACAATTTATAA TTGAAAATGCTCTGAAATGGCATTCTTAGCTTGAGTAGCAAAATTCCACG AAGGTGATATTCTTAGCATTATTTTTATTTTTTTGGCCATTTTCATCATG GAGATTCTTATAAAGTGTATTCTTATAAAAAAAGCGTGTAATACATACCT TTTTATTTTTGCACATTTTTCTTGATGTTCTTCAGTTGAGAGAAGCAGCG AAGGAAGAGAAAGAGGAAGCAACCCGTTTGAAATTGATGATGGTCAACAA GTGTGCTGTTCGATCGCCTCACACTGCACGCAAATTACTTGAAATGCTTT GAATTGCTCCACCTACTCCTCCATTTCATGGATAAGATTTTCTATGTTAT TTAAAGTCGATTGCCACACACTGCACGCAAATTACTTGAAATGCTTTGAC TTGTTCCACCTACACCTCCATTTCATGGATAAGATTTTCTATGTTATTTA AAGTCGATCGCCTCATACTGCACGTAAATTGCTTGAAATGTTTTGACTTG CTTCACTTAATGCTCACCTCCATTTCATGGATAAGATTTTCTATGTTATT TAAAGTCGATCGCCTCATACTGCACGTAAATTGCTTGAAATGTTTTGACT TGCTTCACTTAATGCTCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058308TCONS_00058308Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058307TCONS_00058307Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058308-proteinTCONS_00058308-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_309supercontigscaffold_309:695613..708230 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
P2RX2P2X purinoceptor 2 isoform B Homo Sapiens
P2RX3PREDICTED: P2X purinoceptor 3 isoform X1 Homo Sapiens
P2RX1PREDICTED: P2X purinoceptor 1 isoform X1 Homo Sapiens
P2RX4P2X purinoceptor 4 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (0.03 tpm) - - (2.38 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.36 0.47 0.73 0.62 2.03 1.48 1.38 2.19 1.95 2.2 1.04 1 1.2 1.52 0.95 0.53 0.88 2.38 1.55 2.13 2.18 2.06 0.44 1.07 1.64 2.23 0.16 0.03 0.05 0.14