TCONS_00047805 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00047805
Unique Name	TCONS_00047805
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1173

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_136:353439..370821-

transcript sequence

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GCTGGTTATTCAGTTAGTCTACACGATACAGTCGAACAACAACTGAAAGA
TGCCATGATACTCATCAAAGCACAATTGgaagattttgaaaacaaaggaT
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tcaacGACACTTGATTTGAAAGAAGCTATGGATGGAGCATTCTTTTTGCA
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ATTGTACCATCCAAATTCACCCTCAATCTCAAGCATACAAAGAACTGTAT
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TTGCTGTTCATCGGAATAACGAGAAAGCAAAATTGTAAGAAATTTTGTAA
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attcgtattttttacttttttacgcTTTTGTAGGGTAGATTTTGATCATA
TTTAGTTAATGGTTAATTTTTNN

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transcript from alignment at scaffold_136:353439..370821-

Legend: exon

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>TCONS_00047805 ID=TCONS_00047805|Name=TCONS_00047805|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17383bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_136:353439..370821- (Clytia hemisphaerica)
TCTAGTGTACTAATAAAAAAATTAATTACACTAATAATATTCATAATGGC
TGAACCGAATGCTAAAAGAAGCAAGACTGACAGCAAAGGAAAAGTATGCT
TGGTAGGCAGGTAAGGATTAGATTTTTGAAGAAAAAAAATAGAGCTAGCA
TTAGTGGGTTTTCTACCTGAGGCCAAACGACCTAATTTTATTATTACCAA
AATTGTACTAATTTGTATGTAGTCCTGATACCTGAACGAGTTGTTTTGGG
ACATTCTTTGGATACTGACTTTAAAATCGTTGTATTGATTCGGCTTAAAT
AATGAATATTTCTGCCTAAACACGAGAAAAACAATATAGGGTCATTCCGA
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AAAAAACGGGTATGACATAACGCACTTCCTCTGGAATGGCCGTTTAGTGT
TTTGTGTAAGCTGTCTGTGATTTCAGTTCAATCTTTTATCTTTTTAGTGG
CATCGTTGGTCGAAGCTTTGCTGTCGTAAGTTTTCAGTTTTTTAAATACG
CATCATACTGCGCAACATTTTTTCATTGAGTTTTCTATATAATCATTTAG
GCATAAACTTTACACTAAATACAATTAGTTACGCCGTTTTCGAGGGTAGA
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CTAATAGTTTTTATGAATCTTAGCGCGGGAAAAAATACGGTATATTTTTT
AATATCCCCATGATGGCTTATGGGTATTGAAATTGCGAGAAGATGTGGGA
TAAAAGTCCCGTTTTTTTAAACTAAGAATGCGCTAAGTTATCATCGAAAT
CTTTTACTGGTTTTTGACTTATTGCATACCAGTGTCTCGAACAAACAAAA
CAGGATCTTATTTTCCATTTCAGATTTTTTCCAAAGCTGGTTATTCAGTT
AGTCTACACGATACAGTCGAACAACAACTGAAAGATGCCATGATACTCAT
CAAAGCACAATTGGAAGATTTTGAAAACAAAGGATTACTGAAAGATTGTA
TTCACAAAACTGCTGACGCTGCATTTTCAATGATTTCAACGACACTTGAT
TTGAAAGAAGCTATGGATGGAGCATTCTTTTTGCAGGTATATTTTTATTG
TCATAAGTATGATAAAAAACTCATTTTTCTTTTTTAACACTTAATTTAAT
TCATTGTCAGAGTTCGATGGATGAAAGAAACTCATCTTCAACTCCAAGAT
ATCAATGGGGTAGAGGTACCCTACCCGACGTTAACCTCTCCCTCCAAGAA
GGGGAATATCGCGTGAAGGATTATTCGTGAAGCCTTCTTTTTCTGGTCAA
AGTAGATCACTTTTCTGACTTTCCTTGTACTGCTAAAATGGAAATTATGC
GTGATCGCTTTCTCATTTTTAGACTAATTTAGCGTGGTCTTTGGGTGTTA
TTTGGCTTGATTATTCCACACTTTCTCCTTTTTTCATTTTGTAGGAAAAT
GTGCCAGAGAACCTTGAATTGAAACAGAAAATCTTTAAAGAATTTGACGC
ATTGGCATCAAAGGATATGATCCTCAGCTCCTCAACTTCGGCTATCGTGC
CATCAAAATTCACCCTCAATCTCAAACATACAAAGAACTGTCTTGTCTCG
CACCCTGTAAGTGTATCTTACATAATCCTTTTGCACACCCCTGTGTCAAT
GAATCAAATAAGTTTTTTTAAGGTATTGACAATGAAATGAAAGTTTAAAT
TCAAATTTCTAATAGTAGGGGGAAACCCTTAGGAACCGTGACGTAACTCT
TGTAAATCGACTGAAAATGACATCAAAACTCAATTTCGACGTTAATTTTA
TCGAGATAGATCGGGAAATATCCACTTAAAGGTTTTATTTTTTTCATAAG
TGTTCCGTTTCATATCAGGACAGTGTCTGCTTATTGTTATATTATGCTGA
TATAAGCAAAAAGTTGTTGTTCTTTTCCTCTTTCTGACCAATCTTGCTCC
ACATCCGTGTCAAACTAATGTGAAAGAGCTTGTGATTTAAAATTGATGAG
TAAGCAAACGATGTCACTCTTATTTAAAAACAAAACCTTTAAAAGTCCTC
TATATCGTTTTTGAGAGCTTTCGATTGGCATAAGTGGTTTTGGGTTTTAT
TGACTTTGAAATGTCGTCAAATTTTTGGAGGTTTTGGGGTTTTGCCTGTG
ACGTCATTTTTTGGGTCCTAAAAAAGTTTCCTTGCATGGCCGAAACCCCC
CTCGCGAAAAGATCTAAAGATATTATATTCTTTGAAATGGACCAGGTATG
ATTGCGTCGCATAAAAGATGTCACGGGTCCTAAAGGGTTTGCCCACTACT
ATAACAAGCATAATGCCCTTTTTAATACAATAATTTAATGGGAGTATCCC
AAAGTCAATTTCAAATATCCAAAATTTATTGAAATTTATCGAAATTTATC
GGCTAAGATGTTACGTTGATCATTCTAGAAAGTGGTTAGAATGTGAAAAT
CACCGAGTTTAAAGCCCCGAATAGGCTAGAGAGGAATCTCGAAAACAAGA
AAAAGTGAAGCCTTAAGTTTGCCCCACATTTAGAAATTTTGTTTGAAAAA
CACACGGGTCACGTATTCTGGATGGGAAATAAGTGGCTTCATTTCCCATC
CAGGAGTTTCGGATCTAGCCCCTTCGGGTCTTTAAAATCAATGGTGAAAA
TATCTGTTTATCTTTTATCAAGAGGAATTTTCGAGCCAGTGAGAATGATA
TGAAAGTTATAAATTTTTAATAAGTGTTAACAATGAAAACGTGAAAATAT
CTGTTTATCCTTTCTCCATAGATAAATCCACCAGCATTGTGCCCGTTCAT
TGAGATTCTTCCTTCACCAGAAACTGACCAGGTAATTTCCGAATCCCTTT
TTTCAAATATAAACGTTGCGAAGATCAACTGACATAATAAATCTTTAATT
ATTTTCTCTGCTACAAATGAAAATGTCTAATGTTACAAAGATAAGAAACA
GTGGAATCTCCATAACTAACAAATCTGTCCGAGTTGAGGAGACATTCAAG
TTATAGAGTTTCGAGTTAAAGTGACGCCACCGTTTTTTTTTTGGTGACCT
TTATTTTGCCTTTTTCGTGTAAAAGAGGAAACAATAAGTCTCAACTTTCT
GAATATTATGATGAAAATTGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTGT
TCCTTAAGTGATTATCTGGGGATTTTTTTTTCATTTTTCAGAAACTTTTA
TTTTTGGTGCCTGGGGTCAAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTG
GGGCAGCAATCTGGATCAGGCTGAAATTTTGGACACACTTGTTCCTTGTG
GATGAATGAATGAATATCTGGGGGTCTACAATTGGGCCTATAAATAATTT
AAAGCTACTGAAGTTGAGATTGGCCCGTTTGAAAAAGGATATCTCCCATT
CATAGGAAGTAGTTGAGAAGACTTTATCTCTATGGCGTAAATGTGGAATG
TCACCGATCACTGTCAAAAAAGAAGTAGCTGGCTTTGTCCTCAATCGATT
ACAATACGCTTTGATGGGTGAAGCCTACCGCCTTGTCGAGGTAAGTTTTT
CAATTTCTTTTTTTTTTCATTTCTCAGTTTCCGTTTCAATTGTTTAAAAA
CTCCCAGCTGGCACACAATGTTATTTTAACGTTCATCTAACGTTATGTGG
ACGTTGTGAACGTTAGATAAACGTTGTGTGCCAGCAGCTGGGCTATTAAG
TTATTCTGTAGTCAGGGTAAAACTTCATGCTATCGCTATTTTTTCACATT
GTCTGGCTATCTATTATTCCGATGCCGGATTGGCGGCCGCCCACGTCACA
TTAAAGTTCTAAAGGAGTGACCCAATTTCCCATCAGAGAGAGAAAATAAA
CGGCCTTTGATGTGCCGCATCCCCAGTTGGGTTCAACTACCCTTGCACGT
AAATCTGAAAATATTTCAGTTGGACTCGCCAATCCCCGCAAACGAGGACT
TTGGTCTAGATATCCCGCTGCAAAATCCTTGACGCGGTCTTGCAAAATTC
CGTAATATAAACCTTCCAGATATTGGAAATTTTCCCGAGCTTCAGAGCTT
TAGCTTGTCGGATAAAGATTTCTGCATCTGGGTGCCAAATAAGGTGTCTG
GCTTAAAAGCGAAAGGTTATCGGTGGAAAAAATATTTTTGTCGTGTGCGT
GGTGCTTCAAATTAGCAATAAGAAAACCTCAAACCTAGTGACAGATCATC
ACAGTGGAAACCTGAGGAAATTATGACAGCTTCATTATCAATAAGACTGA
CAAAGATAACAAAGTTAGTAAACTCTTACATTATGTAACGTACACCAAAC
TCCTTAGAAGGTTCAATATTTTTTTATGGAGGAGCTATTCCATCAAAAGA
ACTTTATAATCGCTCGCCCAATGAAACTTCAAAAAAAACCTCGTAAAAAA
ACTTGCTTAAGAGCAATGAAACTCGAATTCGAAAACAAAAAATTTCCAGA
ACAGCTGACAATATTGAAGGTCGTAAAATGATAAATGCAAAGTAAAAATT
TAATCTTCATCAAAAATAAGAACAGAACAAAAACAACCTAAAGCTCTTGT
AATTTGATAACTAAAGTCTGTATTTTGATTACTTTTCAAGTTGGTTCAGG
CATAAGATTGAGCGAAGGTTGAGAGATGTTAATTGTTTATTATTTGTTAT
GTCCTTTGTAACTATGCCAACGATGAAACTCCCTCTCCCGTTCAACTTCT
GAGTTAACATTGATGATAGTGTTCTAGAATTTTGAAATTAATTTTCCAAT
CAGTTTTGCCAGTGACAATCAAATCCATCTAACAAAGCAAACATCAAAAC
TTTTCAAAGCGTTTACAAGTTCTTAACCTTTTTTCAGGTTGCAAGTTTAT
CTTCTTAATCTTAAAATAATGTTTCTTTTTATTTAAGTCAGTTTTTTTTG
AAAAATATTAAAAATGACCGATTTTCCCCAGGAATGGTCATGGCTTAAAC
GAAGATTGCACATTAAAAATATTTTAATAATTAATCATGTCATCAATGTT
GTTAATTAAGTTAGTTAATGAGCTTTTATCAATGATTGAATGAATTTAAT
ACCTCTTTTCGAAGGTGCATTTTAACTTTGAAAGACTTTCAACAGCTACT
AAATTTTATGATAAACTACTAAATTTGGAAGAATGAATACACTTTTTTAT
AAGAACAATTTCATAAGAACACGAGGCTGAAAATTGGTAAAAACCTAAGA
ACAAATTAAGAACAATCCTCAGACTTCAGAGACTATAGAAAATACTGATT
TTAACAGATTTTAATCCCCATTTTAAGTAAAGAAACTAAGCGTTTTAAGA
ACATGGTAAGAACATTTTAGCCTGAAAAATTACAAAATAAAAACTAAGAA
CAGCCCAGCCTGAGCCAAAGTTAAACTGGTTCTTATAGAAAAAGCGTGTA
ATTCAGTTTCAGTGGGAGTCAGCAAACATTCAAAGTCTATTTTTTATTCA
CCTGACATATTAAAACAATGTAACTGATTTTCAAATAATCAAGGAAGGTC
ACAGGTGATTGAATCCAGTTCAAAATATTCATTTAGCTAAATTAAAAAAT
AATTATTTTGATGACAAACATTAAAAATTGAACAAATTCGTTTTCGAATA
AGAGGGAACGAGAAAGCGTTTCTTTGATATTGAAAAGATTAAAATTGAAA
TGTTTCCATAAAGAGAATACCTACACGTTTTTTATAAGAACATCCAAATA
TTTCGAAGCCTCCGGATGTTTTTAACTTTTTGCTAGTTTTAAGGCTAAAA
ATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCAGTATTTTTGTCCATTTTGCTAAGA
AATCGGGTGTTTTAGAGTAAGAAACTTTTGTTTTACATTTTAACAAATTT
AATTTACACAAATAAACGTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATA
AGGCTTCGATGGCCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAAGCT
TTGGAGACTCTAAAATACCCAATTTCTTAGGAAAATGGACAAAATGTCCA
CAAAATGGTGAAAATAAGAACATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTAAAACT
AAAAACTGTTTTTTGTGTAGAATTTTCAATTGAGTGCGAATTTATAATGG
AGAGTTATTAATCTAAATCGACGATGTTCATATGTTCATGTTTGTTTGCT
CCTTGTTTGCTCCTCTGTGTACTCATATCATTTTTCCACATTAACTATTT
CATTTTCATTTGCGGTCGATCGTTTTCCGAGAATTTGAGCGTGTGGTCCA
TGAGCACCTTTAGTGACGTCAAAAGCGGCTTGGTCATCAAAGGGAGCCGA
ATGAGCGGCGCAACCAACATCAAGTTCGGGTGCTTGATGCGGCATCGATC
GAACATCATCCTCTCTAACACCATGTGCACCATAACAAGCATGATCTTCA
AATGGATCTTGATGTGCGCATGTCCGAGCATCATCATCCAAATTTCGGAC
ACCTTGGTTACCTAGCAACGGTTCATTCTCGTTGATTTTTGGTTGACAAC
GTTTTAACATTTGAAGACATTTGTTGGATAAATTGTCCATGAATTCGAAA
TATGATTTTCTCAAATTTTTATCAACGAGGATGGTGATTATCAAGCTGAC
CATTGGGAAAAGCAACATTGTTGATAGTTGTGGAATTGGAACCGAGAAAT
CAGTGTATTCATAATAGTTTTGGTAAAAATCGATGTCAAAGCCTAAATCA
CAGAGTAAAGTGTTCATTGTGGTTGCCACTAAAGAGAACCACACAGTATG
GTGTTGAAGTTTATTCCCGTACGGTCGATTTCTTGATCCGATAAGAATCA
TCAAAAGAAAGGATAAAACTGTTAGTATAATTATTCCTATGGCCATGTAG
TTTAATCCTACATTAAAGTCATCTCCTTGATGTTCAATGAGTATAGGGAT
GCCAAACGTGATAAAGAAAAATAGTGATTTGAGGAAAAGATGTATTTTGT
ATGTGCCTGTCGGATGGAAAGTCAGAAAATATCTCATAGCTATGTATGAG
ATGCAACTTATTTGTTGACTCAGTGTGATGCCTTTTGTGAAATGGTTTAC
AATGGTTTGATATTGCTCAAAAAAATAAGTATTGACACGTTTCCCCTCCT
CGATATATGGTGGAAGTGGTCTGAGGTAGATATACGATACATAAAAAACC
ATATCAAGCGCGTAAGACACCAATTGAAAAATCAAAGTTTGTTGATATAA
AAAGATGGCTGATTTTTCGATGTACGTTGATCGTTGAAGTAATCCAATCA
ATAAAACATGCCAAAATAATGTCCAAAAACATACGAATCCCAAAATTATA
GCATTTTTTCTCGCCTCTGAGGGCATTATCTCTGTCCATTGGTTTTGGAC
CCCCGTATCCGGGAATGTTTGATGATTATATTCTGTTTTAATTGAAACTC
CATAAGCATGATTTATCCAGATGCAAAAATATATGAGAAACAGTAAGGTA
AGGAAAAATATAAGTGAGCCGACAGATAATACCCTCATGTTGACGATGGA
TGTTCCAAATGTGTCTATTTGAATGTTGCTTTGAGCGATTTCTTATTTCT
ACTGTTAAGACTTCTTTTAGTAAACAAAAGTTCTTGTTGAGTTTGTTTAC
CCAAGGTAATATGAGCGACTATTTGATATGATATGATATTTCGACAAAAT
TGTACTTTATAAAATTTTGTTTACGTTAATTGAACACATATGATGATTTT
TACTTTAGTATTAAATAACATTTAGAAATGGCACATATTTTTGGTAAAAT
TATCATCTTCGTTTCTTTGTTGTTTTTTATTTATTTTTGTGTTTGGGTCA
GTGTAGCAAAAACTGTTACCCTGAAAACATCACGCAGTCAAACAACCTAT
ATAATTATAAGGCAATGGACAGAAATTGATCCATTACATGCAAGAGTTAA
TGCAATATCATTGGGACTCGTATGTTTATGGACATTATTTTGGCATGTTT
TATTGATTGGATTACTTCAACGATCAAGGTACATCGAAAAATCAGCCATC
TTTTTATATCAACAAACTTTGATCATACAAATAATTGGGTACACCTTTCC
AATGACTTTTGTTTTCTATATATTTGTTTCTACATTCAGGGAATTCAATG
ACGTCAAGTGGTTGTTTAATAACTGGAAACTCGTTTTCTCTGCTTTTACA
ATGATTTTCGTTCAACAGCTACACAGCCTCCTTTACATACTTCTACGATA
TATTTTAACTTATTATCGCAATGGGACCATTAACATATTACTCAGATACA
AACTATTGTACTTTTTCGCAACACTAGCACTACCTATCATTGCATATTAC
CACCCAATCTACAACGTTAATCTTTTAGTGGCCGCTGGTTTAACTTTCAG
TTCCATCGCTGTTATATCGTTTCTGGTGATGATAGCTTTTGCTTCCAGAT
ATCGATTTCAAGGCAATAAGCTTCGTCCTCACACTGTATGGTTCTTCTTC
ATCATTACTGTATCATTATTCATTTTCGTCAATATGGTGTCAGATGTGAG
AGCTACTTTCAACCCAGTTGTTGATTTCTTCAAGGGACAACCTAATCTAT
ATTTGTGTGCAACACTCATTTGTCCAATGGTCAGCTCAGTAATCACAATT
CTCATCGACAAAAATTTGAGAAAATCATATTTCGAATTCATGGACAATTT
ATCCAACAAATGTCTTCAACTGTTAAAACGTTGTCAACCAAAAAACAACG
AGAATGAACCATTGCTAGGTAACCAAGGTGTCCGAAATTTGGATGATGAA
GCTCGGGCATGCGCACATCAAGATCCATTCAAAGATCNCAACGAGAATGA
ACCGTTGCTAGGTAACCAAGGTGTCCGAAATTTGGATGATGAAGCTCGGA
CATGCGCACATCAAGATCCATTTGAAGATCATGCTTGTTATGGTGCACAT
GGTGTTAGAGAAGATGATGTTCGATCGATGCCGCATCAAGCACCCGAACT
TGATGTTGGTTGCGCCGCTCATTCGGCTCCTTTTGATGACCAAGCCGCTT
TTGACGTCACTAAAGGTGCTCATGGACCACACGCTCAAATTCTCGGAAAA
CGATCGAAAGAAGATGAAAATGGAGAAGGGAATTAAACTTTGAATTATTC
CTACTTGAATCAAAGAACCTTTTTGGTTGAATGATGGTTATCTGAGAATA
CTGATTTTAAAGATTATGTTTTTATTATAATTTACTCAAAGATTACGTCT
CTGAAGTTTTAAACTTCTTTTTTAGTCGCGAGTACAATATCTTGTTGTTG
TTTTTTTTACTTTAAAAAAATTATTACATTACATCACCTGTGCATCGATC
AGCAACTCTGAAAAGTTTTATTTTTCACAATAATCTTGAAGTTTATAGTC
ATACAAAGAATTTGATGAAAAATACTGAATTGATCCAATCCTTAATAATT
TGAAAAGCATTGAGATGTAGTTGTCTTTGTCACTAATCATTGGCTCCCAG
TCCAAACCCCCCCCCTTCCATTCCATTTTACCTTTGGCTCATAAGATATT
CGAAAAACTTTCTAAAATTCCTAGGATTCGATGTCCACTCCCTTTCTTTA
TAAGAACCAGTAAGTTTCTGTCAAGGCTCACTTGTCCTTAATTTTTGGCT
CTTTTAGCTTCAATTCTTTTCTTAAATTCTGTCCTTATTTTTAGTGTAAA
ATTGAGGTATTTCAGACCTTTTATCAAATTTTTAATATCGACCTTTATTT
GCTAAATATTCAGCAATCCATGGAATGACCCCCCCCAGCCCGCAGGGGGG
GGGGCTACAAACAAAATCTTCCTGAAAAAGGCTGGGGCTGGATTTTTTTT
TAATTTCAGGGGGTACCTATGATCTCTGGGGGTATCTAACTTTTATACAG
TAAGGTCTGGGGGCTGGGGAACTATATTTTATATCTTGCTTTTATCTAAC
TATCATTATTCTTTTTAATTATAAAAATATACAATTTTTTCATTTCTTGA
CATATACTCAAGTCACAGGGGTTACCAATCACAGGGGTTACCTACTAACG
TCTGTTGTTTGGGGGTACCTAAAATTCAGGGGGTACCTATTTTCTTAGGA
GGTACCTAAACTCCTGGTCCATGTCATGGCCAGGCTCAACTTTGCTCTTA
AAAATAGCTCTTATTATTTGTCATTTAATTCTCATTGTTCTTATAGAATT
GTTCTTAAATAGAGTTTCGTTTACGCTCTTAACGTTTTTATTCTTACATA
AGTGTTCCCGTTTCATATCAGGACAGTGCCTCTCCATTGTTATATTATGC
TGATATAAGCATAAACATATTTGTCTTCTCCTATTTCTGACCAACTTTAA
TGATACGTGGTTCGCACAATGTTTACATTTTACTACTTTTATGTCCCTTT
AACGGTTTTCTAGATTTTTTGAAACTCATTGCCTCTTGTTTCCATAAGAA
GCGCCCATCTAAGACATATCTTTATGTCATTCTAGATCTTGAATCCAAAA
ACACATTCCTTAACCTTTTTGCTTTTTGCTGTTTTTCGAAATACAGCTTA
TAAAATTAGTTTTTGAAGGACTCCTGTGTATTGTCGTTCAAAATAGTGCT
GCATAACTGTGTAGAGCGAATTTATAAATTTATTTCAAGATTCAAAGTTA
AAAAAGTTTCCTACCTTACGGCAATCATCAAATACTTTTTTTCAGAACAC
TCTGTATGTTTTCTTTGTTTCAATCTTTCATAGAATGGCGTTTGTTCACC
TGAAGATGTCAACACAACATTAACAGATGGACTCGCTATGAGATGGTCTC
TCATTGGCCCATTCGAAACAATACATCTCAATGCCCCTAAAGGTAGGCGA
TAATTGTCCATCATAGATACCATTCGATATCTCTTATGAAGCTGACCGCT
AGGAGCCAGTGTTTACGCGACCTGATAAAACGCTAGAGTCAACAATGTAA
ATCAAACAGAATCAAAAATAGCGAAATTGAAGAACACGTTAATACACGGG
TTGCTAAATTATATCAATGCAGTCAAAACATGTGATTACTCGAAAAAGTT
CACGTGATTTTATTCCCATACTTGCTTTACAACTTGAAGCTGATAACTTC
ATTCGTGTCAATAAATTCGAACTAATCAGAAATAAATGTCATGTAAAAAG
CGTGATTTGTCTTCGGACTTTAATTTTGCAACCTGTGTATTGAGGTATAA
CTTAAATTCACTTACCGAACAAACTTTTTTGTTGTTTGGAACAGAAATTC
GAAAAATATGTTTTTTACATATACCCTTCCCCTTATAGGCGTCAAAGATT
ATTTCGAGCGTTACACAGCCAGTATGGAGCCCATCATACAAGAACAAACA
GAATCCAATACAGTCTTCAAACAAGAAACAATTGATAAAATCCACGAATC
GATGTGTCGTATCGCACCTGTCGAATCGATCATCGAACGATCGAAACTTC
GAGATTCACGACTATCCGCACTCGCTGTTCATCGGAATAGCGAGAAAGCG
GGCATCGTTGTACCGACAACCGTCGGCAATACGATGAGCAACGAAGGAAC
AAAAGTGGAAAGTAAAGGCAAAATTTGCATCGTCGGAAGGTTACGATTCT
ATTAACTCGTATTCTTTTACTTAACATCTCAAACTTAAAGTCAATAATAA
TACCTTAAACTTCAACATGATTTGACAAATACGTTAAAGTTATGGAGCCT
TAGTTAAGCTTATTCTGAGCTCCACACAGGACTGAGCTGTGAGCTGGTCC
CCAATGGTCTTACAAATGGAGGCCATTTTACATAAGTTACAAGAAAATAG
CAATGCAAGTTCATCTTTTCATTATGATTTGGCCAAAATAGACCAAAAAT
CATCCTTTCCCTAAAATATCTCCAGATAGGTAAAGAGACCCTGAAGTTGA
TTTTGAACACTGCAATGGCTTCTTTGCGGGTACCACTCTAAGTACCACAA
AGAGACTCTGGTCAAAGATTTTGGGCTGCCGAGTGAGAAACTACCTCTAG
GATTTATAAAAAGCACTATATGATTATACCTGATGGCGAGTGAAAATGAG
TTTGAGGTCTTTTAAAACTTAGGCCAAAAAGTTTGTTCTGGATTCTCATT
TCATTTTAATATTTCTTATAGTGGATTGGTCGGCCGAAGTTTCGCTGTGG
TAAGTATAGATCGACAATTCCTCAAAAGCTTATTATCATCCTTTTCCCTA
TTAACAGATTATCACTTTAAAAACCATGGAGAGGGTTACTGACCAAGATA
CTCAGCAGATTTCCTCTTGCCTTTGTAATGGCGATAACAGTTGCTCAAAA
CATTCGATTTTACTTTCAAATGAAATAACAGTAAATGGTCTTTTCCAAAT
AAAATTTCCAACCGTTGGCGGCTGGAAATGCCAAAACCCCCTGAATTTCA
GGCTCAAACCCTTTTGAATTCTGAATTTTTGTAGGATTTTAAAAGTCAAT
GGAATTCCAGTTATTTTTGACAGACTTTTGTATATCCCTATGGAATTCTG
CCACAACCTTACTTACCCCCTTGAAACTGAAATGGATCTCCTCAAGCGGT
TTTTTTTCTTGAAAAGCCCCATAAACATTCAATGGAACTTTTTGATTTTA
TTTCTTTTTAGATATTTTCCAAGGCTGGTTACTCAGTCTGTCTATACGAC
AACGTTGAAAAACAACTGAAGGAGGCCATGATTCTAATCAAAGCCAATCT
TGACGATTTCGAAAATAAAGGATTATTAAAATACACGGCTGTCAAAACTG
CTGACGATGCATTTAGTTTCGTCTCCACAGCAACAGACTTGAAAGAAGCA
ATGAATGGAGCGTTCTTTTTGCAGGTATGTCTCAACGAAGAATGTTTTCT
TGTTTTCTATACTATATGAATAGATTTTGGATTTCCTCCAAATTTTCATA
GAAGTCTTGGGGCCCTCCCGGAAATAATAACTTTCTTGAAATTAGAATGA
TTGATTGACTAATACATTGATCCAGAGATCCTTGTAACACAAAGTCTTCC
TAGAGATGAACGCATTTTTACGGGGAAATTCTTGCCAAAAAGTGCCTAAA
AAAGTTTTTTGGACTTTGTGTGGGAAATTGCTTCATTAGTTTTTTCTGAC
TTTATGCATAAAGATGGAGGGCAAGGTTCTCTAAAAGGCTGAAGCAGTTT
TTTCGGAAAATCTTTTTTGGCCGTAAAAATCGGATTTTCTTATTTGGGGA
AGTTCCCTTTTGTCATATTTTCATCTGATTCTTATCATCGGGTAGGTCCA
TTCAGCATGTTGCTTGTTGTTTGTGAGATTGAAAAACCTATTTTTGTGTA
CTCTAAATTCATAGGAAAGTGTTCCAGAGAACCTTGAATTGAAACAGAAA
GTCTTCAAAGAATTCGACGCATTAGCATCAGATGATATGATCCTCAGTTC
GTCTACTTCATGCATTGTACCATCCAAATTCACCCTCAATCTCAAGCATA
CAAAGAACTGTATAGTCTCTCATCCGGTAAGTAGAGAAGTCATGTTTGGT
TATAAGTTACCGATTTCTACCATTTCTGAAACCATACGTTTGAATCTATA
GAGGCGATCCCTTACTCAAATCGATTTTCATCAATAACAGTGGAAAATTG
CATTGCGATGCATCCTCTCACATCATGAATTACTGTTTGTGTTGATTTGA
TTTGAATGAAAATTATTGACAACCGAAAAGATTAAAGGCCCAAGTCTTGA
TTATGAAATTGGAGGGTTCAAAAATATATGAACTAAGGAAGCGCAACCAT
GGTTTTGGTGGACTAGAAAAGAATTTCGATTTTGACCTACTCATATGTTT
TAAAATGGCCCTATTTTAGACTGATTTTCCCCCGAATTGAAAAAAAGGAA
GACATTAATGAAGATTGATTTTACAACCTGTTAATCATTCCATATATCAA
TCTTCTTGAAAAAACATGCTCAATGCATATAAGAATTTATTTATTTCTTT
ACAACAGGTCAATCCACCAGCGTTGTGCCCTTTCTTGGAGGTCGTGCCAT
CTACTGAAACCAACCAGGTACCTTCATAATGATCCCTTTAAACTTAACCT
AATCTAGAAATGGTCATCATTTTCTTACGGGTACGGTTAACCTCTGTAGG
CGCTTGAAAATAAACCATTTGAGGAAAATAGTCAATTTTATAACGAGGAT
CTTGTCCCGCGCCGGAGCAGATGTTTTTTCGTTAACTGAAGAAGACCTGA
TTTAACGGCCGAATACCTGAAACTGTAGTTTTCGCTAATGTAAAGGCCGA
CTGCTTGCAACTTCGGCTGAATACCTGAATTTTCTCAATTGGTATAATTC
ACTAGCGGTCGAATACCTGATTGGACGACCGAGGATCTAAAAAGCTTTGT
TGTTTTCTGTCACTCGAATTATTATCAACCGACCGAGTACTTGATGAATT
CTAATAAATTACACTAATCAAGAATATTCAGGTATTCGGTCGCATTTGTA
GTTATTCGTAGATTTGCGAAAGCCGCAGTTTCAGGTATTCGGTCGTTAAA
TCAGGTCTTCGTTCGTTGACGGAAAAAAATCCACCTGGCTGGTATGGTAT
ATATTTTTTTCGATATGGACATCTATTACTTCTTCCGAAAGATCTCCCCT
CCAAAAGTCTTGACCAGGAAAATTGTTGAGCAGTGTTGAGACATTTTTGT
TTTGACCCTATTTTTTGCTATTGCATTATTACAACATTGAATTCTACATT
AGTCTATTTTCATTCTAAGCAATTAAATTTTTTATTGAATTCACAGGAAG
TAGTTGAGAAGACTTTATCGCTCTGGCGTGAATGTGGAATGTCACCGATC
ACTGTCAAAAAAGAAGTCGCTGGCTTTGTTCTCAATCGATTACAATACGC
GCTGTTAGCCGAATCTTATCGACTTGTGGAGGTAAAAAATATGTAGTACA
TTTTTCATATGGTACCCTATTTTTAAACACAATCACGTAACTCTGTTGTC
ATTTGATTTAACGAAGCGCGCTCTTTGCAAAATCAAGATAGCTTATTCAC
CGCAGATAGTTTAGTTTCACGCATTCCTTTACAGCTTCAGCGTTGTGTGC
AAAAAACAATGACAATCTGATTACAGGTCACTTAAACTAAACTGTGCATC
TTCCGATCTAAGAGACATAGGCTAAATTAAGAGTAAAGTAAGGATCTATG
ATAATAGTCCGTGGGGTGGAAATTTTGTTTAGCTTTTTTTGAACGAATAT
TGCTTATAGTAGAGAAATTTTCGAGAGGAGGTTTATGGCCTAAAGATTGA
CGTTACAGGTAAATTGCAAGGGAATAAGTGCATAACAATCGATTTCAATT
TCTCGATTTATTTAAAAAAAAGCTACCGAGAAACAATTTACTCTCTGTTT
TAGATGCAAATACCCTGTGTCAGGGTTAATAAAAAAACTTTTTAATCGCT
CAAAAAGTTGCTAAATACTATTGATTGGGAATTTCTTTGTGGGGGGGGGG
GGGGGTTTTGGGTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGCGTACTAGGTTC
CTTGTATGACGTGTGGGTGGATGTTATCCGAGCTTTAAAGTCGGAAATTT
TTTCGGTCAAAAATCAAAGCAAAAAAACTTCGTGACCCTTACTGAGACTT
TTTAAGGTCAAAAATAGATATTTCCTTTTTTTGTTTGGAATTAGATTATG
ATTTTTAGACCTTTAATGGGAAGGTCCTAAAAGGTACCTTTAAGTGCTCT
AATACTGCACACTCAGTATAGATACCATAGATATTTACCATCAGTGATCG
TACACTCACAGTTTTTAAGTTAAGTTTTTCCTAACGACCTAACCCTTTTG
GAGTCTTTTTTTCAAAAATAAGTGGGAGGTATTTTTGTAAGCATTTTCTG
AAGAGCATTCCACCATCGTATCAAATGCAACTTCCATGCGTATAAAATAA
AGGTTTGTTTTGATGTGCTAAAAACACCCCTGTGTCACAGATCCGCTGGA
AGCCTCAGCCACGCTGGAAAATCNAGCGCGCTCTTTGCAAAATCAAGAAA
GCTTATTTACCGCAGCCACGCTGGAAAATCTGGCAAAAATTTCGTCCCCG
GTAGGAAAATACCCTGGAATTTTAGCCCCACTGGGAAATTGACTTATATT
TCATTCCCACTGAATTTTTTAACCTTTGAACAATATAGTTTCTATCCCCA
TTGGGATTTCAATAGGAATTTTTATCCCCACTGAGGAAAAAAGTTCCACC
GGAGCTGTGAGACAGAGATGTTAAAAAGAATTTGGGCGAACAATGAATAA
TTCATCCACAGTTAACATTATTTGATCTTTCAGAATGACGTTTGCACCCC
TGATGACGTAAATATCACTCTTACAGATGGTCTTGCAATGCGCTGGTCGT
TGATTGGTCCATTCGAAACTGGCCACCTCAATGCACCAAAGGGTAAGATG
GTTAACTAGATTTCCATAATGCCTAACTGACCATGTCCGGACTTTACGGT
TTAGCATTGATTCGGTACGGGTTTTCCTAAGGAATCGTTTTGCTTTGTAA
CATCATCTTTTTTGATGTTTCAATATTTTTTGTGTCAACACAGCGTAACT
TTTCCATGGACTCTTTTTTCATTCTTAGTTTAGGCCATTTGTAAGCTTTC
TTGCTAATTTTGGTCATTGTTCAATTGTTTCTACCCAAGTGATAGGTCCA
TATAGATTCAGCGACATGTCAACTAAAATTAGCCAAATCTATAGTTGGCT
TTTGTTGATCCTGGGGCCTTCCTAAAATCTCTTTATGAGATTTAATTATT
GAGTTAAGGCCATTTGCAAACATTTTGGCTCATTTGGGTTAGTGTATAAT
TGTTCTTAGCAAAAAAAGTAAAAAACGCTAAATCTGTAATTTGACTGTGT
TGATCGTGCGACCTTCCTTATAGCAAGCTTTTTGGCGCATTTGGTCTGAA
TGATTTTAAGATCACCTTTTTGTTCAGGTATCAAAGATTACTATGAGCGA
TATGGGCCACCAACGGAAGCCGTTCTAAAGGAACAATCAGAAACCGTTCT
CAAGTTTAAACAAGAAACGATTGATAAAATCCACGAATCGATGTGTCGCA
TCGCACCCGTCGAATCGATCATCGAACGATCGAAACTTCGAGATTCACGA
CTCTCCGCACTTGCTGTTCATCGGAATAACGAGAAAGCAAAATTGTAAGA
AATTTTGTAACGGAGTTTTGATAACTTTTGATTTTGATAATGGTTTTTAA
TAGCAAGGTAATTCGTATTTTTTACTTTTTTACGCTTTTGTAGGGTAGAT
TTTGATCATATTTAGTTAATGGTTAATTTTTNN

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_030419	XLOC_030419	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_136	supercontig	scaffold_136:353439..370821 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
16.9383	12.1124	15.8482	15.2585	4.76956	3.72989	3.58197	6.15247	8.5922	5.44067	12.8934	11.1276	10.0699	8.74009	14.7418	16.6532	14.4546	17.466	2.02027	2.49656	10.1963	13.9372	12.795	10.9845	1.93145	0	9.68188	7.94853	4.41011	6.74162

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00047805 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CRYL1 (Lambda-crystallin homolog OS=Homo sapiens GN=CRYL1 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 266.544 bits (680), Expect = 1.268e-85
Identity = 131/312 (41.99%), Postives = 209/312 (66.99%), Query Frame = 1

Query:   76 TDSKGKVCLVGSGIVGRSFAVIFSKAGYSVSLHDTVEQQLKDAMILIKAQLEDFENKGLLKDCIHKTADAAFSMISTTLDLKEAMDGAFFLQESVPENLELKQKVFKEFDALASDDMILSSSTSCIVPSKFTLNLKHTKNCIVSHPVNPPALCPFLEVVPSTETNQEVVEKTLSLWRECGMSPITVKKEVAGFVLNRLQYALLAESYRLVENDVCTPDDVNITLTDGLAMRWSLIGPFETGHLNAPKGIKDYYERYGPPTEAVLKEQSETVLKFKQETIDKIHESMCRIAP--VESIIERSKLRDSRLSALA 1005
            + + G V +VGSG++GRS+A++F+  G+ V L+D  +QQ+++A+  I+ +++  E  G LK  +  + +   S+IS   +++EA++GA  +QE VPE+LELK+K+F + D++  D +ILSSSTSC++PSK    L H K CIV+HPVNPP   P +E+VP  ET    V++T +L ++ G  P+ V+KEVAGFVLNRLQYA+++E++RLVE  + +P D+++ +++GL MR++ IGP ET HLNA +G+  Y +RY    + VL+     + +F + T +K+++ MC   P   E +  R + RD  L  LA
Sbjct:    3 SSAAGCVVIVGSGVIGRSWAMLFASGGFQVKLYDIEQQQIRNALENIRKEMKLLEQAGSLKGSL--SVEEQLSLISGCPNIQEAVEGAMHIQECVPEDLELKKKIFAQLDSIIDDRVILSSSTSCLMPSKLFAGLVHVKQCIVAHPVNPPYYIPLVELVPHPETAPTTVDRTHALMKKIGQCPMRVQKEVAGFVLNRLQYAIISEAWRLVEEGIVSPSDLDLVMSEGLGMRYAFIGPLETMHLNA-EGMLSYCDRYSEGIKHVLQTFG-PIPEFSRATAEKVNQDMCMKVPDDPEHLAARRQWRDECLMRLA 310

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00047805 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00047805 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CRYL1	1.268e-85	41.99	Lambda-crystallin homolog OS=Homo sapiens GN=CRYL1...	[more]

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TCONS_00047805 (transcript) - C. hemisphaerica