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transcript sequence >TCONS_00047826 ID=TCONS_00047826|Name=TCONS_00047826|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=413bp CGTGGCCCCAGGCCTTTAACTAACACATTTATAGGATTATTATAGAAatt catattttcatttttagactCGTGACCAGCAAAGGGACGAAATCAATCGG CTGGAGCAGCAGGTTGCTGCTCAACCTCAAGCTCCTCCACCGGCGCTAGA TATTCCTAATATTTATCACTTCGAGCAGCGCCATTTTTTACGAATAAGTA AGCATTCTTTATCAATATTGAAGTATAGTATTCTATGGATAATTTCGATG GATTATTATGATTCATCTGATAGTTCTGctccatttaaagcaaaaagtCC TCCAATAAAAACGCAGTAATTCGATAACCAACTAAAGTGTATCcggatat aattggcagtggaaacaagaatgcctgtaacttttgatagtcaaatatga ttatggaaattct Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_137:44672..74122- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00047826 ID=TCONS_00047826|Name=TCONS_00047826|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=29451bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_137:44672..74122- (Clytia hemisphaerica) CGTGGCCCCAGGCCTTTAACTAACACATTTATAGGATCAGTGTATGAAAC
TCTTATTTTTAGATTCGTGACCAGCAAGGGGACGGATCGCAGAGTTGGAG
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GTGGCCCACCTTATTTAATGAAAAGCGACGAATATGAGTTCGTTTGTATT
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TCAAAAATTTATCTGCAGTTTACGTTTATATAGACAGAAGCTGCTGCAGA
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CTAATTATTTTTAATTTCCTTTACTTACATTCTTATTATTTAATATACTG
TGTTTTTTTTCCAGCAAATTCAGAAAAACAGTTTTTATACAGGATGAGGT
AACTTTTAATCTAACAAGCGAAATTCGACAAATGATCTTTCGAAATTTAT
GTTGATTTTTCCTCCTTCTAATGAAGGATATTTTAATTCATTGAAAATTG
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TCCATATTAACAAAGGTTCTTACCGCTTTTAGAAAAATTATAGGTAAATT
AATATATCCGAGAATATATGACATTTCAATAAACAACGATAAGATCTTCG
GAATGGTGTCAAGCACATTTTTTATAAAAACATCCAAAGTTTTTGGATTT
TCAAATTTTACCCTAAAACATATTTTCGGCATTTTCTTTATTTTGCCATT
TTGTGAGTATTTTTGGCTTTTTTTCTTAAGAAAACTCCTGAAAGCAGACA
AACTCCATAACCCAAATTTATCTGGTCGCTGGTCGTGGTCGCCGGTCGTG
GTCGCCATTTCTGGTTTAGAAACTCCCCAAAAATCTTTTTACCATGTAAT
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CTTATTTCGATACTTTTGGTATAACCTTTTACTCTTTTAATTTTAGAGTC
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CAAAAATATATTTATTATTTATTTATTTTATTTGATGCAACCAGTATTAT
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ATTACCACGCTAGCAGCCAATCTTAAATGACCCCCCTCAACCACCACACC
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CCACCACCACCACCACGCTACCGACCACTTGACGACCCCTGATATTATGA
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TGTTTACTATAGTACTTCGAATAATGGGGAACGCCCAAGCTGTTGCTGTT
AACCCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTCCTGAACCTCCTCAACCACCACG
CCAGCAGCCAATTATAAATCAACCTCCTCAACGACCACACTGGCAACCAA
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AGGTCACTTGAATTTTCAAACATTCCAATAGAGGCACTTATGAGCCTTAT
GGATATATTCATGAACGAGTTTCAATTAACACCATCACAGGAACGATTAT
GGTAATTCAGGCTATGGACCAGCAAAGCTAGAGCGGAAGCTTGCTGCTCA
ACAACAATCAGCTACTCCACTGGTCTACCGGCACAGCCCAGCCCGGATTC
CTGCGAATTAAAAAGCTTTCTTTTCAATTATAGTATTGGGTAACCCATAC
AGTACGCGAAAAGTAGCTGACATATTCGACAACATGACGGAAACAGATTA
AGAGAGATTTCATCGCATCATATTGATATCAAAAAGTTTTATGGTTCGGC
TGCCATAGAATAAGGATCAATATGACATCTGAAAAGACCGAAATAGTTAA
TTCATTTAAAGATGATGTATTTTCTCAAGAACAAAGAAACACTGGGATGT
GATTCCACCATACGAATTGTAGCAAGGAATAGTGATGCTAAATTATCAAG
GAGTTCATTTCGATTCATTTGATCAGTCATTTTATAAGGATATCGAAATG
CCTTAGAAAAATGCCATTGAAAAAAGTTGAAATGAAGATATGAAGATATG
GCAAAATCGCAGAGTACTCTCGGGTACCCAATAGCTGGGGGGAAGGTTTT
GGAAAACATCTCAAAACTTAATAAGCAGTGGGGGTTGAAAGTTTTGGAAA
AGGAGGTTAATACAACAGAATTAGGACAACGGCGGAAATTTCAAAACATT
GAATAAGAATCAGTTTGAATGAAAATGTACTGCGGGGAAATCGGGGAAAT
CGAAAAATCAATAAGCGGGGTTGGCTATTATGCAAGAAAAAATGTAGTCT
GAATCGCAGACCTCTACAAAACCCCTGGTAGTATAGGTCTGCTTAATGAT
CTACCAACCGCTTTCCGGTTCGGTTATTTTTAGTTCGGAGTACGATATAA
GGAGTACGAATCCGTTAGTGGATGCCAGCAGCCTAGAAAAAATCAGGAGT
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TTTTCGTTCCTTCTAGTCCGTGGTAATTTTCCGGGGGTCAGGATTCGATT
ATTGTCAGTTAGTTAGGGTCAGGGTTGCAAACAACAAAGCAACCTCGCCA
AGCCTGCATTTAACACACGTTATTTGGGTCCACTTTATCCAAGCCTAACG
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CCTTCCCACTGAAAATATCAAAATATCATCCCCGGTGGAAAATTATCCTC
CACTTTTTGTCCCCACTGAAAATAACCAAATAAACCAATCCTCACTGCAA
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AATTAAAAATCCCCATATGGAAACATCAATCCCCATCGAGTTTAAGTCCG
TTATTTTCATCTCCACTGGCTGAAAAAATCCTACCGGGTGCTAATTATTA
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TTTCCAGCAAATTCAGAAGAAAAACAGTTTTTGTACAGGATGAGGTAACT
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ATTTTTTCTCCTTCTAATGAAGGATATTTTAATTCATTGAAAATTGAGCT
CGAGAAATTTTACTCCAAAGAATCTAAGTTAGTTCTGGCATGTATTTCCA
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TATCCGAGAATATATGACATTTCAATAAACAACGATAAGATCTTCGGAAT
GGTGTCAAGCACATTTTTTATAAAAACATCCAAAGTTTTTAGATTTTCAA
ATTTTACCCCAAAACATATTCTCGGCATTTTCTTTACTTCACCATTTTGT
GATGTGAGTATTTTTGGCTTTTTTCTAAAGAAAACGGGTGTTTTTAGGAT
TAATCCAATCAATTTTTTGTTAAACGTTTATTTATTTGTTATCTTTTTTC
AATATTTTTTGTTTACTTTAGGTGCGAAGTGATTTAAGAACATTCTAAGA
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CTCCACCATATCAACCACTCGACAATCCCCACTACTACGAATATCCTTAC
TACCCTTACCCTTATTAATTTTGGTTTTATTTGTCATTATCTTATTATTT
TATTTTTTCTATCTTATTTCGATACTTTTGGTATATCAAAGAAGACGTGT
AATGTGAAATTCCGAGTTGAACAAACCTTTTACTCTTTTATTTTAGAGTC
GATTAGAAAAGACAGACTAATTGTCAACTTGAGAAGAGTGAGTGACCACA
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ACAGAATAGAATAATTTGAGTTATACTGCTAATCCTAGAAAAATTGTACT
TTTAGTAAAATTTTATGCCGGTTGGAAAGTAAATTATTGGTTATTTCATT
TTTATTACAATGGAAATTGTCAAAAAGCTTTTTAGTATCTAATTTAGTGA
ATCTTAGTGAAAATAATGGAAATTATTTTATCTTATATTCATTATTTAAT
GCAACCAATTCTATGTTACCTAATTTAGTATCTTTTAGTTAAAACAAAAG
AAATTAGTTTCTGAAATATTCATTAGTTTTTTTATTTACATAAGTGGGAA
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TATTATTTTGAACGTATATTCATTTGTAATCTTAACTGACTTACAGGCTT
TTGTATAATGTCTTTTAGATGGGGTTGTTCACGAGCGTCCGATGGAGGAT
GTCTCCTTTGCCCCACCAATGGGGAATGCTGCTCCTGTTAACCTTGTTCC
TGTTAACCCTGTTGCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTA
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GTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCC
TGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTA
ACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCT
GTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCC
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ACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCTGTCCCTGTTAACCCT
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CTGGTCTACCGGCACAGCCCAAGTGTCCAATATAAACCACGGCATTTCCT
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ATAGTTTTTGATGACGTTTTGAAAGTGTTGCCCCAAAAACTATTTCTTAA
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TCTTCCTTAGTGAAACACCCAACATAAAATCTTCATTCATTCTATTTAAC
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CATTCATTCATAAATCCATTCATTCCAGAAACACGATTAGTCTGTCGGAA
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AACATTCACGAGATTCAATCATCTCAACTTGACCAATCGTTCTACTCAGT
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AGGTCAGCGTATGAAATTAAGTCGAGGTAGGCGTGGTAATCAAGCACCGT
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TTAGCAAGGATAATCTCTGTCGCGTTAGAATTACCAAGAAGGCTTGCGGA
GAAGCATGATCTTTAGCAGAAATCGTCGACTCAAGGTCCTCTATATAGAT
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ACATGGTATTACCACCTTCCAGGCGTTTTAAATTTTTAGTACGGCCATAC
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AGATCGTTATAACTAGTGGAAGAAATGCCGATTCCTTTAAAATGAAAATT
ACCGAAATTATGAGTATTAAGATATTCACTAACCTTGTCCATGTTTTTTC
AAGATTTGTTCAATTTCATATTGATTCATAAATCGTTTGCCATCTCAACA
AATGTAAAACAGATATTTCTGGCTTGAATTCGATTTATGGTTTTGTGAAT
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GTCAGAATAGGCAAAAGAATGGATCTTATCGGAGTTTTAAAAAAGCGATG
CATTGTGGGATCGTTTCGGGAGTATTACAATAGAAATATCTAATCCCACA
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AATGTTTCGATAAAAAGGTCGGAAATATTACTTTTCGTACAAAAAGATTT
GATTGGGTCAAAAACTGCGGATTTAAAAAAATAACCCGATCAAAAAATTG
AAAAATGTTAAAACTCCAAAAAGGAAGTGTTCAAAAGTTTGAAAATACAA
ATGAAATTCGCAAAAAGAGTCCTTGCTCAAAAGATTTAAATTCCAAAAAA
AATTCGGAAAAATTCCAAATTAACAACAAATCAAGAAGAAAATATAATTT
TAACCCATTTAAAGGCAATGAGTTTGAAAATTTAAATCTCGAAACATTAT
AACTAGAGTTAAACTACCCTAAAAAGGAGAATCCCATAAATAAAAGTAAG
TGAATAAGAATCTAAAGATTACCAAAGTTCAAAAATTGTGTCAAAACCTC
AACCTAATCCGATCGCAGAGCAAAATGAAGTAACTGAAGTAATGTATGTA
AGCAATTCATACAAGTCACAAGGATAAGGATTGTAAAGTAAAGGATAGAA
TTTAAGAAAAGTCTCACCTTAAATAAAGTTGTTTCCATATAATAGATCAT
TTTGACTTTCGTAAAACGTGTCTTCAAGACTTGCCGGCTTCTCCTTTCAC
AAACGCTCTTTTAGCCTTGTATGAAAACTTGATTTTATCTCATTTCGAAC
GCCCTCAATCTCAAGTGAGCAATTCCCTAATGACCTATTAAAATCGACAT
GTAACGTAACAAAAGAAAAAGATAAAAACAAAAAAGTAATCATTACCCAA
GAGACATGTAGTCACATTAGCTATTGTTCAAAAAACAGTTTCGGCAATAA
GTTTGGGATCGTTTGCTTGTGTATTTACGAAGGATCATTGTAAAGTTGTA
ATCATTGAGTTTAAAGCCCGAAGGACTAGAGTAGAATCGCTAACTTTTCT
CAGGCAAGAAAAGTGAAGCCTTAAAAAATGCGCCGTATTTTTTGACGACA
GATTGAATCTAGCAATTCCTTTGTTTACGATTGATATTTTTTTCGAAATT
TAGTGGTAAATTTTAGTTTCAATCTGTCATTTGTGTAAAAACCAGGCGAG
CCGCTCAAGGCCGTGCAGCTTTGTTGGCTTCAAATCCTACCAAGGAGATT
CGATTCTAGCCCTTCGGGCTTATACTTCATTGGTTGCAATTCTCTATCTT
GAAAACCAAACAGAATTTCAAGGGATAGAATCGATATTTTCTGTTGAGGG
TAGAGATTCTTTCAAAACTAAAAAATCTTGAAACTGAAAAAAGTTAACCT
GAAAAGTAGGGTTCCTACAGTTCCTTGATTATTGAACCAAAATATTCACT
GTGTGAAAAATCTATGCCTGTAGAGAATTTCCGTCGCATATAAAAGCGTA
AAGGGAGAACTTTTGATGATCATTTCATTGAAGCGATTAAGAAAAACTAG
GTTCAAAAAACACTTTGAAAAATTGTAGAGAATTCAAATTCTGACAAAGC
AAAGAAATCTACGACAAAATCCTGCATTGTCGGGGTCAGCAAGACGGGGT
TTTTATATAAGCAATAGTCCTTTAATTTCTGCTCCTGAGAAACCCCTAAG
ACAAAGAAAACCGTTTGTCTTTATATTTGGTTTCTTTTCTGTTATAAAGA
CAGTCCTATAATATAAGAAATCCATCTTATCTAGGTTTTTTACGGGACAG
TGTAATTGGACCACAACATTTTTGGAACAAACACCTCGTGAACAGAGCGG
AACATCATAATCAAAATCTTCTCCTGTAATAAAAGATTAAAAAGCAGGAC
AGGAGCAAGATCTAGGAATAACTTTCTTTGACTTTTTCCCAACAAATAAA
AATCATGAGATTTTAATATTTGATCCGAATTTAAGTCCATTCACGTTAAG
TGTGCACTAATTTTTGCTTAACCTCAATACCAAAAATAAAGATTTCTAGC
ATCAAAAAGAGATCATTTTTCTTTCGGACCGAAAAGTCACTCTACTCACG
GGAAGGCTAATTTGTTCGAATTAAAGAAAGTGTTTTACGAGGATTCTCCT
TGGCGAGAACTAGAATTAGTTCGAATAATAAGTGAAGTTCGAATTAGCAA
GATTCTACTGAGTACTACAGTAGAGTCTTCATAACTCAAACACTCACGGA
GATCTCAAATTTGTTCGAGTTAAGGAAACTTTATTGAGTAAGGTTTATAA
GGCATTTTAACTTAAGGAATGACAAAACTAGTTCGAGTTAAGGAGACATT
CGAGTTATAGAGGTTCTAAAAAAACTCAAGAATAAAAGAAAAAAGTATAA
AGTGAAAGTTTAGTGTTTGATATTTTTATTAATATTTGCAAAATCTTTAT
ATACCAAGATATCGTAAGAGATGAAAATTCTAAAAAACGAACATAACATA
ACATGTACAAGCGTAAAAGGTATTATACCGAGTGGCCCAAAAAAAACTTT
ACATACATGATTTTGAATGTCATTATTTTGACGTATCATTGTTAAAACAG
TTTGAAACTTTAAAAGTGTCTCTAAAATTATAAGATTATATGAAAAATAT
CTAAATTCTGAGGAAATAAATAATCGAACAAACAAAAAATGACAAAATAC
AAAAAAGAAAAGAGGAAGAAGGAAGAGATTTATACAAGAAAGTATTATAG
GTTCTTCAAGAGCTCCGATTTTCCAAAGCATTGTGTTTATAGTTCTTATT
TTCACCTCCTGTTTAGAGACCTGAGCTCCTTCAATGCCGAGGGAAACATT
TTTTTGATGATGCTCTAACTTCAAAAAGGATTTTCTTTGCTTTAACTAAG
GATAAAAAGGTGATGTTCATTTAAATGCTTATGACCATGTTTTAGCATTA
AAATTTTTCAAATCAATTTTTCAAATATCACCCTCAATCGAAATTACCGC
CCATTTTTTTAACGAATCATGGCTGATCATGCATACAAAAAAAGTATTAA
GTAGGAACAAAATCTTAAATTTATCGTGTTTTCTGTACAAATATAATTGG
TATCTAAAAAATTTACAGTCCAATTCATATATACAAACAAAATACAAATA
TACCCTATAAAAAGAATATCACAAACATGTAAAATTATTTTGTGAAATTT
TAAGGATTACAATAATATATTTGGAATAAGATTTAAACAATTTAAATTAA
GTTCAAAGAATGCACGTGAAGGGGCGATATTTTTAGACAAAATCAGTAAT
TTCTTAAAAAGTGAGAAAGTTTGTTAAATATGGATACCTACAGAAGAATT
TGCGATGAATTTGGGGGAGTTCTGTCATTTTTTTAACGGTCTAAACTTTA
GTGCAGAGAACATCCCTGTCTTTGTGACCAGGTTGAACTTCAAACGTACT
AGGGCAACGAAGTGAAAAAGTGAAATTTCATCTGGTCTGTCACTCCGACC
TTGCCTTAGCACGTTTGTGTTGATTTACCTTAGGCTGACTTATTTACCTT
TAGTTTTCGATCTGTTTCAATAATTAATAATCGGCAGCAGAGATCAAAAC
ATTCTCTTAGAATAAGAATTACAAAATAGTTTTGTGCTCGTTGAAAAGCT
ATTCAGGAGTGGAATATTATTTTCAAAATAAAAAATTTCAACATCATGTG
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CATCATGCCATAATTATTATTTTCTCACAACTGATTCCTTCCTGTCAAAC
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TTTTATACGCTTTCTAAATGCATCAGTTTAATTCCTTTTAAATCACGTGG
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T
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_137 | supercontig | scaffold_137:44672..74122 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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