XLOC_042924 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042924
Unique NameXLOC_042924
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_49:516214..533473-

Legend: gene
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>XLOC_042924 ID=XLOC_042924|Name=XLOC_042924|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=17260bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:516214..533473- (Clytia hemisphaerica)
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ATAAAATTTATGTTCCAGTTGGCCGGAAAATGCACTCAAAATTAAGTTTT ATTTGAAGAAATGATATAAAAAATCAGTAGTTTATGAAAATAAAAACAAT CTAAGAAAGCGAATTGAAGGTTTAAAGTTGAGTATGAATCAAGAAAAGGT CAACCAGCTTTTCTATATCAGCCATGACACTCCTTCATTTTTGATACAGT GCAGGAGGCCCCAAGTGGTTTTCGTGATGGCATGTTAGAGACTTTTTTCT AGCTTGATTACGTGAATTAGAAAACTTTTTTTCGTGATTGCGTGATCAGA GGTCAAAATATGATCGTGATTTGACAGCTTTTTTGAGCCATGATGCATGA TTTGGACTGGGGGCGTGCAGAGGTGATTTTAACATTGCAGATTCCAGAAA TACATTAATTAATTAATGAAATGCTATAACACTACCAATTCCCTAATCTA GACAAACTTTTAACAAAAAAAACATAAAGGCTCTTTTGGGATAAGTTCTG ATAAAACTTTGATTGAACTTATAGCAAAATGTTATCAATTTTTGACGCCC ACCTCTTTAGTTTAGTTTTATGTCCATGAGTATAATTACTCGTCTCGCCT ATTTTGATAAATAAATAATACTTATACATTTACACGTTTTTTTTTTTAGG AAACTAGTTTTACCAAGCAGTCTCAATGTTTCTTAAGAAATCGGCCTTTT GAGCCTTAAATGTTTCTTACATGTTTCTAAACCTGTTGACATAATCAGCC TCATGGAAGACTGGATTGGAAGGTTCTTAAAAAAAAACCGAATTAAAAAA TGTTATTTTCTCATTCTCAGCCTCAGCATGTTTCTTAGTTTTTAGGCATT CTGAGCCTCATGTTTCTTAAAAGTGTGTTTCTTATAAAAAAACGTGTACT TACTTTCAGATTCAAACAACGATTTGGACACTGGTTTCATTGAAAACACA 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GGACGCCAAAACGGGTTCTAGGCCGACTTTTCAACCTTTCCTTTTCTGCT GTACTTAACTGTATGGTCAGACTTTGTGCCTATGTTTTAATTTCTTTCTT CTTGTTAAGCTGACAGGTGACTCTAGAGTGGCAGGAGATGCTTACTCAAG GTACCGCACCTGATCTCAGACTTCGGTCTTTAGCTTATCACTTTCTTTTG TGTCTTGTGTATTCCTTTTGTTAAAAAAAATTGAATTGGGTTTTTGTTAC ATATTGTCATGGTTAGTCGCTAGTTTGTATCTTCTTCAGTGTATATAACT TCACTATATTTCACATTTTACGAGCATTTTTGCACAAATCGGATGTTTTA GAGTCCGCAAAGCCTTAAAATGTTCATAACTTGTTCTTAAGATTTTGGCC ATCGAAGCCTTTTGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTACA AGTTAATTTCAGTTTTCATTTATAAGTACGGTACTTGAATATCTTTTTCA TTGACTTCTCTCTACGGGGGAGATAATAGGACCTAGCACAAAGTAATTTG TTGGAGGGGGCTAGAAAGCTGGCTGAAGCTATGGTTATTCAAGTATCCAG CGACCGTAGTGCAGTGGTTGAGCATCCATCTACGATGCGCAAGGACCTGG GTTCAAATTTTGGCCGGGTAATACCAAAAACTTCGTACTTAGTACAGGGT AAGTGGAGTAATCCAGGGAGAAAGAGTAGCGCCCTCCCCTACCTTTTTGT AAATAGCTTTCGAAAGAGGAGCCTATATACTATATACATGTAATAAACGT CACATCCTTTTATACAGACTAATTTTAAGAGCTTTTTTCTGTAAACAGGC TTTTTAAATTCTTGTCATAGAAAGCGCCACGCCCGTAACTTCTATACCAC CTGATGAAAAACCACCAGTAGAAAGACTCTCTGCGCATGACGATGACGTA AAGGTATCAAACGACACTGAAAATGAAAAGAGAAAGATTTCAACTGAAGA AGAAAAAACAATGAGAGGAAACGAAGAACTACAAAAAATAGATGGTAACA ATAATAATAAGCAACCAATAAGCGATGGTGAACAACATGAAAGGAAATTA CCACAAGAACCTTCTTCAAACTCAATAGGTATCCTTGATAAATGGTTCTC TTTTCCGAATATGTGTGTGAACTGTGTCTTTAACACGTTCTCTGCCAACT ACGAGTATACTTGTAGTGGAGGGCTCAAAATACTAAAATTTAAAGTATTT AAAACAAAACTCGGGGCATAGGAGTCTCTGAAAGTCAAATTTTCTCAAAA GGTCAGGGTATTCTACTGTGCTCCATAGCTGCATACAAGTTATTTGAATT TGATTCTTTATACAATCAACACTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGAAG GTCCTATAAATTAACCTGTGTTCGTTCGTCCGTTCATCCGTTCGTTCGTC TGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATCATAGGAATCTTTGGATTTTTGG TACAAAGGTGCAAAATGGTCGTGGTCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTC GAAAGAAAAAAAAATTTGGGCAAATTTGGGACAAAAAACGGCTAAAAAAC GGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTT TTGCATGAATGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAACT TTTGTTGGCTCAAAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCATTATTAATAA GCATACATCAATGTTCTTAGCCATATTATTATTTTTATTATTTTTTTTTA AGATGAAAATGTCACGGTGGATGGTTTGAGTTTTCTAGAAACACTTATTA TTTTTTTTGGCTGAAAAACGAATCTTTATCTATAAGAATCACTAACTATA AGCATAGATCAATATTCTTTGCCAAATTATTATTTTATTATTATTTTTTT CTAAACAAAGAAAATGTCACCTTAGAGCGCGATGGTTTGAGTTTTCTAGA AACACTTACTATTTTTTTTGGCTGAAAAACGCATGTTTATCTATAAAAAT CACCATTTATAAACCTAGATCAATGTTCTTAGCCAAATTATTATTTTTAT TATTATTTTTTCTAAAAGAAGAAAATGTCACGGTAGAGCGCCATGGTTTG AGTTTTCTGTAAACCTTATTTATTAAGCTGTGCATTTTTCTGATAGTGAA TTGTTTTATAAAGAAAAGCGTTTTTAATAGTTTGTTTTTTTATTTTTCAA AAATCTTTTTCAATACCGTAAATCACCGATTAAGCGCCCCGCTTGAATTA GCGCCCCGCTCGAATAAGCGCCCCCCATTTAGTTAGAATAATTTTATAAG CGCCCCGCTCGAATAAGCGCCCCCCTTTGAATAAGCGCCCCCCTCCAGGG AGGGGCGCTTATTCGAATTGGTGGCCTAGGCTAATTTCCGGGATAAGAAT TTCTCTTCAGATGATTAACAGTCGAAAGAAATTAACTTGTTATTGAAGAA GATGAAGACGACGACAAAGATATTGTTATTGATTGAATAAGATATTGTCT TAAAAAGAAAAAAACGATTAAGATTTAAATGATAGAAATTGTCAATTGGA TTTTTCTTTTATTCATCCTTTTTTGAAGTTAAGTTTAAGCAGATTCCGAA TTTGTTGATATACGAATTTCTGAAATAAAANNNNNNNNGCCTCGCTTGAA TAAGTGCCCCGCTTGAATAAGCGCCCCCCTCAGAGCCTGAAAAATTAAAT AAGCGCCCGGGCGCTTAATCGGTGATTTACGGTATTTGAAAATAAAATCT GCTATTCTTTAGATGCACTTTTGGAAGTGTATTTATTCAAAATACTCTTT TAAAATCTCCCTTTTCCTGCCGTGATTTGNTCATAGTTTCTCCCAATAGA TATGTTTTCATTTGTCTTTATTCTTTTGTATTTTGACCAGTTATGTTTCA TTGTTTCAATGTTCATTGATTAGTTTGATAACCAGGTAGGTCCATAAAAG TATCACTTGTTTTTTTTCAAAGAATGTATACTTTTATTTTACTTTCCTTT CCTCTTATAATCACTCTTACTTTATTTTTATTTTCCAGGTCGAATCTCAC CACCCATCGCTATCAGCAAGCTGGAATCACCACCAGGGACAATCAAAAAA CCTCCCAAAGCTGGTTTATATGCTTTACTGAAAGCTCGTAGTAAACAGAT ATCCACAACTTCACTGACCTCCAATACAAACTCTGGACCTAACAGAAACT CCTCAGGTACTTCAACGCCTAGTCCAGGACCCAATACTCCCCCTACTGAA CGAAGCAAGATTACTTCAAACGCAATTACTGCTGCAACTATCGAAACCTC GAGACCAGATTCTAGTGCTAGTCTACATTCAGTAAATCCTTCGCTCCACA GAACAAACTCATCAGGGTCTAACGGCCCTATCACTAATCCTATTCCAAGA TCTACCGATTCAAGTAACAATAACTCTACAACCTCGTCCCCAGATGTTAT GCGAAAAATCAGCTCTGGACATCCTGGGATCCAACGAACCAACTCTAGCG GTTATATAAACGCTTTTAAAAACGCATTCGAAAGAAGTAATTCAAATGCT AGTGATTCATCGAACAGTAGTCCTAGCAATCCTAGAAAGTTGTCAGGGGC AACGCAATCATCGGCAGCCATTTTGAAAAATACAATATCGACATCTAAAA TCAATGACTCAAAACCAATGACATATCGACAGAACTCTTTCGAAAAGCGA AAAGTGAATGGTATTGTATCTTCAGCACCGCCCCCAGTTTCTCCAAAACC 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ATACAGACAATACAGTTAGTGATCAGACGGTAAAACCTTCACAGCTTTTC TCCGTATCTAATACCGGAAAATCACAGCCTTGATTTTGTTATCTATAAAT AACTGGCTTCTTGAGTTTGTTTATTTGTTGTTTTTTTTTATTTTCAAAAT CGAAATCCTTAAGGGAGAAGAGTTTTTAAAGGTTCCATGATAAAAAAAGG TTTAAAATCTTTGATGAAGTATCATTCAAAAAAATTTTTTCGTAACTTTT CCAGGTATGATCTCAACTTATAGACCAACTTTAATGACACAGCCCAGCGT TTTCTGAATTCTTTTTCGCAAAAAGCACATCATAAGAATTTGAGCACCAA ATCAAAGATATAAAATAATCCTTATATACATATATCTATGAAATTTATTA AGAAGAACTCTTATCACAAATTTATTGAATTATTACTACAAAAAAATTAA AATTGATAATTTAGAATATTATGAAGATTTTTTATGGTTATTTATTACAA ATTTTTAGGCTTAGATGTTTTGTTTTTGTTTTGTTCAAATTTTTATTCGG CCCTTGTTAAACTCCGGTTACGGAGTTTCTTAAAATCAGTGTTTTTCATT TGTAATTGTGCGTAAATCCGATCAATCGCGAAAGTAGGGTTCGATCTTTC CGGTTTGATTTCCCGATTTGGTTTGCGTTTGCGCTCGCACCTACTAGGAT AAACTCTTTTGAATTTTATGTTAGATATATTAAGAAAGGCTGACCCATGA CAATTACCGGAGTTTGCAACCGTTATTACGGCTGTTTTATTTCTCTTTTT TTTTGTTACTATAATTTTTGTTAAGATTTTTAAGGACAACATAGGTATAT TGTTTGTTTTTCTGGTCACTTCGTTATTTTCATTTTTCTATATTTCATTG GAAGTTTTGTCCGCTTTGATGCCTTAAACCATTTCAGGGTCTCTGTGGCT TTAAGAAAATCGTCTGATTTCAGCTTTAGTACTATAATGAGGCCCCCAAG TGGTTTTCGTGATGGCGTGATAGGGACTTTTCAAAGTGACCATCCAAATT TTTTGCTGATTTTCGTGATCGTGATTGAAGACAAAAAAATGCGTGATATC GTGATCAGAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068877TCONS_00068877Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068876TCONS_00068876Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068877-proteinTCONS_00068877-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_49supercontigscaffold_49:516214..533473 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.98 5.02 1.26 0.77 4.23 3.66 12.56 13.87 7.15 9.01 6.78 5.08 7.53 6.7 3.01 5.39 6.7 5.58 4.85 5.61 6.13 5.78 5.41 6.98 11.3 10.94 13.48 11.31 6.79 5.67