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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00052584 ID=TCONS_00052584|Name=TCONS_00052584|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1988bp
ATGTGTATTGATTGAAAATGATCAAGGAGGAGAACCATTTTAAGTTCAGT
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TAACATAATACAACAACATTTGAATTCTTCAATTCTCA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_218:420711..434873+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00052584 ID=TCONS_00052584|Name=TCONS_00052584|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14163bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_218:420711..434873+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTGTATTGATTGAAAATGATCAAGGAGGAGAACCATTTTAAGTTCAGT
TGTACTTGAATTTAACTGCAGCCGAATCACAACTAAACTTTCCAACACGA
CTCAATCAGTGTCAAATCAAGGAAATTATCCCAGATACATTAACATCATA
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CTCTAACCATCCAAATActctaaaaactttttcaatcaaatccATTCTTA
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AAATCGGAAGCTTTTAGTATTGATTTATGTAGAATACAATCTCAACTCTT
TCAAGGGCATATCACGAAAGTTTGTAATATATATTGATATGTAACTACTA
CAGACGAGTGTCTAACACTCGGACATAACTCATAACTCAAAAGACAGATT
GCCACGGGAGAGTGGTTTTAATGTATTCAACGAATATATTGAGCATTTGC
AAGAATAAGCATCAGCGAAAAGCGGATACATGGTTTGCTAATCTATTTTT
AACGCTCCTTCCTTCTAATTCTTCTAATTCGATAAAATTTGTCCCCTCGA
TATATCCAGAAACTTAAAATTCACCAATGGTTATTTTCCCTCTACCATTA
CAGATGGATATCAACCTCTTGACAATCAACTTCATCTTGATACTGACAAC
ACTTTCAATCACCACACAAACCGTTCAAGCTGGTGAACAAAAAGGACCTG
GCGTACGACACATTTGCGGCAAAGACTTCATCAGAACCTGGCAAATCCTC
TGCAAAATCAAACAACTTAAACGTAACCGTGGTAGGAAAAGACGTTCTCT
TCTTGACGGTAAGTGCTTGATTTATACTTTATTCTAAACacgtctttttt
ctttattacttTGAATTTGTGTAGTTTACGTAGCTAAGCTAAATacaaga
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CTTTGATCCAGGGCTACAAAACGGTCTTTCTATGCCAATTTTGTTGTTTG
AGTCTATTGCNAAAACTCTGGCTCTCAGGGTTAAAACTCTTACTTTGATC
CAGGGCTACAAAACGGTCTTTCTATGCCAATTTTGTTGTTTGAGTCTATT
GCTCCTAAATTCATCTTTAAGTTCCGACCAAAAACTTTTCCTGTGGGAGA
CAAGCGTGTACGTTTCTTCTTTTGACCACGTGATTTATCCTTTCAGATGG
CGTTGTTAAAATCAAATCAGCACACGACTTATTGGACAGCAGAACTGCTA
GATCATTTTTAAAAGCTTCCTTATCGGTAAGGAGTAAACGTTCGATTTAC
AGTCGAGTGAACACATTAAATGCTTCCGAGGAATGTTGCATGGAAGGATG
TCGTCTTTCCGAAATCAATGAATACGATTGCTAAAACATCATGTTTCAGT
TGACAGGACTGTATTCATTCAAACTTTAACGGTTCTAGTATGATCAAAAG
AGTCCAGAAAACTCAAAAGCTGGAACAGGTCTTTTGAAATGGAAATCATG
CCATATGATAGGAGGAAATAAGCCTTCGATTGGCTTTCCGAGATAAACGA
TTGATTACAATTAATTAAGTTATTGGACCATAGGTTATCATGATGAAAAC
TCGATACCTATATTTAAATACGTTATCCAAACCTTTAGTGTAATATCTGA
CAATATACAGTTTAGTTATAGGTATGCTTTTAGATAATTTTTCGGGTTAT
CGGGGTACAAATATATTCCAAAAGTACCAAATTTGAAATCCGAAATCTAA
TTTTAACGTATTTAAAACAATTATTTTAAGTATATATGACAATAAAATGt
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cttttcataaatcattCCGAGTAACGAttacctcgttttgaaaccattac
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CTGATGACCCATGCAGTatgtatttttagattttacaaTAGGATGCTTTA
AGTATATTCGGTATGCAGAATAAAGTAACATAATACAACAACATTTGAAT
TCTTCAATTCTCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1491911889:420711..421026 | TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1491911889:420711..421026 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1510915933:420711..421026 | TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1510915933:420711..421026 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1575043694:420711..421026 | TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1575043694:420711..421026 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1491911889:432814..433018 | TCONS_00052584-exon-scaffold_218-1491911889:432814..433018 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_218 | supercontig | scaffold_218:420711..434873 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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