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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00049910 ID=TCONS_00049910|Name=TCONS_00049910|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=929bp
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GAATTCCAGCGCTTGACCAGTCAAAAGCT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00049910-protein >TCONS_00049910-protein ID=TCONS_00049910-protein|Name=TCONS_00049910-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=109bp
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QMTSDDNTEMKRFGDEELLSRNQDYEIVPDDLDYQHLQPIPQPANYTPLQ
APDNYMKMT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_167:555685..577606+ Legend: exonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00049910 ID=TCONS_00049910|Name=TCONS_00049910|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21922bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_167:555685..577606+ (Clytia hemisphaerica)
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ACTTATCAAAAGATGTACCATTGGGTATACAATCTGGAAACAAAATATTA
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TCTATCCGAAGTTGGTCTAAAAGACAATGGAAATCGTTTCTCGGTATATG
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AACAAGGTTGAATTGAATATTTCTAGCAAAATTATCGATCAGTACGGGTG
AAAAGCTAATCTGGATTTTTGGTTCATTAGTTCTATGACGTCCTCCTCTA
GGTTTTTTTGACCCATAAAATCccaaataaaaatatacaaactatgttta
TGGATTGATCTCATTTCACTGAATAGAAAAATACACAGCAACTTGTATTG
ATATTCTTTTAGTGatacttttttttatagaatttcCAGTTAGTCGTTTG
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TTTTGTGCTTACGGAGTAATGGATCCAAAAGTCGCAGTCGTATACGCTGA
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AATTCACCAACAAAAAGCCGAGGAGGAAATGGTACAAACAAAAGATTGGT
AATAATGAAAACCTTTAATCTTACTTGAGACTTTTCCTAGAACAAGAATA
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TTATTTAGTATAAGCCATTTCAGATTCGAAATGAAACATGGGTAATCATA
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TGGTTTTGGCTAGTTGTTGGTTGTTTAGGTCAAACCCTACTGATTCTCTT
CTTCATTTCGCTCTTCAAATGCTGTAAAAGAATAAAATGCTGCTGTACTG
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CTTAAATTTggcactactggcaaaaaccggagTGTTTCCATAGAAAAcct
tacgtcatgaatatcataaattACATCGAGGAGATACCACAGTCCTTTGA
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TAAACAACGCTCTCTAGTATTTGATACGCGCACCCGCTTATTCGATGGTG
AAAATCCCCcaatttcccttgaaaatcagctgtaatttcttttactttta
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tgccagctgggtttgtTCTTTTCTGGGAGTATGGCAAATGGTGAGCCAAG
TGCTTTTTTGATACGCTCGAGTAAAGATTACATAATGTTTTGCTATCCAA
AATAAAATACCccgaagattctgaaaggtgaCTCAGTTTGGTGACTCTGG
AACTAAGAGGTTTCCAGAACTCTCGTAGCTACCATGGAAAGAGcgtaaaa
ttttgaagaaagtgATTCATggctacaatcagtgccataatatattggca
cttttggctaatttaccatttttcgaaaattgaagttcgagcgagaatgt
caatttttaggccttcaacttgatttcatcgattatttcgatctgggaga
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CTCATGTCTCTGGGACAAATGGGAAATCAAGCCATTNAActctactttag
agcacttacaaatcgatcgtggtttcaaaacaccccggtgaatttccctt
ttgtgccaagtattttgtcactgattgtactCTATTCTCATGTCTCTGGG
ACAAATGGGAAATCAAGCCATTTGTCTCAGTGACTAAGTAAGAAACCAAA
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CTTATCATTAATTTCGGCCTTCCTTTGCTTTTTTGCACCTTTACACCTGG
CAGTTTTCGAcctaaaagagagaaaatacccaaatattttttttttaaat
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CCAGTTTCCCCGAATTTTGGTCGAATCACTTCGCTACTGCCATTTAACTC
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TGCTTTCAGTAATACACGAAACCCGCCAAAATTCAAGAACGatcaatagc
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AAGAGATCAGCgcaaaggatgatgggattGAAACTCGTACAAACATATCG
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GTGATAGGTAGAAATTCTACCTAGGTCATTTGACATTACAACAGAATTCC
AGCGCTTGACCAGTCAAAAGCT Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_167:555685..577606+ >TCONS_00049910 ID=TCONS_00049910|Name=TCONS_00049910|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=990bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_167:555685..577606+ (Clytia hemisphaerica)
GAAATATGTTGGTTTTGGCTAGTTGTTGGTTGTTTAGGTCAAACCCTACT
GATTCTCTTCTTCATTTCGCTCTTCAAATGCTGTAAAAGAATAAAATGTT
GCTGTACTGGAAAGTCAAGATGTAGTTCTTGTCAAAGGAACAGAGAATTT
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GCTCCAGataactacatgaaaatgacaTGAGAAATATGTTGGTTTTGGCT
AGTTGTTGGTTGTTTAGGTCAAACCCTACTGATTCTCTTCTTCATTTCGC
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ATTACGAAATTGTTCCTGACGACTTGGACTATCAACATCTTCAGCCGATC
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CCCTCTACAAGCTCCAGataactacatgaaaatgacaTGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_167 | supercontig | scaffold_167:555685..577606 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
