XLOC_040611 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040611
Unique NameXLOC_040611
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_423:393784..435575+

Legend: gene
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>XLOC_040611 ID=XLOC_040611|Name=XLOC_040611|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=41792bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_423:393784..435575+ (Clytia hemisphaerica)
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TCCAGACCGTTCATATTTGGTGGTCTCTATTTTTTAATTCCATTCGAAAA TCCAATTTCCAATCGACCAAAACTAATAATTAAGCGAGACCTATATTTAT CTgctaatttcatttcaaaaaattttaattgtttttttctctgcTTGCTT TCTACCAGTAATTTCCCGTCTGTACTGCAAACTATTCCACTTATCTTTCG ATAGTACACGTGCCTTATTATGAACGTTCAGGgagtgttttgaaaaagtt aatttCAGATTAAAATCGGACGATGAATCGCTATCAAGTCTAACTTTGCG AAATTTTATCATCGACCTCTTGTATATTTAGAATATTGATAAAAACATGG AAAAGCTTCAAATACATTAAATAGTTTTCCCGTGTTTCAACCCATTTTCC TCATTTTGTCTTCAGTGTTATTGAAAGATCTTTCTATATTCCTTGTCGAT TCTATATTCCGGTTCTCGCAACTTTTTCCCTCCTTCTCAATAAACTTGTC ATAATTGTGTTATGTAGCTTAAAAAGTTTGGAACGAAAATTGTAGAACGA CTGTCGAAAACAAGAGTGGTGTGAAAGTCCCAATCGTTGAGTCTTGGGAT TTCCATCCTTGACCCTTTCATCCATTTCTGACGCATTTCATTTACGCTCT TGCGATCGATTCCACTTTTCCCTAGTATTCTCACAACTACGAAAAAACTG ATCCAATTTTCTCTTCTTATAATTTATGTCAATCACGTGATCATAATAAA TTTTTCCTCTATTGTAATTGACGTCATTTAGTTGCATTGTTCTCTTTGAT AACATTAATGATTATAAAAGTGGTCAGATATCAAACGAAAAGCTTatatc aaaatttgacattCTACAAAACGGTCGTGTCACAGATACACATTGTCGAA ATCACAAAAATCTAAACACgcaagaaaaaatattatatttatttatGAAC AAAATGGCACCTAAAGATATTGGATACGCTCGTATTTTTATGAACGAAGA AGCGCCAATGCCGCATATATTACCTCACCATTTATTTGTTTTAGCTGCTG CTTCGGCTTCCAAAGAGTAcgtgttttttgttgttgtttgtttttgttgg atGTAGCGGCACCTGTCGTATTTTTGGTTCAATGACGAATCTTTCTCCTT GTGATATTTTTAGAACGATGTTGACCCTGTGTGACTGTTCGTCAAAACCT TTCGACCTCCTGATGTTTTAACCTTCACTTCTCTTCTGATCTTACGATTG GTTAAATGAACTtcagtcaaaatattaagaaaatttgattgataCTTTAT ACTTATATTATAACCTATGGTGAGATTGTTAGACACTTCACAGACAAGGT GTGGTAATATCAGTTGTTTTAACCAATTATATTCTTTTCTCTACAGAACT GGCCTCTATCCACTGACGGGTATGGAAAACACCAAAAGCAAGAAAGAGAA CCGCCCACCATTGAACCTTTCACGCCCTAAGTCACCCGAAGACGCCCAAA ACAGTAACCAAGgcaatgaagaagaagaacttAAAGAATTACGACTGGTA AGTTACAACTTGAATAGATGGAAgtaattttttcatttgtcaaaatACTT GATGTTTTGAAAAGACGTGATTTTAGTGGGCTTAATGATGTAAGAATTTT CaactattttaatattttaataccCCACGCAAAAGAAATGTNTTTAGTGG GCTTAATGCTGTAAGAATCTTCaactattttaatattttaataccCCACG CATAGCCTTACTTAACAGAAGATGATATCACAAACTCTAACCCTCTCTTT TTTACCAACCATTAGATTATCCAGATGAACTGTACAATCAAGACACTGGA AGATGGTTCAGGAAAAACATTGAGTTTATTACTCAAACTAGAAGACAAAA TGAATAGACAATTATCCCGTAAAATTGCAGACGACGAAAACCCATTGGAA CTCGCAAATGATTTAGTACATCACGGTCTTATCAGTGAGTTGGACGCGCA AAAAGTCGCcactaagattgaagaatcgtTGAAAGCGGCTGTTTAAGGCT GTCCAAGTCCGCCGCAGATTCGGAGGTTTTAAGAGGTGATATGCGATACC TTATGGAGTTTTGAATGGAGATCCAAATTTGAGAGTAGTTTATACCAACG TATTACTACACACACTCAACCACATCGACCAATTGAAACAACGCTTGGTT TTAAAGGGAAGATTTACTGACCAATCAGGAAGTACCTAAGCCATCACATG ATGTGAGAACGCTTGTTTCATTGGTTGTAAAGAATGCTGAATCAGCGCTT TGCGTCACATTAATACAACGAGAAAAAGAAGGATTTATGTTTTAAAGAAC TTGAGAGTTATTATTTATATTGCAAACTATTTTACGAACATCGAAATGTT TATTTCGAGCAAACACAGTCGTTTACGAGCAGTTTAATTTGCGTGCCACG TGGAGTTGCCATGAAAAGACAATGTATTGATAGAGACACCTAAAAACTTA ATTTAACTGAATGTAGGAAATTTTACCATTGGCTAGAATGTAATGATTTA AACCGAACGCTATTTGCCACCGCAAATTTTTAACCATAGTTTAAAAGAAC GTTTAaaagcttgatttaaaaaacttGAATTATTCGAGGCTGAACTTTTT TTAACGTGAAATGTTATTtgattgtttgtttgttgttgacaaaaaagatt tttatgttttcttaaatcagaaaagcaaaataattttgtataaatttatt tggaagaaaattgtatatatttaaagtgtttaaaacaaatttagaaAGTT TTGATGGTTCCTATTTAGTTGATAGAATGTCAAGAACATCCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064758TCONS_00064758Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064759TCONS_00064759Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064760TCONS_00064760Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Putative nuclear receptor binding proteinTCONS_00064758-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_423supercontigscaffold_423:393784..435575 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
8.7 9.03 4.87 4.15 101.34 72.42 69.73 71.36 195.49 249.33 148.98 405.24 105.15 85.3 82.13 109.16 98.73 135.62 119.76 180.17 143.8 186.47 56.29 83.72 95.78 86.26 31.06 35.48 41.88 40.42