TCONS_00003351 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00003351
Unique NameTCONS_00003351
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1760

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00003351 ID=TCONS_00003351|Name=TCONS_00003351|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1760bp
GTGTTTATGACGGTCTAGAGTGGAAATTGCCAAAGTTATTTGATTAATTA
TTTTCTCTCTGGTTGAGGTTTGTTACACTTGTGAAAAAGAGTATCTGAGA
GTAATACGTACACCAGCGAGATATTCGATGTTTTTTGCTGCttaaaattt
ttatttcaaacgaGATAACAAGACGTAAGAGCAAACGATGCAGATGAACG
GGTCATCGAGAAATTGTTACTACCTACCAGTGCCAATAGGTAACTCGACG
TTCTGTGGATTGAAGAAAGAATGGTCGCCTCGTTTCAATCAGCCTTTATT
GCTGGCAATGTCGATCATTCCTGTATCTTTGtattggatgtttttattcg
tATATCTCAAAGCTTTatacagaatgttgaaaaagatgCACAGGAGGAGC
GTATACCGCCATGTTGAAGTCGCAGAGCCTTTTTCAGTCTTCCACCGTTA
TAAAATGTCGTACCCCGTGCTGCAACATATACGAAAAGCAGATAATTGAA
GTGAAATTATGGTACGTGGTTGTAATAACGGTGTTATTCAAATATCTCTG
GGACGCTATTGACATCACTTTAgatgtttacatttttatcaattggAGCG
AGGAGATGTTATTGATGAGGGAATATATCGAAACACTAGTGTCAACAATG
CCATATATATTTTTGCCTTGGTTGGATGTATTTGTAAAGTGTTCACGTGG
AGAATATTTAGACATATGTCAATCTTCCGTGAAAAGTCTTCGAGTATTCG
ATCGCCTTCGCAAGACGAAAAGTTTGATCTGTTACACATAGCAAGAATGA
AAAACATGGTTTATGTAGCCAGTTTCATTTTTGAAGATGGTCCAGAGCTT
CTATTGGAATACTTTTACATCGAAAAGTATGTGACGTCATTCACTTGGGT
TTTGCTGGTTAAAGATATTCTCCTTGGTATTTTCGCCATTATCACTTGTA
TAACCACGCTCAAGTTTTTGCTGTATGGATATAATCAAGAAAACCGCACG
ATTGTCTCATTTATTTGCTACGGTATTTTAGTCATGGCATTTACCTTGTC
ATCCTTGCTAAGAGTTGGTGCCGCATGCTATCAGTATTTAACAAAGAAAT
TTAACAGATCTTGTTTTGTGGTATCTGAAGGGAAGATTGTACAGACTCCC
TTTGAACAAGGTTGCATGCGTGAGATCGATTACGTCATCGCTGCCCTGAC
TACAGTCCCGTTGGTCTTATTTGGATTAATCATCATTGTAAATTGTTGTT
CAAGCATCATATCAGAATGTTTGTTTGAAGGCCATAACAAAATCCCTAGA
GAGGGTTCACGCAAGAGGGTTATCactgtttcatttttcatgtaTATTCT
CAGTCCTGCCGGTGGGTTTACAAACCTTGGTCAACAATCCTCAAAATTCT
TCAATTATATATACGTCAAATTTGGATGCAAGATTTTTGATTGCTACAAG
AAAAGAATGGATTCCACTGTACCAGCTCCTTGTGAGGAGTTTACTTCTAA
TGCAGCCACCGTAAATCAATCGGAATTACACCACTTTGGTGAGGCAGCTT
CCACCGAGAAAAATAATTCTTCGGTTTATTGCGACACTCGCCTTTGATTT
ATAGTCTTGAGTTAATGGAAAATTAGAAAGCATTTTTCTTGCTGCTGAAT
ATAAGTGGAATCGACGCCTGTATTACGAATTGACGCATGTATTTATAATT
TAAGACAGATAGCTGATACGTCTGTATGGCCTCTCGaattcctttttaaa
aattaattgt
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00003351-protein

>TCONS_00003351-protein ID=TCONS_00003351-protein|Name=TCONS_00003351-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=293bp
MSIFREKSSSIRSPSQDEKFDLLHIARMKNMVYVASFIFEDGPELLLEYF
YIEKYVTSFTWVLLVKDILLGIFAIITCITTLKFLLYGYNQENRTIVSFI
CYGILVMAFTLSSLLRVGAACYQYLTKKFNRSCFVVSEGKIVQTPFEQGC
MREIDYVIAALTTVPLVLFGLIIIVNCCSSIISECLFEGHNKIPREGSRK
RVITVSFFMYILSPAGGFTNLGQQSSKFFNYIYVKFGCKIFDCYKKRMDS
TVPAPCEEFTSNAATVNQSELHHFGEAASTEKNNSSVYCDTRL
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000026:653877..664742-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00003351 ID=TCONS_00003351|Name=TCONS_00003351|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10866bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026:653877..664742- (Clytia hemisphaerica)
GTGTTTATGACGGTCTAGAGTGGAAATTGCCAAAGTTATTTGATTAATTA TTTTCTCTCTGGTTGAGGTTTGTTACACTTGTGAAAAAGAGTATCTGAGA GTAATACGTACACCAGCGAGATATTCGATGTTTTTTGCTGCTTAAAATTT TTGTAATAATGCGATGCCGGCCCAGGCCTAAGTCGACACCACATTATTAA CGGGTGGAGGACTAGTCCAGACATCAAACAGAGAAGGGGAGACTGTACGT ATTTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNTCAATTCCAATAAAAATTTCTCTTTGGGATAAG AACACACGGCGTGTGAAGGCTGAGGGTGCGTGTCCGTATTACGACTATCT AACGCAAAATTAAAAAATTCAAATTGGATTAAAAAAATAGCTATACTTAC ATCTCTGTGTCCCTTCTGTAGGTCTACCTTTGTGCTTCGAAAACTGCAAG TAATTGTGATTATTAATACATTTATAGGCAATGACTGTTCTGTATTTACT AATGTTGTTTTTCTTTTATTGTTCAGGTAGCCGACGAAACGAAGGCAACG ACTAATGTCCATTTTCGTTGGAGTGTGGTGCAGTCATATAAATCACCTAA TTCTCTGGGCCCCAACCTCGTTGCAGACCCCAACGTGAACAGCATTATAA AAATTAAGACCGTGATGATAGAGTTAGAAATTGGAAGTTAGAATGGTTCT CGTTCTCTGGTTCCTTAACGACGATCGTGTTCAGGCTTTCTTTTCGAGTT TTTTNGGTTCCTTAACGACGATCATGTTCAGGCTTTCTTTTCGAGTTCTT TTATTTTCTCCTTCTTTCTTTTCCTTAGCTTTGGCCTTATTAGCCTTCTT TTGTTTTGTTCTGCGATTGAAGTCTACAATGAGGTTTGGGTCTAAAATAT TTTCACTAGGCTCCCAAGTAGCCTGCGACAAGGGATATCCTTGCCACTTC ACAAGATAACTCGTGATTCCAGATCGTTTTCTGGATTTCAGAATTCTTTC CACCCTATAAACCAGGTCTTCCTGTTCGATTTCCACTGTCGGATCGGGGA CGTGCGGCATAGAATCTAAGGGGATGCAATCCAACGGGACGTCACAAAAT TCGTCCTCTCCTTCGACCTCATTGTCCGGTCTTTCCCTGGGGTGTACTTC TTTATTCTGGAGGCATGGACATTTACTGGGACTCTCCTCCCCTCTATTTC GAGTTTAAAATTGACAGGCGAAATTTGCTCAACAATACGATATGGTCCAT GTCAACGGAATCTCAGTTTATTAGAAAGGCCCTTGATAGAGTCCGGCACA TGTAGCCATATCAAGTCTCCTACAAGAAAAGGCGCGTCCACTGGTGTTTT TCTTTCTTCGTTCGCTTGCTGGGATCGTTGCATATTTTCTTTCGCGGTCT CTTGGGCCAAACGAAGGGAGGTTATCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNCATTCTGGGGTCGCGGCCGTGGAGTAAGAAAAAGGGAGT TTCTCTGGTAGTGGAATGGGGGGTAACTCTATAAGCAAATAGGGCAGAGT TAATGTGGGTATCCTAGTCGTCCTGAAATGCGTCAGTGAACTGGGCGAGT GTACGTGCTAAAGTTCCATTATACCGCTCCACCAGTCCGTTTGTCGCTGG GTGATATGCTGTGGTATGAACCCTCTTAATTCGCAAAGCAGTGCTGAGTT CGGCAACGAGCCTCGCCAGGAAATTCTTTCCGCNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNTGAATTCCTTGATCAGCCTCCAGCGGAGTTGTCTCGTCATTG GTCGTCAATGTTCGGAGTGAACCCCTTTCTCTCCTAGGTTCTGGACATTC CCTTGAAAAGTGGCCCAATTTATGGCAATTGTAGCACTCCACACTTCTCC CATTCGACTCTCCTCGCCTCTCATTCATTCTCCCACCGTTAGTTGGACCT TGTCCATTCCACTGACGGTCATGGCCGCCTCCTCTCCCATAACTTCTAAA CTGCCGACCACTAGGTCGAAACTTGCTATGGCCGCTATTTCGTCGATCTT CAGCCCTGATCTGAGCCTCCGAAAGTTTTGTAACAATGTCTTTCAGCGTG TCCATCGTTACATCCGATCTCGCAGTAGCAGCATCTGAGGGCTTGTAAGC CGTCAGATAGCACCTTCTCGCGAGATCCTCTGCCTCCCTGGCCGTCTTTG GCGATCCAAACACAACCATGTTCCTCATCTTTTCAGTCAGTCCTGATATG AAAAGATCCATGAGAAACGTGCCATCGTGTGAATCCAAAATCTGTCGGCG TAGTCCCCTACCGACTCTTTCTCTAACATCTTTATCCTTTCTAGGCTCGA AAGGGTAAAAACGGTTTTGAACTTTTCGAGGAAAAGCTTCAAAACGTTCT CCAAGCTTGTTTTATCCGTAGCCGGAAGGTCCTCGAGCCAACGCGCGGCC CTTCCCGCCACGTATACCGAGAGATATTCAAGGGACTCATTATCGTCCCA TATCTGAGCCTTAGCTAGAAGCCTAAACCGTTTCACAAAAGCCACTGGGT CCTCGTTATCGTTTCCCGAAAAAATAGCAACGCTAAACTTAGGGGCCGCT GGCCGTTTACTTTTTGAAACATATTTTAACGCGTTAGTAAGGCTCCTAAG AACCTCATCGTTTGGGAGTTCAGGTGTAGCGTCTTCGCGGGGCGCAATCC CTTCAGTATTCGCCATTATATAGTGGTCCTCTTCTAAGCTGTTGGGGGAG CTGGACCGTTCAAAACCTAGCAAGGGAGAAAAGCTAAGATCGTCGTTCAT GGGACGCTGTAACAAAACAGTTTCTTAATCTTTTTTATAAGATGCGNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTT TTTTTTTATTACGAGGAAGCGGTTGCTTTTGTGAATCACTTTTGGCCCTA ATCTCAACAACGTAAACCTACTATAATCGCTATCAACAACACACTATAAG TGGTACCTTGACGTCCTGGTTGTTCTTTTCCGTGTAGTCCCTGTGTCCGA TTGACAGGCTGGTATCGATTCCACCAATCAGATTTCGTCAACACCAAAAA AAACAACAACTAATAACTCCAGGTAAAAAAAATTTTCAAAAAAATTTCAA CGAAATAACCAATAAAAAACAACGAAAATTTCAAGGTCGATTCAGGTCAT TCTACTCCACTAATTTCAAATACTCTTATTCAGCATTCACTTTAATTTTT GTTCACTCACAGTCAATCATTCGCTTGTTGCACAAAAAACTTCATGGTTG GCCCAACAAACTCAGTAACTTTGCCTGTGTATAAACAAAAATTAAAGGGA TCGCTGTGAAACAATCTCAACACTCTTCTGTTATTCTGTTTGGTCATGAG CTAATCTTGTTCAACTTTCATCAATTCTATTTTTAGCTTGTTTATCATAC CAAACAGTGTTTCTATTTTCATGTACAGAACTGCGCATATTCTGTACAAC TAATTTTCTCTGCAAATTTGCAATTCGATTTTCTCCGAAATTTCTCGAAA ACCTAAATACGTATATCTACTAAACCTCCATCATGATTCCTATATATCTC ATTAAATTTCTATTATCCACCAACGTGACTGTTCCACGCTCGGGCGCTAA GCTATGGTCACACGTGGTCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC AGAGTAAAACACTTTCAAGTTTATTCAACCGTAACGAGGGCGTTACGGGC GTGGAAGGTGGTTTCTGGGCGTAGTACAGAGGCTATAGAATCGCCTCTGT ACATTTTTATTTCAAACGAGATAACAAGACGTAAGAGCAAACGATGCAGA TGAACGGGTCATCGAGAAATTGTTACTACCTACCAGTGCCAATAGGTAAC TCGACGTTCTGTGGATTGAAGAAAGAATGGTCGCCTCGTTTCAATCAGCC TTTATTGCTGGCAATGTCGATCATTCCTGTATCTTTGTATTGGATGTTTT TATTCGTATATCTCAAAGCTTTATACAGAATGTTGAAAAAGATGCACAGG AGGAGCGTATACCGCCATGTTGAAGTCGCAGAGCCTTTTTCAGTCTTCCA CCGTTATAAAATGTCGTACCCCGTGCTGCAACATATACGAAAAGCAGATA ATTGAAGTGAAATTATGGTACGTGGTTGTAATAACGGTGTTATTCAAATA TCTCTGGGACGCTATTGACATCACTTTAGATGTTTACATTTTTATCAATT GGAGCGAGGAGATGTTATTGATGAGGGAATATATCGAAACACTAGTGTCA ACAATGCCATATATATTTTTGCCTTGGTTGGATGTATTTGTAAAGTGTTC ACGTGGAGAATATTTAGACATATGTCAATCTTCCGTGAAAAGTCTTCGAG TATTCGATCGCCTTCGCAAGACGAAAAGTTTGATCTGTTACACATAGCAA GAATGAAAAACATGGTTTATGTAGCCAGTTTCATTTTTGAAGATGGTCCA GAGCTTCTATTGGAATACTTTTACATCGAAAAGTATGTGACGTCATTCAC TTGGGTTTTGCTGGTTAAAGATATTCTCCTTGGTATTTTCGCCATTATCA CTTGTATAACCACGCTCAAGTTTTTGCTGTATGGATATAATCAAGAAAAC CGCACGATTGTCTCATTTATTTGCTACGGTATTTTAGTCATGGCATTTAC CTTGTCATCCTTGCTAAGAGTTGGTGCCGCATGCTATCAGTATTTAACAA AGAAATTTAACAGATCTTGTTTTGTGGTATCTGAAGGGAAGATTGTACAG ACTCCCTTTGAACAAGGTTGCATGCGTGAGATCGATTACGTCATCGCTGC CCTGACTACAGTCCCGTTGGTCTTATTTGGATTAATCATCATTGTAAATT GTTGTTCAAGCATCATATCAGAATGTTTGTTTGAAGGCCATAACAAAATC CCTAGAGAGGGTTCACGCAAGAGGGTTATCACTGTTTCATTTTTCATGTA TATTCTCAGTCCTGCCGGTGGGTTTACAAACCTTGGTCAACAATCCTCAA AATTCTTCAATTATATATACGTCAAATTTGGATGCAAGATTTTTGATTGC TACAAGAAAAGAATGGATTCCACTGTACCAGCTCCTTGTGAGGAGTTTAC TTCTAATGCAGCCACCGTAAATCAATCGGAATTACACCACTTTGGTGAGG CAGCTTCCACCGAGAAAAATAATTCTTCGGTTTATTGCGACACTCGCCTT TGATTTATAGTCTTGAGTTAATGGAAAATTAGAAAGCATTTTTCTTGCTG CTGAATATAAGTGGAATCGACGCCTGTATTACGAATTGACGCATGTATTT ATAATTTAAGACAGATAGCTGATACGTCTGTATGGCCTCTCGAATTCCTT TTTAAAAATTAATTGT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026:653877..664742-

>TCONS_00003351 ID=TCONS_00003351|Name=TCONS_00003351|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=882bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026:653877..664742- (Clytia hemisphaerica)
ATGTCAATCTTCCGTGAAAAGTCTTCGAGTATTCGATCGCCTTCGCAAGA
CGAAAAGTTTGATCTGTTACACATAGCAAGAATGAAAAACATGGTTTATG
TAGCCAGTTTCATTTTTGAAGATGGTCCAGAGCTTCTATTGGAATACTTT
TACATCGAAAAGTATGTGACGTCATTCACTTGGGTTTTGCTGGTTAAAGA
TATTCTCCTTGGTATTTTCGCCATTATCACTTGTATAACCACGCTCAAGT
TTTTGCTGTATGGATATAATCAAGAAAACCGCACGATTGTCTCATTTATT
TGCTACGGTATTTTAGTCATGGCATTTACCTTGTCATCCTTGCTAAGAGT
TGGTGCCGCATGCTATCAGTATTTAACAAAGAAATTTAACAGATCTTGTT
TTGTGGTATCTGAAGGGAAGATTGTACAGACTCCCTTTGAACAAGGTTGC
ATGCGTGAGATCGATTACGTCATCGCTGCCCTGACTACAGTCCCGTTGGT
CTTATTTGGATTAATCATCATTGTAAATTGTTGTTCAAGCATCATATCAG
AATGTTTGTTTGAAGGCCATAACAAAATCCCTAGAGAGGGTTCACGCAAG
AGGGTTATCACTGTTTCATTTTTCATGTATATTCTCAGTCCTGCCGGTGG
GTTTACAAACCTTGGTCAACAATCCTCAAAATTCTTCAATTATATATACG
TCAAATTTGGATGCAAGATTTTTGATTGCTACAAGAAAAGAATGGATTCC
ACTGTACCAGCTCCTTGTGAGGAGTTTACTTCTAATGCAGCCACCGTAAA
TCAATCGGAATTACACCACTTTGGTGAGGCAGCTTCCACCGAGAAAAATA
ATTCTTCGGTTTATTGCGACACTCGCCTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001854XLOC_001854Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003351-proteinTCONS_00003351-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003351-exon-sc0000026-1575043694:664597..664742TCONS_00003351-exon-sc0000026-1575043694:664597..664742Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003351-exon-sc0000026-1575043694:653877..655490TCONS_00003351-exon-sc0000026-1575043694:653877..655490Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003351-exon-sc0000026-1510915933:664597..664742TCONS_00003351-exon-sc0000026-1510915933:664597..664742Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003351-exon-sc0000026-1510915933:653877..655490TCONS_00003351-exon-sc0000026-1510915933:653877..655490Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003351-exon-sc0000026-1491911889:664597..664742TCONS_00003351-exon-sc0000026-1491911889:664597..664742Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00003351-exon-sc0000026-1491911889:653877..655490TCONS_00003351-exon-sc0000026-1491911889:653877..655490Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000026supercontigsc0000026:653877..664742 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.38886 0.64687 0.880574 0.912181 4.04096 3.5101 2.20562 2.36772 1.00233 1.95782 1.85396 1.11208 1.93203 1.73786 2.26003 2.59262 0.978776 1.12642 2.38294 2.08646 0.375972 0.485433 0.026227 0.143065 1.57177 1.03016 0 0 0.101554 0.0258668
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00003351 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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